Doublet Group distance statistics: 49962

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.031 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.028, 0.046, 0.064, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.046 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.014, 0.035, 0.055, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.011, 0.035, 0.059, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.035 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.101, 0.168, 0.234, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.168 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.078, 0.169, 0.260, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.169 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.193, 0.325, 0.456, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.325 std_dev=0.132
C4'	A	0, 0.236, 0.390, 0.544, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.390 std_dev=0.154
O2'	A	0, 0.296, 0.487, 0.678, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.487 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.313, 0.518, 0.723, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.518 std_dev=0.205
P	B	0, 0.288, 0.499, 0.710, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.499 std_dev=0.211
O5'	B	0, 0.313, 0.557, 0.802, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.557 std_dev=0.244
C5'	A	0, 0.420, 0.694, 0.968, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.694 std_dev=0.274
OP2	B	0, 0.504, 0.836, 1.169, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.836 std_dev=0.333
C5'	B	0, 0.514, 0.895, 1.276, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.895 std_dev=0.381
OP1	B	0, 0.589, 1.009, 1.429, 1.451 max_d=1.451 avg_d=1.009 std_dev=0.420
OP1	A	0, 0.669, 1.106, 1.543, 1.473 max_d=1.473 avg_d=1.106 std_dev=0.437
C3'	B	0, 0.617, 1.091, 1.565, 1.566 max_d=1.566 avg_d=1.091 std_dev=0.474
O3'	B	0, 0.700, 1.177, 1.654, 1.619 max_d=1.619 avg_d=1.177 std_dev=0.477
P	A	0, 0.746, 1.235, 1.723, 1.647 max_d=1.647 avg_d=1.235 std_dev=0.488
O5'	A	0, 0.727, 1.221, 1.715, 1.677 max_d=1.677 avg_d=1.221 std_dev=0.494
C4'	B	0, 0.631, 1.131, 1.632, 1.600 max_d=1.600 avg_d=1.131 std_dev=0.500
C8	B	0, 0.726, 1.270, 1.813, 1.704 max_d=1.704 avg_d=1.270 std_dev=0.543
N7	B	0, 0.748, 1.325, 1.902, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.325 std_dev=0.577
O4'	B	0, 0.710, 1.309, 1.909, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.309 std_dev=0.600
N9	B	0, 0.771, 1.389, 2.007, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.389 std_dev=0.618
C2'	B	0, 0.868, 1.490, 2.111, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.490 std_dev=0.622
OP2	A	0, 0.872, 1.507, 2.141, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.507 std_dev=0.634
C1'	B	0, 0.805, 1.446, 2.088, 1.992 max_d=1.992 avg_d=1.446 std_dev=0.641
C5	B	0, 0.852, 1.526, 2.199, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.526 std_dev=0.674
C4	B	0, 0.868, 1.571, 2.273, 2.241 max_d=2.241 avg_d=1.571 std_dev=0.702
O6	B	0, 0.987, 1.740, 2.494, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.740 std_dev=0.754
C6	B	0, 0.975, 1.731, 2.486, 2.444 max_d=2.444 avg_d=1.731 std_dev=0.756
O2'	B	0, 1.185, 1.987, 2.789, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.987 std_dev=0.802
N3	B	0, 0.993, 1.801, 2.609, 2.623 max_d=2.623 avg_d=1.801 std_dev=0.808
N1	B	0, 1.122, 1.992, 2.862, 2.871 max_d=2.871 avg_d=1.992 std_dev=0.870
C2	B	0, 1.125, 2.021, 2.917, 2.945 max_d=2.945 avg_d=2.021 std_dev=0.896
N2	B	0, 1.286, 2.313, 3.341, 3.399 max_d=3.399 avg_d=2.313 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.09	0.02
C2	0.06	0.00	0.10	0.08	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.09	0.05	0.07	0.01	0.07	0.04	0.04
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.10	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.08	0.02
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.09	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03
C4	0.04	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02	0.04	0.01	0.11	0.06	0.02
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.07	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.07	0.01
C5	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02	0.06	0.01	0.18	0.09	0.05
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.06	0.06	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.01
C6	0.04	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.05	0.02	0.06	0.00	0.18	0.08	0.05
C8	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.20	0.10	0.07
N1	0.05	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.07	0.03	0.05	0.01	0.13	0.06	0.03
N2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.11	0.04	0.08	0.02	0.05	0.04	0.05
N3	0.06	0.01	0.10	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.15	0.09	0.05	0.08	0.01	0.05	0.04	0.05
N7	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.10	0.01	0.23	0.11	0.09
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.13	0.08	0.02
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.03	0.08	0.02	0.11	0.02	0.14	0.17	0.15	0.04	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.10	0.06	0.15	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.09	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.08	0.10	0.03
O5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.08	0.08	0.10	0.03	0.03	0.06	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00
O6	0.04	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.02	0.09	0.00	0.22	0.10	0.08
OP1	0.07	0.07	0.06	0.08	0.11	0.07	0.18	0.11	0.18	0.20	0.13	0.05	0.05	0.23	0.13	0.06	0.07	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.04	0.08	0.06	0.06	0.07	0.09	0.02	0.08	0.10	0.06	0.04	0.04	0.11	0.08	0.15	0.09	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.07	0.03	0.05	0.05	0.09	0.02	0.05	0.06	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.14	0.17	0.13	0.09	0.10	0.07	0.13	0.08	0.11	0.12	0.18	0.13	0.10	0.10	0.22	0.20	0.09	0.10	0.09	0.16	0.11	0.05
C2	0.08	0.13	0.17	0.13	0.08	0.07	0.08	0.12	0.10	0.10	0.12	0.17	0.11	0.11	0.07	0.22	0.23	0.08	0.08	0.12	0.13	0.11	0.07
C2'	0.08	0.13	0.14	0.08	0.07	0.08	0.05	0.17	0.07	0.09	0.10	0.17	0.12	0.09	0.06	0.18	0.14	0.08	0.04	0.07	0.21	0.15	0.11
C3'	0.05	0.12	0.12	0.06	0.06	0.08	0.05	0.21	0.07	0.08	0.10	0.16	0.10	0.08	0.03	0.17	0.12	0.08	0.02	0.08	0.29	0.18	0.17
C4	0.07	0.12	0.14	0.12	0.07	0.08	0.07	0.12	0.10	0.09	0.11	0.15	0.10	0.10	0.06	0.19	0.22	0.08	0.08	0.11	0.14	0.12	0.07
C4'	0.08	0.12	0.14	0.08	0.06	0.06	0.04	0.16	0.06	0.10	0.09	0.16	0.11	0.09	0.06	0.20	0.15	0.06	0.04	0.07	0.27	0.15	0.13
C5	0.05	0.11	0.09	0.08	0.08	0.07	0.11	0.14	0.13	0.11	0.13	0.13	0.09	0.13	0.07	0.14	0.19	0.11	0.06	0.15	0.13	0.15	0.10
C5'	0.06	0.12	0.13	0.07	0.05	0.07	0.05	0.18	0.07	0.09	0.10	0.15	0.10	0.09	0.03	0.20	0.17	0.06	0.06	0.09	0.33	0.19	0.19
C6	0.07	0.12	0.08	0.07	0.10	0.08	0.13	0.14	0.15	0.12	0.14	0.13	0.10	0.15	0.08	0.13	0.19	0.13	0.06	0.18	0.12	0.16	0.11
C8	0.05	0.11	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.13	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.11	0.05	0.14	0.19	0.10	0.07	0.13	0.15	0.15	0.08
N1	0.05	0.11	0.12	0.10	0.08	0.07	0.10	0.13	0.12	0.11	0.12	0.14	0.09	0.12	0.06	0.17	0.21	0.10	0.06	0.15	0.12	0.13	0.09
N2	0.09	0.14	0.18	0.14	0.08	0.07	0.08	0.12	0.10	0.10	0.13	0.19	0.13	0.10	0.08	0.23	0.23	0.07	0.08	0.11	0.13	0.11	0.07
N3	0.10	0.14	0.19	0.15	0.09	0.09	0.08	0.11	0.09	0.11	0.12	0.18	0.13	0.10	0.09	0.24	0.24	0.08	0.10	0.10	0.13	0.10	0.06
N7	0.07	0.12	0.06	0.06	0.10	0.08	0.13	0.14	0.15	0.12	0.14	0.13	0.10	0.14	0.09	0.11	0.17	0.13	0.06	0.17	0.13	0.18	0.11
N9	0.08	0.12	0.14	0.12	0.07	0.09	0.07	0.12	0.09	0.10	0.11	0.15	0.11	0.09	0.07	0.19	0.21	0.08	0.09	0.10	0.14	0.12	0.06
O2'	0.06	0.11	0.12	0.06	0.05	0.06	0.04	0.17	0.04	0.11	0.08	0.16	0.10	0.10	0.06	0.17	0.09	0.06	0.05	0.06	0.22	0.12	0.10
O3'	0.02	0.11	0.08	0.04	0.04	0.11	0.05	0.25	0.07	0.08	0.09	0.15	0.09	0.09	0.01	0.14	0.06	0.09	0.07	0.08	0.33	0.19	0.21
O4'	0.13	0.14	0.18	0.15	0.10	0.12	0.07	0.13	0.08	0.12	0.11	0.18	0.14	0.10	0.11	0.23	0.22	0.10	0.11	0.08	0.18	0.12	0.05
O5'	0.04	0.13	0.10	0.02	0.06	0.09	0.07	0.22	0.09	0.11	0.12	0.17	0.11	0.11	0.05	0.16	0.01	0.06	0.11	0.10	0.34	0.16	0.20
O6	0.11	0.15	0.05	0.05	0.14	0.10	0.17	0.16	0.19	0.16	0.17	0.14	0.12	0.19	0.13	0.11	0.17	0.17	0.08	0.22	0.13	0.19	0.13
OP1	0.05	0.13	0.14	0.03	0.06	0.10	0.09	0.23	0.10	0.13	0.11	0.17	0.12	0.14	0.05	0.20	0.00	0.07	0.22	0.12	0.40	0.21	0.28
OP2	0.23	0.18	0.25	0.08	0.12	0.12	0.12	0.04	0.16	0.15	0.18	0.22	0.17	0.13	0.15	0.41	0.01	0.19	0.06	0.18	0.21	0.10	0.09
P	0.10	0.14	0.15	0.02	0.08	0.02	0.09	0.12	0.11	0.12	0.13	0.17	0.12	0.12	0.08	0.22	0.01	0.04	0.07	0.12	0.25	0.11	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.05	0.04
C2	0.06	0.00	0.07	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.10	0.11	0.08	0.10	0.01	0.12	0.14	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.06	0.07	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.09	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.12	0.05	0.08	0.06	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.06	0.12	0.06
C4	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.10	0.01	0.10	0.12	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.11	0.01	0.12	0.16	0.11
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.15	0.09	0.07	0.07	0.15	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.13	0.09	0.05	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.05	0.12	0.00	0.14	0.18	0.13
C8	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.04	0.14	0.03	0.08	0.01	0.09	0.15	0.11
N1	0.05	0.01	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.10	0.06	0.12	0.01	0.14	0.16	0.12
N2	0.07	0.00	0.07	0.08	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.11	0.14	0.10	0.10	0.02	0.13	0.14	0.10
N3	0.05	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.10	0.07	0.09	0.01	0.11	0.12	0.08
N7	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.10	0.01	0.13	0.18	0.13
N9	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.08	0.02	0.07	0.10	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.04	0.09	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.10	0.04
O3'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.14	0.10	0.14	0.10	0.11	0.05	0.03	0.00	0.02	0.16	0.08	0.07	0.20	0.13
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.10	0.07	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.05	0.11	0.06	0.07
O5'	0.07	0.10	0.02	0.06	0.10	0.01	0.11	0.00	0.12	0.08	0.12	0.10	0.09	0.10	0.08	0.04	0.16	0.10	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.08	0.05	0.12	0.00	0.16	0.20	0.15
OP1	0.08	0.12	0.06	0.06	0.10	0.07	0.12	0.09	0.14	0.09	0.14	0.13	0.11	0.13	0.07	0.05	0.07	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.14	0.09	0.12	0.12	0.06	0.16	0.05	0.18	0.15	0.16	0.14	0.12	0.18	0.10	0.10	0.20	0.06	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.04	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.13	0.11	0.12	0.10	0.08	0.13	0.06	0.04	0.13	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00