Doublet Group distance statistics: 49969

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N9	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
O6	A	0, 0.000, 0.075, 0.151, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.075 std_dev=0.075
P	B	0, 0.000, 0.204, 0.408, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.204 std_dev=0.204
O5'	B	0, 0.000, 0.432, 0.865, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.432 std_dev=0.432
O4'	A	0, 0.000, 0.458, 0.917, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.458 std_dev=0.458
C5'	B	0, 0.000, 0.471, 0.943, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.471 std_dev=0.471
OP1	A	0, 0.000, 0.505, 1.010, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.505 std_dev=0.505
C2'	A	0, 0.000, 0.558, 1.116, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.558 std_dev=0.558
N7	B	0, 0.000, 0.632, 1.264, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.632 std_dev=0.632
C8	B	0, 0.000, 0.637, 1.274, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.637 std_dev=0.637
OP2	B	0, 0.000, 0.653, 1.306, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.653 std_dev=0.653
C3'	A	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C4'	A	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C4'	B	0, 0.000, 0.723, 1.447, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.723 std_dev=0.723
C5	B	0, 0.000, 0.748, 1.496, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.748 std_dev=0.748
O6	B	0, 0.000, 0.753, 1.505, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.753 std_dev=0.753
O4'	B	0, 0.000, 0.777, 1.554, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.777 std_dev=0.777
C6	B	0, 0.000, 0.799, 1.599, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.799 std_dev=0.799
N9	B	0, 0.000, 0.800, 1.600, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.800 std_dev=0.800
P	A	0, 0.000, 0.833, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.833 std_dev=0.833
C3'	B	0, 0.000, 0.866, 1.732, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.866 std_dev=0.866
C4	B	0, 0.000, 0.880, 1.759, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.880 std_dev=0.880
OP1	B	0, 0.000, 0.898, 1.795, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.898 std_dev=0.898
C5'	A	0, 0.000, 0.906, 1.811, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.906 std_dev=0.906
OP2	A	0, 0.000, 0.926, 1.851, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.926 std_dev=0.926
C1'	B	0, 0.000, 0.946, 1.892, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.946 std_dev=0.946
O5'	A	0, 0.000, 0.950, 1.901, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.950 std_dev=0.950
N1	B	0, 0.000, 0.960, 1.920, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.960 std_dev=0.960
O3'	A	0, 0.000, 1.003, 2.005, 2.005 max_d=2.005 avg_d=1.003 std_dev=1.003
O3'	B	0, 0.000, 1.029, 2.058, 2.058 max_d=2.058 avg_d=1.029 std_dev=1.029
C2'	B	0, 0.000, 1.035, 2.069, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.035 std_dev=1.035
N3	B	0, 0.000, 1.083, 2.166, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.083 std_dev=1.083
C2	B	0, 0.000, 1.106, 2.212, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.106 std_dev=1.106
O2'	A	0, 0.000, 1.114, 2.228, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.114 std_dev=1.114
O2'	B	0, 0.000, 1.276, 2.552, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.276 std_dev=1.276
N2	B	0, 0.000, 1.300, 2.599, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.300 std_dev=1.300

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.07
C2	0.01	0.00	0.19	0.08	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.31	0.15	0.09	0.03	0.02	0.07	0.09
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02	0.18	0.02	0.17	0.11	0.25	0.19	0.13	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.03	0.34	0.20	0.31
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.14	0.16	0.11	0.07	0.06	0.18	0.11	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.18	0.18	0.22
C4	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.21	0.09	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.11	0.05	0.10	0.08	0.09	0.03	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06
C5	0.02	0.01	0.02	0.15	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.28	0.12	0.04	0.00	0.02	0.08	0.03	0.01
C5'	0.07	0.12	0.18	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.05	0.10	0.14	0.12	0.04	0.03	0.04	0.20	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
C6	0.03	0.02	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.25	0.15	0.08	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01
C8	0.01	0.00	0.17	0.16	0.00	0.11	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.37	0.01	0.09	0.08	0.05	0.10	0.09	0.06
N1	0.02	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.24	0.13	0.07	0.02	0.04	0.04	0.05
N2	0.01	0.01	0.25	0.07	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.35	0.17	0.11	0.04	0.01	0.09	0.11
N3	0.01	0.00	0.19	0.06	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.33	0.15	0.09	0.02	0.00	0.07	0.10
N7	0.02	0.01	0.13	0.18	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.01	0.04	0.07	0.05	0.12	0.09	0.07
N9	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.15	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.22	0.28	0.04	0.25	0.37	0.12	0.15	0.06	0.39	0.18	0.00	0.01	0.15	0.18	0.33	0.16	0.10	0.08
O3'	0.26	0.31	0.03	0.00	0.21	0.02	0.12	0.20	0.15	0.01	0.24	0.35	0.33	0.01	0.15	0.01	0.00	0.16	0.19	0.12	0.08	0.12	0.08
O4'	0.00	0.15	0.02	0.00	0.09	0.00	0.04	0.02	0.08	0.09	0.13	0.17	0.15	0.04	0.01	0.15	0.16	0.00	0.05	0.07	0.15	0.09	0.05
O5'	0.00	0.09	0.12	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.07	0.11	0.09	0.07	0.01	0.18	0.19	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00
O6	0.04	0.03	0.03	0.15	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.33	0.12	0.07	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00
OP1	0.01	0.02	0.34	0.18	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.10	0.04	0.01	0.00	0.12	0.04	0.16	0.08	0.15	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.07	0.20	0.18	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.04	0.09	0.07	0.09	0.02	0.10	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.09	0.31	0.22	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.11	0.10	0.07	0.02	0.08	0.08	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.35	0.11	0.01	0.29	0.02	0.34	0.09	0.40	0.22	0.39	0.35	0.29	0.31	0.22	0.11	0.02	0.13	0.09	0.43	0.07	0.13	0.03
C2	0.16	0.01	0.23	0.27	0.07	0.22	0.01	0.24	0.07	0.08	0.05	0.01	0.07	0.02	0.11	0.23	0.28	0.14	0.20	0.15	0.31	0.01	0.03
C2'	0.52	0.49	0.45	0.37	0.52	0.40	0.50	0.29	0.45	0.52	0.45	0.48	0.51	0.52	0.52	0.47	0.35	0.50	0.29	0.36	0.41	0.11	0.43
C3'	0.01	0.07	0.05	0.11	0.02	0.09	0.03	0.17	0.07	0.02	0.08	0.08	0.04	0.00	0.01	0.03	0.12	0.02	0.16	0.07	0.18	0.36	0.02
C4	0.09	0.09	0.13	0.19	0.02	0.17	0.08	0.21	0.16	0.02	0.15	0.09	0.03	0.06	0.03	0.14	0.20	0.09	0.19	0.23	0.27	0.02	0.03
C4'	0.05	0.08	0.09	0.15	0.02	0.15	0.06	0.22	0.12	0.03	0.11	0.08	0.03	0.03	0.03	0.09	0.16	0.08	0.23	0.15	0.04	0.38	0.11
C5	0.19	0.03	0.23	0.27	0.09	0.23	0.03	0.24	0.05	0.11	0.03	0.03	0.09	0.03	0.14	0.23	0.26	0.17	0.22	0.12	0.35	0.04	0.05
C5'	0.09	0.00	0.10	0.13	0.03	0.15	0.00	0.19	0.05	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.14	0.11	0.22	0.07	0.18	0.38	0.10
C6	0.27	0.15	0.32	0.33	0.19	0.28	0.12	0.26	0.05	0.16	0.09	0.15	0.21	0.10	0.22	0.33	0.33	0.23	0.22	0.03	0.39	0.09	0.05
C8	0.02	0.14	0.05	0.11	0.09	0.11	0.14	0.18	0.19	0.03	0.18	0.14	0.09	0.12	0.03	0.05	0.10	0.05	0.18	0.22	0.27	0.04	0.03
N1	0.24	0.12	0.30	0.32	0.16	0.26	0.09	0.25	0.02	0.14	0.05	0.12	0.17	0.08	0.18	0.31	0.32	0.20	0.22	0.06	0.36	0.06	0.04
N2	0.16	0.02	0.23	0.28	0.07	0.23	0.01	0.25	0.06	0.08	0.04	0.01	0.08	0.02	0.11	0.24	0.30	0.15	0.21	0.14	0.30	0.01	0.04
N3	0.08	0.09	0.14	0.21	0.02	0.17	0.08	0.21	0.17	0.01	0.15	0.10	0.03	0.06	0.03	0.14	0.22	0.08	0.18	0.24	0.25	0.03	0.02
N7	0.17	0.00	0.19	0.23	0.06	0.22	0.00	0.24	0.06	0.11	0.05	0.00	0.06	0.02	0.12	0.20	0.21	0.17	0.23	0.11	0.37	0.04	0.06
N9	0.02	0.19	0.02	0.10	0.13	0.09	0.19	0.16	0.25	0.08	0.24	0.20	0.14	0.16	0.07	0.02	0.10	0.00	0.15	0.30	0.20	0.07	0.01
O2'	1.00	1.21	0.94	0.76	1.16	0.73	1.18	0.51	1.19	0.98	1.19	1.21	1.19	1.09	1.05	0.98	0.73	0.88	0.44	1.11	0.37	0.14	0.46
O3'	0.07	0.16	0.06	0.13	0.06	0.17	0.10	0.25	0.19	0.06	0.21	0.18	0.09	0.02	0.03	0.07	0.13	0.12	0.31	0.24	0.05	0.47	0.14
O4'	0.05	0.16	0.09	0.18	0.08	0.19	0.15	0.28	0.23	0.02	0.21	0.16	0.09	0.12	0.01	0.10	0.20	0.09	0.28	0.29	0.21	0.32	0.18
O5'	0.04	0.05	0.07	0.12	0.01	0.13	0.05	0.18	0.09	0.01	0.08	0.05	0.01	0.04	0.02	0.08	0.14	0.07	0.20	0.11	0.22	0.38	0.14
O6	0.33	0.26	0.40	0.38	0.27	0.31	0.18	0.25	0.13	0.20	0.18	0.27	0.30	0.14	0.27	0.41	0.37	0.27	0.21	0.05	0.42	0.16	0.03
OP1	0.12	0.19	0.05	0.04	0.16	0.03	0.19	0.13	0.22	0.15	0.21	0.18	0.16	0.19	0.14	0.04	0.10	0.08	0.10	0.23	0.32	0.31	0.14
OP2	0.06	0.16	0.01	0.07	0.12	0.07	0.14	0.15	0.18	0.08	0.18	0.16	0.12	0.13	0.08	0.01	0.11	0.02	0.15	0.20	0.32	0.37	0.15
P	0.04	0.16	0.00	0.08	0.12	0.09	0.16	0.17	0.20	0.09	0.19	0.15	0.12	0.15	0.08	0.02	0.12	0.00	0.18	0.22	0.30	0.40	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.07	0.00	0.17
C2	0.04	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.19
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.08	0.13
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.13	0.08
C4	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.19
C4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.08	0.08
C5	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.13	0.03	0.20
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.26	0.11	0.00
C6	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.00	0.13	0.02	0.20
C8	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.14	0.07	0.20
N1	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.20
N2	0.04	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.01	0.18
N3	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.17
N7	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.16	0.06	0.21
N9	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.18
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.05	0.11
O3'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.17	0.03
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.00	0.17
O5'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.15	0.03	0.20
OP1	0.07	0.07	0.09	0.22	0.09	0.12	0.13	0.26	0.13	0.14	0.10	0.04	0.05	0.16	0.09	0.08	0.32	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.00	0.00	0.08	0.13	0.02	0.08	0.03	0.11	0.02	0.07	0.00	0.01	0.00	0.06	0.03	0.05	0.17	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.19	0.13	0.08	0.19	0.08	0.20	0.00	0.20	0.20	0.20	0.18	0.17	0.21	0.18	0.11	0.03	0.17	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00