Doublet Group distance statistics: 49928

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 5, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.009, 0.016, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.015, 0.023, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.023, 0.041, 0.059, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.041 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.022, 0.040, 0.059, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.023, 0.044, 0.064, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.016, 0.042, 0.069, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.042 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.050, 0.079, 0.107, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.079 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.036, 0.072, 0.109, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.072 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.037, 0.079, 0.121, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.079 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.040, 0.115, 0.189, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.115 std_dev=0.074
C2'	A	0, 0.058, 0.162, 0.266, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.162 std_dev=0.104
C4'	A	0, 0.072, 0.180, 0.288, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.180 std_dev=0.108
C3'	A	0, 0.097, 0.233, 0.370, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.233 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.080, 0.219, 0.359, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.219 std_dev=0.139
C5'	A	0, 0.105, 0.293, 0.482, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.293 std_dev=0.188
O3'	A	0, 0.150, 0.356, 0.562, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.356 std_dev=0.206
O5'	A	0, 0.261, 0.489, 0.716, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.489 std_dev=0.227
P	B	0, 0.452, 0.692, 0.931, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.692 std_dev=0.240
OP2	B	0, 0.316, 0.575, 0.835, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.575 std_dev=0.259
C4'	B	0, 0.375, 0.700, 1.024, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.700 std_dev=0.325
P	A	0, 0.286, 0.635, 0.983, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.635 std_dev=0.348
OP1	B	0, 0.890, 1.288, 1.686, 1.656 max_d=1.656 avg_d=1.288 std_dev=0.398
O5'	B	0, 1.103, 1.512, 1.921, 1.925 max_d=1.925 avg_d=1.512 std_dev=0.409
C5'	B	0, 0.329, 0.777, 1.226, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.777 std_dev=0.449
OP2	A	0, 0.110, 0.617, 1.124, 2.322 max_d=2.322 avg_d=0.617 std_dev=0.507
O4'	B	0, 0.523, 1.072, 1.622, 2.225 max_d=2.225 avg_d=1.072 std_dev=0.549
C3'	B	0, 0.499, 1.052, 1.604, 2.047 max_d=2.047 avg_d=1.052 std_dev=0.553
O3'	B	0, 0.306, 0.918, 1.530, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.918 std_dev=0.612
OP1	A	0, 0.533, 1.261, 1.990, 2.384 max_d=2.384 avg_d=1.261 std_dev=0.729
C2'	B	0, 0.784, 1.636, 2.488, 2.953 max_d=2.953 avg_d=1.636 std_dev=0.852
C1'	B	0, 0.821, 1.698, 2.574, 3.626 max_d=3.626 avg_d=1.698 std_dev=0.876
N9	B	0, 1.287, 2.449, 3.611, 5.482 max_d=5.482 avg_d=2.449 std_dev=1.162
O2'	B	0, 0.898, 2.098, 3.298, 3.867 max_d=3.867 avg_d=2.098 std_dev=1.200
C4	B	0, 1.086, 2.388, 3.689, 6.920 max_d=6.920 avg_d=2.388 std_dev=1.302
C8	B	0, 2.784, 4.155, 5.526, 6.878 max_d=6.878 avg_d=4.155 std_dev=1.371
N7	B	0, 2.948, 4.580, 6.212, 8.484 max_d=8.484 avg_d=4.580 std_dev=1.632
C5	B	0, 1.567, 3.246, 4.924, 8.560 max_d=8.560 avg_d=3.246 std_dev=1.679
N3	B	0, 1.175, 2.871, 4.568, 7.520 max_d=7.520 avg_d=2.871 std_dev=1.696
C6	B	0, 1.549, 3.518, 5.486, 10.572 max_d=10.572 avg_d=3.518 std_dev=1.969
N1	B	0, 1.419, 3.671, 5.923, 11.203 max_d=11.203 avg_d=3.671 std_dev=2.252
N6	B	0, 2.104, 4.403, 6.701, 12.256 max_d=12.256 avg_d=4.403 std_dev=2.299
C2	B	0, 1.304, 3.632, 5.961, 9.845 max_d=9.845 avg_d=3.632 std_dev=2.328

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.54	0.35	0.23
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.12	0.03	0.13	0.02	0.58	0.34	0.23
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.11	0.08	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.42	0.41	0.14
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.08	0.08	0.13	0.10	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.28	0.38	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.17	0.02	0.56	0.33	0.23
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.05	0.32	0.35	0.12
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.22	0.02	0.56	0.29	0.23
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.08	0.09	0.08	0.07	0.10	0.06	0.04	0.04	0.02	0.01	0.10	0.21	0.21	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.04	0.21	0.01	0.57	0.29	0.22
C8	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.24	0.02	0.54	0.27	0.23
N1	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.04	0.17	0.02	0.57	0.31	0.22
N2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.12	0.17	0.04	0.11	0.03	0.60	0.36	0.24
N3	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.12	0.02	0.57	0.35	0.22
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04	0.26	0.02	0.55	0.26	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.17	0.03	0.54	0.32	0.23
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.04	0.06	0.04	0.08	0.04	0.08	0.12	0.08	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.09	0.09	0.45	0.47	0.18
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.03	0.07	0.04	0.08	0.08	0.09	0.17	0.12	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.18	0.10	0.19	0.45	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.12	0.04	0.52	0.33	0.25
O5'	0.09	0.13	0.03	0.07	0.17	0.02	0.22	0.01	0.21	0.24	0.17	0.11	0.12	0.26	0.17	0.09	0.18	0.12	0.00	0.23	0.03	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.07	0.09	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.09	0.10	0.04	0.23	0.00	0.56	0.27	0.21
OP1	0.54	0.58	0.42	0.28	0.56	0.32	0.56	0.21	0.57	0.54	0.57	0.60	0.57	0.55	0.54	0.45	0.19	0.52	0.03	0.56	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.34	0.41	0.38	0.33	0.35	0.29	0.21	0.29	0.27	0.31	0.36	0.35	0.26	0.32	0.47	0.45	0.33	0.02	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.23	0.14	0.08	0.23	0.12	0.23	0.02	0.22	0.23	0.22	0.24	0.22	0.23	0.23	0.18	0.18	0.25	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.68	0.09	0.11	0.26	0.25	0.23	0.14	0.39	0.31	0.61	0.52	0.37	0.22	0.16	0.06	0.06	0.30	0.33	0.21	0.17	0.16
C2	0.19	1.04	0.09	0.11	0.42	0.22	0.33	0.15	0.60	0.32	0.94	0.80	0.56	0.23	0.14	0.07	0.07	0.26	0.27	0.33	0.14	0.17
C2'	0.32	0.59	0.15	0.14	0.29	0.28	0.25	0.25	0.33	0.40	0.51	0.48	0.30	0.33	0.27	0.23	0.20	0.38	0.37	0.29	0.27	0.22
C3'	0.38	0.60	0.25	0.24	0.35	0.33	0.31	0.32	0.36	0.45	0.51	0.53	0.33	0.39	0.34	0.35	0.31	0.42	0.39	0.30	0.33	0.25
C4	0.18	1.01	0.09	0.11	0.40	0.22	0.32	0.14	0.57	0.31	0.90	0.79	0.53	0.22	0.12	0.08	0.09	0.25	0.26	0.30	0.14	0.16
C4'	0.29	0.46	0.10	0.12	0.20	0.29	0.18	0.22	0.24	0.35	0.39	0.36	0.23	0.27	0.23	0.17	0.15	0.37	0.34	0.17	0.24	0.15
C5	0.16	1.22	0.10	0.11	0.52	0.20	0.41	0.13	0.71	0.31	1.10	0.97	0.65	0.23	0.13	0.11	0.12	0.23	0.23	0.35	0.14	0.18
C5'	0.26	0.44	0.15	0.18	0.19	0.29	0.17	0.26	0.22	0.34	0.37	0.37	0.20	0.26	0.21	0.23	0.24	0.35	0.32	0.15	0.28	0.14
C6	0.17	1.34	0.10	0.11	0.58	0.20	0.46	0.14	0.79	0.32	1.21	1.06	0.73	0.25	0.17	0.12	0.13	0.24	0.22	0.39	0.15	0.20
C8	0.13	1.08	0.11	0.11	0.45	0.20	0.35	0.13	0.62	0.30	0.96	0.86	0.56	0.22	0.11	0.12	0.13	0.22	0.25	0.27	0.14	0.16
N1	0.18	1.23	0.10	0.11	0.52	0.20	0.41	0.15	0.72	0.32	1.12	0.96	0.67	0.24	0.15	0.10	0.11	0.25	0.24	0.38	0.16	0.19
N2	0.21	0.97	0.10	0.12	0.38	0.24	0.31	0.16	0.56	0.34	0.88	0.74	0.52	0.25	0.15	0.05	0.05	0.28	0.28	0.32	0.14	0.16
N3	0.20	0.92	0.09	0.11	0.36	0.23	0.29	0.15	0.52	0.32	0.83	0.71	0.49	0.23	0.14	0.06	0.06	0.27	0.28	0.29	0.14	0.16
N7	0.14	1.28	0.12	0.13	0.56	0.19	0.44	0.13	0.74	0.32	1.14	1.02	0.68	0.24	0.14	0.14	0.15	0.22	0.21	0.34	0.14	0.18
N9	0.18	0.90	0.09	0.10	0.36	0.23	0.28	0.14	0.51	0.31	0.81	0.71	0.47	0.21	0.12	0.08	0.09	0.26	0.28	0.25	0.15	0.16
O2'	0.35	0.47	0.14	0.13	0.26	0.29	0.25	0.20	0.29	0.40	0.41	0.38	0.28	0.34	0.30	0.25	0.19	0.41	0.34	0.26	0.26	0.19
O3'	0.53	0.68	0.43	0.39	0.51	0.40	0.49	0.39	0.51	0.58	0.60	0.63	0.49	0.55	0.51	0.58	0.49	0.51	0.41	0.34	0.38	0.29
O4'	0.24	0.67	0.12	0.13	0.29	0.27	0.26	0.13	0.41	0.29	0.61	0.52	0.39	0.22	0.18	0.08	0.09	0.31	0.34	0.17	0.17	0.16
O5'	0.34	0.38	0.13	0.19	0.27	0.40	0.26	0.29	0.28	0.37	0.34	0.33	0.27	0.32	0.30	0.09	0.02	0.46	0.36	0.29	0.45	0.28
O6	0.18	1.50	0.11	0.12	0.67	0.19	0.54	0.14	0.90	0.34	1.37	1.19	0.83	0.28	0.21	0.14	0.15	0.25	0.20	0.42	0.16	0.21
OP1	0.09	0.91	0.30	0.22	0.49	0.13	0.42	0.28	0.58	0.29	0.80	0.79	0.54	0.30	0.22	0.32	0.02	0.08	0.56	0.68	0.45	0.60
OP2	0.40	0.78	0.25	0.11	0.54	0.37	0.49	0.29	0.58	0.41	0.71	0.72	0.54	0.42	0.42	0.36	0.01	0.54	0.44	0.34	0.28	0.25
P	0.19	0.58	0.10	0.02	0.32	0.19	0.24	0.10	0.35	0.14	0.50	0.52	0.30	0.11	0.16	0.21	0.00	0.27	0.40	0.38	0.26	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.18	0.01	0.06	0.39	0.27	0.16
C2	0.04	0.00	0.45	0.42	0.01	0.41	0.01	0.65	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.79	0.39	0.46	0.99	1.69	1.26	1.36
C2'	0.00	0.45	0.00	0.01	0.22	0.02	0.08	0.15	0.18	0.26	0.34	0.45	0.11	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.48	0.15	0.28
C3'	0.02	0.42	0.01	0.00	0.21	0.00	0.12	0.01	0.21	0.14	0.34	0.41	0.17	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.34	0.49	0.19	0.32
C4	0.02	0.01	0.22	0.21	0.00	0.19	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.22	0.24	0.42	0.89	0.58	0.65
C4'	0.01	0.41	0.02	0.00	0.19	0.00	0.09	0.00	0.18	0.21	0.32	0.39	0.13	0.12	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.25	0.33	0.08
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.20	0.16	0.10	0.25	0.71	0.41	0.47
C5'	0.07	0.65	0.15	0.01	0.26	0.00	0.12	0.00	0.26	0.44	0.50	0.59	0.18	0.31	0.12	0.10	0.10	0.01	0.01	0.26	0.16	0.02
C6	0.03	0.00	0.18	0.21	0.01	0.18	0.01	0.26	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.36	0.22	0.20	0.44	0.98	0.68	0.73
C8	0.01	0.02	0.26	0.14	0.01	0.21	0.01	0.44	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.40	0.19	0.24	0.52	0.66	0.36	0.49
N1	0.04	0.00	0.34	0.34	0.01	0.32	0.01	0.50	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.62	0.32	0.35	0.78	1.44	1.07	1.14
N3	0.04	0.00	0.45	0.41	0.00	0.39	0.00	0.59	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.76	0.37	0.46	0.88	1.46	1.08	1.18
N6	0.03	0.01	0.11	0.17	0.01	0.13	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.27	0.18	0.14	0.35	0.84	0.57	0.62
N7	0.01	0.01	0.15	0.07	0.01	0.12	0.00	0.31	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.26	0.15	0.13	0.39	0.61	0.25	0.40
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.14	0.01	0.14	0.49	0.21	0.25
O2'	0.02	0.79	0.00	0.01	0.38	0.09	0.20	0.10	0.36	0.40	0.62	0.76	0.27	0.26	0.08	0.00	0.04	0.06	0.30	0.50	0.20	0.32
O3'	0.18	0.39	0.02	0.01	0.22	0.02	0.16	0.10	0.22	0.19	0.32	0.37	0.18	0.15	0.14	0.04	0.00	0.14	0.38	0.42	0.30	0.31
O4'	0.01	0.46	0.02	0.01	0.24	0.01	0.10	0.01	0.20	0.24	0.35	0.46	0.14	0.13	0.01	0.06	0.14	0.00	0.22	0.34	0.35	0.19
O5'	0.06	0.99	0.23	0.34	0.42	0.01	0.25	0.01	0.44	0.52	0.78	0.88	0.35	0.39	0.14	0.30	0.38	0.22	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.39	1.69	0.48	0.49	0.89	0.25	0.71	0.26	0.98	0.66	1.44	1.46	0.84	0.61	0.49	0.50	0.42	0.34	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	1.26	0.15	0.19	0.58	0.33	0.41	0.16	0.68	0.36	1.07	1.08	0.57	0.25	0.21	0.20	0.30	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	1.36	0.28	0.32	0.65	0.08	0.47	0.02	0.73	0.49	1.14	1.18	0.62	0.40	0.25	0.32	0.31	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00