Doublet Group distance statistics: 49915

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.045, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.045
C8	A	0, 0.000, 0.050, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.050 std_dev=0.050
P	B	0, 0.000, 0.250, 0.501, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.250 std_dev=0.250
O4'	A	0, 0.000, 0.603, 1.205, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.603 std_dev=0.603
OP1	B	0, 0.000, 0.633, 1.265, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.633 std_dev=0.633
O5'	A	0, 0.000, 0.663, 1.325, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.663 std_dev=0.663
C2'	A	0, 0.000, 0.684, 1.368, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.684 std_dev=0.684
OP2	B	0, 0.000, 0.726, 1.451, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.726 std_dev=0.726
C3'	A	0, 0.000, 0.771, 1.542, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.771 std_dev=0.771
C4'	A	0, 0.000, 0.782, 1.563, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.782 std_dev=0.782
O3'	A	0, 0.000, 0.972, 1.944, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.972 std_dev=0.972
C5'	A	0, 0.000, 1.119, 2.238, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.119 std_dev=1.119
P	A	0, 0.000, 1.150, 2.300, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.150 std_dev=1.150
O2'	A	0, 0.000, 1.211, 2.421, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.211 std_dev=1.211
OP2	A	0, 0.000, 1.539, 3.078, 3.078 max_d=3.078 avg_d=1.539 std_dev=1.539
O5'	B	0, 0.000, 1.649, 3.299, 3.299 max_d=3.299 avg_d=1.649 std_dev=1.649
OP1	A	0, 0.000, 2.233, 4.466, 4.466 max_d=4.466 avg_d=2.233 std_dev=2.233
C5'	B	0, 0.000, 2.547, 5.095, 5.095 max_d=5.095 avg_d=2.547 std_dev=2.547
C6	B	0, 0.000, 3.534, 7.068, 7.068 max_d=7.068 avg_d=3.534 std_dev=3.534
C4'	B	0, 0.000, 3.635, 7.270, 7.270 max_d=7.270 avg_d=3.635 std_dev=3.635
C5	B	0, 0.000, 3.661, 7.322, 7.322 max_d=7.322 avg_d=3.661 std_dev=3.661
C3'	B	0, 0.000, 3.837, 7.674, 7.674 max_d=7.674 avg_d=3.837 std_dev=3.837
O4'	B	0, 0.000, 3.994, 7.988, 7.988 max_d=7.988 avg_d=3.994 std_dev=3.994
N1	B	0, 0.000, 4.387, 8.774, 8.774 max_d=8.774 avg_d=4.387 std_dev=4.387
O3'	B	0, 0.000, 4.437, 8.873, 8.873 max_d=8.873 avg_d=4.437 std_dev=4.437
C4	B	0, 0.000, 4.458, 8.915, 8.915 max_d=8.915 avg_d=4.458 std_dev=4.458
C1'	B	0, 0.000, 4.664, 9.328, 9.328 max_d=9.328 avg_d=4.664 std_dev=4.664
C2'	B	0, 0.000, 4.709, 9.418, 9.418 max_d=9.418 avg_d=4.709 std_dev=4.709
N4	B	0, 0.000, 4.737, 9.475, 9.475 max_d=9.475 avg_d=4.737 std_dev=4.737
N3	B	0, 0.000, 5.134, 10.268, 10.268 max_d=10.268 avg_d=5.134 std_dev=5.134
C2	B	0, 0.000, 5.208, 10.415, 10.415 max_d=10.415 avg_d=5.208 std_dev=5.208
O2'	B	0, 0.000, 5.813, 11.627, 11.627 max_d=11.627 avg_d=5.813 std_dev=5.813
O2	B	0, 0.000, 6.100, 12.200, 12.200 max_d=12.200 avg_d=6.100 std_dev=6.100

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.11	0.01	0.88	0.06	0.47
C2	0.00	0.00	0.30	0.25	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.10	0.11	0.01	0.94	0.19	0.43
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.15	0.01	0.06	0.16	0.12	0.14	0.22	0.37	0.30	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.08	0.79	0.14	0.30
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.19	0.01	0.20	0.00	0.23	0.09	0.26	0.26	0.22	0.14	0.11	0.01	0.00	0.03	0.20	0.23	0.64	0.18	0.15
C4	0.00	0.00	0.15	0.19	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.05	0.11	0.01	0.77	0.25	0.36
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.01	0.02	0.25	0.01	0.00	0.00	0.03	0.74	0.14	0.28
C5	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.05	0.03	0.12	0.00	0.59	0.38	0.27
C5'	0.07	0.03	0.16	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.09	0.16	0.06	0.01	0.03	0.15	0.10	0.08	0.19	0.01	0.00	0.11	0.27	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.23	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.03	0.05	0.12	0.00	0.63	0.39	0.28
C8	0.01	0.00	0.14	0.09	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.08	0.05	0.12	0.00	0.42	0.41	0.21
N1	0.00	0.00	0.22	0.26	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.03	0.08	0.11	0.00	0.80	0.29	0.36
N2	0.01	0.00	0.37	0.26	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.06	0.12	0.09	0.01	1.05	0.12	0.47
N3	0.01	0.00	0.30	0.22	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.09	0.10	0.01	0.95	0.14	0.45
N7	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.04	0.02	0.12	0.00	0.39	0.47	0.18
N9	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.13	0.01	0.11	0.01	0.69	0.24	0.35
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.25	0.18	0.08	0.16	0.25	0.07	0.13	0.06	0.26	0.14	0.00	0.02	0.14	0.15	0.20	1.33	0.37	0.76
O3'	0.24	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.19	0.03	0.08	0.03	0.06	0.09	0.04	0.13	0.02	0.00	0.16	0.06	0.01	1.00	0.08	0.35
O4'	0.00	0.10	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.12	0.09	0.02	0.01	0.14	0.16	0.00	0.22	0.03	0.78	0.11	0.43
O5'	0.11	0.11	0.14	0.20	0.11	0.00	0.12	0.00	0.12	0.12	0.11	0.09	0.10	0.12	0.11	0.15	0.06	0.22	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.23	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.01	0.03	0.12	0.00	0.53	0.46	0.23
OP1	0.88	0.94	0.79	0.64	0.77	0.74	0.59	0.27	0.63	0.42	0.80	1.05	0.95	0.39	0.69	1.33	1.00	0.78	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.19	0.14	0.18	0.25	0.14	0.38	0.36	0.39	0.41	0.29	0.12	0.14	0.47	0.24	0.37	0.08	0.11	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00
P	0.47	0.43	0.30	0.15	0.36	0.28	0.27	0.01	0.28	0.21	0.36	0.47	0.45	0.18	0.35	0.76	0.35	0.43	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.15	0.58	1.55	1.64	0.23	1.39	0.23	1.12	0.27	0.67	0.16	0.63	0.85	1.76	1.94	1.12	0.84	0.12	0.14	0.14
C2	0.29	0.39	0.77	0.95	1.14	0.69	0.96	0.58	0.45	0.18	0.84	1.63	0.19	0.97	1.31	0.34	0.44	0.18	0.08	0.15
C2'	0.82	0.31	1.30	1.36	0.52	1.04	0.59	0.72	0.12	0.34	0.10	0.89	0.62	1.58	1.78	0.73	0.41	0.28	0.47	0.31
C3'	1.12	0.57	1.49	1.56	0.25	1.37	0.30	1.11	0.17	0.62	0.15	0.63	0.88	1.78	1.93	1.08	0.74	0.02	0.23	0.04
C4	0.37	0.26	0.78	0.95	0.98	0.73	0.86	0.62	0.36	0.07	0.67	1.40	0.06	0.94	1.23	0.43	0.48	0.17	0.05	0.15
C4'	1.40	0.81	1.69	1.77	0.01	1.67	0.05	1.39	0.43	0.88	0.39	0.38	1.12	1.98	2.09	1.40	0.94	0.04	0.30	0.07
C5	0.11	0.76	0.26	0.48	1.39	0.33	1.20	0.32	0.71	0.52	1.15	1.80	0.61	0.37	0.72	0.03	0.26	0.19	0.14	0.15
C5'	1.15	0.59	1.32	1.36	0.15	1.45	0.20	1.26	0.23	0.66	0.21	0.47	0.88	1.60	1.58	1.22	0.72	0.13	0.54	0.14
C6	0.36	1.07	0.04	0.31	1.69	0.14	1.39	0.19	0.91	0.78	1.48	2.15	0.95	0.15	0.58	0.19	0.16	0.20	0.19	0.15
C8	0.22	0.33	0.49	0.65	0.91	0.55	0.84	0.51	0.40	0.16	0.66	1.21	0.17	0.59	0.79	0.33	0.43	0.17	0.05	0.16
N1	0.10	0.81	0.35	0.59	1.48	0.37	1.22	0.35	0.72	0.54	1.25	1.97	0.67	0.50	0.91	0.01	0.27	0.19	0.15	0.15
N2	0.39	0.29	0.91	1.08	1.07	0.79	0.90	0.64	0.38	0.09	0.75	1.58	0.07	1.15	1.48	0.42	0.48	0.18	0.07	0.14
N3	0.54	0.10	1.01	1.16	0.88	0.89	0.77	0.73	0.25	0.07	0.54	1.35	0.13	1.23	1.51	0.56	0.55	0.16	0.02	0.14
N7	0.26	0.86	0.02	0.24	1.40	0.15	1.26	0.20	0.81	0.64	1.19	1.70	0.74	0.10	0.40	0.10	0.18	0.19	0.17	0.15
N9	0.61	0.03	0.98	1.12	0.68	0.92	0.62	0.78	0.13	0.18	0.36	1.05	0.24	1.13	1.36	0.66	0.61	0.15	0.03	0.15
O2'	1.09	0.56	1.68	1.69	0.39	1.26	0.50	0.83	0.02	0.56	0.11	0.81	0.95	2.04	2.23	0.90	0.47	0.23	0.47	0.29
O3'	1.29	0.66	1.69	1.74	0.27	1.57	0.32	1.28	0.22	0.72	0.18	0.71	1.03	2.08	2.20	1.25	0.81	0.09	0.23	0.02
O4'	1.39	0.77	1.67	1.80	0.01	1.68	0.01	1.46	0.51	0.90	0.35	0.39	1.03	1.87	2.01	1.44	1.12	0.28	0.08	0.33
O5'	1.89	1.36	1.98	1.95	0.59	2.10	0.50	1.77	0.93	1.39	0.98	0.27	1.67	2.27	2.07	1.91	1.13	0.05	0.27	0.15
O6	0.74	1.50	0.36	0.04	2.04	0.17	1.64	0.04	1.18	1.14	1.91	2.52	1.43	0.29	0.21	0.52	0.00	0.21	0.25	0.15
OP1	1.70	1.44	1.91	1.68	0.73	1.55	0.52	1.01	0.82	1.32	1.13	0.49	1.80	2.30	1.98	1.49	0.57	0.84	0.60	0.43
OP2	1.79	1.34	1.78	1.46	0.52	1.70	0.36	1.11	0.73	1.28	0.95	0.23	1.73	2.31	1.53	1.70	0.42	0.76	1.05	0.54
P	2.05	1.63	2.19	2.01	0.86	2.02	0.70	1.47	1.07	1.58	1.27	0.57	1.99	2.58	2.24	1.93	0.88	0.45	0.52	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.02	0.18	0.02
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.23	0.09	0.44	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.24	0.24	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.12	0.00	0.15	0.03	0.15	0.08	0.08	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.36	0.24	0.18
C4	0.02	0.01	0.02	0.12	0.00	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.00	0.37	0.18	0.63	0.25
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.10	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.40	0.16	0.59	0.24
C5'	0.02	0.11	0.02	0.03	0.24	0.01	0.28	0.00	0.23	0.13	0.17	0.27	0.04	0.05	0.06	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00
C6	0.00	0.01	0.03	0.15	0.01	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.32	0.08	0.43	0.14
N1	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.21	0.05	0.35	0.08
N3	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.17	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.03	0.00	0.31	0.15	0.57	0.21
N4	0.02	0.02	0.02	0.12	0.00	0.10	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.12	0.01	0.41	0.23	0.72	0.31
O2	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.18	0.10	0.01	0.16	0.06	0.39	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.13	0.11	0.18	0.00	0.10	0.08	0.07	0.28	0.23	0.13
O3'	0.03	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.17	0.06	0.15	0.05	0.03	0.12	0.10	0.10	0.00	0.00	0.10	0.66	0.35	0.36
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.15
O5'	0.07	0.23	0.06	0.05	0.37	0.01	0.40	0.00	0.32	0.21	0.31	0.41	0.16	0.07	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.09	0.24	0.36	0.18	0.06	0.16	0.03	0.08	0.05	0.15	0.23	0.06	0.28	0.66	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.44	0.24	0.24	0.63	0.06	0.59	0.03	0.43	0.35	0.57	0.72	0.39	0.23	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.13	0.11	0.18	0.25	0.01	0.24	0.00	0.14	0.08	0.21	0.31	0.09	0.13	0.36	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00