Doublet Group distance statistics: 49986

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.018, 0.030, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.014, 0.040, 0.065, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.040 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.033, 0.061, 0.089, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.061 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.011, 0.043, 0.075, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.043 std_dev=0.032
C4	B	0, 0.240, 0.406, 0.572, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.406 std_dev=0.166
O4'	A	0, 0.081, 0.253, 0.425, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.253 std_dev=0.172
C2'	A	0, 0.044, 0.226, 0.408, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.226 std_dev=0.182
N9	B	0, 0.190, 0.401, 0.612, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.401 std_dev=0.211
C5	B	0, 0.263, 0.479, 0.695, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.479 std_dev=0.216
O2'	A	0, 0.058, 0.307, 0.556, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.307 std_dev=0.249
C4'	A	0, 0.136, 0.387, 0.639, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.387 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.301, 0.553, 0.806, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.553 std_dev=0.253
C3'	A	0, 0.124, 0.405, 0.686, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.405 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.259, 0.548, 0.836, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.548 std_dev=0.289
N1	B	0, 0.441, 0.731, 1.020, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.731 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.154, 0.459, 0.763, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.459 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.400, 0.715, 1.030, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.715 std_dev=0.315
C8	B	0, 0.376, 0.714, 1.052, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.714 std_dev=0.338
N7	B	0, 0.434, 0.780, 1.127, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.780 std_dev=0.346
O6	B	0, 0.363, 0.713, 1.063, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.713 std_dev=0.350
C2	B	0, 0.530, 0.893, 1.256, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.893 std_dev=0.363
O3'	A	0, 0.251, 0.638, 1.025, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.638 std_dev=0.387
O5'	B	0, 0.588, 0.983, 1.377, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.983 std_dev=0.395
C3'	B	0, 0.185, 0.583, 0.980, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.583 std_dev=0.397
P	B	0, 0.402, 0.817, 1.232, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.817 std_dev=0.415
O4'	B	0, 0.194, 0.619, 1.044, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.619 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.501, 0.946, 1.391, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.946 std_dev=0.445
C5'	A	0, 0.182, 0.637, 1.091, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.637 std_dev=0.454
OP2	B	0, 0.313, 0.780, 1.247, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.780 std_dev=0.467
C4'	B	0, 0.359, 0.850, 1.340, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.850 std_dev=0.491
O5'	A	0, 0.217, 0.744, 1.272, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.744 std_dev=0.527
N2	B	0, 0.798, 1.329, 1.860, 1.989 max_d=1.989 avg_d=1.329 std_dev=0.531
O3'	B	0, 0.210, 0.779, 1.348, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.779 std_dev=0.569
OP1	B	0, 0.573, 1.143, 1.713, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.143 std_dev=0.570
C5'	B	0, 0.703, 1.338, 1.974, 2.475 max_d=2.475 avg_d=1.338 std_dev=0.635
P	A	0, 0.332, 0.998, 1.665, 2.024 max_d=2.024 avg_d=0.998 std_dev=0.667
OP2	A	0, 0.606, 1.314, 2.023, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.314 std_dev=0.709
OP1	A	0, 0.303, 1.036, 1.768, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.036 std_dev=0.733

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.02	0.18	0.22	0.23
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.02	0.36	0.01	0.41	0.56	0.47
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.08	0.10	0.14	0.12	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.25	0.08	0.26	0.24	0.25
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.03	0.13	0.19	0.13	0.16	0.12	0.18	0.10	0.02	0.01	0.01	0.33	0.15	0.36	0.17	0.27
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.01	0.37	0.01	0.41	0.50	0.45
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.07	0.08	0.06	0.13	0.06	0.08	0.03	0.00	0.01	0.11	0.12	0.18	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.03	0.45	0.01	0.53	0.62	0.56
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.14	0.01	0.19	0.00	0.21	0.21	0.17	0.13	0.12	0.24	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.24	0.19	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.46	0.00	0.57	0.68	0.59
C8	0.01	0.01	0.08	0.19	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.04	0.44	0.02	0.49	0.48	0.50
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.02	0.42	0.01	0.50	0.65	0.54
N2	0.03	0.01	0.14	0.16	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.20	0.02	0.34	0.01	0.38	0.55	0.44
N3	0.02	0.00	0.12	0.12	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.14	0.01	0.32	0.01	0.35	0.48	0.41
N7	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.22	0.04	0.49	0.02	0.59	0.63	0.59
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.33	0.02	0.35	0.39	0.39
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.10	0.08	0.08	0.07	0.11	0.06	0.16	0.23	0.17	0.05	0.03	0.00	0.02	0.07	0.09	0.11	0.17	0.15	0.11
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.10	0.03	0.15	0.04	0.16	0.21	0.15	0.20	0.14	0.22	0.10	0.02	0.00	0.02	0.27	0.19	0.41	0.20	0.25
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.08	0.04	0.10	0.15	0.15
O5'	0.16	0.36	0.25	0.33	0.37	0.01	0.45	0.01	0.46	0.44	0.42	0.34	0.32	0.49	0.33	0.09	0.27	0.08	0.00	0.50	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.19	0.04	0.50	0.00	0.64	0.74	0.64
OP1	0.18	0.41	0.26	0.36	0.41	0.12	0.53	0.19	0.57	0.49	0.50	0.38	0.35	0.59	0.35	0.17	0.41	0.10	0.01	0.64	0.00	0.04	0.01
OP2	0.22	0.56	0.24	0.17	0.50	0.18	0.62	0.34	0.68	0.48	0.65	0.55	0.48	0.63	0.39	0.15	0.20	0.15	0.02	0.74	0.04	0.00	0.01
P	0.23	0.47	0.25	0.27	0.45	0.05	0.56	0.01	0.59	0.50	0.54	0.44	0.41	0.59	0.39	0.11	0.25	0.15	0.00	0.64	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.21	0.33	0.23	0.22	0.30	0.20	0.48	0.22	0.24	0.19	0.23	0.25	0.25	0.27	0.52	0.26	0.33	0.31	0.28	0.07	0.15	0.08
C2	0.25	0.21	0.30	0.17	0.19	0.23	0.18	0.36	0.20	0.13	0.20	0.23	0.24	0.17	0.18	0.38	0.19	0.24	0.40	0.23	0.18	0.36	0.17
C2'	0.38	0.24	0.31	0.22	0.25	0.27	0.24	0.49	0.25	0.28	0.23	0.25	0.26	0.29	0.28	0.49	0.26	0.31	0.32	0.28	0.11	0.21	0.13
C3'	0.36	0.26	0.27	0.23	0.26	0.22	0.27	0.38	0.28	0.28	0.26	0.27	0.27	0.30	0.29	0.42	0.29	0.33	0.15	0.31	0.07	0.07	0.02
C4	0.34	0.19	0.29	0.19	0.20	0.26	0.19	0.40	0.22	0.21	0.19	0.19	0.22	0.22	0.25	0.41	0.20	0.27	0.39	0.28	0.15	0.29	0.15
C4'	0.35	0.22	0.25	0.22	0.23	0.22	0.24	0.40	0.26	0.26	0.23	0.23	0.24	0.29	0.26	0.43	0.28	0.32	0.09	0.32	0.20	0.17	0.10
C5	0.32	0.17	0.28	0.23	0.19	0.28	0.18	0.38	0.22	0.24	0.19	0.17	0.19	0.21	0.25	0.36	0.23	0.29	0.43	0.29	0.25	0.37	0.23
C5'	0.35	0.29	0.28	0.30	0.29	0.25	0.33	0.36	0.36	0.32	0.32	0.29	0.29	0.36	0.30	0.40	0.37	0.32	0.15	0.42	0.36	0.35	0.22
C6	0.26	0.16	0.25	0.21	0.17	0.24	0.16	0.34	0.20	0.22	0.18	0.18	0.18	0.19	0.22	0.31	0.21	0.24	0.42	0.27	0.26	0.41	0.24
C8	0.38	0.17	0.31	0.28	0.20	0.34	0.19	0.43	0.22	0.27	0.19	0.17	0.21	0.23	0.28	0.43	0.29	0.37	0.42	0.30	0.32	0.33	0.28
N1	0.22	0.19	0.26	0.17	0.16	0.20	0.15	0.31	0.20	0.12	0.19	0.20	0.20	0.13	0.17	0.32	0.18	0.21	0.41	0.24	0.21	0.39	0.19
N2	0.25	0.25	0.34	0.22	0.20	0.28	0.17	0.38	0.19	0.15	0.21	0.27	0.27	0.17	0.19	0.43	0.26	0.31	0.42	0.21	0.24	0.38	0.21
N3	0.30	0.21	0.31	0.17	0.20	0.26	0.20	0.42	0.21	0.18	0.19	0.22	0.24	0.22	0.22	0.43	0.19	0.24	0.39	0.25	0.14	0.31	0.14
N7	0.36	0.16	0.29	0.28	0.20	0.33	0.19	0.42	0.22	0.29	0.19	0.16	0.19	0.24	0.28	0.38	0.29	0.35	0.45	0.31	0.35	0.40	0.31
N9	0.38	0.19	0.31	0.23	0.21	0.30	0.19	0.43	0.22	0.23	0.19	0.19	0.22	0.23	0.27	0.46	0.25	0.32	0.37	0.29	0.17	0.24	0.15
O2'	0.44	0.30	0.41	0.33	0.31	0.37	0.29	0.61	0.28	0.34	0.27	0.31	0.32	0.33	0.34	0.59	0.36	0.37	0.35	0.30	0.15	0.21	0.16
O3'	0.37	0.30	0.29	0.27	0.30	0.24	0.30	0.31	0.31	0.32	0.29	0.30	0.31	0.33	0.32	0.43	0.33	0.37	0.02	0.33	0.02	0.02	0.01
O4'	0.37	0.19	0.27	0.19	0.20	0.25	0.20	0.45	0.23	0.22	0.19	0.20	0.22	0.25	0.24	0.48	0.24	0.31	0.20	0.31	0.14	0.09	0.03
O5'	0.44	0.44	0.45	0.56	0.44	0.52	0.49	0.66	0.51	0.46	0.48	0.43	0.43	0.51	0.43	0.46	0.62	0.45	0.46	0.56	0.32	0.53	0.36
O6	0.25	0.16	0.24	0.24	0.17	0.25	0.17	0.35	0.18	0.25	0.18	0.18	0.16	0.23	0.22	0.27	0.24	0.24	0.44	0.26	0.32	0.46	0.29
OP1	0.39	0.54	0.47	0.63	0.52	0.47	0.61	0.61	0.67	0.54	0.62	0.52	0.49	0.64	0.47	0.39	0.69	0.38	0.52	0.75	0.36	0.76	0.47
OP2	0.59	0.68	0.65	0.72	0.66	0.66	0.72	0.74	0.77	0.65	0.74	0.68	0.65	0.73	0.62	0.62	0.78	0.56	0.46	0.82	0.58	0.46	0.37
P	0.47	0.55	0.50	0.60	0.53	0.53	0.59	0.64	0.63	0.53	0.60	0.54	0.52	0.60	0.50	0.48	0.66	0.46	0.44	0.69	0.36	0.54	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.25	0.02	0.25	0.51	0.27
C2	0.02	0.00	0.21	0.29	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.36	0.06	0.40	0.01	0.36	0.53	0.33
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.02	0.07	0.03	0.11	0.09	0.17	0.25	0.20	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.24	0.09	0.30	0.30	0.16
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.18	0.00	0.14	0.04	0.20	0.09	0.26	0.34	0.26	0.07	0.07	0.01	0.01	0.02	0.32	0.18	0.43	0.18	0.20
C4	0.02	0.01	0.11	0.18	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.19	0.03	0.42	0.01	0.36	0.52	0.33
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.08	0.11	0.12	0.09	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.11	0.16	0.41	0.12
C5	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.02	0.51	0.01	0.42	0.53	0.38
C5'	0.05	0.20	0.03	0.04	0.18	0.00	0.23	0.00	0.25	0.21	0.24	0.20	0.17	0.25	0.15	0.07	0.06	0.01	0.01	0.28	0.29	0.42	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.20	0.01	0.10	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.02	0.51	0.01	0.44	0.54	0.40
C8	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.04	0.53	0.02	0.40	0.52	0.37
N1	0.02	0.00	0.17	0.26	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.32	0.04	0.46	0.01	0.41	0.54	0.37
N2	0.03	0.00	0.25	0.34	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.43	0.06	0.36	0.01	0.34	0.53	0.32
N3	0.02	0.00	0.20	0.26	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.31	0.06	0.36	0.01	0.33	0.52	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.09	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.56	0.02	0.44	0.53	0.41
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.41	0.01	0.34	0.52	0.32
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.09	0.07	0.07	0.07	0.09	0.06	0.13	0.19	0.14	0.05	0.04	0.00	0.05	0.06	0.07	0.08	0.18	0.39	0.20
O3'	0.02	0.36	0.03	0.01	0.19	0.02	0.16	0.06	0.24	0.10	0.32	0.43	0.31	0.09	0.07	0.05	0.00	0.01	0.31	0.23	0.51	0.24	0.28
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.25	0.02	0.28	0.60	0.34
O5'	0.25	0.40	0.24	0.32	0.42	0.01	0.51	0.01	0.51	0.53	0.46	0.36	0.36	0.56	0.41	0.07	0.31	0.25	0.00	0.55	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.11	0.01	0.28	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.23	0.02	0.55	0.00	0.47	0.55	0.43
OP1	0.25	0.36	0.30	0.43	0.36	0.16	0.42	0.29	0.44	0.40	0.41	0.34	0.33	0.44	0.34	0.18	0.51	0.28	0.01	0.47	0.00	0.04	0.00
OP2	0.51	0.53	0.30	0.18	0.52	0.41	0.53	0.42	0.54	0.52	0.54	0.53	0.52	0.53	0.52	0.39	0.24	0.60	0.02	0.55	0.04	0.00	0.01
P	0.27	0.33	0.16	0.20	0.33	0.12	0.38	0.01	0.40	0.37	0.37	0.32	0.31	0.41	0.32	0.20	0.28	0.34	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00