Doublet Group distance statistics: 49947

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N2	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.000, 0.156, 0.313, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.156 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
C4'	A	0, 0.000, 0.509, 1.018, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.509 std_dev=0.509
OP2	B	0, 0.000, 0.540, 1.081, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.540 std_dev=0.540
P	B	0, 0.000, 0.557, 1.114, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.557 std_dev=0.557
C3'	A	0, 0.000, 0.559, 1.118, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.559 std_dev=0.559
C5'	A	0, 0.000, 0.677, 1.355, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.677 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.000, 0.738, 1.477, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.738 std_dev=0.738
O5'	A	0, 0.000, 0.768, 1.537, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.768 std_dev=0.768
C5'	B	0, 0.000, 0.782, 1.564, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.782 std_dev=0.782
O3'	A	0, 0.000, 0.998, 1.996, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.998 std_dev=0.998
OP1	B	0, 0.000, 1.052, 2.105, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.052 std_dev=1.052
C4'	B	0, 0.000, 1.093, 2.186, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.093 std_dev=1.093
C3'	B	0, 0.000, 1.368, 2.736, 2.736 max_d=2.736 avg_d=1.368 std_dev=1.368
O4'	B	0, 0.000, 1.470, 2.940, 2.940 max_d=2.940 avg_d=1.470 std_dev=1.470
P	A	0, 0.000, 1.593, 3.186, 3.186 max_d=3.186 avg_d=1.593 std_dev=1.593
C2'	B	0, 0.000, 1.819, 3.639, 3.639 max_d=3.639 avg_d=1.819 std_dev=1.819
C1'	B	0, 0.000, 1.875, 3.751, 3.751 max_d=3.751 avg_d=1.875 std_dev=1.875
OP2	A	0, 0.000, 1.881, 3.762, 3.762 max_d=3.762 avg_d=1.881 std_dev=1.881
O3'	B	0, 0.000, 1.999, 3.998, 3.998 max_d=3.998 avg_d=1.999 std_dev=1.999
N9	B	0, 0.000, 2.135, 4.270, 4.270 max_d=4.270 avg_d=2.135 std_dev=2.135
O2'	B	0, 0.000, 2.174, 4.349, 4.349 max_d=4.349 avg_d=2.174 std_dev=2.174
C8	B	0, 0.000, 2.182, 4.365, 4.365 max_d=4.365 avg_d=2.182 std_dev=2.182
C4	B	0, 0.000, 2.405, 4.809, 4.809 max_d=4.809 avg_d=2.405 std_dev=2.405
OP1	A	0, 0.000, 2.453, 4.907, 4.907 max_d=4.907 avg_d=2.453 std_dev=2.453
N3	B	0, 0.000, 2.465, 4.931, 4.931 max_d=4.931 avg_d=2.465 std_dev=2.465
N7	B	0, 0.000, 2.468, 4.936, 4.936 max_d=4.936 avg_d=2.468 std_dev=2.468
C5	B	0, 0.000, 2.616, 5.232, 5.232 max_d=5.232 avg_d=2.616 std_dev=2.616
C2	B	0, 0.000, 2.764, 5.528, 5.528 max_d=5.528 avg_d=2.764 std_dev=2.764
C6	B	0, 0.000, 2.934, 5.869, 5.869 max_d=5.869 avg_d=2.934 std_dev=2.934
N1	B	0, 0.000, 3.001, 6.002, 6.002 max_d=6.002 avg_d=3.001 std_dev=3.001
N6	B	0, 0.000, 3.179, 6.358, 6.358 max_d=6.358 avg_d=3.179 std_dev=3.179

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01	0.02	0.57	0.50	0.35
C2	0.04	0.00	0.01	0.09	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.31	0.06	0.06	0.01	0.00	0.86	0.75	0.52
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.13	0.32	0.11
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.22	0.01	0.21	0.25	0.15	0.04	0.06	0.27	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.12	0.22	0.02
C4	0.02	0.01	0.02	0.15	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.05	0.02	0.06	0.01	0.89	0.62	0.47
C4'	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.08	0.16	0.02	0.06	0.04	0.16	0.07	0.10	0.03	0.01	0.00	0.11	0.03	0.27	0.07
C5	0.01	0.00	0.02	0.22	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.16	0.00	0.14	0.01	1.01	0.56	0.46
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.16	0.21	0.09	0.01	0.00	0.23	0.09	0.08	0.11	0.02	0.00	0.20	0.03	0.08	0.00
C6	0.02	0.00	0.01	0.21	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.14	0.01	0.13	0.00	1.05	0.62	0.50
C8	0.02	0.01	0.03	0.25	0.00	0.16	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.23	0.05	0.21	0.01	0.96	0.39	0.38
N1	0.04	0.00	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.29	0.04	0.04	0.06	0.00	0.98	0.71	0.53
N2	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.14	0.06	0.05	0.00	0.79	0.80	0.52
N3	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.08	0.06	0.02	0.00	0.80	0.72	0.50
N7	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.26	0.04	0.23	0.01	1.04	0.43	0.40
N9	0.00	0.02	0.02	0.16	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.09	0.00	0.09	0.01	0.83	0.52	0.41
O2'	0.04	0.31	0.01	0.00	0.21	0.10	0.19	0.08	0.24	0.06	0.29	0.33	0.28	0.11	0.11	0.00	0.10	0.07	0.13	0.23	0.19	0.20	0.08
O3'	0.06	0.06	0.04	0.01	0.05	0.03	0.16	0.11	0.14	0.23	0.04	0.14	0.08	0.26	0.09	0.10	0.00	0.01	0.04	0.19	0.61	0.09	0.27
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.63	0.46	0.37
O5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.13	0.21	0.06	0.05	0.02	0.23	0.09	0.13	0.04	0.03	0.00	0.17	0.01	0.03	0.00
O6	0.02	0.00	0.01	0.24	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.19	0.00	0.17	0.00	1.10	0.58	0.49
OP1	0.57	0.86	0.13	0.12	0.89	0.03	1.01	0.03	1.05	0.96	0.98	0.79	0.80	1.04	0.83	0.19	0.61	0.63	0.01	1.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.50	0.75	0.32	0.22	0.62	0.27	0.56	0.08	0.62	0.39	0.71	0.80	0.72	0.43	0.52	0.20	0.09	0.46	0.03	0.58	0.00	0.00	0.00
P	0.35	0.52	0.11	0.02	0.47	0.07	0.46	0.00	0.50	0.38	0.53	0.52	0.50	0.40	0.41	0.08	0.27	0.37	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.17	0.14	0.08	0.14	0.06	0.40	0.06	0.04	0.08	0.10	0.05	0.04	0.07	0.35	0.14	0.06	0.24	0.11	0.31	0.28
C2	0.03	0.05	0.18	0.20	0.06	0.04	0.10	0.29	0.11	0.08	0.09	0.03	0.14	0.11	0.05	0.39	0.26	0.09	0.35	0.19	0.36	0.36
C2'	0.05	0.01	0.04	0.00	0.04	0.09	0.05	0.43	0.05	0.07	0.03	0.01	0.07	0.07	0.05	0.21	0.09	0.01	0.23	0.05	0.27	0.25
C3'	0.15	0.07	0.06	0.13	0.13	0.01	0.16	0.32	0.15	0.20	0.10	0.08	0.17	0.20	0.16	0.13	0.24	0.11	0.37	0.09	0.39	0.38
C4	0.04	0.03	0.14	0.17	0.05	0.03	0.07	0.29	0.08	0.07	0.06	0.02	0.11	0.09	0.05	0.33	0.21	0.09	0.34	0.13	0.34	0.35
C4'	0.04	0.04	0.03	0.06	0.01	0.05	0.03	0.30	0.02	0.07	0.01	0.03	0.04	0.07	0.04	0.24	0.10	0.02	0.31	0.10	0.37	0.34
C5	0.12	0.13	0.08	0.13	0.14	0.07	0.17	0.19	0.18	0.16	0.16	0.11	0.21	0.18	0.13	0.25	0.18	0.19	0.40	0.28	0.36	0.38
C5'	0.03	0.09	0.00	0.11	0.01	0.03	0.02	0.25	0.01	0.08	0.05	0.07	0.02	0.07	0.03	0.21	0.18	0.02	0.32	0.08	0.38	0.34
C6	0.15	0.17	0.08	0.15	0.18	0.09	0.22	0.16	0.23	0.20	0.21	0.15	0.27	0.23	0.17	0.26	0.21	0.23	0.42	0.36	0.37	0.39
C8	0.09	0.06	0.05	0.10	0.08	0.05	0.09	0.24	0.09	0.10	0.08	0.05	0.11	0.11	0.08	0.21	0.11	0.14	0.36	0.12	0.33	0.34
N1	0.10	0.13	0.13	0.18	0.13	0.03	0.17	0.22	0.19	0.15	0.17	0.11	0.23	0.18	0.12	0.33	0.24	0.17	0.39	0.29	0.36	0.38
N2	0.01	0.04	0.20	0.21	0.04	0.06	0.08	0.31	0.10	0.07	0.08	0.02	0.14	0.10	0.03	0.42	0.28	0.07	0.34	0.18	0.37	0.37
N3	0.01	0.01	0.20	0.20	0.00	0.08	0.04	0.34	0.05	0.03	0.02	0.02	0.07	0.05	0.00	0.40	0.25	0.04	0.31	0.10	0.34	0.34
N7	0.16	0.15	0.02	0.09	0.16	0.13	0.19	0.14	0.19	0.19	0.17	0.14	0.22	0.20	0.16	0.17	0.12	0.23	0.42	0.32	0.35	0.38
N9	0.01	0.01	0.13	0.14	0.01	0.05	0.03	0.33	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.31	0.16	0.05	0.31	0.03	0.32	0.32
O2'	0.18	0.17	0.10	0.15	0.17	0.02	0.18	0.32	0.18	0.17	0.18	0.17	0.19	0.17	0.17	0.06	0.24	0.11	0.30	0.09	0.33	0.30
O3'	0.41	0.38	0.30	0.37	0.42	0.21	0.45	0.13	0.45	0.46	0.41	0.38	0.47	0.48	0.44	0.10	0.52	0.35	0.51	0.17	0.49	0.48
O4'	0.11	0.16	0.19	0.15	0.13	0.16	0.12	0.38	0.12	0.09	0.14	0.16	0.11	0.09	0.12	0.38	0.18	0.10	0.22	0.22	0.32	0.28
O5'	0.11	0.22	0.10	0.08	0.14	0.07	0.11	0.08	0.14	0.03	0.19	0.21	0.11	0.05	0.10	0.36	0.00	0.08	0.31	0.18	0.45	0.38
O6	0.21	0.24	0.03	0.12	0.25	0.15	0.29	0.08	0.31	0.27	0.29	0.22	0.35	0.30	0.23	0.20	0.19	0.30	0.45	0.46	0.37	0.40
OP1	0.02	0.41	0.09	0.25	0.14	0.40	0.01	0.87	0.11	0.27	0.30	0.37	0.03	0.22	0.04	0.10	0.04	0.20	0.75	1.72	1.00	1.05
OP2	0.23	0.35	0.24	0.30	0.29	0.12	0.27	0.09	0.30	0.19	0.33	0.34	0.28	0.21	0.24	0.12	0.00	0.17	0.13	0.73	0.16	0.03
P	0.08	0.23	0.01	0.03	0.12	0.11	0.07	0.28	0.11	0.05	0.18	0.22	0.08	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.15	0.92	0.21	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.20	0.36	0.26	0.24
C2	0.03	0.00	0.09	0.06	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.30	0.14	0.36	0.34	0.44	0.38
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.15	0.05	0.04	0.07	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.20	0.57	0.25	0.26
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.11	0.03	0.07	0.03	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.22	0.71	0.27	0.31
C4	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.20	0.07	0.33	0.33	0.43	0.36
C4'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.05	0.00	0.02	0.28	0.08	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.13	0.01	0.33	0.28	0.49	0.39
C5'	0.06	0.08	0.15	0.02	0.03	0.01	0.11	0.00	0.07	0.24	0.01	0.07	0.11	0.22	0.10	0.01	0.05	0.00	0.01	0.32	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.17	0.04	0.35	0.27	0.51	0.40
C8	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.11	0.28	0.28	0.47	0.36
N1	0.02	0.00	0.07	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.25	0.10	0.36	0.30	0.49	0.40
N3	0.03	0.00	0.09	0.07	0.00	0.11	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.31	0.15	0.33	0.36	0.40	0.35
N6	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.13	0.01	0.35	0.23	0.54	0.41
N7	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.03	0.07	0.30	0.24	0.51	0.38
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.01	0.29	0.33	0.40	0.33
O2'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.17	0.15	0.15	0.01	0.18	0.03	0.22	0.22	0.17	0.08	0.07	0.00	0.10	0.09	0.24	0.69	0.25	0.30
O3'	0.18	0.30	0.03	0.01	0.20	0.05	0.13	0.05	0.17	0.00	0.25	0.31	0.13	0.03	0.12	0.10	0.00	0.16	0.09	0.75	0.27	0.25
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.04	0.11	0.10	0.15	0.01	0.07	0.01	0.09	0.16	0.00	0.13	0.19	0.11	0.13
O5'	0.20	0.36	0.20	0.22	0.33	0.02	0.33	0.01	0.35	0.28	0.36	0.33	0.35	0.30	0.29	0.24	0.09	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.34	0.57	0.71	0.33	0.28	0.28	0.32	0.27	0.28	0.30	0.36	0.23	0.24	0.33	0.69	0.75	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.44	0.25	0.27	0.43	0.08	0.49	0.30	0.51	0.47	0.49	0.40	0.54	0.51	0.40	0.25	0.27	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.38	0.26	0.31	0.36	0.01	0.39	0.01	0.40	0.36	0.40	0.35	0.41	0.38	0.33	0.30	0.25	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00