Doublet Group distance statistics: 49916

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O3'	A	0, 0.000, 0.201, 0.402, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.201 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.000, 0.375, 0.750, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.375 std_dev=0.375
OP2	B	0, 0.000, 0.397, 0.795, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.397 std_dev=0.397
C2'	A	0, 0.000, 0.480, 0.961, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.480 std_dev=0.480
O4'	A	0, 0.000, 0.513, 1.025, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.513 std_dev=0.513
OP1	B	0, 0.000, 0.586, 1.171, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.586 std_dev=0.586
P	A	0, 0.000, 0.637, 1.275, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.637 std_dev=0.637
C4'	A	0, 0.000, 0.638, 1.277, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.638 std_dev=0.638
O5'	A	0, 0.000, 0.666, 1.331, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.666 std_dev=0.666
P	B	0, 0.000, 0.715, 1.430, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.715 std_dev=0.715
OP2	A	0, 0.000, 0.753, 1.506, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.753 std_dev=0.753
O2'	A	0, 0.000, 0.871, 1.743, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.871 std_dev=0.871
C5'	A	0, 0.000, 1.305, 2.611, 2.611 max_d=2.611 avg_d=1.305 std_dev=1.305
OP1	A	0, 0.000, 1.866, 3.732, 3.732 max_d=3.732 avg_d=1.866 std_dev=1.866
O5'	B	0, 0.000, 1.922, 3.845, 3.845 max_d=3.845 avg_d=1.922 std_dev=1.922
C5'	B	0, 0.000, 2.687, 5.375, 5.375 max_d=5.375 avg_d=2.687 std_dev=2.687
C4'	B	0, 0.000, 4.023, 8.047, 8.047 max_d=8.047 avg_d=4.023 std_dev=4.023
O4'	B	0, 0.000, 4.154, 8.308, 8.308 max_d=8.308 avg_d=4.154 std_dev=4.154
C6	B	0, 0.000, 4.362, 8.724, 8.724 max_d=8.724 avg_d=4.362 std_dev=4.362
C3'	B	0, 0.000, 4.776, 9.551, 9.551 max_d=9.551 avg_d=4.776 std_dev=4.776
C5	B	0, 0.000, 4.972, 9.944, 9.944 max_d=9.944 avg_d=4.972 std_dev=4.972
C1'	B	0, 0.000, 5.263, 10.526, 10.526 max_d=10.526 avg_d=5.263 std_dev=5.263
N1	B	0, 0.000, 5.308, 10.616, 10.616 max_d=10.616 avg_d=5.308 std_dev=5.308
C2'	B	0, 0.000, 5.460, 10.921, 10.921 max_d=10.921 avg_d=5.460 std_dev=5.460
O3'	B	0, 0.000, 5.761, 11.523, 11.523 max_d=11.523 avg_d=5.761 std_dev=5.761
C4	B	0, 0.000, 6.357, 12.713, 12.713 max_d=12.713 avg_d=6.357 std_dev=6.357
O2'	B	0, 0.000, 6.567, 13.133, 13.133 max_d=13.133 avg_d=6.567 std_dev=6.567
C2	B	0, 0.000, 6.627, 13.254, 13.254 max_d=13.254 avg_d=6.627 std_dev=6.627
N3	B	0, 0.000, 7.049, 14.098, 14.098 max_d=14.098 avg_d=7.049 std_dev=7.049
N4	B	0, 0.000, 7.190, 14.380, 14.380 max_d=14.380 avg_d=7.190 std_dev=7.190
O2	B	0, 0.000, 7.555, 15.110, 15.110 max_d=15.110 avg_d=7.555 std_dev=7.555

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.25	0.03	0.15	0.27	0.11
C2	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.22	0.00	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.31	0.03	0.25	0.37	0.02	0.30	0.20	0.12
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.08	0.06	0.09	0.10	0.16	0.13	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.41	0.04	0.28	0.69	0.42
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.29	0.00	0.54	0.53	0.42
C4	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.07	0.16	0.34	0.00	0.40	0.26	0.08
C4'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.07	0.18	0.28	0.21	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01
C5	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.10	0.33	0.01	0.59	0.28	0.01
C5'	0.04	0.23	0.08	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.23	0.16	0.33	0.21	0.18	0.06	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04
C6	0.03	0.02	0.06	0.00	0.00	0.11	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.08	0.14	0.34	0.00	0.60	0.25	0.01
C8	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.12	0.08	0.26	0.01	0.64	0.34	0.03
N1	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.18	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.21	0.36	0.01	0.46	0.21	0.07
N2	0.02	0.00	0.16	0.01	0.00	0.28	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.01	0.29	0.38	0.01	0.19	0.17	0.17
N3	0.01	0.00	0.13	0.01	0.01	0.21	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.29	0.03	0.25	0.35	0.02	0.24	0.21	0.14
N7	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.02	0.28	0.01	0.73	0.32	0.06
N9	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.03	0.29	0.00	0.41	0.29	0.05
O2'	0.02	0.31	0.00	0.04	0.12	0.02	0.02	0.09	0.10	0.24	0.22	0.39	0.29	0.16	0.05	0.00	0.01	0.01	0.41	0.05	0.44	0.82	0.50
O3'	0.07	0.03	0.03	0.01	0.07	0.03	0.09	0.02	0.08	0.12	0.05	0.01	0.03	0.12	0.09	0.01	0.00	0.04	0.11	0.09	0.63	0.34	0.33
O4'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.16	0.00	0.10	0.02	0.14	0.08	0.21	0.29	0.25	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.11	0.38	0.05	0.10
O5'	0.25	0.37	0.41	0.29	0.34	0.01	0.33	0.00	0.34	0.26	0.36	0.38	0.35	0.28	0.29	0.41	0.11	0.10	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00
O6	0.03	0.02	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.11	0.33	0.00	0.71	0.25	0.03
OP1	0.15	0.30	0.28	0.54	0.40	0.01	0.59	0.07	0.60	0.64	0.46	0.19	0.24	0.73	0.41	0.44	0.63	0.38	0.01	0.71	0.00	0.05	0.01
OP2	0.27	0.20	0.69	0.53	0.26	0.01	0.28	0.03	0.25	0.34	0.21	0.17	0.21	0.32	0.29	0.82	0.34	0.05	0.00	0.25	0.05	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.42	0.42	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.07	0.17	0.14	0.06	0.05	0.50	0.33	0.10	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.75	1.17	0.70	0.14	1.45	0.17	1.33	0.33	1.10	1.02	1.36	1.59	1.07	0.82	0.79	0.37	0.09	0.05	0.26	0.06
C2	1.66	1.95	1.82	0.96	1.72	0.71	1.46	0.34	1.46	1.71	1.95	1.69	2.10	2.28	0.54	1.13	0.58	0.10	0.26	0.28
C2'	0.83	1.37	0.72	0.12	1.81	0.14	1.72	0.30	1.39	1.22	1.64	2.00	1.21	0.70	0.80	0.46	0.19	0.13	0.02	0.15
C3'	0.19	0.86	0.02	0.85	1.53	0.80	1.43	0.85	0.96	0.68	1.25	1.87	0.63	0.11	1.62	0.13	0.27	0.07	0.19	0.13
C4	1.39	1.59	1.56	0.73	1.44	0.53	1.26	0.23	1.27	1.44	1.59	1.39	1.67	1.89	0.26	0.92	0.49	0.12	0.26	0.25
C4'	0.43	0.12	0.61	1.41	0.73	1.31	0.66	1.27	0.25	0.02	0.47	1.05	0.09	0.62	2.19	0.70	0.72	0.31	0.58	0.44
C5	1.60	1.60	1.90	1.14	1.21	0.87	1.05	0.52	1.21	1.50	1.46	1.05	1.77	2.30	0.77	1.13	0.68	0.16	0.25	0.35
C5'	1.32	0.80	1.49	2.24	0.12	2.11	0.16	1.96	0.58	0.91	0.43	0.23	1.04	1.53	3.02	1.54	1.37	0.66	0.92	0.89
C6	1.83	1.81	2.18	1.44	1.27	1.10	1.07	0.68	1.28	1.66	1.61	1.06	2.06	2.70	1.17	1.32	0.78	0.15	0.24	0.38
C8	1.12	1.13	1.34	0.62	0.93	0.47	0.87	0.24	0.96	1.09	1.06	0.83	1.18	1.54	0.16	0.76	0.47	0.18	0.26	0.27
N1	1.84	1.97	2.11	1.30	1.53	0.98	1.29	0.56	1.42	1.76	1.85	1.40	2.20	2.64	0.98	1.30	0.71	0.13	0.25	0.34
N2	1.69	2.08	1.81	0.92	1.90	0.68	1.59	0.30	1.54	1.79	2.12	1.91	2.23	2.28	0.50	1.14	0.56	0.09	0.26	0.26
N3	1.43	1.77	1.53	0.66	1.69	0.47	1.46	0.15	1.39	1.55	1.83	1.71	1.84	1.89	0.16	0.93	0.46	0.09	0.26	0.23
N7	1.45	1.32	1.80	1.13	0.88	0.87	0.79	0.57	1.01	1.28	1.13	0.68	1.47	2.11	0.76	1.05	0.69	0.19	0.24	0.37
N9	1.08	1.31	1.20	0.38	1.30	0.26	1.18	0.03	1.13	1.20	1.35	1.29	1.31	1.40	0.16	0.68	0.34	0.11	0.27	0.19
O2'	1.68	2.32	1.51	0.61	2.77	0.57	2.64	0.30	2.28	2.12	2.61	2.92	2.15	1.47	0.04	1.24	0.77	0.42	0.34	0.52
O3'	0.53	1.37	0.23	0.63	2.16	0.58	1.96	0.66	1.40	1.12	1.85	2.59	1.11	0.15	1.43	0.17	0.06	0.04	0.08	0.01
O4'	0.07	0.29	0.14	0.93	0.66	0.88	0.60	0.90	0.34	0.19	0.51	0.85	0.17	0.04	1.61	0.36	0.47	0.19	0.56	0.28
O5'	1.28	0.91	1.55	2.15	0.18	1.84	0.08	1.47	0.46	0.90	0.57	0.12	1.21	1.68	3.05	1.33	0.89	0.08	0.25	0.23
O6	1.97	1.81	2.41	1.75	1.09	1.34	0.91	0.88	1.22	1.68	1.51	0.80	2.14	2.99	1.58	1.47	0.88	0.16	0.22	0.43
OP1	2.12	1.86	2.38	2.98	1.14	2.48	1.04	2.10	1.44	1.85	1.53	0.77	2.09	2.35	3.51	2.04	1.81	0.63	1.25	1.16
OP2	1.66	1.66	2.06	2.31	0.89	1.68	0.56	1.02	0.84	1.41	1.39	0.64	2.04	2.23	3.09	1.36	0.60	0.67	0.27	0.24
P	2.00	1.73	2.33	2.85	0.93	2.33	0.76	1.80	1.15	1.66	1.38	0.59	2.05	2.43	3.65	1.89	1.32	0.08	0.52	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.23	0.00	0.13	0.30	0.03	0.13
C2	0.01	0.00	0.12	0.23	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.05	0.06	0.06	0.35	0.49	0.07
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.15	0.06	0.02	0.10	0.05	0.19	0.01	0.04	0.00	0.37	0.47	0.26	0.44
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.35	0.00	0.33	0.03	0.27	0.21	0.30	0.37	0.16	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.12	0.13
C4	0.02	0.00	0.04	0.35	0.00	0.11	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.18	0.04	0.22	0.37	0.87	0.27
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.08	0.12	0.01	0.24	0.00	0.00	0.01	0.14	0.21	0.02
C5	0.02	0.00	0.03	0.33	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.22	0.01	0.25	0.37	0.86	0.30
C5'	0.06	0.03	0.15	0.03	0.10	0.00	0.12	0.00	0.09	0.03	0.07	0.12	0.01	0.08	0.16	0.01	0.00	0.26	0.37	0.00
C6	0.02	0.00	0.06	0.27	0.01	0.12	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.14	0.01	0.16	0.36	0.58	0.17
N1	0.01	0.00	0.02	0.21	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.02	0.02	0.04	0.34	0.38	0.04
N3	0.02	0.00	0.10	0.30	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.07	0.06	0.14	0.36	0.71	0.18
N4	0.02	0.00	0.05	0.37	0.01	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.22	0.05	0.25	0.37	1.01	0.34
O2	0.00	0.01	0.19	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.19	0.07	0.00	0.33	0.36	0.00
O2'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.24	0.24	0.22	0.08	0.18	0.15	0.22	0.26	0.12	0.00	0.08	0.18	0.27	0.39	0.24	0.38
O3'	0.23	0.05	0.04	0.01	0.18	0.00	0.22	0.16	0.14	0.02	0.07	0.22	0.19	0.08	0.00	0.14	0.12	0.45	0.05	0.12
O4'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.07	0.18	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02
O5'	0.13	0.06	0.37	0.08	0.22	0.01	0.25	0.00	0.16	0.04	0.14	0.25	0.00	0.27	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.30	0.35	0.47	0.05	0.37	0.14	0.37	0.26	0.36	0.34	0.36	0.37	0.33	0.39	0.45	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.49	0.26	0.12	0.87	0.21	0.86	0.37	0.58	0.38	0.71	1.01	0.36	0.24	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.13	0.07	0.44	0.13	0.27	0.02	0.30	0.00	0.17	0.04	0.18	0.34	0.00	0.38	0.12	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00