Doublet Group distance statistics: 49942

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C5	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N7	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.000, 0.058, 0.116, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.058 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.000, 0.061, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.061 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.000, 0.066, 0.131, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.066 std_dev=0.066
C4'	A	0, 0.000, 0.081, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.081 std_dev=0.081
O3'	A	0, 0.000, 0.095, 0.190, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.095 std_dev=0.095
C5'	A	0, 0.000, 0.097, 0.193, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.097 std_dev=0.097
N2	A	0, 0.000, 0.099, 0.198, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.099 std_dev=0.099
O2'	A	0, 0.000, 0.134, 0.268, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.134 std_dev=0.134
OP1	B	0, 0.000, 0.178, 0.356, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.178 std_dev=0.178
P	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
P	B	0, 0.000, 0.197, 0.393, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.197 std_dev=0.197
OP2	B	0, 0.000, 0.216, 0.431, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.216 std_dev=0.216
C2	B	0, 0.000, 0.239, 0.478, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.239 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.000, 0.250, 0.499, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.250 std_dev=0.250
O5'	A	0, 0.000, 0.251, 0.501, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.251 std_dev=0.251
N3	B	0, 0.000, 0.274, 0.548, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.274 std_dev=0.274
C5'	B	0, 0.000, 0.299, 0.597, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.299 std_dev=0.299
C6	B	0, 0.000, 0.304, 0.608, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
C4'	B	0, 0.000, 0.322, 0.645, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.322 std_dev=0.322
N6	B	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
O4'	B	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
O5'	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
C5	B	0, 0.000, 0.341, 0.682, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.341 std_dev=0.341
N9	B	0, 0.000, 0.346, 0.691, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.346 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.000, 0.349, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.349 std_dev=0.349
C3'	B	0, 0.000, 0.355, 0.710, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.355 std_dev=0.355
C2'	B	0, 0.000, 0.368, 0.736, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.368 std_dev=0.368
O2'	B	0, 0.000, 0.370, 0.740, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.370
N7	B	0, 0.000, 0.389, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.389 std_dev=0.389
OP2	A	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
C8	B	0, 0.000, 0.397, 0.793, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.397 std_dev=0.397
O3'	B	0, 0.000, 0.405, 0.811, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.405 std_dev=0.405
OP1	A	0, 0.000, 0.453, 0.905, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.453 std_dev=0.453

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.12	0.17	0.01
C2	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.15	0.02	0.03	0.25	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.11	0.13	0.01
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.03
C4	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.27	0.07
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01
C5	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01	0.29	0.08
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.12	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03
C6	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.00	0.03	0.28	0.07
C8	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.26	0.07
N1	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.05	0.14	0.01	0.04	0.26	0.05
N2	0.05	0.00	0.06	0.09	0.00	0.11	0.03	0.12	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.11	0.09	0.20	0.05	0.02	0.21	0.00
N3	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.26	0.06
N7	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.28	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.24	0.06
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.09	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.20	0.05	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.02
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.12	0.14	0.00
O5'	0.05	0.15	0.02	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.11	0.04	0.14	0.20	0.11	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.11	0.00	0.03	0.28	0.07
OP1	0.12	0.03	0.11	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.05	0.20	0.04	0.12	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.25	0.13	0.13	0.27	0.09	0.29	0.08	0.28	0.26	0.26	0.21	0.26	0.28	0.24	0.05	0.07	0.14	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.04	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.03	0.07	0.07	0.05	0.00	0.06	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.03
C2	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.07	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C2'	0.05	0.05	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00
C3'	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.01
C4'	0.10	0.09	0.09	0.08	0.10	0.07	0.07	0.05	0.05	0.07	0.06	0.10	0.03	0.06	0.09	0.10	0.07	0.10	0.08	0.09	0.14	0.08
C5	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.06	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.01	0.09	0.09	0.04	0.03	0.06	0.04	0.06	0.03	0.03	0.00
C5'	0.11	0.09	0.10	0.09	0.10	0.08	0.08	0.07	0.06	0.08	0.07	0.11	0.04	0.07	0.10	0.11	0.09	0.11	0.10	0.11	0.16	0.10
C6	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.08	0.03	0.00	0.08	0.08	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01
C8	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.07	0.07	0.08	0.07	0.10	0.05	0.01	0.10	0.11	0.05	0.03	0.07	0.05	0.09	0.00	0.00	0.03
N1	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.00	0.08	0.08	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01
N2	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.04	0.01	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00
N3	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.02
N7	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05	0.09	0.08	0.09	0.08	0.12	0.06	0.03	0.11	0.12	0.07	0.05	0.09	0.07	0.10	0.01	0.00	0.03
N9	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.01	0.08	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.00
O2'	0.11	0.10	0.08	0.06	0.10	0.06	0.07	0.02	0.05	0.06	0.07	0.12	0.02	0.04	0.10	0.10	0.05	0.11	0.02	0.00	0.06	0.02
O3'	0.07	0.07	0.05	0.04	0.07	0.03	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.09	0.01	0.02	0.07	0.07	0.04	0.06	0.02	0.03	0.09	0.03
O4'	0.09	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.09	0.01	0.04	0.08	0.08	0.05	0.09	0.07	0.09	0.13	0.08
O5'	0.07	0.07	0.06	0.05	0.08	0.04	0.08	0.03	0.06	0.07	0.06	0.08	0.05	0.07	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.06	0.15	0.08
O6	0.04	0.00	0.05	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.05	0.09	0.03	0.00	0.08	0.09	0.04	0.03	0.07	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01
OP1	0.11	0.16	0.13	0.14	0.13	0.13	0.15	0.14	0.17	0.13	0.18	0.13	0.19	0.15	0.12	0.12	0.14	0.10	0.11	0.13	0.09	0.13
OP2	0.21	0.17	0.19	0.18	0.18	0.19	0.14	0.19	0.12	0.15	0.13	0.19	0.08	0.13	0.19	0.21	0.18	0.22	0.19	0.20	0.20	0.19
P	0.08	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.00	0.04	0.07	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.11	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.07	0.04
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01
C4	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02
C5	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.07	0.05
C5'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.06	0.03	0.08	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.09	0.07
C8	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.04	0.04
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.03	0.08	0.08	0.09	0.06
N3	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01
N6	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.10	0.11	0.12	0.10
N7	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.07	0.06
N9	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01
O2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03
O5'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.04	0.10	0.07	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.08	0.05	0.08	0.03	0.11	0.07	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.09	0.04	0.09	0.04	0.12	0.07	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.07	0.04	0.06	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00