Doublet Group distance statistics: 49936

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C5	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.002, 0.021, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.003, 0.025, 0.053, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.028
N2	A	0, -0.006, 0.057, 0.119, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.057 std_dev=0.063
O2'	A	0, 0.042, 0.121, 0.200, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.121 std_dev=0.079
O4'	A	0, 0.020, 0.102, 0.184, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.102 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.028, 0.118, 0.207, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.118 std_dev=0.090
C4'	A	0, 0.023, 0.175, 0.328, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.175 std_dev=0.153
C3'	A	0, 0.033, 0.191, 0.348, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.191 std_dev=0.158
C5'	A	0, 0.037, 0.244, 0.450, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.244 std_dev=0.206
O3'	A	0, 0.046, 0.293, 0.541, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.293 std_dev=0.247
P	B	0, 0.212, 0.504, 0.796, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.504 std_dev=0.292
O5'	B	0, 0.178, 0.472, 0.766, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.472 std_dev=0.294
C5'	B	0, 0.147, 0.444, 0.741, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.444 std_dev=0.297
OP1	B	0, 0.150, 0.471, 0.792, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.471 std_dev=0.321
OP2	B	0, 0.233, 0.702, 1.170, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.702 std_dev=0.469
O4'	B	0, 0.058, 0.555, 1.053, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.555 std_dev=0.497
C4'	B	0, 0.084, 0.718, 1.353, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.718 std_dev=0.635
OP1	A	0, 0.356, 1.070, 1.784, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.070 std_dev=0.714
C8	B	0, 0.068, 0.817, 1.566, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.817 std_dev=0.749
P	A	0, 0.398, 1.159, 1.920, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.159 std_dev=0.761
OP2	A	0, 0.429, 1.239, 2.049, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.239 std_dev=0.810
C1'	B	0, 0.013, 0.895, 1.778, 2.329 max_d=2.329 avg_d=0.895 std_dev=0.883
N9	B	0, 0.009, 0.944, 1.879, 2.462 max_d=2.462 avg_d=0.944 std_dev=0.935
C3'	B	0, 0.119, 1.057, 1.994, 2.531 max_d=2.531 avg_d=1.057 std_dev=0.937
O5'	A	0, 0.633, 1.621, 2.608, 2.566 max_d=2.566 avg_d=1.621 std_dev=0.987
N7	B	0, -0.011, 1.119, 2.249, 2.966 max_d=2.966 avg_d=1.119 std_dev=1.130
C2'	B	0, 0.020, 1.214, 2.408, 3.149 max_d=3.149 avg_d=1.214 std_dev=1.194
O3'	B	0, 0.132, 1.389, 2.646, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.389 std_dev=1.257
O2'	B	0, -0.028, 1.422, 2.873, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.422 std_dev=1.451
C5	B	0, -0.180, 1.514, 3.208, 4.354 max_d=4.354 avg_d=1.514 std_dev=1.694
C4	B	0, -0.229, 1.490, 3.209, 4.388 max_d=4.388 avg_d=1.490 std_dev=1.719
C6	B	0, -0.409, 2.084, 4.577, 6.311 max_d=6.311 avg_d=2.084 std_dev=2.493
N3	B	0, -0.526, 2.036, 4.597, 6.406 max_d=6.406 avg_d=2.036 std_dev=2.561
N6	B	0, -0.417, 2.236, 4.889, 6.730 max_d=6.730 avg_d=2.236 std_dev=2.653
N1	B	0, -0.675, 2.572, 5.820, 8.116 max_d=8.116 avg_d=2.572 std_dev=3.247
C2	B	0, -0.725, 2.526, 5.778, 8.088 max_d=8.088 avg_d=2.526 std_dev=3.251

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.01	0.46	0.37	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.19	0.02	0.09	0.02	0.43	0.40	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.09	0.12	0.10	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.48	0.40	0.10
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.14	0.17	0.13	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.14	0.11	0.37	0.32	0.10
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.10	0.01	0.38	0.34	0.13
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.08	0.09	0.07	0.02	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.38	0.33	0.09
C5	0.00	0.02	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.12	0.02	0.30	0.28	0.12
C5'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.10	0.11	0.09	0.05	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.08	0.23	0.16	0.03
C6	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.15	0.01	0.12	0.01	0.31	0.28	0.12
C8	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.15	0.04	0.25	0.24	0.11
N1	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.18	0.01	0.10	0.01	0.37	0.35	0.14
N2	0.04	0.01	0.12	0.17	0.02	0.09	0.04	0.11	0.05	0.03	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.22	0.03	0.08	0.05	0.47	0.45	0.16
N3	0.03	0.00	0.10	0.13	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.08	0.01	0.45	0.41	0.15
N7	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.15	0.04	0.22	0.23	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.37	0.32	0.12
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.10	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.61	0.47	0.14
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.11	0.01	0.11	0.04	0.15	0.04	0.18	0.22	0.16	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.25	0.15	0.35	0.36	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.03	0.41	0.34	0.15
O5'	0.10	0.09	0.05	0.14	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.15	0.10	0.08	0.08	0.15	0.12	0.05	0.25	0.16	0.00	0.14	0.03	0.04	0.02
O6	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.15	0.03	0.14	0.00	0.27	0.24	0.12
OP1	0.46	0.43	0.48	0.37	0.38	0.38	0.30	0.23	0.31	0.25	0.37	0.47	0.45	0.22	0.37	0.61	0.35	0.41	0.03	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.40	0.40	0.32	0.34	0.33	0.28	0.16	0.28	0.24	0.35	0.45	0.41	0.23	0.32	0.47	0.36	0.34	0.04	0.24	0.02	0.00	0.02
P	0.13	0.15	0.10	0.10	0.13	0.09	0.12	0.03	0.12	0.11	0.14	0.16	0.15	0.11	0.12	0.14	0.18	0.15	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	1.85	0.06	0.05	0.84	0.07	0.65	0.08	1.13	0.34	1.70	1.47	1.00	0.07	0.19	0.11	0.12	0.05	0.11	0.16	0.24	0.10
C2	0.05	2.13	0.05	0.05	1.00	0.09	0.90	0.11	1.49	0.22	2.08	1.63	1.44	0.16	0.27	0.13	0.13	0.09	0.07	0.07	0.23	0.10
C2'	0.09	1.55	0.19	0.15	0.68	0.06	0.53	0.02	0.96	0.35	1.44	1.21	0.87	0.08	0.11	0.25	0.27	0.05	0.11	0.09	0.30	0.11
C3'	0.17	1.32	0.30	0.26	0.57	0.12	0.47	0.08	0.83	0.35	1.23	1.03	0.77	0.13	0.12	0.36	0.42	0.11	0.14	0.13	0.36	0.16
C4	0.05	2.09	0.06	0.06	0.98	0.07	0.86	0.11	1.42	0.24	2.02	1.62	1.35	0.12	0.26	0.11	0.13	0.08	0.09	0.08	0.22	0.09
C4'	0.06	1.37	0.18	0.14	0.59	0.05	0.41	0.10	0.77	0.39	1.22	1.11	0.66	0.16	0.06	0.20	0.25	0.03	0.11	0.13	0.36	0.11
C5	0.08	2.20	0.08	0.08	1.07	0.09	0.98	0.12	1.58	0.17	2.17	1.69	1.54	0.23	0.33	0.10	0.13	0.09	0.08	0.07	0.29	0.12
C5'	0.08	1.22	0.21	0.19	0.54	0.05	0.38	0.13	0.69	0.39	1.08	1.00	0.59	0.18	0.08	0.21	0.33	0.02	0.12	0.12	0.38	0.11
C6	0.08	2.27	0.09	0.07	1.12	0.09	1.06	0.12	1.69	0.12	2.27	1.73	1.67	0.31	0.36	0.09	0.12	0.09	0.07	0.07	0.33	0.14
C8	0.08	2.10	0.10	0.09	1.02	0.07	0.89	0.12	1.44	0.23	2.02	1.65	1.36	0.14	0.29	0.10	0.15	0.08	0.10	0.10	0.23	0.09
N1	0.06	2.22	0.05	0.05	1.07	0.10	0.99	0.13	1.62	0.16	2.21	1.69	1.60	0.25	0.32	0.12	0.12	0.10	0.07	0.07	0.29	0.13
N2	0.05	2.10	0.07	0.07	0.97	0.10	0.87	0.11	1.46	0.23	2.05	1.59	1.42	0.14	0.25	0.17	0.15	0.10	0.08	0.07	0.22	0.09
N3	0.04	2.03	0.06	0.06	0.93	0.08	0.80	0.11	1.36	0.28	1.96	1.56	1.29	0.08	0.22	0.14	0.14	0.09	0.10	0.09	0.20	0.08
N7	0.09	2.20	0.11	0.10	1.09	0.09	1.00	0.14	1.60	0.16	2.18	1.71	1.55	0.25	0.35	0.10	0.14	0.09	0.09	0.07	0.32	0.14
N9	0.06	2.02	0.07	0.06	0.95	0.06	0.79	0.10	1.33	0.28	1.91	1.58	1.23	0.06	0.24	0.11	0.13	0.06	0.11	0.11	0.20	0.08
O2'	0.05	1.47	0.16	0.10	0.62	0.05	0.45	0.08	0.84	0.37	1.33	1.16	0.73	0.15	0.07	0.20	0.20	0.04	0.08	0.11	0.34	0.12
O3'	0.28	0.99	0.45	0.39	0.41	0.20	0.34	0.15	0.63	0.38	0.94	0.75	0.60	0.20	0.18	0.55	0.60	0.17	0.18	0.18	0.40	0.20
O4'	0.09	1.78	0.07	0.07	0.81	0.14	0.59	0.16	1.03	0.37	1.59	1.44	0.88	0.11	0.18	0.11	0.13	0.11	0.14	0.25	0.30	0.16
O5'	0.10	1.33	0.04	0.07	0.62	0.28	0.40	0.37	0.70	0.41	1.12	1.15	0.56	0.24	0.14	0.02	0.02	0.21	0.23	0.43	0.66	0.40
O6	0.12	2.34	0.12	0.10	1.19	0.09	1.16	0.12	1.81	0.07	2.38	1.78	1.83	0.41	0.42	0.08	0.12	0.08	0.09	0.10	0.38	0.17
OP1	0.51	0.43	0.53	0.38	0.35	0.13	0.66	0.22	0.44	1.19	0.21	0.34	0.63	1.14	0.69	0.27	0.01	0.30	0.55	0.34	0.29	0.21
OP2	0.44	0.88	0.20	0.24	0.57	0.75	0.38	0.72	0.50	0.11	0.72	0.85	0.39	0.13	0.36	0.29	0.04	0.73	0.37	0.42	0.80	0.52
P	0.04	0.88	0.14	0.04	0.33	0.26	0.12	0.27	0.30	0.49	0.66	0.79	0.18	0.38	0.09	0.08	0.01	0.16	0.15	0.30	0.67	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.07	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.15	0.62	0.30
C2	0.09	0.00	0.32	0.84	0.02	0.54	0.01	0.89	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.08	1.01	0.08	1.19	1.84	2.37	1.94
C2'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.18	0.01	0.06	0.01	0.13	0.16	0.23	0.34	0.08	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.84	0.36
C3'	0.01	0.84	0.00	0.00	0.46	0.01	0.26	0.03	0.43	0.28	0.68	0.82	0.33	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.83	0.33
C4	0.05	0.02	0.18	0.46	0.00	0.32	0.00	0.54	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.49	0.05	0.76	1.02	1.41	1.17
C4'	0.01	0.54	0.01	0.01	0.32	0.00	0.22	0.00	0.34	0.16	0.48	0.50	0.29	0.04	0.07	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.52	0.14
C5	0.02	0.01	0.06	0.26	0.00	0.22	0.00	0.44	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.29	0.03	0.64	0.91	1.01	0.99
C5'	0.05	0.89	0.01	0.03	0.54	0.00	0.44	0.00	0.63	0.13	0.83	0.78	0.57	0.10	0.19	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.25	0.01
C6	0.04	0.00	0.13	0.43	0.00	0.34	0.00	0.63	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.51	0.05	0.88	1.33	1.42	1.39
C8	0.01	0.02	0.16	0.28	0.01	0.16	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.07	0.30	0.09	0.15	0.16	0.22	0.15
N1	0.07	0.00	0.23	0.68	0.01	0.48	0.01	0.83	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.82	0.07	1.13	1.76	2.05	1.82
N3	0.10	0.00	0.34	0.82	0.01	0.50	0.00	0.78	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.92	0.07	1.04	1.52	2.14	1.67
N6	0.02	0.00	0.08	0.33	0.00	0.29	0.01	0.57	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.39	0.05	0.79	1.24	1.11	1.23
N7	0.00	0.02	0.10	0.12	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.13	0.05	0.18	0.28	0.24	0.30
N9	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.29	0.38	0.68	0.51
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.03	0.00	0.03	0.08	0.03	0.10	0.84	0.31
O3'	0.01	1.01	0.01	0.01	0.49	0.05	0.29	0.10	0.51	0.30	0.82	0.92	0.39	0.13	0.07	0.03	0.00	0.03	0.14	0.15	0.94	0.32
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.07	0.07	0.05	0.05	0.01	0.08	0.03	0.00	0.04	0.03	0.34	0.10
O5'	0.11	1.19	0.04	0.07	0.76	0.02	0.64	0.01	0.88	0.15	1.13	1.04	0.79	0.18	0.29	0.03	0.14	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	1.84	0.15	0.14	1.02	0.03	0.91	0.05	1.33	0.16	1.76	1.52	1.24	0.28	0.38	0.10	0.15	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.62	2.37	0.84	0.83	1.41	0.52	1.01	0.25	1.42	0.22	2.05	2.14	1.11	0.24	0.68	0.84	0.94	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.30	1.94	0.36	0.33	1.17	0.14	0.99	0.01	1.39	0.15	1.82	1.67	1.23	0.30	0.51	0.31	0.32	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00