Doublet Group distance statistics: 49981

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 11, 16, 9, 4, 0, 4, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C4	B	0, 0.219, 0.350, 0.481, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.350 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.024, 0.162, 0.299, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.162 std_dev=0.137
N9	B	0, 0.166, 0.311, 0.456, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.311 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.030, 0.189, 0.347, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.189 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.180, 0.341, 0.502, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.341 std_dev=0.161
C8	B	0, 0.117, 0.315, 0.512, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.315 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.144, 0.342, 0.540, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.342 std_dev=0.198
O2'	A	0, 0.066, 0.265, 0.463, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.265 std_dev=0.198
C4'	A	0, 0.068, 0.269, 0.469, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.269 std_dev=0.201
C1'	B	0, 0.224, 0.463, 0.703, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.463 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.046, 0.295, 0.545, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.295 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.260, 0.516, 0.772, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.516 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.239, 0.506, 0.774, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.506 std_dev=0.268
O4'	B	0, 0.254, 0.550, 0.846, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.550 std_dev=0.296
C2'	B	0, 0.245, 0.554, 0.863, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.554 std_dev=0.309
C2	B	0, 0.301, 0.629, 0.958, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.629 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.289, 0.620, 0.950, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.620 std_dev=0.330
C4'	B	0, 0.264, 0.606, 0.948, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.606 std_dev=0.342
C5'	A	0, 0.115, 0.469, 0.824, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.469 std_dev=0.354
O6	B	0, 0.279, 0.634, 0.990, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.634 std_dev=0.356
O3'	A	0, 0.088, 0.449, 0.810, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.449 std_dev=0.361
C3'	B	0, 0.260, 0.621, 0.983, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.621 std_dev=0.362
C5'	B	0, 0.274, 0.660, 1.046, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.660 std_dev=0.386
O5'	B	0, 0.232, 0.631, 1.030, 2.165 max_d=2.165 avg_d=0.631 std_dev=0.399
O2'	B	0, 0.299, 0.699, 1.100, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.699 std_dev=0.401
P	B	0, 0.204, 0.615, 1.026, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.615 std_dev=0.411
OP2	B	0, 0.235, 0.668, 1.101, 2.123 max_d=2.123 avg_d=0.668 std_dev=0.433
N2	B	0, 0.392, 0.841, 1.289, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.841 std_dev=0.448
O3'	B	0, 0.306, 0.785, 1.264, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.785 std_dev=0.479
OP1	B	0, 0.297, 0.788, 1.279, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.788 std_dev=0.491
O5'	A	0, 0.132, 0.812, 1.491, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.812 std_dev=0.679
P	A	0, 0.213, 1.020, 1.826, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.020 std_dev=0.806
OP2	A	0, 0.259, 1.218, 2.178, 3.882 max_d=3.882 avg_d=1.218 std_dev=0.959
OP1	A	0, 0.314, 1.399, 2.485, 4.190 max_d=4.190 avg_d=1.399 std_dev=1.086

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.02	0.25	0.28	0.15
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.03	0.47	0.02	0.63	0.56	0.44
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.07	0.08	0.13	0.11	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.27	0.05	0.32	0.24	0.20
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.09	0.13	0.10	0.16	0.12	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.35	0.09	0.41	0.23	0.27
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.48	0.01	0.60	0.54	0.43
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.08	0.22	0.27	0.06
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.60	0.01	0.79	0.70	0.58
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.13	0.10	0.18	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.19	0.28	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.63	0.01	0.87	0.77	0.63
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.05	0.58	0.02	0.67	0.59	0.52
N1	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.56	0.01	0.78	0.69	0.55
N2	0.05	0.01	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.20	0.04	0.42	0.02	0.59	0.52	0.39
N3	0.04	0.01	0.11	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.03	0.40	0.02	0.53	0.47	0.36
N7	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.66	0.02	0.85	0.76	0.64
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.43	0.02	0.49	0.44	0.36
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.11	0.16	0.12	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.09	0.08	0.26	0.17	0.09
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.10	0.15	0.12	0.20	0.14	0.14	0.06	0.04	0.00	0.02	0.29	0.11	0.49	0.25	0.27
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.04	0.18	0.32	0.14
O5'	0.20	0.47	0.27	0.35	0.48	0.02	0.60	0.01	0.63	0.58	0.56	0.42	0.40	0.66	0.43	0.09	0.29	0.11	0.00	0.68	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.11	0.04	0.68	0.00	0.98	0.87	0.71
OP1	0.25	0.63	0.32	0.41	0.60	0.22	0.79	0.28	0.87	0.67	0.78	0.59	0.53	0.85	0.49	0.26	0.49	0.18	0.02	0.98	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.56	0.24	0.23	0.54	0.27	0.70	0.37	0.77	0.59	0.69	0.52	0.47	0.76	0.44	0.17	0.25	0.32	0.02	0.87	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.44	0.20	0.27	0.43	0.06	0.58	0.02	0.63	0.52	0.55	0.39	0.36	0.64	0.36	0.09	0.27	0.14	0.01	0.71	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.15	0.20	0.17	0.12	0.22	0.13	0.24	0.16	0.14	0.15	0.18	0.16	0.17	0.14	0.28	0.19	0.24	0.21	0.20	0.06	0.11	0.07
C2	0.20	0.20	0.22	0.16	0.11	0.18	0.14	0.23	0.18	0.15	0.19	0.23	0.18	0.17	0.12	0.30	0.18	0.18	0.20	0.22	0.14	0.22	0.14
C2'	0.18	0.14	0.16	0.16	0.13	0.19	0.16	0.23	0.17	0.15	0.16	0.15	0.14	0.19	0.12	0.22	0.18	0.20	0.23	0.21	0.11	0.13	0.12
C3'	0.13	0.17	0.11	0.13	0.16	0.12	0.21	0.18	0.24	0.19	0.21	0.15	0.14	0.25	0.14	0.14	0.16	0.16	0.08	0.28	0.02	0.07	0.02
C4	0.22	0.16	0.19	0.14	0.12	0.18	0.12	0.22	0.15	0.16	0.15	0.19	0.16	0.17	0.14	0.26	0.15	0.21	0.21	0.19	0.10	0.19	0.11
C4'	0.14	0.16	0.10	0.13	0.15	0.13	0.22	0.19	0.26	0.19	0.22	0.16	0.13	0.26	0.12	0.16	0.16	0.17	0.07	0.32	0.10	0.16	0.07
C5	0.21	0.17	0.19	0.16	0.13	0.18	0.12	0.24	0.15	0.19	0.16	0.20	0.16	0.19	0.17	0.24	0.16	0.21	0.24	0.20	0.16	0.24	0.17
C5'	0.17	0.29	0.18	0.20	0.27	0.14	0.35	0.19	0.41	0.29	0.36	0.28	0.24	0.38	0.22	0.16	0.23	0.17	0.11	0.48	0.20	0.31	0.17
C6	0.21	0.18	0.20	0.16	0.14	0.17	0.13	0.24	0.14	0.20	0.16	0.22	0.18	0.21	0.17	0.25	0.16	0.20	0.24	0.21	0.17	0.25	0.17
C8	0.22	0.16	0.19	0.18	0.13	0.21	0.13	0.26	0.17	0.18	0.17	0.18	0.15	0.16	0.16	0.24	0.19	0.25	0.27	0.23	0.19	0.24	0.20
N1	0.20	0.18	0.21	0.16	0.11	0.17	0.13	0.24	0.18	0.17	0.17	0.22	0.18	0.19	0.15	0.28	0.17	0.19	0.21	0.24	0.15	0.23	0.15
N2	0.20	0.25	0.26	0.21	0.13	0.22	0.17	0.25	0.22	0.15	0.25	0.29	0.21	0.17	0.12	0.34	0.24	0.21	0.21	0.24	0.18	0.24	0.18
N3	0.21	0.18	0.21	0.14	0.12	0.17	0.13	0.22	0.16	0.15	0.17	0.21	0.18	0.17	0.12	0.29	0.16	0.18	0.19	0.20	0.11	0.19	0.12
N7	0.22	0.18	0.19	0.18	0.14	0.20	0.13	0.26	0.17	0.20	0.18	0.20	0.17	0.18	0.17	0.23	0.18	0.24	0.28	0.22	0.21	0.28	0.22
N9	0.22	0.15	0.19	0.16	0.12	0.20	0.12	0.24	0.16	0.15	0.15	0.17	0.15	0.16	0.15	0.25	0.17	0.24	0.22	0.21	0.10	0.17	0.12
O2'	0.28	0.23	0.28	0.27	0.21	0.29	0.20	0.31	0.20	0.20	0.21	0.24	0.24	0.21	0.22	0.35	0.29	0.28	0.29	0.22	0.16	0.14	0.15
O3'	0.13	0.16	0.13	0.16	0.16	0.13	0.21	0.17	0.23	0.19	0.20	0.14	0.14	0.24	0.14	0.14	0.20	0.16	0.02	0.28	0.02	0.03	0.01
O4'	0.19	0.15	0.14	0.13	0.12	0.17	0.16	0.21	0.20	0.14	0.17	0.16	0.13	0.20	0.11	0.23	0.15	0.21	0.13	0.26	0.05	0.13	0.03
O5'	0.54	0.64	0.50	0.46	0.63	0.40	0.69	0.34	0.72	0.64	0.69	0.63	0.61	0.71	0.60	0.49	0.43	0.50	0.46	0.77	0.31	0.53	0.39
O6	0.21	0.21	0.20	0.18	0.16	0.18	0.16	0.26	0.16	0.22	0.18	0.25	0.20	0.23	0.19	0.25	0.18	0.20	0.26	0.23	0.20	0.28	0.20
OP1	0.66	0.93	0.66	0.62	0.85	0.51	0.96	0.48	1.06	0.81	1.02	0.92	0.84	0.95	0.76	0.61	0.60	0.58	0.60	1.16	0.61	0.75	0.60
OP2	0.58	0.76	0.57	0.53	0.71	0.43	0.78	0.37	0.84	0.68	0.82	0.76	0.70	0.77	0.65	0.53	0.52	0.51	0.44	0.91	0.42	0.54	0.40
P	0.51	0.67	0.50	0.47	0.64	0.38	0.71	0.32	0.77	0.63	0.73	0.66	0.62	0.72	0.58	0.47	0.45	0.46	0.44	0.84	0.34	0.56	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.20	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.05	0.18	0.02	0.19	0.30	0.18
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.07	0.05	0.10	0.14	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.06	0.15	0.17	0.09
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.13	0.10	0.14	0.17	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.16	0.14	0.18	0.16	0.12
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.18	0.02	0.19	0.28	0.18
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.07	0.07	0.06	0.11	0.06	0.07	0.02	0.01	0.02	0.10	0.11	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.23	0.02	0.25	0.34	0.24
C5'	0.07	0.15	0.03	0.03	0.17	0.01	0.22	0.00	0.23	0.24	0.19	0.14	0.13	0.26	0.16	0.07	0.07	0.03	0.01	0.26	0.14	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.16	0.02	0.24	0.01	0.27	0.37	0.26
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.05	0.23	0.04	0.22	0.28	0.20
N1	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.03	0.21	0.02	0.24	0.35	0.23
N2	0.06	0.00	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.22	0.06	0.17	0.02	0.18	0.30	0.17
N3	0.05	0.01	0.12	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.05	0.16	0.02	0.17	0.27	0.15
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.00	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.25	0.04	0.27	0.35	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.17	0.03	0.16	0.25	0.14
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.09	0.04	0.12	0.18	0.13	0.04	0.02	0.00	0.06	0.07	0.08	0.08	0.15	0.15	0.07
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.12	0.02	0.13	0.07	0.16	0.11	0.18	0.22	0.16	0.13	0.06	0.06	0.00	0.02	0.19	0.17	0.24	0.20	0.18
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.15	0.04	0.16	0.22	0.14
O5'	0.12	0.18	0.12	0.16	0.18	0.02	0.23	0.01	0.24	0.23	0.21	0.17	0.16	0.25	0.17	0.08	0.19	0.15	0.00	0.26	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.14	0.02	0.10	0.02	0.26	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.17	0.04	0.26	0.00	0.32	0.41	0.30
OP1	0.13	0.19	0.15	0.18	0.19	0.11	0.25	0.14	0.27	0.22	0.24	0.18	0.17	0.27	0.16	0.15	0.24	0.16	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.30	0.17	0.16	0.28	0.15	0.34	0.17	0.37	0.28	0.35	0.30	0.27	0.35	0.25	0.15	0.20	0.22	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.09	0.12	0.18	0.03	0.24	0.02	0.26	0.20	0.23	0.17	0.15	0.26	0.14	0.07	0.18	0.14	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00