Doublet Group distance statistics: 49982

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 4, 9, 5, 6, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.013, 0.026, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.029 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.018, 0.034, 0.049, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.034 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.030, 0.047, 0.063, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.047 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.026, 0.047, 0.068, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.047 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.032, 0.056, 0.081, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.056 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.047, 0.075, 0.104, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.075 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.006, 0.035, 0.064, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.035 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.069, 0.102, 0.136, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.102 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.073, 0.113, 0.153, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.113 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.023, 0.160, 0.297, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.160 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.055, 0.249, 0.442, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.249 std_dev=0.194
C2'	A	0, 0.090, 0.288, 0.487, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.288 std_dev=0.198
N3	B	0, 0.214, 0.415, 0.616, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.415 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.164, 0.366, 0.567, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.366 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.187, 0.404, 0.622, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.404 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.238, 0.476, 0.714, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.476 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.226, 0.465, 0.705, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.465 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.324, 0.595, 0.867, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.595 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.227, 0.505, 0.784, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.505 std_dev=0.278
C2'	B	0, 0.287, 0.571, 0.854, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.571 std_dev=0.284
C8	B	0, 0.219, 0.504, 0.790, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.504 std_dev=0.286
O2'	A	0, 0.160, 0.447, 0.734, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.447 std_dev=0.287
C3'	A	0, 0.097, 0.394, 0.692, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.394 std_dev=0.297
N7	B	0, 0.241, 0.540, 0.839, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.540 std_dev=0.299
N1	B	0, 0.277, 0.583, 0.889, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.583 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.259, 0.574, 0.888, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.574 std_dev=0.315
O6	B	0, 0.443, 0.771, 1.099, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.771 std_dev=0.328
O2'	B	0, 0.330, 0.683, 1.035, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.683 std_dev=0.352
N2	B	0, 0.283, 0.640, 0.996, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.640 std_dev=0.357
C5'	A	0, 0.121, 0.529, 0.937, 2.011 max_d=2.011 avg_d=0.529 std_dev=0.408
C3'	B	0, 0.284, 0.692, 1.100, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.692 std_dev=0.408
C4'	B	0, 0.275, 0.688, 1.102, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.688 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.198, 0.633, 1.069, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.633 std_dev=0.435
O3'	A	0, 0.169, 0.629, 1.089, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.629 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.272, 0.768, 1.264, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.768 std_dev=0.496
O5'	B	0, 0.243, 0.748, 1.252, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.748 std_dev=0.505
O3'	B	0, 0.329, 0.839, 1.348, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.839 std_dev=0.509
P	B	0, 0.242, 0.845, 1.448, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.845 std_dev=0.603
P	A	0, 0.330, 0.942, 1.553, 2.164 max_d=2.164 avg_d=0.942 std_dev=0.611
OP2	B	0, 0.270, 0.934, 1.598, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.934 std_dev=0.664
OP1	B	0, 0.321, 1.114, 1.907, 2.906 max_d=2.906 avg_d=1.114 std_dev=0.793
OP2	A	0, 0.275, 1.164, 2.052, 3.596 max_d=3.596 avg_d=1.164 std_dev=0.889
OP1	A	0, 0.345, 1.390, 2.434, 3.892 max_d=3.892 avg_d=1.390 std_dev=1.044

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.02	0.45	0.36	0.18
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.04	0.24	0.01	0.75	0.53	0.34
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.07	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.15	0.06	0.28	0.24	0.14
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.03	0.11	0.16	0.11	0.16	0.12	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.22	0.13	0.26	0.22	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.23	0.02	0.74	0.52	0.33
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.07	0.05	0.11	0.05	0.08	0.02	0.00	0.02	0.09	0.21	0.29	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.02	0.29	0.02	0.89	0.64	0.41
C5'	0.03	0.12	0.03	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.18	0.15	0.11	0.09	0.20	0.11	0.08	0.05	0.02	0.01	0.21	0.25	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.30	0.01	0.95	0.69	0.44
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.04	0.28	0.02	0.81	0.58	0.37
N1	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.03	0.28	0.01	0.87	0.62	0.40
N2	0.05	0.01	0.13	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.21	0.05	0.23	0.02	0.71	0.50	0.32
N3	0.04	0.01	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.04	0.21	0.02	0.67	0.47	0.30
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.31	0.03	0.96	0.70	0.44
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.20	0.02	0.65	0.47	0.28
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.08	0.07	0.08	0.10	0.05	0.13	0.20	0.15	0.05	0.03	0.00	0.06	0.07	0.09	0.09	0.25	0.26	0.09
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.05	0.13	0.18	0.13	0.21	0.15	0.18	0.08	0.06	0.00	0.02	0.22	0.16	0.43	0.30	0.22
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.10	0.03	0.42	0.41	0.19
O5'	0.10	0.24	0.15	0.22	0.23	0.02	0.29	0.01	0.30	0.28	0.28	0.23	0.21	0.31	0.20	0.09	0.22	0.10	0.00	0.33	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.02	0.09	0.02	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.09	0.16	0.03	0.33	0.00	1.04	0.77	0.48
OP1	0.45	0.75	0.28	0.26	0.74	0.21	0.89	0.25	0.95	0.81	0.87	0.71	0.67	0.96	0.65	0.25	0.43	0.42	0.02	1.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.36	0.53	0.24	0.22	0.52	0.29	0.64	0.35	0.69	0.58	0.62	0.50	0.47	0.70	0.47	0.26	0.30	0.41	0.02	0.77	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.34	0.14	0.18	0.33	0.05	0.41	0.02	0.44	0.37	0.40	0.32	0.30	0.44	0.28	0.09	0.22	0.19	0.01	0.48	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.28	0.18	0.18	0.19	0.21	0.21	0.23	0.27	0.16	0.29	0.31	0.24	0.21	0.14	0.22	0.20	0.21	0.18	0.31	0.05	0.10	0.05
C2	0.24	0.33	0.26	0.23	0.17	0.25	0.16	0.24	0.23	0.19	0.30	0.40	0.29	0.18	0.15	0.33	0.24	0.25	0.20	0.25	0.16	0.21	0.15
C2'	0.17	0.23	0.17	0.19	0.18	0.20	0.21	0.24	0.24	0.18	0.24	0.25	0.21	0.21	0.15	0.20	0.21	0.19	0.22	0.26	0.10	0.08	0.10
C3'	0.12	0.22	0.09	0.09	0.19	0.10	0.24	0.13	0.27	0.19	0.26	0.23	0.19	0.26	0.15	0.10	0.12	0.12	0.07	0.31	0.02	0.06	0.01
C4	0.18	0.31	0.17	0.15	0.18	0.18	0.18	0.19	0.26	0.17	0.30	0.35	0.26	0.18	0.12	0.22	0.16	0.19	0.16	0.28	0.10	0.21	0.12
C4'	0.11	0.26	0.09	0.10	0.21	0.12	0.28	0.15	0.33	0.20	0.31	0.27	0.21	0.29	0.15	0.12	0.13	0.13	0.05	0.39	0.10	0.18	0.08
C5	0.18	0.31	0.17	0.18	0.14	0.19	0.12	0.21	0.23	0.21	0.30	0.36	0.24	0.19	0.14	0.20	0.18	0.20	0.21	0.27	0.18	0.31	0.20
C5'	0.17	0.36	0.18	0.19	0.31	0.14	0.39	0.16	0.45	0.29	0.42	0.36	0.30	0.40	0.24	0.15	0.21	0.14	0.13	0.52	0.21	0.32	0.18
C6	0.21	0.31	0.19	0.19	0.12	0.20	0.10	0.21	0.19	0.24	0.28	0.39	0.24	0.23	0.16	0.24	0.19	0.20	0.21	0.25	0.19	0.32	0.21
C8	0.18	0.29	0.16	0.21	0.16	0.22	0.18	0.26	0.28	0.18	0.31	0.33	0.22	0.17	0.13	0.18	0.22	0.22	0.25	0.32	0.24	0.34	0.25
N1	0.23	0.32	0.23	0.20	0.11	0.22	0.12	0.21	0.21	0.20	0.29	0.41	0.26	0.20	0.15	0.30	0.21	0.22	0.19	0.26	0.15	0.26	0.16
N2	0.29	0.34	0.33	0.31	0.18	0.32	0.17	0.31	0.24	0.19	0.31	0.42	0.29	0.18	0.18	0.43	0.34	0.30	0.25	0.26	0.24	0.21	0.21
N3	0.22	0.32	0.22	0.20	0.20	0.23	0.19	0.23	0.25	0.19	0.30	0.37	0.29	0.19	0.15	0.29	0.21	0.23	0.19	0.26	0.15	0.18	0.13
N7	0.18	0.29	0.17	0.22	0.15	0.22	0.14	0.25	0.25	0.22	0.31	0.35	0.22	0.19	0.15	0.18	0.23	0.22	0.27	0.30	0.27	0.39	0.28
N9	0.17	0.29	0.16	0.17	0.18	0.19	0.20	0.21	0.27	0.16	0.30	0.33	0.24	0.18	0.13	0.19	0.17	0.20	0.18	0.31	0.10	0.20	0.12
O2'	0.28	0.27	0.30	0.32	0.23	0.34	0.22	0.34	0.24	0.21	0.26	0.30	0.27	0.22	0.22	0.34	0.34	0.30	0.28	0.25	0.17	0.08	0.14
O3'	0.13	0.19	0.10	0.11	0.18	0.11	0.23	0.12	0.25	0.20	0.22	0.18	0.17	0.25	0.16	0.13	0.14	0.15	0.02	0.28	0.02	0.03	0.01
O4'	0.14	0.28	0.12	0.12	0.20	0.16	0.25	0.18	0.32	0.16	0.32	0.31	0.23	0.25	0.13	0.17	0.14	0.17	0.10	0.38	0.06	0.14	0.04
O5'	0.33	0.54	0.34	0.32	0.49	0.25	0.57	0.25	0.63	0.46	0.61	0.54	0.48	0.57	0.42	0.28	0.32	0.28	0.29	0.69	0.23	0.30	0.25
O6	0.22	0.30	0.21	0.22	0.14	0.21	0.15	0.23	0.15	0.27	0.25	0.41	0.24	0.29	0.20	0.24	0.22	0.21	0.24	0.26	0.25	0.39	0.26
OP1	0.52	1.04	0.50	0.45	0.87	0.33	1.00	0.38	1.16	0.70	1.16	1.07	0.90	0.92	0.69	0.44	0.47	0.38	0.41	1.27	0.70	0.60	0.53
OP2	0.43	0.69	0.50	0.53	0.61	0.39	0.70	0.39	0.79	0.54	0.77	0.70	0.61	0.67	0.52	0.44	0.57	0.35	0.43	0.87	0.46	0.55	0.43
P	0.35	0.67	0.38	0.36	0.58	0.24	0.67	0.25	0.77	0.50	0.75	0.67	0.58	0.64	0.47	0.30	0.37	0.26	0.29	0.86	0.31	0.36	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.06	0.10	0.06
C2	0.04	0.00	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.05	0.15	0.02	0.18	0.30	0.19
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.09	0.06	0.10	0.13	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.09	0.11	0.07
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.12	0.08	0.13	0.15	0.12	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.13	0.12	0.13	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.15	0.02	0.16	0.27	0.18
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.02	0.19	0.02	0.24	0.34	0.25
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.06	0.06	0.15	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.15	0.07	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.16	0.02	0.20	0.01	0.27	0.38	0.27
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.18	0.03	0.20	0.26	0.21
N1	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.18	0.03	0.18	0.02	0.24	0.36	0.24
N2	0.05	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.20	0.06	0.14	0.03	0.16	0.29	0.18
N3	0.04	0.01	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.05	0.13	0.02	0.14	0.25	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.20	0.03	0.27	0.35	0.27
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.13	0.02	0.13	0.20	0.15
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.06	0.08	0.07	0.10	0.04	0.12	0.15	0.11	0.06	0.03	0.00	0.05	0.05	0.05	0.10	0.11	0.09	0.06
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.04	0.16	0.10	0.18	0.20	0.14	0.12	0.06	0.05	0.00	0.02	0.13	0.17	0.19	0.18	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.03	0.09	0.07	0.08
O5'	0.06	0.15	0.06	0.09	0.15	0.01	0.19	0.01	0.20	0.18	0.18	0.14	0.13	0.20	0.13	0.05	0.13	0.08	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.09	0.13	0.02	0.07	0.02	0.15	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.10	0.17	0.03	0.22	0.00	0.32	0.43	0.31
OP1	0.06	0.18	0.09	0.12	0.16	0.07	0.24	0.07	0.27	0.20	0.24	0.16	0.14	0.27	0.13	0.11	0.19	0.09	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.30	0.11	0.13	0.27	0.04	0.34	0.03	0.38	0.26	0.36	0.29	0.25	0.35	0.20	0.09	0.18	0.07	0.02	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.19	0.07	0.10	0.18	0.02	0.25	0.02	0.27	0.21	0.24	0.18	0.16	0.27	0.15	0.06	0.15	0.08	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00