Doublet Group distance statistics: 49980

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 3, 8, 9, 14, 12, 10, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.029, 0.042, 0.055, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.042 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.031, 0.046, 0.060, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.046 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.037, 0.054, 0.070, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.054 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.050, 0.067, 0.084, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.067 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.053, 0.071, 0.090, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.071 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.048, 0.067, 0.086, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.067 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.055, 0.075, 0.095, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.075 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.029, 0.053, 0.076, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.053 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.040, 0.064, 0.088, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.064 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.047, 0.076, 0.105, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.076 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.096, 0.131, 0.166, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.131 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.134, 0.210, 0.286, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.210 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.147, 0.275, 0.402, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.275 std_dev=0.127
C4	B	0, 0.230, 0.381, 0.532, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.381 std_dev=0.151
N9	B	0, 0.218, 0.374, 0.531, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.374 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.389, 0.565, 0.741, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.565 std_dev=0.176
C8	B	0, 0.322, 0.504, 0.686, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.504 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.329, 0.513, 0.698, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.513 std_dev=0.184
O2'	A	0, 0.474, 0.669, 0.863, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.669 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.363, 0.559, 0.754, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.559 std_dev=0.195
C5	B	0, 0.260, 0.492, 0.723, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.492 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.294, 0.535, 0.776, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.535 std_dev=0.241
N7	B	0, 0.336, 0.585, 0.834, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.585 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.478, 0.729, 0.980, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.729 std_dev=0.251
O4'	B	0, 0.363, 0.624, 0.886, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.624 std_dev=0.261
O5'	A	0, 0.662, 0.949, 1.237, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.949 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.485, 0.784, 1.082, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.784 std_dev=0.298
O3'	A	0, 0.499, 0.806, 1.112, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.806 std_dev=0.307
C6	B	0, 0.393, 0.711, 1.029, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.711 std_dev=0.318
O5'	B	0, 0.506, 0.826, 1.146, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.826 std_dev=0.320
C5'	A	0, 0.633, 0.967, 1.300, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.967 std_dev=0.333
N2	B	0, 0.665, 1.000, 1.335, 1.527 max_d=1.527 avg_d=1.000 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.339, 0.680, 1.020, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.680 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.465, 0.811, 1.157, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.811 std_dev=0.346
P	B	0, 0.541, 0.896, 1.251, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.896 std_dev=0.355
OP2	B	0, 0.547, 0.904, 1.261, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.904 std_dev=0.357
C3'	B	0, 0.479, 0.853, 1.227, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.853 std_dev=0.374
C5'	B	0, 0.497, 0.875, 1.253, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.875 std_dev=0.378
O6	B	0, 0.540, 0.940, 1.340, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.940 std_dev=0.400
P	A	0, 1.002, 1.464, 1.926, 2.409 max_d=2.409 avg_d=1.464 std_dev=0.462
O2'	B	0, 0.433, 0.898, 1.364, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.898 std_dev=0.466
OP1	B	0, 0.621, 1.091, 1.560, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.091 std_dev=0.470
O3'	B	0, 0.616, 1.134, 1.651, 2.430 max_d=2.430 avg_d=1.134 std_dev=0.518
OP2	A	0, 1.095, 1.661, 2.227, 2.721 max_d=2.721 avg_d=1.661 std_dev=0.566
OP1	A	0, 1.164, 1.896, 2.628, 4.374 max_d=4.374 avg_d=1.896 std_dev=0.732

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.01	0.24	0.26	0.17
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.04	0.36	0.02	0.47	0.50	0.35
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.09	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.07	0.26	0.22	0.15
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.10	0.13	0.16	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.25	0.12	0.33	0.21	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.37	0.01	0.45	0.47	0.35
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.07	0.07	0.05	0.11	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.16	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.44	0.01	0.57	0.59	0.45
C5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.15	0.01	0.21	0.00	0.21	0.22	0.18	0.12	0.12	0.25	0.14	0.05	0.05	0.02	0.01	0.24	0.23	0.28	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.46	0.01	0.61	0.64	0.48
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.43	0.02	0.50	0.50	0.42
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.16	0.03	0.42	0.02	0.56	0.59	0.43
N2	0.05	0.01	0.14	0.16	0.02	0.07	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.21	0.05	0.33	0.02	0.44	0.48	0.32
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.04	0.32	0.02	0.40	0.43	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.48	0.02	0.61	0.63	0.50
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.34	0.01	0.38	0.39	0.30
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.03	0.12	0.17	0.13	0.04	0.03	0.00	0.05	0.06	0.06	0.09	0.18	0.18	0.07
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.14	0.11	0.16	0.21	0.15	0.12	0.06	0.05	0.00	0.02	0.23	0.15	0.38	0.25	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.17	0.03	0.21	0.27	0.18
O5'	0.20	0.36	0.19	0.25	0.37	0.02	0.44	0.01	0.46	0.43	0.42	0.33	0.32	0.48	0.34	0.06	0.23	0.17	0.00	0.49	0.03	0.03	0.01
O6	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.24	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.15	0.03	0.49	0.00	0.68	0.71	0.54
OP1	0.24	0.47	0.26	0.33	0.45	0.16	0.57	0.23	0.61	0.50	0.56	0.44	0.40	0.61	0.38	0.18	0.38	0.21	0.03	0.68	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.50	0.22	0.21	0.47	0.21	0.59	0.28	0.64	0.50	0.59	0.48	0.43	0.63	0.39	0.18	0.25	0.27	0.03	0.71	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.35	0.15	0.20	0.35	0.05	0.45	0.02	0.48	0.42	0.43	0.32	0.30	0.50	0.30	0.07	0.22	0.18	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.29	0.20	0.18	0.24	0.18	0.26	0.22	0.30	0.21	0.30	0.31	0.27	0.25	0.21	0.26	0.17	0.22	0.15	0.33	0.05	0.12	0.05
C2	0.25	0.29	0.25	0.21	0.14	0.22	0.13	0.23	0.20	0.23	0.27	0.35	0.24	0.20	0.18	0.31	0.25	0.22	0.24	0.24	0.21	0.28	0.21
C2'	0.20	0.22	0.17	0.17	0.20	0.16	0.22	0.21	0.24	0.20	0.24	0.23	0.21	0.23	0.19	0.22	0.16	0.20	0.16	0.27	0.09	0.15	0.09
C3'	0.18	0.21	0.15	0.17	0.20	0.13	0.23	0.17	0.25	0.20	0.24	0.21	0.19	0.25	0.18	0.17	0.17	0.19	0.07	0.29	0.03	0.07	0.02
C4	0.21	0.31	0.19	0.16	0.21	0.16	0.22	0.18	0.29	0.19	0.32	0.34	0.27	0.20	0.17	0.24	0.13	0.19	0.18	0.32	0.12	0.21	0.13
C4'	0.19	0.23	0.15	0.15	0.20	0.13	0.24	0.19	0.28	0.20	0.27	0.24	0.21	0.26	0.18	0.19	0.15	0.19	0.06	0.33	0.07	0.12	0.05
C5	0.20	0.31	0.17	0.18	0.20	0.15	0.21	0.18	0.30	0.20	0.33	0.35	0.25	0.20	0.17	0.21	0.13	0.18	0.20	0.34	0.16	0.25	0.16
C5'	0.20	0.30	0.19	0.19	0.26	0.14	0.32	0.18	0.37	0.26	0.35	0.29	0.26	0.33	0.23	0.19	0.20	0.19	0.09	0.43	0.17	0.24	0.14
C6	0.20	0.29	0.19	0.20	0.16	0.17	0.15	0.19	0.25	0.23	0.31	0.35	0.23	0.22	0.17	0.23	0.16	0.19	0.23	0.31	0.20	0.29	0.20
C8	0.22	0.32	0.19	0.21	0.24	0.18	0.27	0.20	0.34	0.21	0.35	0.34	0.27	0.25	0.21	0.21	0.18	0.21	0.18	0.39	0.14	0.20	0.14
N1	0.23	0.29	0.23	0.21	0.14	0.20	0.13	0.21	0.20	0.25	0.28	0.36	0.23	0.24	0.19	0.27	0.21	0.21	0.25	0.26	0.21	0.30	0.21
N2	0.29	0.27	0.33	0.28	0.13	0.27	0.13	0.27	0.17	0.24	0.23	0.35	0.24	0.21	0.21	0.39	0.36	0.27	0.28	0.22	0.25	0.30	0.24
N3	0.23	0.30	0.22	0.18	0.19	0.19	0.18	0.21	0.25	0.19	0.29	0.34	0.26	0.18	0.16	0.29	0.20	0.20	0.21	0.27	0.17	0.23	0.17
N7	0.20	0.31	0.17	0.21	0.22	0.16	0.24	0.19	0.33	0.20	0.35	0.34	0.26	0.21	0.18	0.20	0.17	0.19	0.20	0.38	0.17	0.25	0.17
N9	0.22	0.31	0.19	0.18	0.24	0.17	0.26	0.19	0.32	0.20	0.33	0.33	0.27	0.24	0.20	0.23	0.15	0.20	0.15	0.35	0.08	0.16	0.09
O2'	0.26	0.26	0.24	0.21	0.24	0.23	0.25	0.25	0.26	0.23	0.26	0.28	0.26	0.25	0.23	0.30	0.23	0.25	0.24	0.28	0.14	0.17	0.14
O3'	0.17	0.18	0.15	0.17	0.18	0.13	0.21	0.17	0.23	0.20	0.20	0.17	0.17	0.23	0.17	0.17	0.21	0.19	0.03	0.26	0.03	0.02	0.01
O4'	0.22	0.28	0.17	0.16	0.23	0.16	0.26	0.20	0.31	0.20	0.31	0.30	0.25	0.25	0.20	0.23	0.15	0.20	0.10	0.35	0.05	0.11	0.03
O5'	0.38	0.53	0.36	0.39	0.50	0.28	0.56	0.27	0.61	0.48	0.58	0.53	0.49	0.56	0.45	0.33	0.38	0.34	0.33	0.67	0.32	0.49	0.34
O6	0.20	0.28	0.19	0.22	0.15	0.18	0.15	0.20	0.22	0.24	0.29	0.35	0.21	0.24	0.18	0.22	0.18	0.20	0.25	0.30	0.24	0.32	0.23
OP1	0.54	0.71	0.58	0.61	0.67	0.48	0.74	0.48	0.81	0.65	0.78	0.70	0.66	0.74	0.61	0.52	0.64	0.48	0.56	0.88	0.62	0.80	0.60
OP2	0.50	0.72	0.51	0.55	0.65	0.40	0.73	0.35	0.80	0.60	0.78	0.72	0.65	0.71	0.58	0.46	0.57	0.43	0.43	0.88	0.41	0.59	0.41
P	0.39	0.56	0.40	0.43	0.51	0.30	0.59	0.29	0.65	0.50	0.62	0.55	0.50	0.59	0.46	0.35	0.45	0.34	0.37	0.72	0.39	0.58	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.09	0.02	0.10	0.22	0.11
C2	0.04	0.00	0.16	0.19	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.23	0.04	0.19	0.02	0.19	0.25	0.18
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.08	0.08	0.08	0.13	0.20	0.16	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.15	0.07	0.18	0.21	0.14
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.02	0.17	0.17	0.18	0.22	0.17	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.17	0.18	0.19	0.13	0.13
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.02	0.19	0.02	0.17	0.24	0.16
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.07	0.11	0.08	0.09	0.05	0.14	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.14	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.16	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.03	0.25	0.02	0.21	0.27	0.21
C5'	0.03	0.09	0.08	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.10	0.11	0.08	0.14	0.07	0.07	0.09	0.01	0.01	0.13	0.08	0.13	0.01
C6	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.19	0.15	0.03	0.26	0.01	0.24	0.29	0.23
C8	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.25	0.03	0.19	0.23	0.18
N1	0.03	0.01	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.19	0.03	0.23	0.02	0.22	0.28	0.21
N2	0.05	0.01	0.20	0.22	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.30	0.05	0.18	0.04	0.19	0.26	0.17
N3	0.04	0.01	0.16	0.17	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.04	0.17	0.02	0.16	0.24	0.15
N7	0.02	0.02	0.06	0.18	0.01	0.09	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.04	0.28	0.03	0.23	0.27	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.17	0.02	0.13	0.22	0.13
O2'	0.03	0.21	0.00	0.02	0.15	0.14	0.16	0.07	0.19	0.11	0.21	0.23	0.19	0.15	0.09	0.00	0.07	0.11	0.12	0.20	0.16	0.20	0.11
O3'	0.11	0.23	0.03	0.01	0.12	0.02	0.12	0.09	0.15	0.15	0.19	0.30	0.22	0.15	0.06	0.07	0.00	0.08	0.21	0.16	0.34	0.24	0.24
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.11	0.08	0.00	0.10	0.04	0.10	0.25	0.14
O5'	0.09	0.19	0.15	0.17	0.19	0.02	0.25	0.01	0.26	0.25	0.23	0.18	0.17	0.28	0.17	0.12	0.21	0.10	0.00	0.28	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.18	0.02	0.08	0.02	0.13	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.20	0.16	0.04	0.28	0.00	0.27	0.32	0.26
OP1	0.10	0.19	0.18	0.19	0.17	0.08	0.21	0.08	0.24	0.19	0.22	0.19	0.16	0.23	0.13	0.16	0.34	0.10	0.03	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.25	0.21	0.13	0.24	0.14	0.27	0.13	0.29	0.23	0.28	0.26	0.24	0.27	0.22	0.20	0.24	0.25	0.02	0.32	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.14	0.13	0.16	0.03	0.21	0.01	0.23	0.18	0.21	0.17	0.15	0.23	0.13	0.11	0.24	0.14	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00