Doublet Group distance statistics: 49927

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 5, 4, 0, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.009, 0.028, 0.047, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.017, 0.037, 0.058, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.017, 0.041, 0.064, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.041 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.029, 0.053, 0.078, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.053 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.023, 0.047, 0.071, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.023, 0.051, 0.079, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.051 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.028, 0.060, 0.092, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.060 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.033, 0.066, 0.098, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.066 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.030, 0.069, 0.108, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.069 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.064, 0.137, 0.211, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.137 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.021, 0.130, 0.239, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.130 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.054, 0.171, 0.287, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.171 std_dev=0.117
O3'	A	0, 0.146, 0.288, 0.430, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.288 std_dev=0.142
N7	B	0, 0.219, 0.405, 0.590, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.405 std_dev=0.185
O2'	A	0, 0.035, 0.223, 0.410, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.223 std_dev=0.187
C4'	A	0, -0.007, 0.184, 0.375, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.184 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.195, 0.393, 0.591, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.393 std_dev=0.198
C6	B	0, 0.234, 0.437, 0.639, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.437 std_dev=0.203
C8	B	0, 0.232, 0.436, 0.639, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.436 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.203, 0.423, 0.643, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.423 std_dev=0.220
N1	B	0, 0.308, 0.533, 0.757, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.533 std_dev=0.225
N6	B	0, 0.213, 0.440, 0.667, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.440 std_dev=0.227
N9	B	0, 0.192, 0.424, 0.657, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.424 std_dev=0.233
C2	B	0, 0.317, 0.554, 0.791, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.554 std_dev=0.237
C2'	B	0, 0.193, 0.436, 0.678, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.436 std_dev=0.242
N3	B	0, 0.259, 0.502, 0.746, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.502 std_dev=0.244
OP2	B	0, 0.168, 0.417, 0.666, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.417 std_dev=0.249
O5'	B	0, 0.208, 0.462, 0.715, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.462 std_dev=0.254
O5'	A	0, 0.167, 0.421, 0.675, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.421 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.170, 0.426, 0.682, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.426 std_dev=0.256
P	B	0, 0.208, 0.470, 0.732, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.470 std_dev=0.262
C3'	B	0, 0.184, 0.448, 0.712, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.448 std_dev=0.264
P	A	0, 0.175, 0.449, 0.723, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.449 std_dev=0.274
O3'	B	0, 0.225, 0.516, 0.808, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.516 std_dev=0.291
O4'	B	0, 0.172, 0.464, 0.756, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.464 std_dev=0.292
OP1	B	0, 0.253, 0.546, 0.840, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.546 std_dev=0.293
C4'	B	0, 0.173, 0.473, 0.772, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.473 std_dev=0.300
OP1	A	0, 0.174, 0.502, 0.830, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.502 std_dev=0.328
O2'	B	0, 0.214, 0.545, 0.876, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.545 std_dev=0.331
OP2	A	0, 0.171, 0.512, 0.853, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.512 std_dev=0.341
C5'	B	0, 0.216, 0.566, 0.917, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.566 std_dev=0.350
C5'	A	0, -0.079, 0.361, 0.802, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.361 std_dev=0.440

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.07	0.04	0.02	0.04	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.14	0.05	0.11	0.16	0.10
C2	0.06	0.00	0.07	0.06	0.02	0.07	0.02	0.13	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.05	0.08	0.20	0.03	0.21	0.17	0.17
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.09	0.04	0.07	0.05	0.09	0.08	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.12	0.05	0.08	0.22	0.13
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.07	0.06	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.13	0.06	0.09	0.19	0.13
C4	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.06	0.18	0.03	0.17	0.17	0.15
C4'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.10	0.07	0.10	0.05	0.10	0.03	0.01	0.03	0.10	0.08	0.07	0.05
C5	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.08	0.00	0.27	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.06	0.20	0.03	0.20	0.20	0.19
C5'	0.07	0.13	0.09	0.03	0.19	0.01	0.27	0.00	0.27	0.31	0.20	0.11	0.12	0.33	0.20	0.07	0.10	0.02	0.01	0.31	0.17	0.10	0.01
C6	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.08	0.01	0.27	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.04	0.07	0.22	0.01	0.24	0.22	0.22
C8	0.02	0.03	0.07	0.05	0.01	0.10	0.02	0.31	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.05	0.04	0.17	0.05	0.15	0.20	0.14
N1	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.20	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.10	0.05	0.07	0.21	0.03	0.23	0.20	0.20
N2	0.07	0.01	0.09	0.07	0.02	0.10	0.02	0.11	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.17	0.07	0.09	0.20	0.04	0.22	0.18	0.18
N3	0.06	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.02	0.12	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.05	0.08	0.18	0.03	0.18	0.16	0.14
N7	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.10	0.01	0.33	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.10	0.05	0.04	0.20	0.04	0.18	0.21	0.18
N9	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.20	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.02	0.17	0.04	0.13	0.17	0.12
O2'	0.02	0.13	0.01	0.03	0.06	0.10	0.06	0.07	0.06	0.12	0.10	0.17	0.12	0.10	0.05	0.00	0.08	0.04	0.12	0.07	0.10	0.22	0.12
O3'	0.06	0.05	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.10	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.00	0.06	0.15	0.05	0.09	0.17	0.12
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.07	0.09	0.08	0.04	0.02	0.04	0.06	0.00	0.18	0.08	0.14	0.16	0.12
O5'	0.14	0.20	0.12	0.13	0.18	0.03	0.20	0.01	0.22	0.17	0.21	0.20	0.18	0.20	0.17	0.12	0.15	0.18	0.00	0.24	0.02	0.03	0.01
O6	0.05	0.03	0.05	0.06	0.03	0.10	0.03	0.31	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.08	0.24	0.00	0.27	0.26	0.25
OP1	0.11	0.21	0.08	0.09	0.17	0.08	0.20	0.17	0.24	0.15	0.23	0.22	0.18	0.18	0.13	0.10	0.09	0.14	0.02	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.17	0.22	0.19	0.17	0.07	0.20	0.10	0.22	0.20	0.20	0.18	0.16	0.21	0.17	0.22	0.17	0.16	0.03	0.26	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.13	0.13	0.15	0.05	0.19	0.01	0.22	0.14	0.20	0.18	0.14	0.18	0.12	0.12	0.12	0.12	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.25	0.12	0.11	0.17	0.08	0.16	0.09	0.18	0.12	0.23	0.23	0.16	0.15	0.10	0.12	0.12	0.09	0.09	0.12	0.12	0.10
C2	0.21	0.24	0.22	0.18	0.20	0.19	0.19	0.18	0.15	0.24	0.19	0.23	0.19	0.25	0.22	0.25	0.20	0.21	0.18	0.21	0.20	0.19
C2'	0.15	0.25	0.16	0.16	0.21	0.13	0.19	0.15	0.21	0.13	0.24	0.25	0.20	0.17	0.16	0.15	0.15	0.13	0.14	0.11	0.12	0.11
C3'	0.18	0.26	0.16	0.15	0.22	0.15	0.20	0.14	0.21	0.16	0.24	0.26	0.21	0.18	0.18	0.17	0.14	0.19	0.15	0.14	0.15	0.13
C4	0.14	0.25	0.16	0.14	0.12	0.15	0.11	0.16	0.10	0.21	0.22	0.20	0.11	0.21	0.14	0.18	0.16	0.16	0.17	0.21	0.20	0.20
C4'	0.16	0.26	0.16	0.16	0.20	0.17	0.17	0.18	0.19	0.13	0.23	0.26	0.22	0.17	0.15	0.17	0.15	0.19	0.19	0.22	0.21	0.20
C5	0.15	0.26	0.17	0.16	0.07	0.17	0.10	0.19	0.10	0.23	0.21	0.18	0.14	0.22	0.15	0.20	0.18	0.18	0.19	0.24	0.23	0.22
C5'	0.36	0.42	0.37	0.38	0.35	0.41	0.24	0.43	0.23	0.19	0.33	0.44	0.19	0.15	0.31	0.37	0.36	0.40	0.43	0.43	0.41	0.41
C6	0.21	0.21	0.23	0.20	0.13	0.21	0.16	0.21	0.14	0.26	0.18	0.14	0.19	0.25	0.22	0.27	0.22	0.22	0.20	0.25	0.23	0.23
C8	0.07	0.31	0.12	0.11	0.18	0.11	0.13	0.15	0.17	0.17	0.26	0.28	0.13	0.18	0.08	0.13	0.14	0.12	0.16	0.23	0.23	0.21
N1	0.23	0.19	0.24	0.20	0.19	0.21	0.19	0.20	0.16	0.26	0.15	0.19	0.21	0.25	0.24	0.28	0.22	0.23	0.19	0.23	0.21	0.21
N2	0.23	0.27	0.23	0.18	0.22	0.19	0.21	0.18	0.20	0.24	0.23	0.26	0.22	0.24	0.24	0.27	0.21	0.22	0.17	0.21	0.19	0.19
N3	0.18	0.26	0.18	0.15	0.17	0.16	0.17	0.16	0.15	0.22	0.23	0.22	0.14	0.23	0.19	0.21	0.17	0.18	0.17	0.20	0.19	0.19
N7	0.08	0.31	0.13	0.13	0.11	0.15	0.10	0.20	0.14	0.21	0.25	0.26	0.13	0.20	0.09	0.16	0.16	0.15	0.20	0.26	0.24	0.24
N9	0.08	0.28	0.11	0.11	0.15	0.11	0.12	0.13	0.16	0.16	0.25	0.24	0.13	0.18	0.08	0.12	0.14	0.12	0.14	0.19	0.19	0.18
O2'	0.22	0.25	0.24	0.25	0.24	0.25	0.23	0.29	0.24	0.20	0.25	0.26	0.25	0.19	0.23	0.23	0.23	0.20	0.26	0.20	0.18	0.22
O3'	0.17	0.26	0.16	0.16	0.23	0.14	0.22	0.14	0.25	0.17	0.27	0.25	0.26	0.20	0.19	0.17	0.15	0.17	0.13	0.15	0.16	0.12
O4'	0.10	0.25	0.13	0.14	0.16	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.23	0.23	0.16	0.16	0.10	0.14	0.16	0.11	0.13	0.17	0.14	0.13
O5'	0.16	0.30	0.17	0.17	0.22	0.18	0.22	0.20	0.24	0.19	0.27	0.28	0.27	0.23	0.17	0.17	0.15	0.18	0.21	0.24	0.20	0.20
O6	0.23	0.22	0.25	0.23	0.14	0.22	0.18	0.24	0.18	0.27	0.21	0.13	0.22	0.25	0.23	0.31	0.26	0.23	0.21	0.27	0.24	0.24
OP1	0.15	0.34	0.18	0.17	0.24	0.17	0.22	0.20	0.26	0.18	0.31	0.31	0.26	0.21	0.17	0.18	0.16	0.16	0.20	0.22	0.20	0.19
OP2	0.18	0.29	0.25	0.25	0.23	0.22	0.24	0.23	0.24	0.26	0.26	0.28	0.27	0.29	0.20	0.26	0.24	0.15	0.24	0.24	0.25	0.23
P	0.15	0.31	0.18	0.18	0.22	0.18	0.20	0.21	0.23	0.18	0.28	0.29	0.24	0.22	0.16	0.19	0.17	0.15	0.21	0.23	0.20	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.08	0.12	0.08
C2	0.04	0.00	0.13	0.19	0.02	0.10	0.02	0.12	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.12	0.22	0.04	0.16	0.19	0.19	0.16
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.11	0.14	0.06	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.11	0.06
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.09	0.13	0.14	0.19	0.09	0.11	0.05	0.03	0.01	0.02	0.08	0.11	0.12	0.09
C4	0.02	0.02	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.11	0.11	0.14	0.10
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07	0.11	0.06	0.10	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.08	0.03	0.11	0.10	0.13	0.09
C5'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.07	0.17	0.09	0.12	0.09	0.16	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.08	0.04	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.09	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.11	0.04	0.10	0.10	0.13	0.09
C8	0.03	0.03	0.06	0.13	0.01	0.12	0.01	0.17	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.13	0.07	0.18	0.17	0.19	0.16
N1	0.04	0.01	0.11	0.14	0.02	0.07	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.11	0.18	0.04	0.12	0.14	0.15	0.12
N3	0.04	0.01	0.14	0.19	0.01	0.11	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.11	0.21	0.05	0.16	0.18	0.19	0.16
N6	0.04	0.03	0.06	0.09	0.02	0.06	0.02	0.09	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.08	0.11	0.05	0.12	0.12	0.14	0.11
N7	0.03	0.02	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.11	0.06	0.17	0.17	0.20	0.17
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.09	0.09	0.12	0.08
O2'	0.03	0.12	0.01	0.03	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.11	0.11	0.08	0.04	0.04	0.00	0.11	0.05	0.05	0.10	0.09	0.05
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.10	0.02	0.08	0.04	0.11	0.13	0.18	0.21	0.11	0.11	0.04	0.11	0.00	0.02	0.13	0.17	0.16	0.14
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.12	0.11	0.14	0.12
O5'	0.07	0.16	0.05	0.08	0.11	0.02	0.11	0.01	0.10	0.18	0.12	0.16	0.12	0.17	0.09	0.05	0.13	0.12	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.08	0.19	0.09	0.11	0.11	0.07	0.10	0.08	0.10	0.17	0.14	0.18	0.12	0.17	0.09	0.10	0.17	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.19	0.11	0.12	0.14	0.06	0.13	0.04	0.13	0.19	0.15	0.19	0.14	0.20	0.12	0.09	0.16	0.14	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.08	0.16	0.06	0.09	0.10	0.03	0.09	0.02	0.09	0.16	0.12	0.16	0.11	0.17	0.08	0.05	0.14	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00