Doublet Group distance statistics: 49979

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 13, 24, 24, 11, 5, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.031 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.043 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.018, 0.054, 0.090, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.054 std_dev=0.036
C4	B	0, 0.281, 0.411, 0.542, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.411 std_dev=0.130
C5	B	0, 0.230, 0.378, 0.526, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.378 std_dev=0.148
N9	B	0, 0.383, 0.537, 0.691, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.537 std_dev=0.154
O4'	A	0, 0.026, 0.183, 0.340, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.183 std_dev=0.157
N3	B	0, 0.257, 0.434, 0.611, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.434 std_dev=0.177
C2	B	0, 0.258, 0.436, 0.615, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.436 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.225, 0.405, 0.585, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.405 std_dev=0.180
C2'	A	0, 0.067, 0.247, 0.428, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.247 std_dev=0.181
N1	B	0, 0.247, 0.433, 0.618, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.433 std_dev=0.185
C8	B	0, 0.345, 0.539, 0.732, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.539 std_dev=0.193
N7	B	0, 0.259, 0.457, 0.654, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.457 std_dev=0.198
O2'	A	0, 0.114, 0.335, 0.556, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.335 std_dev=0.221
O6	B	0, 0.274, 0.506, 0.738, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.506 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.477, 0.711, 0.944, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.711 std_dev=0.233
N2	B	0, 0.313, 0.553, 0.793, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.553 std_dev=0.240
C4'	A	0, 0.075, 0.315, 0.556, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.315 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.099, 0.375, 0.651, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.375 std_dev=0.276
C2'	B	0, 0.537, 0.821, 1.106, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.821 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.569, 0.863, 1.156, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.863 std_dev=0.294
O3'	A	0, 0.161, 0.553, 0.945, 2.007 max_d=2.007 avg_d=0.553 std_dev=0.392
O5'	B	0, 0.206, 0.628, 1.051, 3.317 max_d=3.317 avg_d=0.628 std_dev=0.422
C3'	B	0, 0.672, 1.108, 1.543, 2.589 max_d=2.589 avg_d=1.108 std_dev=0.436
C5'	A	0, 0.108, 0.557, 1.005, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.557 std_dev=0.448
O2'	B	0, 0.530, 0.994, 1.459, 2.320 max_d=2.320 avg_d=0.994 std_dev=0.465
C4'	B	0, 0.717, 1.204, 1.691, 2.654 max_d=2.654 avg_d=1.204 std_dev=0.487
OP2	B	0, 0.117, 0.620, 1.123, 3.250 max_d=3.250 avg_d=0.620 std_dev=0.503
O5'	A	0, 0.085, 0.632, 1.179, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.632 std_dev=0.547
P	B	0, -0.001, 0.576, 1.152, 4.670 max_d=4.670 avg_d=0.576 std_dev=0.576
P	A	0, 0.144, 0.763, 1.382, 3.858 max_d=3.858 avg_d=0.763 std_dev=0.619
O3'	B	0, 0.843, 1.488, 2.133, 3.961 max_d=3.961 avg_d=1.488 std_dev=0.645
C5'	B	0, 0.931, 1.611, 2.290, 3.282 max_d=3.282 avg_d=1.611 std_dev=0.680
OP1	A	0, 0.157, 0.891, 1.625, 4.005 max_d=4.005 avg_d=0.891 std_dev=0.734
OP1	B	0, -0.051, 0.731, 1.512, 6.438 max_d=6.438 avg_d=0.731 std_dev=0.781
OP2	A	0, 0.048, 0.887, 1.726, 6.665 max_d=6.665 avg_d=0.887 std_dev=0.839

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.18	0.02	0.18	0.29	0.16
C2	0.04	0.00	0.16	0.20	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.25	0.04	0.36	0.02	0.29	0.44	0.32
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.08	0.13	0.19	0.16	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.23	0.07	0.28	0.21	0.17
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.03	0.15	0.14	0.18	0.23	0.19	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.31	0.15	0.39	0.20	0.25
C4	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.39	0.01	0.29	0.45	0.33
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.10	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.10	0.18	0.28	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.48	0.01	0.38	0.58	0.44
C5'	0.03	0.14	0.03	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.17	0.14	0.12	0.19	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.21	0.21	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.19	0.04	0.50	0.01	0.41	0.63	0.47
C8	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.04	0.49	0.02	0.35	0.53	0.41
N1	0.03	0.01	0.13	0.18	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.23	0.04	0.44	0.01	0.36	0.55	0.40
N2	0.05	0.01	0.19	0.23	0.01	0.11	0.02	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.30	0.06	0.32	0.03	0.27	0.41	0.29
N3	0.04	0.01	0.16	0.19	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.22	0.04	0.32	0.02	0.25	0.39	0.27
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.54	0.02	0.43	0.65	0.50
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.36	0.02	0.26	0.40	0.29
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.13	0.19	0.14	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.08	0.08	0.24	0.25	0.14
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.14	0.03	0.15	0.05	0.19	0.17	0.23	0.30	0.22	0.17	0.08	0.06	0.00	0.02	0.29	0.19	0.48	0.29	0.30
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.14	0.04	0.18	0.35	0.19
O5'	0.18	0.36	0.23	0.31	0.39	0.02	0.48	0.01	0.50	0.49	0.44	0.32	0.32	0.54	0.36	0.08	0.29	0.14	0.00	0.55	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.19	0.04	0.55	0.00	0.47	0.71	0.53
OP1	0.18	0.29	0.28	0.39	0.29	0.18	0.38	0.21	0.41	0.35	0.36	0.27	0.25	0.43	0.26	0.24	0.48	0.18	0.02	0.47	0.00	0.02	0.01
OP2	0.29	0.44	0.21	0.20	0.45	0.28	0.58	0.34	0.63	0.53	0.55	0.41	0.39	0.65	0.40	0.25	0.29	0.35	0.02	0.71	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.32	0.17	0.25	0.33	0.08	0.44	0.02	0.47	0.41	0.40	0.29	0.27	0.50	0.29	0.14	0.30	0.19	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.17	0.21	0.18	0.15	0.22	0.21	0.33	0.24	0.22	0.20	0.20	0.17	0.28	0.15	0.35	0.21	0.20	0.37	0.31	0.35	0.36	0.38
C2	0.22	0.21	0.25	0.20	0.13	0.25	0.15	0.29	0.17	0.20	0.19	0.25	0.19	0.20	0.16	0.35	0.25	0.25	0.28	0.21	0.21	0.38	0.26
C2'	0.18	0.19	0.16	0.20	0.20	0.20	0.27	0.37	0.29	0.29	0.24	0.18	0.17	0.35	0.18	0.28	0.21	0.17	0.43	0.34	0.42	0.35	0.42
C3'	0.22	0.29	0.21	0.25	0.29	0.18	0.38	0.30	0.40	0.36	0.35	0.26	0.26	0.44	0.27	0.24	0.23	0.21	0.37	0.46	0.50	0.43	0.51
C4	0.23	0.18	0.22	0.16	0.13	0.19	0.17	0.24	0.21	0.18	0.19	0.21	0.17	0.22	0.14	0.33	0.18	0.20	0.27	0.27	0.17	0.36	0.25
C4'	0.19	0.23	0.18	0.23	0.24	0.18	0.34	0.34	0.37	0.32	0.30	0.22	0.21	0.41	0.22	0.26	0.23	0.18	0.36	0.44	0.57	0.51	0.55
C5	0.25	0.19	0.22	0.18	0.13	0.21	0.14	0.24	0.21	0.18	0.21	0.22	0.18	0.17	0.17	0.30	0.18	0.23	0.25	0.27	0.15	0.35	0.20
C5'	0.26	0.35	0.27	0.31	0.34	0.23	0.44	0.32	0.48	0.40	0.42	0.32	0.31	0.50	0.31	0.28	0.31	0.25	0.39	0.57	0.65	0.65	0.61
C6	0.23	0.21	0.22	0.18	0.14	0.19	0.11	0.22	0.17	0.19	0.20	0.24	0.19	0.17	0.17	0.28	0.18	0.20	0.25	0.23	0.19	0.36	0.19
C8	0.28	0.18	0.23	0.21	0.15	0.26	0.18	0.28	0.25	0.18	0.22	0.20	0.17	0.21	0.18	0.33	0.21	0.29	0.32	0.34	0.21	0.35	0.28
N1	0.21	0.21	0.24	0.18	0.13	0.19	0.13	0.22	0.17	0.16	0.19	0.25	0.20	0.17	0.15	0.31	0.21	0.20	0.25	0.21	0.20	0.37	0.22
N2	0.26	0.23	0.30	0.28	0.16	0.34	0.16	0.37	0.18	0.23	0.21	0.29	0.21	0.21	0.20	0.40	0.34	0.34	0.31	0.20	0.27	0.40	0.30
N3	0.21	0.19	0.24	0.19	0.13	0.24	0.17	0.32	0.19	0.22	0.18	0.23	0.18	0.24	0.14	0.35	0.23	0.22	0.29	0.23	0.23	0.38	0.29
N7	0.28	0.20	0.23	0.21	0.15	0.26	0.16	0.29	0.24	0.20	0.23	0.21	0.17	0.18	0.20	0.31	0.21	0.29	0.29	0.32	0.18	0.35	0.23
N9	0.25	0.18	0.22	0.17	0.14	0.22	0.19	0.26	0.24	0.19	0.20	0.20	0.17	0.24	0.15	0.34	0.19	0.23	0.32	0.31	0.23	0.35	0.30
O2'	0.25	0.22	0.26	0.31	0.23	0.32	0.27	0.53	0.27	0.32	0.23	0.23	0.22	0.34	0.24	0.38	0.33	0.26	0.50	0.32	0.53	0.34	0.47
O3'	0.28	0.35	0.31	0.37	0.36	0.25	0.44	0.39	0.46	0.44	0.41	0.32	0.32	0.50	0.35	0.28	0.35	0.27	0.41	0.52	0.64	0.44	0.61
O4'	0.20	0.18	0.17	0.17	0.16	0.17	0.25	0.31	0.28	0.24	0.23	0.20	0.17	0.32	0.15	0.31	0.18	0.18	0.34	0.37	0.44	0.44	0.45
O5'	0.43	0.51	0.41	0.41	0.49	0.37	0.56	0.37	0.60	0.49	0.57	0.51	0.48	0.58	0.46	0.42	0.41	0.42	0.51	0.67	0.56	0.64	0.57
O6	0.23	0.22	0.22	0.21	0.16	0.21	0.14	0.25	0.17	0.23	0.22	0.27	0.19	0.22	0.20	0.27	0.20	0.22	0.26	0.22	0.26	0.36	0.20
OP1	0.45	0.51	0.48	0.53	0.49	0.48	0.56	0.52	0.63	0.50	0.58	0.50	0.47	0.58	0.47	0.48	0.56	0.47	0.63	0.72	0.75	0.83	0.73
OP2	0.46	0.63	0.41	0.42	0.56	0.42	0.65	0.43	0.74	0.53	0.71	0.62	0.56	0.64	0.50	0.43	0.43	0.46	0.42	0.85	0.47	0.55	0.45
P	0.40	0.50	0.38	0.40	0.46	0.37	0.54	0.39	0.61	0.46	0.57	0.49	0.45	0.55	0.42	0.40	0.42	0.40	0.48	0.70	0.55	0.65	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.17	0.03	0.19	0.26	0.15
C2	0.05	0.00	0.16	0.19	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.05	0.37	0.02	0.45	0.46	0.37
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.06	0.09	0.08	0.13	0.19	0.15	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.27	0.08	0.30	0.27	0.24
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.04	0.18	0.15	0.19	0.22	0.17	0.16	0.10	0.02	0.01	0.02	0.33	0.18	0.35	0.19	0.26
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.37	0.02	0.42	0.44	0.36
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.08	0.09	0.07	0.13	0.06	0.10	0.03	0.01	0.02	0.12	0.15	0.26	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.03	0.46	0.02	0.53	0.55	0.46
C5'	0.05	0.17	0.06	0.04	0.17	0.01	0.24	0.00	0.25	0.24	0.21	0.15	0.14	0.27	0.15	0.07	0.08	0.02	0.01	0.29	0.20	0.36	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.18	0.01	0.10	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.14	0.18	0.04	0.48	0.01	0.59	0.59	0.50
C8	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.05	0.44	0.03	0.43	0.46	0.41
N1	0.04	0.01	0.13	0.19	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.04	0.44	0.01	0.54	0.55	0.45
N2	0.06	0.01	0.19	0.22	0.01	0.09	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.27	0.06	0.34	0.03	0.43	0.44	0.34
N3	0.05	0.01	0.15	0.17	0.00	0.07	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.05	0.33	0.02	0.38	0.40	0.31
N7	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.13	0.00	0.27	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.16	0.05	0.50	0.03	0.55	0.58	0.50
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.33	0.03	0.33	0.37	0.30
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.11	0.10	0.12	0.07	0.14	0.10	0.17	0.21	0.16	0.12	0.07	0.00	0.05	0.08	0.12	0.15	0.23	0.26	0.15
O3'	0.08	0.22	0.03	0.01	0.13	0.03	0.15	0.08	0.18	0.14	0.21	0.27	0.20	0.16	0.08	0.05	0.00	0.06	0.29	0.20	0.36	0.20	0.25
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.08	0.06	0.00	0.13	0.05	0.16	0.29	0.15
O5'	0.17	0.37	0.27	0.33	0.37	0.02	0.46	0.01	0.48	0.44	0.44	0.34	0.33	0.50	0.33	0.12	0.29	0.13	0.00	0.52	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.18	0.02	0.12	0.02	0.29	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.15	0.20	0.05	0.52	0.00	0.66	0.66	0.56
OP1	0.19	0.45	0.30	0.35	0.42	0.15	0.53	0.20	0.59	0.43	0.54	0.43	0.38	0.55	0.33	0.23	0.36	0.16	0.02	0.66	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.46	0.27	0.19	0.44	0.26	0.55	0.36	0.59	0.46	0.55	0.44	0.40	0.58	0.37	0.26	0.20	0.29	0.02	0.66	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.37	0.24	0.26	0.36	0.06	0.46	0.02	0.50	0.41	0.45	0.34	0.31	0.50	0.30	0.15	0.25	0.15	0.01	0.56	0.01	0.01	0.00