Doublet Group distance statistics: 49978

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 9, 21, 20, 12, 20, 11, 19, 3, 3, 6, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.020, 0.031, 0.042, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.031 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.019, 0.032, 0.046, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.032 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.030, 0.043, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.018, 0.033, 0.048, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.033 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.020, 0.043, 0.067, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.043 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N7	B	0, 0.207, 0.367, 0.527, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.367 std_dev=0.160
C5	B	0, 0.198, 0.397, 0.596, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.397 std_dev=0.199
C8	B	0, 0.188, 0.387, 0.587, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.387 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.298, 0.536, 0.774, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.536 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.048, 0.299, 0.549, 2.348 max_d=2.348 avg_d=0.299 std_dev=0.250
O4'	A	0, 0.022, 0.274, 0.526, 2.349 max_d=2.349 avg_d=0.274 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.196, 0.456, 0.716, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.456 std_dev=0.260
O6	B	0, 0.403, 0.667, 0.931, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.667 std_dev=0.264
N9	B	0, 0.206, 0.471, 0.735, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.471 std_dev=0.265
N1	B	0, 0.359, 0.651, 0.943, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.651 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.370, 0.689, 1.009, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.689 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.314, 0.634, 0.955, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.634 std_dev=0.321
C3'	A	0, 0.105, 0.449, 0.793, 3.124 max_d=3.124 avg_d=0.449 std_dev=0.344
O2'	A	0, 0.035, 0.385, 0.736, 3.239 max_d=3.239 avg_d=0.385 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.346, 0.700, 1.054, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.700 std_dev=0.354
C4'	A	0, 0.063, 0.438, 0.812, 3.392 max_d=3.392 avg_d=0.438 std_dev=0.374
O4'	B	0, 0.312, 0.690, 1.068, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.690 std_dev=0.378
N2	B	0, 0.488, 0.868, 1.248, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.868 std_dev=0.380
O3'	A	0, 0.226, 0.633, 1.041, 3.112 max_d=3.112 avg_d=0.633 std_dev=0.407
C3'	B	0, 0.504, 0.939, 1.375, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.939 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.406, 0.849, 1.291, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.849 std_dev=0.442
C2'	B	0, 0.457, 0.912, 1.367, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.912 std_dev=0.455
O5'	B	0, 0.347, 0.804, 1.262, 2.311 max_d=2.311 avg_d=0.804 std_dev=0.458
P	B	0, 0.275, 0.781, 1.288, 3.101 max_d=3.101 avg_d=0.781 std_dev=0.506
C5'	B	0, 0.349, 0.856, 1.364, 2.392 max_d=2.392 avg_d=0.856 std_dev=0.508
OP2	B	0, 0.214, 0.778, 1.342, 3.331 max_d=3.331 avg_d=0.778 std_dev=0.564
O3'	B	0, 0.692, 1.262, 1.831, 3.054 max_d=3.054 avg_d=1.262 std_dev=0.569
C5'	A	0, 0.196, 0.778, 1.360, 5.411 max_d=5.411 avg_d=0.778 std_dev=0.582
O2'	B	0, 0.597, 1.189, 1.780, 3.533 max_d=3.533 avg_d=1.189 std_dev=0.592
OP1	B	0, 0.410, 1.025, 1.639, 3.494 max_d=3.494 avg_d=1.025 std_dev=0.614
O5'	A	0, -0.017, 0.863, 1.744, 6.639 max_d=6.639 avg_d=0.863 std_dev=0.881
P	A	0, -0.065, 1.174, 2.413, 9.270 max_d=9.270 avg_d=1.174 std_dev=1.239
OP1	A	0, 0.073, 1.501, 2.929, 10.786 max_d=10.786 avg_d=1.501 std_dev=1.428
OP2	A	0, -0.188, 1.449, 3.085, 10.813 max_d=10.813 avg_d=1.449 std_dev=1.637

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.22	0.02	0.23	0.34	0.22
C2	0.03	0.00	0.16	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.14	0.35	0.01	0.44	0.63	0.43
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.02	0.06	0.07	0.09	0.08	0.13	0.19	0.15	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.08	0.25	0.27	0.16
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.16	0.15	0.15	0.15	0.12	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.26	0.17	0.33	0.23	0.20
C4	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.07	0.39	0.01	0.42	0.64	0.44
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.09	0.13	0.09	0.14	0.07	0.10	0.03	0.00	0.02	0.10	0.18	0.30	0.10
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.04	0.49	0.01	0.55	0.85	0.59
C5'	0.05	0.19	0.07	0.02	0.16	0.01	0.21	0.00	0.22	0.24	0.20	0.20	0.17	0.25	0.14	0.06	0.08	0.02	0.01	0.24	0.25	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.07	0.49	0.01	0.58	0.91	0.62
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.14	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.13	0.08	0.54	0.02	0.54	0.79	0.60
N1	0.02	0.00	0.13	0.15	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.11	0.42	0.01	0.52	0.78	0.53
N2	0.04	0.00	0.19	0.15	0.01	0.13	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.20	0.17	0.32	0.02	0.45	0.58	0.41
N3	0.03	0.01	0.15	0.12	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.14	0.32	0.01	0.39	0.55	0.37
N7	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.14	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05	0.57	0.02	0.64	0.97	0.70
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.38	0.02	0.37	0.56	0.40
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.08	0.10	0.09	0.06	0.10	0.16	0.13	0.23	0.17	0.15	0.07	0.00	0.05	0.08	0.10	0.11	0.24	0.37	0.17
O3'	0.10	0.16	0.02	0.01	0.10	0.03	0.12	0.08	0.14	0.13	0.15	0.20	0.15	0.15	0.07	0.05	0.00	0.07	0.30	0.16	0.44	0.40	0.28
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.07	0.08	0.11	0.17	0.14	0.05	0.01	0.08	0.07	0.00	0.22	0.05	0.25	0.37	0.23
O5'	0.22	0.35	0.18	0.26	0.39	0.02	0.49	0.01	0.49	0.54	0.42	0.32	0.32	0.57	0.38	0.10	0.30	0.22	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.16	0.05	0.54	0.00	0.67	1.04	0.70
OP1	0.23	0.44	0.25	0.33	0.42	0.18	0.55	0.25	0.58	0.54	0.52	0.45	0.39	0.64	0.37	0.24	0.44	0.25	0.02	0.67	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.63	0.27	0.23	0.64	0.30	0.85	0.27	0.91	0.79	0.78	0.58	0.55	0.97	0.56	0.37	0.40	0.37	0.02	1.04	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.43	0.16	0.20	0.44	0.10	0.59	0.02	0.62	0.60	0.53	0.41	0.37	0.70	0.40	0.17	0.28	0.23	0.01	0.70	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.26	0.18	0.17	0.21	0.20	0.23	0.32	0.27	0.18	0.27	0.28	0.24	0.23	0.18	0.29	0.18	0.21	0.33	0.30	0.36	0.48	0.39
C2	0.31	0.27	0.31	0.27	0.16	0.31	0.16	0.32	0.24	0.21	0.28	0.31	0.23	0.17	0.21	0.39	0.28	0.32	0.34	0.29	0.27	0.35	0.27
C2'	0.25	0.28	0.21	0.24	0.26	0.22	0.28	0.35	0.30	0.26	0.29	0.28	0.27	0.29	0.24	0.27	0.23	0.23	0.43	0.31	0.45	0.55	0.49
C3'	0.20	0.26	0.18	0.25	0.26	0.16	0.32	0.29	0.34	0.30	0.30	0.25	0.24	0.36	0.24	0.17	0.26	0.20	0.43	0.38	0.55	0.74	0.63
C4	0.24	0.25	0.21	0.19	0.17	0.22	0.19	0.26	0.26	0.17	0.27	0.27	0.21	0.19	0.17	0.29	0.18	0.24	0.32	0.30	0.26	0.38	0.28
C4'	0.17	0.21	0.12	0.20	0.19	0.14	0.25	0.32	0.28	0.22	0.25	0.22	0.19	0.29	0.16	0.20	0.22	0.16	0.39	0.33	0.60	0.75	0.63
C5	0.25	0.23	0.21	0.20	0.16	0.22	0.17	0.23	0.24	0.20	0.25	0.25	0.20	0.18	0.19	0.26	0.19	0.25	0.32	0.30	0.26	0.38	0.27
C5'	0.19	0.26	0.16	0.24	0.24	0.14	0.32	0.28	0.36	0.27	0.32	0.26	0.23	0.36	0.21	0.18	0.28	0.18	0.41	0.42	0.68	0.87	0.68
C6	0.28	0.23	0.26	0.24	0.18	0.25	0.15	0.24	0.21	0.24	0.24	0.26	0.21	0.20	0.23	0.30	0.22	0.27	0.35	0.28	0.27	0.37	0.26
C8	0.23	0.23	0.17	0.18	0.18	0.19	0.21	0.22	0.26	0.18	0.26	0.25	0.20	0.20	0.18	0.24	0.18	0.23	0.30	0.31	0.31	0.45	0.32
N1	0.31	0.24	0.30	0.27	0.18	0.29	0.14	0.28	0.22	0.24	0.25	0.29	0.23	0.18	0.24	0.36	0.26	0.31	0.35	0.28	0.26	0.35	0.26
N2	0.34	0.30	0.37	0.33	0.18	0.37	0.17	0.37	0.25	0.21	0.30	0.36	0.25	0.18	0.23	0.47	0.35	0.37	0.35	0.28	0.30	0.34	0.28
N3	0.27	0.27	0.26	0.23	0.17	0.28	0.19	0.33	0.26	0.18	0.28	0.30	0.23	0.19	0.17	0.35	0.23	0.28	0.33	0.29	0.28	0.36	0.29
N7	0.24	0.22	0.18	0.20	0.17	0.20	0.18	0.21	0.25	0.20	0.25	0.24	0.19	0.19	0.19	0.23	0.19	0.24	0.31	0.31	0.30	0.41	0.29
N9	0.23	0.25	0.18	0.16	0.19	0.19	0.21	0.25	0.27	0.17	0.27	0.26	0.22	0.21	0.17	0.27	0.16	0.22	0.31	0.31	0.30	0.43	0.32
O2'	0.29	0.31	0.26	0.26	0.29	0.29	0.29	0.47	0.30	0.27	0.31	0.33	0.31	0.30	0.27	0.34	0.27	0.27	0.44	0.32	0.46	0.47	0.46
O3'	0.20	0.23	0.19	0.27	0.23	0.15	0.28	0.30	0.30	0.27	0.26	0.22	0.21	0.32	0.22	0.19	0.29	0.21	0.42	0.34	0.65	0.76	0.72
O4'	0.24	0.25	0.19	0.18	0.20	0.19	0.21	0.31	0.26	0.17	0.26	0.28	0.24	0.22	0.17	0.30	0.20	0.21	0.32	0.30	0.45	0.59	0.48
O5'	0.39	0.51	0.37	0.41	0.50	0.32	0.59	0.37	0.62	0.54	0.57	0.49	0.47	0.63	0.46	0.34	0.41	0.37	0.56	0.69	0.76	1.02	0.78
O6	0.28	0.24	0.26	0.26	0.22	0.25	0.19	0.25	0.20	0.26	0.23	0.27	0.23	0.24	0.25	0.29	0.24	0.28	0.36	0.27	0.29	0.38	0.28
OP1	0.46	0.61	0.49	0.53	0.58	0.44	0.68	0.48	0.75	0.59	0.70	0.61	0.56	0.71	0.52	0.48	0.57	0.43	0.64	0.84	0.95	1.14	0.87
OP2	0.53	0.84	0.51	0.52	0.76	0.43	0.91	0.46	1.02	0.74	0.96	0.83	0.74	0.91	0.66	0.46	0.54	0.47	0.57	1.15	0.83	1.04	0.75
P	0.40	0.60	0.38	0.40	0.56	0.30	0.67	0.34	0.75	0.57	0.69	0.59	0.53	0.70	0.49	0.35	0.42	0.35	0.52	0.85	0.78	1.03	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.16	0.02	0.16	0.31	0.13
C2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.21	0.05	0.34	0.01	0.30	0.40	0.28
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.05	0.07	0.08	0.11	0.17	0.14	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.07	0.27	0.30	0.18
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.15	0.14	0.17	0.21	0.17	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.27	0.16	0.32	0.26	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.35	0.01	0.28	0.36	0.26
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.08	0.06	0.09	0.05	0.08	0.02	0.00	0.01	0.10	0.15	0.29	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.02	0.42	0.01	0.34	0.40	0.33
C5'	0.03	0.14	0.05	0.02	0.12	0.00	0.16	0.00	0.18	0.15	0.16	0.13	0.11	0.18	0.10	0.06	0.06	0.01	0.01	0.20	0.18	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.44	0.01	0.38	0.44	0.37
C8	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.04	0.41	0.02	0.30	0.34	0.29
N1	0.03	0.00	0.11	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.19	0.04	0.40	0.01	0.35	0.43	0.34
N2	0.05	0.01	0.17	0.21	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.26	0.06	0.32	0.02	0.30	0.40	0.28
N3	0.04	0.01	0.14	0.17	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.19	0.05	0.30	0.01	0.26	0.36	0.24
N7	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.04	0.46	0.02	0.36	0.39	0.36
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.31	0.01	0.24	0.32	0.21
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.08	0.08	0.06	0.10	0.08	0.12	0.16	0.12	0.09	0.05	0.00	0.05	0.06	0.10	0.11	0.21	0.31	0.13
O3'	0.06	0.21	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.06	0.16	0.15	0.19	0.26	0.19	0.15	0.07	0.05	0.00	0.05	0.27	0.18	0.40	0.32	0.28
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.06	0.05	0.00	0.13	0.03	0.16	0.37	0.17
O5'	0.16	0.34	0.22	0.27	0.35	0.01	0.42	0.01	0.44	0.41	0.40	0.32	0.30	0.46	0.31	0.10	0.27	0.13	0.00	0.47	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.18	0.03	0.47	0.00	0.42	0.47	0.41
OP1	0.16	0.30	0.27	0.32	0.28	0.15	0.34	0.18	0.38	0.30	0.35	0.30	0.26	0.36	0.24	0.21	0.40	0.16	0.02	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.40	0.30	0.26	0.36	0.29	0.40	0.29	0.44	0.34	0.43	0.40	0.36	0.39	0.32	0.31	0.32	0.37	0.02	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.28	0.18	0.21	0.26	0.06	0.33	0.02	0.37	0.29	0.34	0.28	0.24	0.36	0.21	0.13	0.28	0.17	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00