Doublet Group distance statistics: 49925

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 8, 20, 17, 7, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.011, 0.017, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.014, 0.022, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.019, 0.027, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.022, 0.035, 0.047, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.035 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.017, 0.030, 0.044, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.030 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.024, 0.038, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.038 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.024, 0.038, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.038 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.030, 0.048, 0.066, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.048 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.036, 0.056, 0.077, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.056 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.036, 0.059, 0.082, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.059 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.032, 0.065, 0.097, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.065 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.049, 0.089, 0.129, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.089 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.385, 0.458, 0.532, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.458 std_dev=0.073
C4'	A	0, 0.518, 0.626, 0.735, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.626 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.651, 0.761, 0.871, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.761 std_dev=0.110
OP2	B	0, 0.389, 0.516, 0.642, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.516 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.643, 0.789, 0.935, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.789 std_dev=0.146
OP1	B	0, 0.629, 0.797, 0.965, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.797 std_dev=0.168
P	B	0, 0.529, 0.700, 0.872, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.700 std_dev=0.172
C5'	A	0, 0.410, 0.589, 0.767, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.589 std_dev=0.178
O5'	A	0, 0.388, 0.568, 0.747, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.568 std_dev=0.180
O3'	A	0, 1.596, 1.854, 2.113, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.854 std_dev=0.258
O2'	A	0, 1.644, 1.918, 2.193, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.918 std_dev=0.274
OP1	A	0, 0.242, 0.538, 0.833, 2.415 max_d=2.415 avg_d=0.538 std_dev=0.296
P	A	0, 0.237, 0.542, 0.848, 2.513 max_d=2.513 avg_d=0.542 std_dev=0.305
OP2	A	0, 0.264, 0.625, 0.987, 2.992 max_d=2.992 avg_d=0.625 std_dev=0.362
O5'	B	0, 0.340, 0.787, 1.233, 3.913 max_d=3.913 avg_d=0.787 std_dev=0.447
C5'	B	0, 0.348, 0.876, 1.405, 4.608 max_d=4.608 avg_d=0.876 std_dev=0.528
C4'	B	0, 0.058, 0.943, 1.827, 7.387 max_d=7.387 avg_d=0.943 std_dev=0.885
O4'	B	0, 0.028, 0.982, 1.936, 7.943 max_d=7.943 avg_d=0.982 std_dev=0.954
C3'	B	0, -0.256, 0.883, 2.021, 9.246 max_d=9.246 avg_d=0.883 std_dev=1.139
C8	B	0, -0.410, 0.876, 2.161, 10.338 max_d=10.338 avg_d=0.876 std_dev=1.285
O3'	B	0, -0.360, 0.935, 2.229, 10.443 max_d=10.443 avg_d=0.935 std_dev=1.294
C1'	B	0, -0.302, 1.001, 2.304, 10.583 max_d=10.583 avg_d=1.001 std_dev=1.303
N9	B	0, -0.421, 0.965, 2.352, 11.174 max_d=11.174 avg_d=0.965 std_dev=1.386
C2'	B	0, -0.483, 0.955, 2.394, 11.553 max_d=11.553 avg_d=0.955 std_dev=1.439
N7	B	0, -0.643, 0.864, 2.371, 11.971 max_d=11.971 avg_d=0.864 std_dev=1.507
C4	B	0, -0.645, 1.012, 2.669, 13.231 max_d=13.231 avg_d=1.012 std_dev=1.657
O2'	B	0, -0.670, 1.028, 2.727, 13.549 max_d=13.549 avg_d=1.028 std_dev=1.699
C5	B	0, -0.791, 0.948, 2.686, 13.776 max_d=13.776 avg_d=0.948 std_dev=1.738
N3	B	0, -0.717, 1.124, 2.965, 14.701 max_d=14.701 avg_d=1.124 std_dev=1.841
C6	B	0, -1.046, 1.004, 3.054, 16.143 max_d=16.143 avg_d=1.004 std_dev=2.050
C2	B	0, -0.940, 1.161, 3.263, 16.676 max_d=16.676 avg_d=1.161 std_dev=2.102
N6	B	0, -1.231, 0.978, 3.186, 17.300 max_d=17.300 avg_d=0.978 std_dev=2.208
N1	B	0, -1.106, 1.115, 3.336, 17.523 max_d=17.523 avg_d=1.115 std_dev=2.221

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.12	0.01	0.14	0.17	0.16
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08	0.07
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.06	0.03	0.02	0.15	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.02	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.02	0.09	0.01	0.09	0.12	0.10
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.10	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.03	0.02	0.09	0.01	0.10	0.15	0.11
C5'	0.02	0.08	0.06	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.07	0.10	0.08	0.06	0.08	0.05	0.04	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.04	0.03	0.12	0.00	0.12	0.19	0.15
C8	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.02	0.07	0.01	0.11	0.08	0.07
N1	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.12	0.01	0.14	0.19	0.17
N2	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.04	0.12	0.01	0.17	0.17	0.18
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.10	0.01	0.12	0.13	0.13
N7	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.13	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.07	0.06
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.09	0.10	0.12	0.04	0.13	0.11	0.12	0.09	0.07	0.13	0.08	0.00	0.03	0.08	0.09	0.15	0.10	0.07	0.06
O3'	0.10	0.16	0.01	0.00	0.08	0.02	0.03	0.06	0.04	0.11	0.10	0.22	0.16	0.10	0.03	0.03	0.00	0.07	0.04	0.04	0.05	0.10	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04
O5'	0.04	0.12	0.05	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.12	0.07	0.12	0.12	0.10	0.08	0.06	0.09	0.04	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.04	0.03	0.13	0.00	0.14	0.21	0.16
OP1	0.05	0.14	0.06	0.02	0.09	0.02	0.10	0.01	0.12	0.11	0.14	0.17	0.12	0.11	0.07	0.10	0.05	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.17	0.08	0.05	0.12	0.03	0.15	0.03	0.19	0.08	0.19	0.17	0.13	0.13	0.07	0.07	0.10	0.04	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.16	0.07	0.02	0.10	0.01	0.11	0.01	0.15	0.07	0.17	0.18	0.13	0.09	0.06	0.06	0.05	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.10	0.56	0.55	0.12	0.40	0.10	0.29	0.17	0.10	0.12	0.16	0.30	0.12	0.20	0.64	0.72	0.30	0.22	0.10	0.08	0.12
C2	0.26	0.26	0.49	0.51	0.16	0.38	0.35	0.28	0.50	0.13	0.44	0.12	0.70	0.35	0.08	0.64	0.76	0.23	0.16	0.09	0.07	0.09
C2'	0.43	0.19	0.62	0.62	0.21	0.45	0.10	0.33	0.10	0.17	0.11	0.26	0.18	0.08	0.28	0.67	0.76	0.35	0.27	0.10	0.09	0.14
C3'	0.42	0.26	0.54	0.53	0.27	0.41	0.18	0.32	0.15	0.23	0.19	0.31	0.12	0.14	0.32	0.56	0.61	0.36	0.32	0.09	0.19	0.25
C4	0.21	0.28	0.43	0.47	0.19	0.35	0.38	0.27	0.51	0.18	0.44	0.14	0.70	0.40	0.08	0.56	0.71	0.19	0.14	0.08	0.06	0.09
C4'	0.30	0.16	0.41	0.37	0.18	0.26	0.11	0.19	0.09	0.17	0.11	0.20	0.11	0.10	0.23	0.43	0.43	0.25	0.20	0.07	0.09	0.15
C5	0.10	0.48	0.30	0.38	0.37	0.29	0.59	0.24	0.75	0.35	0.67	0.32	0.96	0.60	0.21	0.43	0.65	0.12	0.10	0.08	0.06	0.08
C5'	0.07	0.14	0.09	0.06	0.13	0.06	0.17	0.09	0.20	0.13	0.18	0.12	0.25	0.18	0.10	0.10	0.10	0.08	0.08	0.16	0.15	0.07
C6	0.09	0.56	0.28	0.37	0.42	0.29	0.66	0.24	0.84	0.38	0.77	0.38	1.07	0.65	0.25	0.43	0.65	0.11	0.09	0.08	0.06	0.08
C8	0.09	0.39	0.27	0.35	0.32	0.27	0.52	0.23	0.64	0.34	0.56	0.26	0.81	0.56	0.19	0.37	0.60	0.11	0.10	0.08	0.06	0.08
N1	0.16	0.44	0.38	0.44	0.30	0.34	0.53	0.26	0.70	0.27	0.64	0.26	0.92	0.52	0.14	0.54	0.71	0.16	0.12	0.08	0.06	0.08
N2	0.32	0.19	0.55	0.55	0.10	0.41	0.27	0.29	0.42	0.08	0.36	0.09	0.62	0.27	0.12	0.71	0.78	0.27	0.17	0.09	0.07	0.10
N3	0.30	0.17	0.52	0.54	0.10	0.39	0.26	0.29	0.39	0.09	0.33	0.08	0.57	0.27	0.11	0.66	0.76	0.26	0.18	0.09	0.07	0.10
N7	0.08	0.56	0.19	0.30	0.46	0.24	0.69	0.22	0.84	0.46	0.76	0.41	1.04	0.71	0.31	0.31	0.57	0.08	0.07	0.08	0.06	0.07
N9	0.22	0.21	0.42	0.47	0.14	0.35	0.32	0.27	0.43	0.15	0.36	0.10	0.59	0.35	0.07	0.53	0.69	0.20	0.15	0.08	0.07	0.09
O2'	0.60	0.36	0.81	0.77	0.40	0.55	0.28	0.39	0.22	0.38	0.27	0.44	0.16	0.24	0.48	0.86	0.87	0.47	0.36	0.12	0.11	0.17
O3'	0.70	0.57	0.79	0.76	0.59	0.66	0.49	0.58	0.45	0.54	0.50	0.62	0.36	0.45	0.63	0.78	0.78	0.64	0.63	0.36	0.39	0.54
O4'	0.27	0.09	0.42	0.39	0.10	0.27	0.11	0.19	0.17	0.09	0.14	0.12	0.27	0.12	0.15	0.48	0.51	0.22	0.16	0.10	0.10	0.10
O5'	0.08	0.21	0.05	0.06	0.17	0.10	0.22	0.13	0.26	0.15	0.25	0.17	0.30	0.21	0.12	0.05	0.05	0.10	0.12	0.18	0.18	0.09
O6	0.10	0.72	0.19	0.31	0.56	0.24	0.81	0.22	1.02	0.50	0.95	0.52	1.27	0.79	0.36	0.34	0.60	0.09	0.08	0.08	0.07	0.07
OP1	0.31	0.47	0.30	0.32	0.40	0.32	0.42	0.30	0.47	0.33	0.49	0.43	0.49	0.38	0.35	0.29	0.31	0.30	0.27	0.24	0.26	0.16
OP2	0.36	0.40	0.38	0.42	0.38	0.40	0.37	0.38	0.38	0.34	0.39	0.39	0.37	0.35	0.36	0.40	0.45	0.35	0.31	0.26	0.21	0.18
P	0.33	0.45	0.31	0.33	0.41	0.33	0.43	0.32	0.47	0.37	0.47	0.42	0.49	0.41	0.36	0.30	0.31	0.32	0.29	0.27	0.26	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.04
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.10	0.06	0.13	0.23	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.06	0.06	0.09	0.24	0.09
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.05	0.07	0.03	0.07	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.09	0.08	0.36	0.14
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.11	0.06	0.08	0.06	0.10	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.05	0.08	0.10	0.38	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.05	0.14	0.07	0.35	0.16
N1	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.09	0.06	0.12	0.31	0.10
N3	0.03	0.01	0.08	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.10	0.06	0.12	0.18	0.06
N6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.11	0.09	0.46	0.17
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.14	0.07	0.44	0.19
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.06	0.21	0.09
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.06	0.10	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.06	0.08	0.07	0.09	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.07	0.10	0.25	0.13
O4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.09	0.10	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.04
O5'	0.04	0.06	0.04	0.05	0.06	0.01	0.09	0.01	0.08	0.14	0.06	0.06	0.11	0.14	0.07	0.03	0.07	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.05	0.13	0.05	0.06	0.09	0.05	0.08	0.07	0.10	0.07	0.12	0.12	0.09	0.07	0.06	0.06	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.23	0.08	0.13	0.24	0.11	0.36	0.13	0.38	0.35	0.31	0.18	0.46	0.44	0.21	0.10	0.25	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.07	0.07	0.08	0.09	0.02	0.14	0.01	0.14	0.16	0.10	0.06	0.17	0.19	0.09	0.06	0.13	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00