Doublet Group distance statistics: 49987

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 0, 2, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.002, 0.022, 0.041, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.004, 0.017, 0.038, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.017 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.002, 0.032, 0.063, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.032 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.002, 0.039, 0.076, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.039 std_dev=0.037
O4'	A	0, -0.045, 0.103, 0.252, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.103 std_dev=0.148
C2'	A	0, -0.024, 0.133, 0.289, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.133 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.054, 0.214, 0.375, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.214 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.005, 0.217, 0.429, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.217 std_dev=0.212
C3'	A	0, 0.007, 0.240, 0.473, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.240 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.066, 0.363, 0.659, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.363 std_dev=0.297
N3	B	0, 0.240, 0.548, 0.856, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.548 std_dev=0.308
C2	B	0, 0.281, 0.589, 0.898, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.589 std_dev=0.309
C5'	B	0, 0.273, 0.584, 0.895, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.584 std_dev=0.311
P	B	0, 0.154, 0.475, 0.797, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.475 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.319, 0.648, 0.978, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.648 std_dev=0.330
N2	B	0, 0.329, 0.667, 1.005, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.667 std_dev=0.338
OP2	B	0, 0.187, 0.527, 0.868, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.527 std_dev=0.341
C1'	B	0, 0.242, 0.583, 0.925, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.583 std_dev=0.342
C4	B	0, 0.182, 0.537, 0.891, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.537 std_dev=0.354
N9	B	0, 0.211, 0.565, 0.919, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.565 std_dev=0.354
N1	B	0, 0.280, 0.636, 0.993, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.636 std_dev=0.356
C2'	B	0, 0.174, 0.549, 0.924, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.549 std_dev=0.375
C6	B	0, 0.344, 0.720, 1.097, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.720 std_dev=0.377
C5	B	0, 0.262, 0.651, 1.040, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.651 std_dev=0.389
O4'	B	0, 0.290, 0.700, 1.110, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.700 std_dev=0.410
C5'	A	0, -0.040, 0.378, 0.796, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.378 std_dev=0.418
C8	B	0, 0.268, 0.690, 1.111, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.690 std_dev=0.422
O6	B	0, 0.428, 0.873, 1.318, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.873 std_dev=0.445
O5'	A	0, 0.005, 0.451, 0.897, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.451 std_dev=0.446
OP1	B	0, 0.188, 0.645, 1.103, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.645 std_dev=0.458
N7	B	0, 0.291, 0.755, 1.219, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.755 std_dev=0.464
C3'	B	0, 0.368, 0.860, 1.352, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.860 std_dev=0.492
O5'	B	0, 0.123, 0.673, 1.223, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.673 std_dev=0.550
OP2	A	0, 0.252, 0.821, 1.391, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.821 std_dev=0.570
P	A	0, 0.131, 0.702, 1.273, 2.168 max_d=2.168 avg_d=0.702 std_dev=0.571
OP1	A	0, 0.161, 0.892, 1.623, 2.720 max_d=2.720 avg_d=0.892 std_dev=0.731
O2'	B	0, 0.544, 1.385, 2.227, 2.850 max_d=2.850 avg_d=1.385 std_dev=0.841
O3'	B	0, 0.818, 2.047, 3.276, 3.505 max_d=3.505 avg_d=2.047 std_dev=1.229

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.02	0.17	0.16	0.09
C2	0.05	0.00	0.13	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.15	0.06	0.22	0.02	0.21	0.24	0.19
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.10	0.16	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.04	0.22	0.19	0.10
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.09	0.10	0.14	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.22	0.19	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.02	0.23	0.01	0.21	0.22	0.19
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.17	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.27	0.01	0.24	0.26	0.24
C5'	0.04	0.08	0.03	0.03	0.09	0.01	0.13	0.00	0.12	0.17	0.10	0.09	0.08	0.17	0.11	0.04	0.07	0.03	0.01	0.14	0.16	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.09	0.03	0.28	0.00	0.25	0.27	0.25
C8	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.08	0.28	0.04	0.24	0.22	0.24
N1	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.12	0.03	0.25	0.01	0.23	0.26	0.22
N2	0.07	0.00	0.16	0.14	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.20	0.08	0.21	0.01	0.21	0.24	0.18
N3	0.04	0.01	0.12	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.06	0.20	0.02	0.20	0.22	0.17
N7	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.07	0.30	0.04	0.27	0.28	0.28
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.22	0.02	0.20	0.19	0.17
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.13	0.21	0.14	0.04	0.02	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.20	0.19	0.09
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.07	0.09	0.10	0.12	0.20	0.13	0.10	0.05	0.05	0.00	0.02	0.15	0.09	0.26	0.24	0.15
O4'	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.08	0.03	0.08	0.06	0.07	0.02	0.03	0.02	0.00	0.16	0.06	0.15	0.18	0.08
O5'	0.14	0.22	0.06	0.06	0.23	0.03	0.27	0.01	0.28	0.28	0.25	0.21	0.20	0.30	0.22	0.04	0.15	0.16	0.00	0.29	0.01	0.04	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.09	0.06	0.29	0.00	0.27	0.29	0.27
OP1	0.17	0.21	0.22	0.22	0.21	0.17	0.24	0.16	0.25	0.24	0.23	0.21	0.20	0.27	0.20	0.20	0.26	0.15	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.24	0.19	0.19	0.22	0.14	0.26	0.07	0.27	0.22	0.26	0.24	0.22	0.28	0.19	0.19	0.24	0.18	0.04	0.29	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.10	0.10	0.19	0.05	0.24	0.02	0.25	0.24	0.22	0.18	0.17	0.28	0.17	0.09	0.15	0.08	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.28	0.10	0.17	0.23	0.28	0.32	0.25	0.38	0.25	0.31	0.31	0.27	0.39	0.19	0.17	0.50	0.33	0.35	0.48	0.08	0.25	0.14
C2	0.24	0.22	0.21	0.21	0.14	0.29	0.22	0.36	0.32	0.19	0.25	0.31	0.22	0.27	0.16	0.33	0.67	0.27	0.45	0.45	0.19	0.31	0.19
C2'	0.25	0.33	0.07	0.13	0.31	0.24	0.38	0.24	0.41	0.33	0.36	0.34	0.32	0.44	0.25	0.13	0.33	0.34	0.36	0.47	0.15	0.36	0.21
C3'	0.28	0.36	0.21	0.24	0.37	0.22	0.44	0.20	0.45	0.43	0.40	0.35	0.35	0.51	0.34	0.22	0.21	0.38	0.15	0.51	0.04	0.06	0.02
C4	0.25	0.27	0.14	0.17	0.15	0.27	0.22	0.28	0.34	0.12	0.30	0.32	0.25	0.27	0.12	0.22	0.51	0.30	0.38	0.48	0.12	0.27	0.15
C4'	0.26	0.31	0.11	0.14	0.30	0.22	0.40	0.17	0.43	0.38	0.35	0.32	0.30	0.49	0.28	0.15	0.29	0.36	0.17	0.52	0.17	0.11	0.06
C5	0.25	0.29	0.17	0.18	0.16	0.27	0.17	0.26	0.32	0.10	0.32	0.34	0.26	0.19	0.15	0.27	0.43	0.32	0.35	0.49	0.15	0.27	0.15
C5'	0.24	0.32	0.20	0.21	0.34	0.21	0.46	0.21	0.49	0.45	0.39	0.31	0.30	0.56	0.31	0.20	0.24	0.36	0.08	0.60	0.31	0.35	0.20
C6	0.25	0.28	0.20	0.18	0.17	0.26	0.15	0.29	0.27	0.17	0.29	0.35	0.25	0.19	0.18	0.34	0.46	0.31	0.39	0.45	0.16	0.28	0.17
C8	0.26	0.30	0.15	0.18	0.21	0.28	0.27	0.22	0.39	0.11	0.35	0.33	0.27	0.27	0.16	0.20	0.34	0.37	0.26	0.52	0.18	0.23	0.15
N1	0.25	0.24	0.21	0.19	0.16	0.28	0.18	0.33	0.28	0.20	0.24	0.33	0.24	0.24	0.19	0.34	0.58	0.29	0.43	0.45	0.17	0.30	0.18
N2	0.24	0.25	0.25	0.24	0.19	0.31	0.27	0.41	0.34	0.23	0.29	0.32	0.24	0.30	0.19	0.40	0.79	0.29	0.49	0.43	0.25	0.33	0.23
N3	0.25	0.25	0.17	0.20	0.14	0.28	0.25	0.34	0.34	0.18	0.27	0.31	0.24	0.31	0.13	0.28	0.65	0.26	0.43	0.46	0.16	0.29	0.18
N7	0.26	0.31	0.18	0.19	0.20	0.27	0.22	0.23	0.36	0.09	0.35	0.34	0.27	0.18	0.17	0.28	0.34	0.36	0.29	0.50	0.20	0.25	0.16
N9	0.25	0.28	0.11	0.16	0.20	0.27	0.28	0.25	0.38	0.16	0.32	0.31	0.26	0.33	0.14	0.15	0.44	0.34	0.32	0.50	0.10	0.24	0.13
O2'	0.28	0.33	0.13	0.21	0.31	0.30	0.37	0.37	0.40	0.36	0.35	0.34	0.32	0.43	0.28	0.30	0.52	0.31	0.56	0.45	0.26	0.49	0.35
O3'	0.33	0.38	0.29	0.31	0.39	0.28	0.44	0.26	0.44	0.45	0.40	0.37	0.38	0.50	0.39	0.34	0.29	0.44	0.02	0.48	0.02	0.03	0.01
O4'	0.26	0.28	0.07	0.13	0.25	0.25	0.35	0.20	0.40	0.31	0.32	0.31	0.27	0.44	0.21	0.13	0.43	0.34	0.27	0.52	0.10	0.12	0.06
O5'	0.27	0.42	0.28	0.30	0.42	0.24	0.56	0.20	0.62	0.48	0.52	0.39	0.38	0.63	0.37	0.27	0.26	0.37	0.06	0.74	0.33	0.41	0.21
O6	0.26	0.31	0.22	0.19	0.21	0.26	0.17	0.28	0.25	0.21	0.31	0.38	0.27	0.20	0.22	0.40	0.41	0.32	0.38	0.38	0.18	0.29	0.18
OP1	0.40	0.51	0.62	0.62	0.56	0.33	0.70	0.46	0.73	0.70	0.62	0.46	0.48	0.81	0.54	0.67	0.54	0.34	0.38	0.83	0.49	0.76	0.47
OP2	0.20	0.35	0.44	0.34	0.34	0.14	0.49	0.22	0.55	0.43	0.45	0.33	0.30	0.57	0.30	0.54	0.21	0.24	0.21	0.68	0.25	0.43	0.21
P	0.22	0.38	0.40	0.36	0.39	0.16	0.54	0.24	0.59	0.50	0.48	0.34	0.33	0.64	0.35	0.43	0.25	0.28	0.15	0.72	0.32	0.50	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.34	0.01	0.21	0.03	0.23	0.46	0.16
C2	0.05	0.00	0.18	0.13	0.02	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.38	0.52	0.16	0.32	0.02	0.20	0.29	0.18
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.02	0.06	0.19	0.08	0.12	0.14	0.22	0.17	0.08	0.03	0.00	0.04	0.02	0.33	0.07	0.54	0.65	0.43
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.18	0.01	0.30	0.02	0.28	0.41	0.19	0.16	0.12	0.42	0.22	0.02	0.01	0.02	0.29	0.34	0.43	0.34	0.27
C4	0.03	0.02	0.09	0.18	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.30	0.27	0.08	0.37	0.01	0.20	0.29	0.19
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.09	0.21	0.06	0.15	0.10	0.19	0.08	0.30	0.03	0.00	0.02	0.12	0.18	0.34	0.07
C5	0.02	0.01	0.06	0.30	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.35	0.10	0.05	0.48	0.01	0.24	0.24	0.27
C5'	0.07	0.16	0.19	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.20	0.17	0.19	0.15	0.23	0.10	0.12	0.22	0.02	0.01	0.22	0.16	0.25	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.28	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.38	0.16	0.08	0.48	0.00	0.25	0.23	0.29
C8	0.01	0.02	0.12	0.41	0.00	0.21	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.32	0.21	0.09	0.54	0.01	0.24	0.27	0.29
N1	0.04	0.00	0.14	0.19	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.39	0.35	0.12	0.40	0.01	0.21	0.23	0.22
N2	0.07	0.00	0.22	0.16	0.02	0.15	0.01	0.19	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.40	0.68	0.19	0.28	0.02	0.20	0.31	0.17
N3	0.05	0.01	0.17	0.12	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.33	0.53	0.15	0.29	0.02	0.20	0.33	0.16
N7	0.02	0.01	0.08	0.42	0.01	0.19	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.36	0.21	0.06	0.58	0.01	0.29	0.26	0.36
N9	0.01	0.02	0.03	0.22	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.23	0.12	0.02	0.36	0.02	0.20	0.34	0.17
O2'	0.01	0.38	0.00	0.02	0.30	0.30	0.35	0.12	0.38	0.32	0.39	0.40	0.33	0.36	0.23	0.00	0.06	0.20	0.31	0.40	0.54	0.71	0.41
O3'	0.34	0.52	0.04	0.01	0.27	0.03	0.10	0.22	0.16	0.21	0.35	0.68	0.53	0.21	0.12	0.06	0.00	0.24	0.37	0.12	0.52	0.35	0.31
O4'	0.01	0.16	0.02	0.02	0.08	0.00	0.05	0.02	0.08	0.09	0.12	0.19	0.15	0.06	0.02	0.20	0.24	0.00	0.09	0.07	0.11	0.50	0.19
O5'	0.21	0.32	0.33	0.29	0.37	0.02	0.48	0.01	0.48	0.54	0.40	0.28	0.29	0.58	0.36	0.31	0.37	0.09	0.00	0.54	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.07	0.34	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.40	0.12	0.07	0.54	0.00	0.29	0.27	0.35
OP1	0.23	0.20	0.54	0.43	0.20	0.18	0.24	0.16	0.25	0.24	0.21	0.20	0.20	0.29	0.20	0.54	0.52	0.11	0.02	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.29	0.65	0.34	0.29	0.34	0.24	0.25	0.23	0.27	0.23	0.31	0.33	0.26	0.34	0.71	0.35	0.50	0.02	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.18	0.43	0.27	0.19	0.07	0.27	0.02	0.29	0.29	0.22	0.17	0.16	0.36	0.17	0.41	0.31	0.19	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00