Doublet Group distance statistics: 49957

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 2, 2, 1, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.017, 0.033, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.044 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.029, 0.049, 0.070, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.049 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.025, 0.047, 0.069, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.047 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.027, 0.051, 0.075, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.051 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.023, 0.048, 0.073, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.048 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.042 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.028, 0.054, 0.081, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.054 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.028, 0.059, 0.089, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.059 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.040, 0.073, 0.106, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.073 std_dev=0.033
C3'	A	0, 0.079, 0.203, 0.327, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.203 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.143, 0.284, 0.424, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.284 std_dev=0.140
O4'	A	0, 0.187, 0.341, 0.494, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.341 std_dev=0.153
O3'	A	0, 0.066, 0.225, 0.384, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.225 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.209, 0.409, 0.608, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.409 std_dev=0.200
O2'	A	0, 0.303, 0.566, 0.829, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.566 std_dev=0.263
P	A	0, 0.197, 0.487, 0.776, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.487 std_dev=0.289
OP2	B	0, 0.218, 0.529, 0.839, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.529 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.373, 0.714, 1.055, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.714 std_dev=0.341
P	B	0, 0.416, 0.771, 1.126, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.771 std_dev=0.355
OP1	A	0, 0.405, 0.798, 1.191, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.798 std_dev=0.393
O5'	A	0, 0.273, 0.701, 1.129, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.701 std_dev=0.428
OP2	A	0, 0.319, 0.812, 1.305, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.812 std_dev=0.493
O5'	B	0, 0.604, 1.129, 1.654, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.129 std_dev=0.525
C5'	B	0, 0.724, 1.265, 1.807, 1.822 max_d=1.822 avg_d=1.265 std_dev=0.542
C4'	B	0, 0.762, 1.340, 1.917, 1.972 max_d=1.972 avg_d=1.340 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.719, 1.319, 1.919, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.319 std_dev=0.600
O4'	B	0, 0.761, 1.365, 1.969, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.365 std_dev=0.604
C3'	B	0, 0.830, 1.459, 2.087, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.459 std_dev=0.629
O3'	B	0, 0.881, 1.520, 2.159, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.520 std_dev=0.639
C1'	B	0, 0.802, 1.462, 2.122, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.462 std_dev=0.660
C8	B	0, 0.723, 1.389, 2.055, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.389 std_dev=0.666
C2'	B	0, 0.878, 1.559, 2.240, 2.475 max_d=2.475 avg_d=1.559 std_dev=0.681
N9	B	0, 0.750, 1.433, 2.117, 2.315 max_d=2.315 avg_d=1.433 std_dev=0.683
N7	B	0, 0.745, 1.449, 2.153, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.449 std_dev=0.704
O2'	B	0, 0.959, 1.684, 2.409, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.684 std_dev=0.725
C4	B	0, 0.756, 1.487, 2.217, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.487 std_dev=0.731
C5	B	0, 0.763, 1.507, 2.252, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.507 std_dev=0.744
N3	B	0, 0.784, 1.562, 2.339, 2.556 max_d=2.556 avg_d=1.562 std_dev=0.777
C6	B	0, 0.813, 1.621, 2.428, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.621 std_dev=0.808
O6	B	0, 0.857, 1.694, 2.531, 2.657 max_d=2.657 avg_d=1.694 std_dev=0.837
C2	B	0, 0.817, 1.658, 2.499, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.658 std_dev=0.841
N1	B	0, 0.834, 1.687, 2.540, 2.737 max_d=2.737 avg_d=1.687 std_dev=0.853
N2	B	0, 0.855, 1.764, 2.674, 3.141 max_d=3.141 avg_d=1.764 std_dev=0.910

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.03	0.20	0.11	0.08
C2	0.05	0.00	0.06	0.06	0.01	0.10	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.04	0.11	0.13	0.02	0.16	0.08	0.08
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.23	0.04	0.21	0.25	0.17
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.08	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.04	0.32	0.15	0.13
C4	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.06	0.17	0.02	0.15	0.15	0.12
C4'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.12	0.09	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.27	0.04	0.09
C5	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.24	0.02	0.15	0.23	0.17
C5'	0.03	0.13	0.06	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.18	0.15	0.15	0.12	0.19	0.10	0.06	0.02	0.02	0.01	0.17	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.04	0.07	0.22	0.00	0.15	0.20	0.16
C8	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.05	0.33	0.03	0.17	0.32	0.22
N1	0.05	0.01	0.05	0.04	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.04	0.09	0.16	0.01	0.15	0.13	0.12
N2	0.06	0.01	0.08	0.08	0.02	0.12	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.16	0.06	0.12	0.14	0.03	0.18	0.09	0.08
N3	0.05	0.01	0.06	0.05	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.11	0.12	0.02	0.16	0.08	0.08
N7	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.08	0.00	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.33	0.03	0.17	0.33	0.23
N9	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.02	0.20	0.02	0.16	0.20	0.14
O2'	0.03	0.13	0.00	0.02	0.07	0.02	0.06	0.06	0.08	0.08	0.11	0.16	0.12	0.07	0.03	0.00	0.04	0.02	0.25	0.09	0.26	0.31	0.20
O3'	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.04	0.00	0.06	0.05	0.04	0.45	0.08	0.12
O4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.07	0.05	0.09	0.12	0.11	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.06	0.19	0.04	0.06
O5'	0.12	0.13	0.23	0.12	0.17	0.03	0.24	0.01	0.22	0.33	0.16	0.14	0.12	0.33	0.20	0.25	0.05	0.03	0.00	0.25	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.07	0.02	0.17	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.04	0.06	0.25	0.00	0.16	0.24	0.18
OP1	0.20	0.16	0.21	0.32	0.15	0.27	0.15	0.05	0.15	0.17	0.15	0.18	0.16	0.17	0.16	0.26	0.45	0.19	0.03	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.08	0.25	0.15	0.15	0.04	0.23	0.02	0.20	0.32	0.13	0.09	0.08	0.33	0.20	0.31	0.08	0.04	0.02	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.08	0.17	0.13	0.12	0.09	0.17	0.02	0.16	0.22	0.12	0.08	0.08	0.23	0.14	0.20	0.12	0.06	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.12	0.12	0.16	0.14	0.22	0.12	0.24	0.19	0.20	0.14	0.13	0.24	0.14	0.18	0.18	0.12	0.13	0.29	0.37	0.21	0.10
C2	0.17	0.18	0.14	0.14	0.19	0.15	0.23	0.14	0.25	0.22	0.21	0.18	0.18	0.26	0.18	0.19	0.17	0.17	0.15	0.29	0.39	0.25	0.14
C2'	0.09	0.17	0.09	0.11	0.17	0.11	0.24	0.11	0.27	0.20	0.23	0.15	0.13	0.26	0.14	0.17	0.18	0.09	0.12	0.32	0.38	0.13	0.12
C3'	0.14	0.18	0.15	0.17	0.17	0.19	0.22	0.19	0.26	0.18	0.23	0.17	0.15	0.24	0.15	0.20	0.25	0.16	0.24	0.31	0.33	0.21	0.12
C4	0.15	0.17	0.14	0.14	0.17	0.14	0.22	0.13	0.23	0.21	0.19	0.16	0.16	0.24	0.17	0.19	0.16	0.16	0.14	0.27	0.39	0.25	0.14
C4'	0.20	0.18	0.19	0.20	0.18	0.23	0.21	0.23	0.23	0.19	0.21	0.18	0.18	0.22	0.18	0.24	0.26	0.22	0.29	0.28	0.28	0.31	0.15
C5	0.20	0.20	0.17	0.17	0.20	0.17	0.22	0.18	0.23	0.23	0.21	0.20	0.20	0.25	0.20	0.20	0.18	0.20	0.20	0.27	0.40	0.30	0.18
C5'	0.26	0.20	0.26	0.26	0.21	0.29	0.21	0.29	0.23	0.21	0.21	0.20	0.21	0.22	0.22	0.29	0.30	0.29	0.39	0.27	0.23	0.35	0.21
C6	0.22	0.22	0.19	0.19	0.22	0.20	0.24	0.20	0.24	0.24	0.22	0.24	0.22	0.26	0.22	0.21	0.21	0.22	0.23	0.27	0.40	0.31	0.19
C8	0.16	0.16	0.14	0.14	0.17	0.15	0.20	0.14	0.21	0.20	0.18	0.16	0.16	0.23	0.17	0.19	0.16	0.17	0.16	0.25	0.40	0.30	0.15
N1	0.20	0.21	0.17	0.17	0.21	0.18	0.23	0.17	0.25	0.23	0.22	0.22	0.21	0.26	0.21	0.20	0.19	0.21	0.19	0.28	0.39	0.29	0.17
N2	0.16	0.19	0.14	0.14	0.20	0.15	0.24	0.13	0.26	0.22	0.23	0.19	0.18	0.27	0.18	0.19	0.17	0.16	0.14	0.31	0.39	0.24	0.14
N3	0.15	0.17	0.13	0.13	0.18	0.14	0.23	0.12	0.25	0.21	0.21	0.17	0.16	0.26	0.17	0.19	0.16	0.15	0.13	0.30	0.39	0.24	0.13
N7	0.21	0.20	0.18	0.18	0.21	0.19	0.22	0.20	0.23	0.23	0.21	0.21	0.21	0.24	0.21	0.20	0.19	0.21	0.23	0.26	0.40	0.34	0.20
N9	0.13	0.15	0.13	0.13	0.16	0.13	0.20	0.11	0.22	0.19	0.18	0.14	0.14	0.23	0.15	0.18	0.16	0.14	0.12	0.27	0.39	0.24	0.12
O2'	0.12	0.22	0.13	0.14	0.22	0.12	0.29	0.12	0.32	0.26	0.28	0.20	0.19	0.32	0.19	0.18	0.19	0.11	0.09	0.37	0.43	0.11	0.17
O3'	0.14	0.19	0.14	0.16	0.17	0.17	0.23	0.18	0.27	0.18	0.24	0.18	0.16	0.24	0.15	0.19	0.24	0.16	0.22	0.32	0.34	0.18	0.10
O4'	0.16	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.22	0.19	0.24	0.20	0.21	0.17	0.17	0.24	0.17	0.22	0.22	0.17	0.21	0.28	0.34	0.31	0.15
O5'	0.42	0.30	0.44	0.46	0.32	0.46	0.28	0.46	0.26	0.34	0.27	0.30	0.33	0.28	0.36	0.45	0.51	0.46	0.55	0.27	0.40	0.40	0.40
O6	0.25	0.26	0.22	0.23	0.25	0.23	0.25	0.24	0.26	0.25	0.25	0.28	0.26	0.26	0.25	0.23	0.26	0.25	0.28	0.28	0.40	0.32	0.22
OP1	0.33	0.42	0.28	0.23	0.38	0.28	0.42	0.26	0.46	0.34	0.45	0.43	0.39	0.40	0.34	0.28	0.24	0.33	0.28	0.49	0.28	0.32	0.24
OP2	0.44	0.36	0.47	0.49	0.38	0.45	0.37	0.43	0.37	0.41	0.36	0.36	0.38	0.38	0.41	0.46	0.57	0.46	0.51	0.39	0.37	0.39	0.37
P	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.17	0.21	0.17	0.26	0.17	0.23	0.18	0.15	0.21	0.15	0.15	0.27	0.19	0.27	0.31	0.21	0.27	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.02	0.33	0.13	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.03	0.15	0.02	0.30	0.26	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.08	0.08	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.06	0.33	0.17	0.08
C3'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.14	0.01	0.18	0.02	0.18	0.16	0.15	0.12	0.12	0.19	0.12	0.01	0.01	0.02	0.03	0.20	0.28	0.22	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02	0.18	0.01	0.27	0.28	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.06	0.04	0.04	0.12	0.06	0.09	0.04	0.01	0.02	0.11	0.31	0.13	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.26	0.02	0.23	0.01	0.25	0.37	0.19
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.17	0.12	0.06	0.07	0.19	0.10	0.09	0.02	0.01	0.01	0.18	0.18	0.17	0.03
C6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.28	0.02	0.23	0.01	0.25	0.38	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.22	0.02	0.24	0.02	0.24	0.35	0.20
N1	0.02	0.01	0.06	0.15	0.02	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.24	0.03	0.19	0.02	0.27	0.32	0.15
N2	0.03	0.00	0.08	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.17	0.05	0.12	0.03	0.33	0.23	0.10
N3	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.03	0.13	0.02	0.32	0.22	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.28	0.02	0.26	0.02	0.23	0.42	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.17	0.02	0.27	0.25	0.13
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.07	0.09	0.05	0.09	0.07	0.04	0.11	0.17	0.13	0.04	0.02	0.00	0.13	0.09	0.12	0.06	0.38	0.17	0.14
O3'	0.03	0.19	0.05	0.01	0.18	0.04	0.26	0.02	0.28	0.22	0.24	0.17	0.15	0.28	0.13	0.13	0.00	0.04	0.09	0.32	0.31	0.25	0.10
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.09	0.04	0.00	0.10	0.02	0.32	0.09	0.12
O5'	0.09	0.15	0.04	0.03	0.18	0.02	0.23	0.01	0.23	0.24	0.19	0.12	0.13	0.26	0.17	0.12	0.09	0.10	0.00	0.27	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.20	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.32	0.02	0.27	0.00	0.25	0.43	0.23
OP1	0.33	0.30	0.33	0.28	0.27	0.31	0.25	0.18	0.25	0.24	0.27	0.33	0.32	0.23	0.27	0.38	0.31	0.32	0.02	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.26	0.17	0.22	0.28	0.13	0.37	0.17	0.38	0.35	0.32	0.23	0.22	0.42	0.25	0.17	0.25	0.09	0.02	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.08	0.06	0.14	0.09	0.19	0.03	0.20	0.20	0.15	0.10	0.11	0.23	0.13	0.14	0.10	0.12	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00