Doublet Group distance statistics: 49949

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C5	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
P	B	0, 0.000, 0.280, 0.559, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.280 std_dev=0.280
O5'	B	0, 0.000, 0.755, 1.509, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.755 std_dev=0.755
C5'	B	0, 0.000, 0.811, 1.622, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.811 std_dev=0.811
OP2	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
OP1	B	0, 0.000, 0.925, 1.850, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.925 std_dev=0.925
O4'	A	0, 0.000, 1.065, 2.130, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.065 std_dev=1.065
C2'	A	0, 0.000, 1.090, 2.180, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.090 std_dev=1.090
C3'	A	0, 0.000, 1.468, 2.935, 2.935 max_d=2.935 avg_d=1.468 std_dev=1.468
O2'	A	0, 0.000, 1.491, 2.981, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.491 std_dev=1.491
O3'	A	0, 0.000, 1.572, 3.145, 3.145 max_d=3.145 avg_d=1.572 std_dev=1.572
C4'	A	0, 0.000, 1.585, 3.170, 3.170 max_d=3.170 avg_d=1.585 std_dev=1.585
C4'	B	0, 0.000, 2.220, 4.440, 4.440 max_d=4.440 avg_d=2.220 std_dev=2.220
C5'	A	0, 0.000, 2.524, 5.048, 5.048 max_d=5.048 avg_d=2.524 std_dev=2.524
O4'	B	0, 0.000, 3.121, 6.241, 6.241 max_d=6.241 avg_d=3.121 std_dev=3.121
O5'	A	0, 0.000, 3.132, 6.265, 6.265 max_d=6.265 avg_d=3.132 std_dev=3.132
C3'	B	0, 0.000, 3.298, 6.596, 6.596 max_d=6.596 avg_d=3.298 std_dev=3.298
C8	B	0, 0.000, 3.765, 7.529, 7.529 max_d=7.529 avg_d=3.765 std_dev=3.765
P	A	0, 0.000, 3.805, 7.610, 7.610 max_d=7.610 avg_d=3.805 std_dev=3.805
OP2	A	0, 0.000, 3.975, 7.949, 7.949 max_d=7.949 avg_d=3.975 std_dev=3.975
O3'	B	0, 0.000, 4.003, 8.006, 8.006 max_d=8.006 avg_d=4.003 std_dev=4.003
OP1	A	0, 0.000, 4.093, 8.185, 8.185 max_d=8.185 avg_d=4.093 std_dev=4.093
C1'	B	0, 0.000, 4.218, 8.437, 8.437 max_d=8.437 avg_d=4.218 std_dev=4.218
C2'	B	0, 0.000, 4.224, 8.448, 8.448 max_d=8.448 avg_d=4.224 std_dev=4.224
N7	B	0, 0.000, 4.424, 8.847, 8.847 max_d=8.847 avg_d=4.424 std_dev=4.424
N9	B	0, 0.000, 4.571, 9.141, 9.141 max_d=9.141 avg_d=4.571 std_dev=4.571
O2'	B	0, 0.000, 5.289, 10.578, 10.578 max_d=10.578 avg_d=5.289 std_dev=5.289
C5	B	0, 0.000, 5.723, 11.446, 11.446 max_d=11.446 avg_d=5.723 std_dev=5.723
C4	B	0, 0.000, 5.828, 11.656, 11.656 max_d=11.656 avg_d=5.828 std_dev=5.828
C6	B	0, 0.000, 6.916, 13.832, 13.832 max_d=13.832 avg_d=6.916 std_dev=6.916
N3	B	0, 0.000, 6.954, 13.908, 13.908 max_d=13.908 avg_d=6.954 std_dev=6.954
N6	B	0, 0.000, 7.023, 14.047, 14.047 max_d=14.047 avg_d=7.023 std_dev=7.023
C2	B	0, 0.000, 7.996, 15.992, 15.992 max_d=15.992 avg_d=7.996 std_dev=7.996
N1	B	0, 0.000, 8.044, 16.087, 16.087 max_d=16.087 avg_d=8.044 std_dev=8.044

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.21	0.00	0.03	0.00	0.11	0.06	0.07
C2	0.00	0.00	0.42	0.29	0.02	0.21	0.02	0.29	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.34	0.08	0.40	0.65	0.00	0.66	0.69	0.63
C2'	0.01	0.42	0.00	0.00	0.23	0.01	0.13	0.12	0.20	0.17	0.34	0.49	0.40	0.06	0.03	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.31	0.05	0.06
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.28	0.01	0.36	0.00	0.39	0.30	0.36	0.25	0.23	0.37	0.22	0.00	0.02	0.03	0.01	0.43	0.24	0.16	0.02
C4	0.01	0.02	0.23	0.28	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.21	0.27	0.00	0.30	0.23	0.19
C4'	0.00	0.21	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.03	0.31	0.10	0.32	0.22	0.27	0.09	0.25	0.00	0.00	0.01	0.09	0.14	0.09	0.03
C5	0.00	0.02	0.13	0.36	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.20	0.08	0.09	0.00	0.12	0.02	0.00
C5'	0.02	0.29	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.04	0.40	0.14	0.42	0.29	0.36	0.09	0.11	0.17	0.01	0.00	0.13	0.21	0.14	0.00
C6	0.00	0.01	0.20	0.39	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.23	0.16	0.24	0.00	0.25	0.20	0.16
C8	0.02	0.02	0.17	0.30	0.00	0.31	0.00	0.40	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.45	0.15	0.25	0.36	0.01	0.28	0.55	0.51
N1	0.00	0.01	0.34	0.36	0.01	0.10	0.02	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.17	0.18	0.30	0.49	0.00	0.51	0.52	0.46
N2	0.01	0.00	0.49	0.25	0.01	0.32	0.02	0.42	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.50	0.03	0.49	0.85	0.01	0.87	0.94	0.87
N3	0.01	0.01	0.40	0.23	0.01	0.22	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.34	0.00	0.41	0.59	0.00	0.59	0.59	0.54
N7	0.02	0.03	0.06	0.37	0.01	0.27	0.00	0.36	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.39	0.24	0.14	0.25	0.01	0.21	0.44	0.40
N9	0.00	0.01	0.03	0.22	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.15	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.11
O2'	0.02	0.34	0.00	0.00	0.05	0.25	0.13	0.11	0.05	0.45	0.17	0.50	0.34	0.39	0.15	0.00	0.06	0.19	0.27	0.13	0.02	0.17	0.24
O3'	0.21	0.08	0.00	0.02	0.08	0.00	0.20	0.17	0.23	0.15	0.18	0.03	0.00	0.24	0.02	0.06	0.00	0.11	0.11	0.30	0.03	0.28	0.13
O4'	0.00	0.40	0.01	0.03	0.21	0.00	0.08	0.01	0.16	0.25	0.30	0.49	0.41	0.14	0.00	0.19	0.11	0.00	0.02	0.10	0.04	0.06	0.10
O5'	0.03	0.65	0.07	0.01	0.27	0.01	0.09	0.00	0.24	0.36	0.49	0.85	0.59	0.25	0.00	0.27	0.11	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01
O6	0.00	0.00	0.16	0.43	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.30	0.10	0.13	0.00	0.15	0.08	0.05
OP1	0.11	0.66	0.31	0.24	0.30	0.14	0.12	0.21	0.25	0.28	0.51	0.87	0.59	0.21	0.06	0.02	0.03	0.04	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.69	0.05	0.16	0.23	0.09	0.02	0.14	0.20	0.55	0.52	0.94	0.59	0.44	0.10	0.17	0.28	0.06	0.00	0.08	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.63	0.06	0.02	0.19	0.03	0.00	0.00	0.16	0.51	0.46	0.87	0.54	0.40	0.11	0.24	0.13	0.10	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	2.01	3.09	2.14	1.92	2.66	1.24	2.57	0.51	2.78	1.88	3.04	2.91	2.60	2.07	2.24	2.20	2.13	1.40	0.50	0.51	0.27	0.13
C2	1.68	3.25	1.41	1.30	2.60	0.96	2.80	0.41	3.33	1.83	3.49	2.84	3.55	2.29	2.03	1.32	1.42	1.29	0.42	0.53	0.13	0.09
C2'	1.27	2.48	1.53	1.31	1.93	0.51	1.89	0.20	2.19	1.16	2.47	2.23	2.10	1.40	1.49	1.68	1.59	0.61	0.15	1.03	0.84	0.67
C3'	1.52	2.48	1.85	1.68	2.05	0.84	2.00	0.17	2.23	1.44	2.46	2.29	2.15	1.62	1.70	2.02	2.03	0.88	0.24	0.43	0.30	0.17
C4	1.61	2.83	1.46	1.40	2.39	0.97	2.53	0.41	2.84	1.76	2.95	2.55	2.86	2.14	1.94	1.39	1.55	1.20	0.42	0.57	0.15	0.11
C4'	2.07	2.87	2.38	2.20	2.48	1.40	2.34	0.66	2.51	1.84	2.77	2.75	2.34	1.93	2.17	2.56	2.59	1.46	0.61	0.09	0.03	0.12
C5	1.20	2.16	0.99	1.07	1.84	0.76	2.00	0.34	2.24	1.40	2.29	1.95	2.30	1.76	1.49	0.86	1.21	0.94	0.35	0.59	0.04	0.09
C5'	1.83	2.43	2.14	2.08	2.14	1.31	2.04	0.66	2.17	1.66	2.36	2.34	2.04	1.74	1.92	2.31	2.54	1.32	0.59	0.15	0.23	0.24
C6	1.06	2.09	0.76	0.87	1.72	0.66	1.91	0.30	2.22	1.28	2.26	1.83	2.38	1.66	1.35	0.58	0.99	0.88	0.31	0.54	0.01	0.06
C8	1.24	1.88	1.23	1.34	1.68	0.85	1.70	0.38	1.80	1.33	1.89	1.77	1.71	1.50	1.45	1.16	1.52	0.92	0.40	0.60	0.09	0.10
N1	1.35	2.68	1.03	1.04	2.16	0.79	2.37	0.35	2.81	1.55	2.90	2.33	3.05	1.99	1.68	0.87	1.15	1.08	0.36	0.53	0.04	0.07
N2	1.80	3.60	1.51	1.34	2.80	1.01	2.98	0.42	3.62	1.92	3.87	3.10	3.89	2.40	2.17	1.45	1.46	1.38	0.42	0.52	0.15	0.10
N3	1.83	3.39	1.65	1.49	2.75	1.06	2.91	0.44	3.39	1.93	3.58	3.00	3.49	2.37	2.18	1.61	1.63	1.36	0.44	0.55	0.19	0.12
N7	0.94	1.57	0.80	0.99	1.38	0.66	1.46	0.31	1.58	1.10	1.63	1.45	1.57	1.32	1.15	0.67	1.16	0.74	0.33	0.62	0.02	0.07
N9	1.68	2.67	1.66	1.59	2.33	1.05	2.36	0.45	2.56	1.74	2.70	2.48	2.45	2.00	1.95	1.63	1.76	1.22	0.46	0.56	0.19	0.11
O2'	1.26	2.50	1.62	1.34	1.84	0.50	1.68	0.26	2.00	0.93	2.40	2.25	1.83	1.10	1.37	1.86	1.67	0.54	0.24	1.30	1.01	0.84
O3'	1.53	2.46	1.93	1.78	1.99	0.90	1.89	0.23	2.13	1.34	2.40	2.27	2.03	1.49	1.64	2.17	2.22	0.88	0.27	0.42	0.21	0.13
O4'	2.38	3.16	2.56	2.36	2.82	1.66	2.65	0.90	2.78	2.14	3.04	3.07	2.56	2.22	2.52	2.63	2.61	1.80	0.82	0.08	0.10	0.21
O5'	2.32	2.78	2.64	2.60	2.48	1.87	2.29	1.16	2.39	1.95	2.64	2.73	2.21	1.95	2.29	2.90	3.20	1.85	0.94	0.47	0.52	0.51
O6	0.72	1.55	0.38	0.60	1.26	0.48	1.43	0.24	1.69	0.94	1.71	1.34	1.85	1.26	0.97	0.14	0.71	0.66	0.25	0.51	0.11	0.02
OP1	1.90	2.17	2.15	2.17	1.96	1.66	1.80	1.09	1.88	1.58	2.06	2.15	1.74	1.57	1.83	2.53	2.91	1.58	0.81	0.73	0.55	0.54
OP2	2.03	2.27	2.08	2.29	2.14	1.91	2.04	1.51	2.09	1.89	2.21	2.25	1.97	1.87	2.05	2.18	2.78	1.86	1.23	1.09	1.19	1.01
P	2.36	2.63	2.58	2.67	2.43	2.12	2.26	1.52	2.32	2.03	2.51	2.61	2.16	2.00	2.31	2.82	3.35	2.06	1.21	0.94	0.90	0.86

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.21	0.01	0.03	0.55	0.07	0.11
C2	0.05	0.00	0.21	0.17	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.14	0.03	0.16	0.69	0.24	0.03
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.14	0.08	0.12	0.16	0.20	0.04	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.73	0.08	0.32
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.16	0.01	0.22	0.01	0.23	0.21	0.21	0.14	0.25	0.24	0.15	0.02	0.01	0.02	0.11	0.16	0.42	0.06
C4	0.01	0.03	0.08	0.16	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.16	0.09	0.01	0.14	0.71	0.20	0.00
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.07	0.03	0.10	0.13	0.07	0.22	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03
C5	0.01	0.03	0.02	0.22	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.26	0.02	0.02	0.21	0.76	0.23	0.04
C5'	0.03	0.04	0.14	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.08	0.10	0.06	0.02	0.09	0.11	0.04	0.06	0.18	0.01	0.01	0.15	0.05	0.03
C6	0.03	0.02	0.08	0.23	0.02	0.09	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.01	0.01	0.23	0.76	0.26	0.06
C8	0.00	0.04	0.12	0.21	0.02	0.14	0.01	0.10	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.00	0.00	0.29	0.10	0.09	0.21	0.75	0.18	0.01
N1	0.05	0.01	0.16	0.21	0.03	0.07	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.13	0.06	0.01	0.20	0.73	0.26	0.06
N3	0.05	0.01	0.20	0.14	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.18	0.03	0.12	0.66	0.20	0.00
N6	0.02	0.03	0.04	0.25	0.02	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.28	0.07	0.02	0.24	0.79	0.26	0.08
N7	0.00	0.04	0.08	0.24	0.02	0.13	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.33	0.12	0.07	0.25	0.78	0.23	0.06
N9	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.00	0.00	0.17	0.05	0.03	0.11	0.67	0.15	0.04
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.16	0.22	0.26	0.06	0.23	0.29	0.13	0.00	0.28	0.33	0.17	0.00	0.01	0.15	0.28	0.71	0.15	0.30
O3'	0.21	0.14	0.00	0.01	0.09	0.01	0.02	0.18	0.01	0.10	0.06	0.18	0.07	0.12	0.05	0.01	0.00	0.13	0.03	0.11	0.72	0.28
O4'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.15	0.13	0.00	0.13	0.26	0.01	0.00
O5'	0.03	0.16	0.35	0.11	0.14	0.01	0.21	0.01	0.23	0.21	0.20	0.12	0.24	0.25	0.11	0.28	0.03	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.55	0.69	0.73	0.16	0.71	0.06	0.76	0.15	0.76	0.75	0.73	0.66	0.79	0.78	0.67	0.71	0.11	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.24	0.08	0.42	0.20	0.10	0.23	0.05	0.26	0.18	0.26	0.20	0.26	0.23	0.15	0.15	0.72	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.03	0.32	0.06	0.00	0.03	0.04	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.08	0.06	0.04	0.30	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00