Doublet Group distance statistics: 49931

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O4'	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.011, 0.029, 0.048, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.029 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.016, 0.039, 0.062, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.039 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.027, 0.056, 0.085, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.056 std_dev=0.029
C4'	A	0, 0.029, 0.059, 0.088, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.059 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.031, 0.065, 0.099, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.065 std_dev=0.034
C5'	A	0, 0.067, 0.121, 0.174, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.121 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.039, 0.098, 0.157, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.098 std_dev=0.059
C3'	A	0, 0.024, 0.086, 0.149, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.086 std_dev=0.062
C1'	B	0, 0.081, 0.144, 0.208, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.144 std_dev=0.064
O5'	A	0, 0.072, 0.142, 0.212, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.142 std_dev=0.070
N9	B	0, 0.061, 0.137, 0.213, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.137 std_dev=0.076
O4'	B	0, 0.088, 0.164, 0.240, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.164 std_dev=0.076
C4	B	0, 0.059, 0.141, 0.222, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.141 std_dev=0.082
C8	B	0, 0.080, 0.166, 0.252, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.166 std_dev=0.086
N1	B	0, 0.105, 0.194, 0.283, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.194 std_dev=0.089
O3'	A	0, 0.029, 0.119, 0.210, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.119 std_dev=0.091
N3	B	0, 0.104, 0.195, 0.286, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.195 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.078, 0.171, 0.263, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.171 std_dev=0.092
C4'	B	0, 0.122, 0.216, 0.309, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.216 std_dev=0.094
C6	B	0, 0.046, 0.143, 0.239, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.143 std_dev=0.096
N7	B	0, 0.064, 0.161, 0.258, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.161 std_dev=0.097
C5	B	0, 0.024, 0.123, 0.222, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.123 std_dev=0.099
C2	B	0, 0.119, 0.218, 0.318, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.218 std_dev=0.100
C2'	B	0, 0.108, 0.209, 0.309, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.209 std_dev=0.101
P	A	0, 0.088, 0.191, 0.293, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.191 std_dev=0.103
N6	B	0, 0.065, 0.171, 0.277, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.171 std_dev=0.106
OP1	B	0, 0.167, 0.286, 0.406, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.286 std_dev=0.120
O2'	B	0, 0.136, 0.256, 0.377, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.256 std_dev=0.121
P	B	0, 0.142, 0.266, 0.389, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.266 std_dev=0.123
C3'	B	0, 0.130, 0.255, 0.380, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.255 std_dev=0.125
O5'	B	0, 0.140, 0.266, 0.391, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.266 std_dev=0.125
C5'	B	0, 0.133, 0.262, 0.391, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.262 std_dev=0.129
OP2	B	0, 0.124, 0.262, 0.401, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.262 std_dev=0.139
OP2	A	0, 0.079, 0.221, 0.362, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.221 std_dev=0.142
OP1	A	0, 0.099, 0.251, 0.403, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.251 std_dev=0.152
O3'	B	0, 0.176, 0.337, 0.497, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.337 std_dev=0.161

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01
C2	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.03	0.04
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.03	0.04
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.09	0.05	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.10	0.06	0.08
C8	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.09	0.06	0.07
N1	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.00	0.09	0.04	0.06
N2	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.06	0.03	0.03
N3	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.03
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.11	0.08	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.04
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.07	0.10	0.05
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01
O5'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.04	0.02	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.07	0.00	0.12	0.08	0.09
OP1	0.04	0.07	0.04	0.04	0.07	0.04	0.09	0.03	0.10	0.09	0.09	0.06	0.06	0.11	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.08	0.03	0.10	0.07	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.07	0.06	0.03	0.03	0.09	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.07	0.03	0.03	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.07	0.03	0.07	0.05	0.09	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.03
C2	0.04	0.07	0.04	0.04	0.07	0.04	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.06	0.06	0.09	0.04	0.06	0.05	0.04	0.03	0.03
C2'	0.03	0.05	0.04	0.03	0.05	0.06	0.06	0.06	0.04	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.09	0.04	0.05	0.04	0.07	0.01	0.02
C3'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.06	0.03	0.08	0.03	0.05	0.05	0.06	0.02	0.02
C4	0.03	0.07	0.03	0.03	0.07	0.05	0.06	0.06	0.04	0.07	0.06	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.04	0.04	0.05	0.04	0.02	0.02
C4'	0.04	0.08	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.06	0.02	0.07	0.03	0.06	0.05	0.07	0.03	0.03
C5	0.03	0.07	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.11	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03
C5'	0.05	0.09	0.04	0.03	0.06	0.05	0.06	0.06	0.09	0.03	0.10	0.08	0.09	0.05	0.04	0.06	0.04	0.06	0.08	0.06	0.06	0.04
C6	0.03	0.06	0.04	0.04	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.11	0.07	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03
C8	0.02	0.08	0.03	0.04	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.05	0.10	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03
N1	0.04	0.07	0.04	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.07	0.04	0.06	0.06	0.11	0.06	0.05	0.04	0.04	0.03	0.03
N2	0.05	0.07	0.04	0.04	0.07	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.08	0.03	0.06	0.06	0.09	0.04	0.06	0.05	0.04	0.03	0.03
N3	0.05	0.07	0.04	0.04	0.07	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.06	0.06	0.09	0.03	0.06	0.05	0.04	0.02	0.03
N7	0.02	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.08	0.05	0.11	0.07	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03
N9	0.02	0.07	0.03	0.03	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.06	0.07	0.04	0.07	0.05	0.09	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.02
O2'	0.04	0.04	0.05	0.04	0.06	0.06	0.08	0.06	0.07	0.08	0.04	0.04	0.08	0.09	0.06	0.08	0.05	0.06	0.04	0.08	0.02	0.03
O3'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.02	0.07	0.03	0.05	0.05	0.07	0.02	0.03
O4'	0.03	0.10	0.03	0.02	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.09	0.09	0.05	0.07	0.04	0.07	0.03	0.06	0.04	0.07	0.03	0.03
O5'	0.05	0.07	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.06	0.02	0.07	0.05	0.08	0.03	0.02	0.06	0.03	0.07	0.09	0.06	0.07	0.05
O6	0.03	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.13	0.09	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03
OP1	0.07	0.09	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.06	0.09	0.08	0.11	0.07	0.06	0.06	0.08	0.08	0.12	0.07	0.14	0.10
OP2	0.06	0.07	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.07	0.08	0.04	0.08	0.06	0.10	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.11	0.07	0.11	0.09
P	0.05	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.07	0.05	0.09	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.10	0.06	0.11	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.10	0.06	0.10	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.04	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.05	0.10	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.06	0.11	0.08
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.12	0.07	0.12	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.11	0.05	0.11	0.07
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.11	0.07	0.11	0.08
N3	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.09	0.05	0.09	0.06
N6	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.12	0.08	0.13	0.10
N7	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.12	0.07	0.12	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.05	0.08	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.04
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.07	0.03	0.04
O5'	0.05	0.10	0.05	0.04	0.10	0.01	0.11	0.00	0.12	0.11	0.11	0.09	0.12	0.12	0.09	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.05	0.06	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07	0.05	0.04	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.10	0.04	0.03	0.10	0.02	0.11	0.02	0.12	0.11	0.11	0.09	0.13	0.12	0.08	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.07	0.03	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.08	0.06	0.10	0.09	0.05	0.03	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00