Doublet Group distance statistics: 49984

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 2, 0, 5, 2, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.025, 0.046, 0.068, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.046 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.025, 0.051, 0.076, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.051 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.019, 0.051, 0.083, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.051 std_dev=0.032
N2	A	0, -0.003, 0.051, 0.104, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.051 std_dev=0.054
C8	B	0, 0.347, 0.609, 0.870, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.609 std_dev=0.261
N7	B	0, 0.338, 0.600, 0.862, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.600 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.492, 0.760, 1.027, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.760 std_dev=0.267
N9	B	0, 0.484, 0.754, 1.023, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.754 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.465, 0.741, 1.017, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.741 std_dev=0.276
C1'	B	0, 0.535, 0.831, 1.126, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.831 std_dev=0.296
C4	B	0, 0.581, 0.890, 1.198, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.890 std_dev=0.309
C4'	B	0, 0.408, 0.722, 1.036, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.722 std_dev=0.314
C6	B	0, 0.562, 0.881, 1.199, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.881 std_dev=0.319
O6	B	0, 0.506, 0.829, 1.152, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.829 std_dev=0.323
P	B	0, 0.161, 0.496, 0.831, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.496 std_dev=0.335
O4'	A	0, -0.081, 0.260, 0.601, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.260 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.558, 0.906, 1.255, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.906 std_dev=0.349
C2'	A	0, -0.077, 0.279, 0.634, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.279 std_dev=0.356
C3'	B	0, 0.440, 0.804, 1.167, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.804 std_dev=0.364
C5'	B	0, 0.249, 0.643, 1.038, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.643 std_dev=0.395
O5'	B	0, 0.241, 0.640, 1.040, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.640 std_dev=0.399
N3	B	0, 0.754, 1.158, 1.561, 1.527 max_d=1.527 avg_d=1.158 std_dev=0.404
O2'	B	0, 0.650, 1.080, 1.511, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.080 std_dev=0.431
N1	B	0, 0.712, 1.146, 1.580, 1.740 max_d=1.740 avg_d=1.146 std_dev=0.434
O3'	B	0, 0.494, 0.942, 1.389, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.942 std_dev=0.447
O2'	A	0, -0.081, 0.390, 0.862, 2.202 max_d=2.202 avg_d=0.390 std_dev=0.471
C2	B	0, 0.809, 1.283, 1.757, 1.888 max_d=1.888 avg_d=1.283 std_dev=0.474
OP2	B	0, 0.162, 0.642, 1.122, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.642 std_dev=0.480
C3'	A	0, -0.099, 0.434, 0.967, 2.459 max_d=2.459 avg_d=0.434 std_dev=0.533
C4'	A	0, -0.133, 0.403, 0.939, 2.496 max_d=2.496 avg_d=0.403 std_dev=0.536
OP1	B	0, 0.120, 0.685, 1.251, 2.541 max_d=2.541 avg_d=0.685 std_dev=0.565
N2	B	0, 0.981, 1.593, 2.206, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.593 std_dev=0.612
O3'	A	0, -0.110, 0.595, 1.299, 3.230 max_d=3.230 avg_d=0.595 std_dev=0.704
P	A	0, 0.428, 1.165, 1.902, 3.352 max_d=3.352 avg_d=1.165 std_dev=0.737
OP2	A	0, 0.627, 1.365, 2.103, 3.001 max_d=3.001 avg_d=1.365 std_dev=0.738
C5'	A	0, -0.024, 0.720, 1.464, 3.421 max_d=3.421 avg_d=0.720 std_dev=0.744
O5'	A	0, 0.232, 0.997, 1.762, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.997 std_dev=0.765
OP1	A	0, 0.394, 1.350, 2.307, 4.188 max_d=4.188 avg_d=1.350 std_dev=0.957

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.15	0.00	0.25	0.02	0.20	0.47	0.21
C2	0.05	0.00	0.26	0.24	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.17	0.18	0.48	0.01	0.36	0.50	0.32
C2'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.13	0.02	0.07	0.11	0.12	0.13	0.20	0.32	0.25	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.40	0.10	0.44	0.41	0.31
C3'	0.02	0.24	0.00	0.00	0.20	0.01	0.23	0.05	0.26	0.19	0.26	0.26	0.21	0.22	0.14	0.02	0.01	0.02	0.37	0.27	0.50	0.27	0.25
C4	0.02	0.01	0.13	0.20	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.09	0.48	0.01	0.33	0.49	0.29
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.07	0.14	0.09	0.14	0.06	0.17	0.03	0.01	0.02	0.11	0.18	0.42	0.11
C5	0.01	0.01	0.07	0.23	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.06	0.58	0.02	0.39	0.53	0.37
C5'	0.06	0.19	0.11	0.05	0.16	0.01	0.20	0.00	0.21	0.20	0.20	0.20	0.17	0.23	0.13	0.08	0.14	0.01	0.02	0.24	0.28	0.45	0.03
C6	0.02	0.01	0.12	0.26	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.09	0.60	0.00	0.44	0.56	0.41
C8	0.03	0.02	0.13	0.19	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.15	0.12	0.55	0.03	0.32	0.49	0.31
N1	0.03	0.00	0.20	0.26	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.14	0.55	0.01	0.41	0.54	0.37
N2	0.08	0.01	0.32	0.26	0.02	0.14	0.01	0.20	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.26	0.23	0.22	0.45	0.02	0.36	0.50	0.31
N3	0.05	0.01	0.25	0.21	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.16	0.18	0.43	0.01	0.32	0.48	0.28
N7	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.18	0.08	0.62	0.03	0.40	0.53	0.39
N9	0.01	0.02	0.02	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.05	0.02	0.43	0.02	0.27	0.47	0.25
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.06	0.17	0.12	0.08	0.10	0.24	0.10	0.26	0.16	0.23	0.10	0.00	0.05	0.13	0.20	0.13	0.31	0.43	0.22
O3'	0.15	0.17	0.03	0.01	0.08	0.03	0.13	0.14	0.15	0.15	0.15	0.23	0.16	0.18	0.05	0.05	0.00	0.11	0.33	0.19	0.64	0.38	0.36
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.12	0.14	0.22	0.18	0.08	0.02	0.13	0.11	0.00	0.16	0.08	0.18	0.57	0.30
O5'	0.25	0.48	0.40	0.37	0.48	0.02	0.58	0.02	0.60	0.55	0.55	0.45	0.43	0.62	0.43	0.20	0.33	0.16	0.00	0.64	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.27	0.01	0.11	0.02	0.24	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.13	0.19	0.08	0.64	0.00	0.49	0.60	0.46
OP1	0.20	0.36	0.44	0.50	0.33	0.18	0.39	0.28	0.44	0.32	0.41	0.36	0.32	0.40	0.27	0.31	0.64	0.18	0.02	0.49	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.50	0.41	0.27	0.49	0.42	0.53	0.45	0.56	0.49	0.54	0.50	0.48	0.53	0.47	0.43	0.38	0.57	0.02	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.32	0.31	0.25	0.29	0.11	0.37	0.03	0.41	0.31	0.37	0.31	0.28	0.39	0.25	0.22	0.36	0.30	0.01	0.46	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.17	0.24	0.27	0.14	0.30	0.14	0.34	0.19	0.18	0.17	0.20	0.17	0.18	0.17	0.30	0.29	0.30	0.36	0.26	0.05	0.18	0.20
C2	0.27	0.27	0.25	0.21	0.18	0.23	0.16	0.21	0.23	0.23	0.28	0.32	0.24	0.18	0.21	0.30	0.22	0.25	0.32	0.27	0.24	0.25	0.15
C2'	0.53	0.36	0.55	0.57	0.38	0.59	0.30	0.59	0.27	0.38	0.30	0.38	0.41	0.30	0.44	0.57	0.58	0.58	0.56	0.25	0.18	0.15	0.33
C3'	0.59	0.52	0.67	0.75	0.55	0.67	0.53	0.73	0.50	0.58	0.50	0.52	0.55	0.55	0.58	0.61	0.78	0.60	0.77	0.47	0.61	0.37	0.74
C4	0.25	0.20	0.22	0.21	0.15	0.23	0.14	0.24	0.20	0.21	0.21	0.23	0.18	0.17	0.19	0.25	0.22	0.27	0.33	0.26	0.20	0.22	0.13
C4'	0.40	0.31	0.49	0.62	0.35	0.56	0.36	0.67	0.36	0.42	0.33	0.30	0.33	0.41	0.38	0.44	0.68	0.45	0.68	0.38	0.69	0.46	0.76
C5	0.24	0.20	0.20	0.20	0.16	0.22	0.14	0.22	0.21	0.23	0.22	0.22	0.18	0.17	0.20	0.23	0.20	0.26	0.33	0.27	0.31	0.26	0.14
C5'	0.47	0.44	0.60	0.74	0.47	0.63	0.51	0.74	0.52	0.54	0.48	0.42	0.44	0.56	0.49	0.52	0.83	0.50	0.78	0.56	0.85	0.74	0.91
C6	0.25	0.22	0.21	0.18	0.19	0.20	0.16	0.19	0.21	0.25	0.24	0.25	0.21	0.20	0.22	0.24	0.18	0.24	0.33	0.27	0.35	0.27	0.13
C8	0.24	0.17	0.20	0.23	0.13	0.26	0.14	0.28	0.21	0.18	0.20	0.18	0.15	0.14	0.17	0.23	0.25	0.28	0.35	0.29	0.29	0.27	0.21
N1	0.26	0.26	0.23	0.19	0.19	0.20	0.16	0.17	0.23	0.24	0.27	0.29	0.23	0.19	0.22	0.28	0.19	0.23	0.32	0.28	0.30	0.25	0.13
N2	0.28	0.34	0.28	0.24	0.19	0.26	0.18	0.25	0.26	0.23	0.33	0.40	0.28	0.19	0.21	0.35	0.27	0.27	0.32	0.29	0.27	0.28	0.20
N3	0.26	0.24	0.24	0.22	0.16	0.25	0.15	0.25	0.21	0.22	0.24	0.28	0.22	0.19	0.19	0.29	0.23	0.26	0.32	0.26	0.18	0.23	0.14
N7	0.24	0.19	0.20	0.21	0.16	0.24	0.15	0.26	0.22	0.21	0.22	0.20	0.17	0.16	0.19	0.22	0.23	0.27	0.35	0.30	0.36	0.31	0.20
N9	0.25	0.17	0.22	0.23	0.13	0.26	0.14	0.28	0.20	0.18	0.19	0.20	0.16	0.16	0.17	0.26	0.25	0.28	0.34	0.27	0.16	0.20	0.16
O2'	0.34	0.18	0.35	0.36	0.18	0.42	0.21	0.45	0.24	0.23	0.19	0.21	0.21	0.28	0.21	0.45	0.39	0.40	0.37	0.34	0.29	0.61	0.22
O3'	0.50	0.47	0.64	0.77	0.49	0.65	0.48	0.76	0.46	0.52	0.46	0.46	0.48	0.49	0.51	0.56	0.83	0.50	0.85	0.44	0.94	0.40	0.94
O4'	0.23	0.16	0.25	0.35	0.14	0.34	0.18	0.45	0.23	0.22	0.20	0.17	0.14	0.23	0.17	0.26	0.40	0.28	0.44	0.31	0.34	0.25	0.46
O5'	0.52	0.65	0.59	0.65	0.62	0.55	0.67	0.59	0.71	0.62	0.69	0.64	0.61	0.68	0.58	0.53	0.70	0.50	0.74	0.75	0.61	0.70	0.75
O6	0.25	0.24	0.21	0.18	0.21	0.20	0.19	0.20	0.21	0.25	0.25	0.26	0.23	0.22	0.23	0.24	0.18	0.23	0.33	0.26	0.41	0.30	0.15
OP1	0.66	0.73	0.82	0.93	0.71	0.77	0.74	0.81	0.78	0.70	0.77	0.73	0.71	0.73	0.68	0.77	1.03	0.63	0.97	0.82	0.94	1.06	1.03
OP2	0.50	0.68	0.65	0.72	0.62	0.60	0.69	0.65	0.77	0.58	0.75	0.69	0.62	0.66	0.56	0.58	0.81	0.49	0.68	0.84	0.66	0.85	0.75
P	0.45	0.59	0.59	0.69	0.54	0.56	0.61	0.62	0.67	0.53	0.65	0.59	0.53	0.60	0.50	0.52	0.78	0.43	0.74	0.74	0.67	0.82	0.80

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.17	0.03	0.22	0.18	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.17	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.22	0.06	0.31	0.01	0.47	0.31	0.25
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.13	0.10	0.16	0.13	0.11	0.05	0.01	0.03	0.01	0.14	0.09	0.22	0.22	0.14
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.14	0.17	0.15	0.21	0.16	0.16	0.07	0.02	0.01	0.01	0.22	0.15	0.26	0.25	0.20
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.30	0.01	0.42	0.28	0.23
C4'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.11	0.13	0.08	0.06	0.05	0.13	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.14	0.22	0.19	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.05	0.34	0.02	0.53	0.33	0.28
C5'	0.03	0.12	0.01	0.02	0.12	0.00	0.18	0.00	0.20	0.18	0.17	0.11	0.09	0.20	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.24	0.28	0.24	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.14	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.16	0.06	0.36	0.01	0.60	0.37	0.31
C8	0.02	0.02	0.13	0.17	0.01	0.13	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.19	0.06	0.31	0.04	0.41	0.28	0.23
N1	0.03	0.00	0.10	0.15	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.19	0.05	0.34	0.01	0.55	0.35	0.29
N2	0.04	0.01	0.16	0.21	0.02	0.06	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.28	0.07	0.30	0.02	0.46	0.31	0.25
N3	0.04	0.01	0.13	0.16	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.20	0.05	0.28	0.01	0.40	0.28	0.22
N7	0.02	0.02	0.11	0.16	0.01	0.13	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.18	0.06	0.35	0.04	0.55	0.34	0.29
N9	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.03	0.27	0.03	0.33	0.23	0.18
O2'	0.03	0.15	0.01	0.02	0.09	0.05	0.10	0.05	0.11	0.10	0.13	0.18	0.14	0.10	0.06	0.00	0.05	0.06	0.06	0.12	0.19	0.20	0.08
O3'	0.02	0.22	0.03	0.01	0.12	0.01	0.13	0.02	0.16	0.19	0.19	0.28	0.20	0.18	0.07	0.05	0.00	0.01	0.32	0.17	0.33	0.32	0.27
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.03	0.06	0.01	0.00	0.20	0.07	0.22	0.22	0.12
O5'	0.17	0.31	0.14	0.22	0.30	0.01	0.34	0.01	0.36	0.31	0.34	0.30	0.28	0.35	0.27	0.06	0.32	0.20	0.00	0.38	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.15	0.01	0.14	0.02	0.24	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.12	0.17	0.07	0.38	0.00	0.68	0.40	0.35
OP1	0.22	0.47	0.22	0.26	0.42	0.22	0.53	0.28	0.60	0.41	0.55	0.46	0.40	0.55	0.33	0.19	0.33	0.22	0.02	0.68	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.31	0.22	0.25	0.28	0.19	0.33	0.24	0.37	0.28	0.35	0.31	0.28	0.34	0.23	0.20	0.32	0.22	0.01	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.14	0.20	0.23	0.02	0.28	0.02	0.31	0.23	0.29	0.25	0.22	0.29	0.18	0.08	0.27	0.12	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00