Doublet Group distance statistics: 49966

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.015, 0.042, 0.069, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.042 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.024, 0.056, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.056 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.026, 0.064, 0.102, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.064 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.027, 0.065, 0.104, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.065 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.032, 0.073, 0.115, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.073 std_dev=0.042
C2	A	0, 0.011, 0.059, 0.108, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.059 std_dev=0.049
N3	A	0, 0.021, 0.070, 0.118, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.070 std_dev=0.049
O6	A	0, 0.019, 0.071, 0.123, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.071 std_dev=0.052
C1'	A	0, 0.016, 0.070, 0.124, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.070 std_dev=0.054
N2	A	0, 0.024, 0.102, 0.181, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.102 std_dev=0.079
N9	B	0, 0.155, 0.361, 0.567, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.361 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.147, 0.358, 0.570, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.358 std_dev=0.212
C1'	B	0, 0.191, 0.430, 0.670, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.430 std_dev=0.240
N3	B	0, 0.146, 0.422, 0.697, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.422 std_dev=0.276
O4'	B	0, 0.204, 0.482, 0.760, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.482 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.263, 0.585, 0.906, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.585 std_dev=0.322
C5	B	0, 0.237, 0.574, 0.911, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.574 std_dev=0.337
C8	B	0, 0.175, 0.522, 0.870, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.522 std_dev=0.348
P	B	0, 0.287, 0.639, 0.990, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.639 std_dev=0.351
C2'	B	0, 0.212, 0.600, 0.989, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.600 std_dev=0.388
OP1	B	0, 0.232, 0.630, 1.029, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.630 std_dev=0.398
N7	B	0, 0.299, 0.699, 1.100, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.699 std_dev=0.401
N1	B	0, 0.317, 0.718, 1.119, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.718 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.243, 0.646, 1.049, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.646 std_dev=0.403
C3'	B	0, 0.305, 0.709, 1.112, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.709 std_dev=0.403
N2	B	0, 0.388, 0.796, 1.204, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.796 std_dev=0.408
O4'	A	0, 0.387, 0.799, 1.210, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.799 std_dev=0.412
O2'	B	0, 0.354, 0.777, 1.201, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.777 std_dev=0.423
C6	B	0, 0.331, 0.776, 1.222, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.776 std_dev=0.445
P	A	0, 0.365, 0.848, 1.332, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.848 std_dev=0.484
O3'	B	0, 0.447, 0.935, 1.423, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.935 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.261, 0.766, 1.270, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.766 std_dev=0.505
O5'	B	0, 0.460, 0.969, 1.478, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.969 std_dev=0.509
C2'	A	0, 0.518, 1.044, 1.569, 1.381 max_d=1.381 avg_d=1.044 std_dev=0.525
O6	B	0, 0.481, 1.081, 1.680, 1.670 max_d=1.670 avg_d=1.081 std_dev=0.600
OP2	B	0, 0.108, 0.732, 1.355, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.732 std_dev=0.623
C4'	A	0, 0.664, 1.344, 2.024, 1.782 max_d=1.782 avg_d=1.344 std_dev=0.680
O5'	A	0, 0.481, 1.194, 1.907, 1.919 max_d=1.919 avg_d=1.194 std_dev=0.713
C3'	A	0, 0.710, 1.429, 2.148, 1.852 max_d=1.852 avg_d=1.429 std_dev=0.719
OP2	A	0, 0.511, 1.254, 1.997, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.254 std_dev=0.743
O2'	A	0, 0.784, 1.618, 2.452, 2.210 max_d=2.210 avg_d=1.618 std_dev=0.834
C5'	A	0, 0.920, 1.847, 2.774, 2.403 max_d=2.403 avg_d=1.847 std_dev=0.927
O3'	A	0, 0.937, 1.932, 2.927, 2.663 max_d=2.663 avg_d=1.932 std_dev=0.995
OP1	A	0, 0.890, 1.908, 2.927, 3.076 max_d=3.076 avg_d=1.908 std_dev=1.019

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.07	0.04	0.03	0.06	0.10	0.08	0.02	0.01	0.02	0.25	0.01	0.19	0.03	0.33	0.44	0.09
C2	0.09	0.00	0.17	0.19	0.02	0.12	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.39	0.13	0.12	0.02	0.25	0.51	0.07
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.04	0.04	0.17	0.07	0.09	0.12	0.21	0.17	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.33	0.06	0.29	0.55	0.25
C3'	0.04	0.19	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.01	0.18	0.15	0.18	0.22	0.18	0.17	0.11	0.02	0.02	0.02	0.22	0.19	0.35	0.38	0.25
C4	0.03	0.02	0.08	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.07	0.22	0.02	0.29	0.50	0.04
C4'	0.02	0.12	0.04	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.09	0.15	0.12	0.06	0.05	0.15	0.05	0.01	0.02	0.06	0.40	0.34	0.07
C5	0.02	0.02	0.04	0.16	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.18	0.03	0.32	0.02	0.29	0.51	0.05
C5'	0.07	0.14	0.17	0.01	0.11	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.12	0.16	0.14	0.09	0.09	0.11	0.11	0.01	0.00	0.07	0.39	0.44	0.01
C6	0.04	0.01	0.07	0.18	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.22	0.05	0.31	0.01	0.28	0.51	0.05
C8	0.03	0.03	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.19	0.08	0.05	0.40	0.03	0.29	0.52	0.07
N1	0.06	0.01	0.12	0.18	0.02	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.31	0.10	0.22	0.02	0.27	0.51	0.04
N2	0.10	0.01	0.21	0.22	0.03	0.15	0.02	0.16	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.10	0.46	0.16	0.06	0.03	0.23	0.51	0.10
N3	0.08	0.01	0.17	0.18	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.39	0.13	0.10	0.01	0.26	0.50	0.08
N7	0.02	0.02	0.06	0.17	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.20	0.11	0.03	0.43	0.03	0.29	0.52	0.08
N9	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.10	0.19	0.02	0.26	0.03	0.30	0.50	0.04
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.15	0.13	0.11	0.12	0.19	0.06	0.10	0.06	0.20	0.10	0.00	0.05	0.10	0.32	0.15	0.18	0.48	0.13
O3'	0.25	0.39	0.03	0.02	0.26	0.05	0.18	0.11	0.22	0.08	0.31	0.46	0.39	0.11	0.19	0.05	0.00	0.19	0.18	0.17	0.47	0.35	0.35
O4'	0.01	0.13	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.10	0.16	0.13	0.03	0.02	0.10	0.19	0.00	0.12	0.03	0.39	0.41	0.04
O5'	0.19	0.12	0.33	0.22	0.22	0.02	0.32	0.00	0.31	0.40	0.22	0.06	0.10	0.43	0.26	0.32	0.18	0.12	0.00	0.38	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.06	0.19	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.15	0.17	0.03	0.38	0.00	0.29	0.52	0.10
OP1	0.33	0.25	0.29	0.35	0.29	0.40	0.29	0.39	0.28	0.29	0.27	0.23	0.26	0.29	0.30	0.18	0.47	0.39	0.03	0.29	0.00	0.04	0.01
OP2	0.44	0.51	0.55	0.38	0.50	0.34	0.51	0.44	0.51	0.52	0.51	0.51	0.50	0.52	0.50	0.48	0.35	0.41	0.02	0.52	0.04	0.00	0.02
P	0.09	0.07	0.25	0.25	0.04	0.07	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.10	0.08	0.08	0.04	0.13	0.35	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.06	0.07	0.07	0.05	0.08	0.08	0.12	0.12	0.07	0.06	0.12	0.10	0.13	0.05	0.06	0.06	0.13	0.42	0.20	0.03	0.26	0.06
C2	0.09	0.03	0.07	0.07	0.05	0.06	0.13	0.11	0.17	0.11	0.10	0.07	0.05	0.18	0.05	0.11	0.10	0.12	0.27	0.25	0.07	0.21	0.10
C2'	0.27	0.27	0.24	0.23	0.26	0.24	0.26	0.24	0.29	0.23	0.28	0.28	0.27	0.25	0.25	0.24	0.22	0.27	0.49	0.34	0.21	0.31	0.20
C3'	0.23	0.19	0.17	0.13	0.18	0.19	0.16	0.09	0.16	0.18	0.16	0.23	0.22	0.19	0.19	0.17	0.14	0.22	0.61	0.20	0.24	0.28	0.27
C4	0.10	0.03	0.06	0.07	0.04	0.07	0.12	0.11	0.16	0.11	0.09	0.08	0.06	0.17	0.04	0.09	0.09	0.14	0.29	0.24	0.07	0.22	0.09
C4'	0.12	0.09	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.11	0.08	0.09	0.02	0.15	0.11	0.13	0.06	0.08	0.07	0.09	0.51	0.15	0.17	0.38	0.16
C5	0.12	0.04	0.07	0.06	0.03	0.11	0.10	0.15	0.14	0.09	0.07	0.10	0.08	0.16	0.05	0.07	0.08	0.18	0.23	0.23	0.07	0.17	0.09
C5'	0.12	0.09	0.09	0.10	0.06	0.10	0.10	0.19	0.12	0.12	0.05	0.16	0.11	0.17	0.06	0.14	0.15	0.08	0.47	0.18	0.23	0.53	0.20
C6	0.13	0.06	0.08	0.06	0.05	0.13	0.09	0.18	0.13	0.08	0.07	0.11	0.10	0.15	0.07	0.07	0.08	0.19	0.21	0.22	0.07	0.15	0.09
C8	0.12	0.04	0.07	0.06	0.03	0.11	0.11	0.13	0.15	0.10	0.08	0.09	0.08	0.17	0.05	0.07	0.08	0.17	0.27	0.23	0.07	0.22	0.09
N1	0.11	0.04	0.06	0.06	0.03	0.10	0.10	0.15	0.14	0.08	0.07	0.09	0.08	0.15	0.05	0.08	0.08	0.16	0.24	0.23	0.06	0.17	0.09
N2	0.08	0.04	0.07	0.08	0.06	0.04	0.14	0.10	0.18	0.12	0.12	0.05	0.05	0.19	0.05	0.13	0.11	0.10	0.27	0.27	0.07	0.22	0.10
N3	0.08	0.04	0.08	0.08	0.06	0.05	0.14	0.11	0.18	0.13	0.12	0.06	0.05	0.19	0.05	0.12	0.11	0.10	0.29	0.27	0.07	0.24	0.09
N7	0.14	0.05	0.08	0.07	0.04	0.14	0.10	0.18	0.14	0.09	0.07	0.11	0.10	0.16	0.06	0.08	0.09	0.20	0.22	0.23	0.08	0.17	0.10
N9	0.10	0.03	0.06	0.06	0.04	0.07	0.12	0.11	0.16	0.11	0.09	0.08	0.07	0.17	0.04	0.08	0.07	0.13	0.32	0.24	0.07	0.25	0.09
O2'	0.25	0.25	0.22	0.22	0.26	0.19	0.30	0.24	0.34	0.27	0.30	0.24	0.24	0.31	0.25	0.19	0.18	0.25	0.48	0.41	0.34	0.36	0.28
O3'	0.37	0.39	0.28	0.20	0.38	0.26	0.40	0.15	0.39	0.41	0.39	0.40	0.39	0.42	0.39	0.23	0.15	0.36	0.73	0.42	0.41	0.46	0.45
O4'	0.16	0.12	0.10	0.10	0.12	0.12	0.14	0.17	0.14	0.16	0.10	0.17	0.15	0.19	0.13	0.05	0.05	0.16	0.48	0.20	0.21	0.36	0.20
O5'	0.32	0.22	0.25	0.25	0.28	0.27	0.28	0.27	0.23	0.36	0.21	0.21	0.25	0.32	0.33	0.13	0.18	0.31	1.02	0.21	0.69	0.29	0.66
O6	0.17	0.11	0.11	0.09	0.09	0.19	0.10	0.24	0.13	0.09	0.08	0.16	0.14	0.15	0.11	0.08	0.09	0.24	0.17	0.22	0.10	0.12	0.09
OP1	0.09	0.15	0.10	0.12	0.16	0.09	0.26	0.11	0.31	0.22	0.26	0.10	0.10	0.29	0.13	0.10	0.19	0.09	0.56	0.39	0.20	0.52	0.22
OP2	0.34	0.26	0.38	0.48	0.31	0.45	0.34	0.65	0.31	0.43	0.27	0.26	0.28	0.42	0.36	0.34	0.48	0.39	0.35	0.33	0.58	0.84	0.59
P	0.13	0.08	0.10	0.10	0.11	0.10	0.14	0.19	0.13	0.18	0.10	0.09	0.10	0.19	0.13	0.07	0.09	0.13	0.55	0.17	0.23	0.44	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.03	0.46	0.12	0.13
C2	0.05	0.00	0.15	0.08	0.02	0.03	0.02	0.11	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.28	0.13	0.07	0.20	0.05	0.15	0.14	0.05
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.06	0.11	0.19	0.14	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.24	0.05	0.48	0.20	0.13
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.08	0.19	0.05	0.14	0.08	0.18	0.07	0.01	0.01	0.02	0.34	0.11	0.41	0.32	0.16
C4	0.02	0.02	0.07	0.03	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.02	0.04	0.25	0.01	0.21	0.09	0.03
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.06	0.06	0.03	0.14	0.05	0.08	0.03	0.00	0.01	0.12	0.45	0.27	0.09
C5	0.02	0.02	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.21	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.06	0.06	0.38	0.02	0.06	0.10	0.13
C5'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.13	0.01	0.21	0.00	0.22	0.22	0.18	0.07	0.08	0.26	0.12	0.07	0.06	0.01	0.01	0.28	0.36	0.39	0.01
C6	0.03	0.03	0.07	0.08	0.01	0.09	0.02	0.22	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.19	0.03	0.08	0.39	0.01	0.09	0.14	0.19
C8	0.04	0.02	0.06	0.19	0.01	0.13	0.01	0.22	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.19	0.02	0.44	0.04	0.18	0.05	0.08
N1	0.04	0.01	0.11	0.05	0.03	0.06	0.03	0.18	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.25	0.07	0.09	0.31	0.04	0.05	0.16	0.14
N2	0.07	0.00	0.19	0.14	0.02	0.06	0.03	0.07	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.34	0.22	0.07	0.14	0.07	0.18	0.14	0.02
N3	0.05	0.01	0.14	0.08	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.25	0.12	0.06	0.16	0.03	0.25	0.11	0.02
N7	0.03	0.03	0.03	0.18	0.02	0.14	0.01	0.26	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.48	0.04	0.07	0.07	0.18
N9	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.25	0.03	0.32	0.08	0.04
O2'	0.02	0.28	0.01	0.01	0.16	0.08	0.13	0.07	0.19	0.04	0.25	0.34	0.25	0.05	0.05	0.00	0.04	0.07	0.20	0.18	0.47	0.25	0.12
O3'	0.02	0.13	0.04	0.01	0.02	0.03	0.06	0.06	0.03	0.19	0.07	0.22	0.12	0.17	0.07	0.04	0.00	0.03	0.31	0.06	0.39	0.38	0.18
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.07	0.06	0.04	0.01	0.07	0.03	0.00	0.12	0.09	0.53	0.14	0.21
O5'	0.09	0.20	0.24	0.34	0.25	0.01	0.38	0.01	0.39	0.44	0.31	0.14	0.16	0.48	0.25	0.20	0.31	0.12	0.00	0.47	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.05	0.05	0.11	0.01	0.12	0.02	0.28	0.01	0.04	0.04	0.07	0.03	0.04	0.03	0.18	0.06	0.09	0.47	0.00	0.22	0.18	0.27
OP1	0.46	0.15	0.48	0.41	0.21	0.45	0.06	0.36	0.09	0.18	0.05	0.18	0.25	0.07	0.32	0.47	0.39	0.53	0.01	0.22	0.00	0.03	0.01
OP2	0.12	0.14	0.20	0.32	0.09	0.27	0.10	0.39	0.14	0.05	0.16	0.14	0.11	0.07	0.08	0.25	0.38	0.14	0.01	0.18	0.03	0.00	0.02
P	0.13	0.05	0.13	0.16	0.03	0.09	0.13	0.01	0.19	0.08	0.14	0.02	0.02	0.18	0.04	0.12	0.18	0.21	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00