Doublet Group distance statistics: 49991

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.014
O4'	A	0, 0.038, 0.086, 0.135, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.086 std_dev=0.048
C4'	A	0, 0.064, 0.133, 0.201, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.133 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.009, 0.105, 0.201, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.105 std_dev=0.096
C3'	A	0, 0.046, 0.170, 0.294, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.170 std_dev=0.124
C5'	A	0, 0.105, 0.246, 0.387, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.246 std_dev=0.141
O2'	A	0, 0.049, 0.195, 0.341, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.195 std_dev=0.146
O5'	A	0, 0.147, 0.303, 0.459, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.303 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.076, 0.262, 0.449, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.262 std_dev=0.186
C4	B	0, 0.114, 0.342, 0.571, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.342 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.124, 0.364, 0.605, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.364 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.143, 0.390, 0.638, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.390 std_dev=0.247
P	B	0, 0.071, 0.322, 0.572, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.322 std_dev=0.250
O5'	B	0, 0.134, 0.390, 0.647, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.390 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.140, 0.407, 0.675, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.407 std_dev=0.268
OP2	B	0, 0.098, 0.369, 0.640, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.369 std_dev=0.271
C4'	B	0, 0.115, 0.396, 0.678, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.396 std_dev=0.282
C5'	B	0, 0.064, 0.358, 0.653, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.358 std_dev=0.295
P	A	0, 0.210, 0.508, 0.805, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.508 std_dev=0.298
OP1	B	0, 0.150, 0.454, 0.758, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.454 std_dev=0.304
N9	B	0, 0.119, 0.428, 0.737, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.428 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.086, 0.415, 0.744, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.415 std_dev=0.329
N1	B	0, 0.123, 0.463, 0.803, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.463 std_dev=0.340
O6	B	0, 0.184, 0.525, 0.866, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.525 std_dev=0.341
OP1	A	0, 0.189, 0.545, 0.902, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.545 std_dev=0.356
C2	B	0, 0.107, 0.489, 0.872, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.489 std_dev=0.382
C3'	B	0, 0.186, 0.575, 0.964, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.575 std_dev=0.389
N7	B	0, 0.069, 0.477, 0.884, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.477 std_dev=0.407
C8	B	0, 0.099, 0.515, 0.931, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.515 std_dev=0.416
C1'	B	0, 0.089, 0.514, 0.939, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.514 std_dev=0.425
OP2	A	0, 0.230, 0.679, 1.128, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.679 std_dev=0.449
O3'	B	0, 0.260, 0.749, 1.237, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.749 std_dev=0.489
N2	B	0, 0.170, 0.709, 1.248, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.709 std_dev=0.539
C2'	B	0, 0.109, 0.762, 1.415, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.762 std_dev=0.653
O2'	B	0, -0.063, 1.112, 2.287, 3.218 max_d=3.218 avg_d=1.112 std_dev=1.175

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02	0.15	0.01	0.15	0.28	0.20
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.15	0.18	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.04	0.07	0.05	0.09	0.04	0.01	0.00	0.00	0.11	0.06	0.21	0.26	0.17
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02	0.15	0.01	0.15	0.25	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.10	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.17	0.00	0.21	0.32	0.24
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.05	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.18	0.01	0.23	0.35	0.26
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.05	0.17	0.01	0.19	0.25	0.21
N1	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02	0.17	0.01	0.20	0.32	0.24
N2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.03	0.14	0.01	0.13	0.27	0.19
N3	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.02	0.13	0.01	0.12	0.23	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.19	0.01	0.24	0.33	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.13	0.00	0.13	0.20	0.16
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.10	0.14	0.11	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.18	0.17	0.08
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.02	0.05	0.11	0.03	0.10	0.06	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.16	0.07	0.34	0.41	0.28
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.03	0.10	0.14	0.14
O5'	0.07	0.15	0.07	0.11	0.15	0.02	0.17	0.01	0.18	0.17	0.17	0.14	0.13	0.19	0.13	0.06	0.16	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.03	0.20	0.00	0.27	0.38	0.29
OP1	0.06	0.15	0.15	0.21	0.15	0.10	0.21	0.07	0.23	0.19	0.20	0.13	0.12	0.24	0.13	0.18	0.34	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.28	0.18	0.26	0.25	0.05	0.32	0.01	0.35	0.25	0.32	0.27	0.23	0.33	0.20	0.17	0.41	0.14	0.01	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.20	0.09	0.17	0.19	0.02	0.24	0.02	0.26	0.21	0.24	0.19	0.17	0.27	0.16	0.08	0.28	0.14	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.30	0.15	0.27	0.07	0.18	0.13	0.19	0.17	0.43	0.26	0.41	0.21	0.35	0.20	0.26	0.22	0.20	0.22	0.22	0.04	0.07	0.07
C2	0.45	0.26	0.48	0.39	0.24	0.23	0.22	0.20	0.16	0.49	0.25	0.44	0.20	0.40	0.42	0.49	0.24	0.25	0.24	0.26	0.11	0.14	0.11
C2'	0.12	0.34	0.08	0.22	0.13	0.14	0.17	0.18	0.22	0.38	0.29	0.44	0.28	0.33	0.12	0.18	0.21	0.15	0.23	0.25	0.09	0.10	0.11
C3'	0.14	0.33	0.26	0.14	0.19	0.12	0.17	0.11	0.21	0.20	0.27	0.41	0.31	0.24	0.10	0.17	0.21	0.18	0.08	0.23	0.02	0.03	0.01
C4	0.35	0.26	0.31	0.40	0.16	0.23	0.18	0.21	0.13	0.50	0.23	0.38	0.19	0.43	0.34	0.29	0.28	0.24	0.27	0.22	0.11	0.14	0.13
C4'	0.09	0.32	0.21	0.13	0.15	0.11	0.13	0.13	0.19	0.22	0.27	0.42	0.28	0.23	0.06	0.13	0.18	0.13	0.06	0.22	0.11	0.09	0.05
C5	0.32	0.24	0.31	0.45	0.21	0.25	0.21	0.23	0.07	0.45	0.19	0.34	0.22	0.43	0.32	0.21	0.34	0.24	0.31	0.17	0.15	0.17	0.16
C5'	0.14	0.33	0.29	0.13	0.19	0.12	0.17	0.12	0.22	0.15	0.28	0.40	0.29	0.19	0.12	0.22	0.20	0.17	0.06	0.25	0.19	0.18	0.12
C6	0.36	0.26	0.39	0.48	0.28	0.26	0.26	0.23	0.08	0.43	0.17	0.35	0.27	0.41	0.36	0.25	0.34	0.24	0.30	0.18	0.16	0.18	0.16
C8	0.22	0.23	0.20	0.40	0.12	0.23	0.12	0.22	0.10	0.38	0.20	0.32	0.19	0.35	0.21	0.14	0.36	0.22	0.31	0.17	0.14	0.17	0.17
N1	0.42	0.24	0.47	0.44	0.29	0.25	0.25	0.21	0.10	0.45	0.17	0.39	0.27	0.40	0.40	0.38	0.28	0.24	0.27	0.24	0.14	0.16	0.14
N2	0.49	0.25	0.56	0.35	0.23	0.21	0.21	0.19	0.19	0.47	0.28	0.48	0.17	0.37	0.42	0.64	0.23	0.25	0.21	0.27	0.10	0.14	0.11
N3	0.42	0.29	0.41	0.36	0.17	0.22	0.20	0.20	0.17	0.52	0.28	0.44	0.18	0.42	0.39	0.46	0.23	0.26	0.24	0.25	0.09	0.12	0.10
N7	0.26	0.23	0.25	0.45	0.18	0.26	0.17	0.24	0.09	0.38	0.19	0.30	0.21	0.37	0.26	0.16	0.39	0.23	0.33	0.14	0.17	0.20	0.19
N9	0.26	0.26	0.21	0.36	0.10	0.22	0.13	0.21	0.14	0.45	0.23	0.37	0.19	0.39	0.25	0.21	0.28	0.23	0.27	0.20	0.10	0.12	0.12
O2'	0.21	0.38	0.16	0.22	0.19	0.18	0.23	0.23	0.27	0.44	0.34	0.49	0.30	0.37	0.22	0.37	0.20	0.20	0.24	0.29	0.12	0.10	0.12
O3'	0.21	0.33	0.36	0.09	0.22	0.14	0.19	0.13	0.21	0.21	0.26	0.41	0.33	0.26	0.16	0.22	0.17	0.19	0.02	0.23	0.02	0.01	0.00
O4'	0.15	0.30	0.12	0.20	0.08	0.13	0.10	0.15	0.17	0.32	0.26	0.41	0.23	0.27	0.13	0.17	0.20	0.17	0.14	0.20	0.06	0.05	0.01
O5'	0.17	0.35	0.20	0.26	0.25	0.16	0.25	0.15	0.29	0.22	0.33	0.41	0.31	0.27	0.18	0.20	0.35	0.20	0.21	0.32	0.13	0.20	0.16
O6	0.35	0.29	0.40	0.51	0.30	0.28	0.29	0.24	0.16	0.38	0.21	0.35	0.31	0.37	0.35	0.22	0.38	0.24	0.32	0.16	0.19	0.20	0.19
OP1	0.12	0.33	0.15	0.35	0.25	0.24	0.32	0.27	0.38	0.25	0.37	0.36	0.28	0.34	0.19	0.16	0.55	0.20	0.32	0.44	0.25	0.34	0.29
OP2	0.30	0.47	0.17	0.62	0.41	0.42	0.47	0.43	0.52	0.41	0.51	0.48	0.41	0.49	0.36	0.13	0.75	0.33	0.54	0.58	0.45	0.56	0.48
P	0.18	0.38	0.12	0.38	0.29	0.24	0.34	0.25	0.40	0.29	0.40	0.42	0.33	0.36	0.23	0.16	0.52	0.22	0.33	0.45	0.24	0.35	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.00	0.00	0.03	0.19	0.01	0.22	0.02	0.21	0.33	0.24
C2	0.04	0.00	0.23	0.14	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.25	0.27	0.16	0.01	0.17	0.21	0.20
C2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.13	0.03	0.09	0.18	0.14	0.12	0.20	0.26	0.22	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.39	0.13	0.42	0.54	0.44
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.21	0.01	0.33	0.02	0.33	0.38	0.24	0.10	0.11	0.41	0.22	0.02	0.01	0.02	0.06	0.39	0.13	0.12	0.07
C4	0.02	0.01	0.13	0.21	0.00	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.13	0.16	0.01	0.17	0.22	0.19
C4'	0.01	0.17	0.03	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.07	0.29	0.07	0.26	0.17	0.25	0.10	0.27	0.03	0.00	0.02	0.12	0.08	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.33	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.19	0.06	0.24	0.01	0.21	0.21	0.21
C5'	0.09	0.18	0.18	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.14	0.30	0.12	0.27	0.19	0.30	0.11	0.09	0.19	0.01	0.01	0.19	0.08	0.03	0.02
C6	0.02	0.00	0.14	0.33	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.19	0.11	0.24	0.01	0.22	0.23	0.22
C8	0.01	0.01	0.12	0.38	0.01	0.29	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.39	0.30	0.17	0.30	0.02	0.24	0.22	0.23
N1	0.03	0.00	0.20	0.24	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.17	0.20	0.17	0.01	0.16	0.19	0.18
N2	0.06	0.00	0.26	0.10	0.01	0.26	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.38	0.34	0.18	0.01	0.21	0.23	0.24
N3	0.04	0.00	0.22	0.11	0.00	0.17	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.27	0.27	0.18	0.01	0.20	0.25	0.23
N7	0.00	0.01	0.07	0.41	0.01	0.25	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.40	0.33	0.10	0.35	0.02	0.29	0.26	0.29
N9	0.00	0.01	0.03	0.22	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.10	0.02	0.17	0.01	0.18	0.25	0.19
O2'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.17	0.27	0.29	0.09	0.26	0.39	0.17	0.14	0.10	0.40	0.22	0.00	0.06	0.18	0.27	0.31	0.27	0.56	0.33
O3'	0.19	0.25	0.05	0.01	0.12	0.03	0.19	0.19	0.19	0.30	0.17	0.38	0.27	0.33	0.10	0.06	0.00	0.11	0.25	0.26	0.43	0.34	0.31
O4'	0.01	0.27	0.02	0.02	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.17	0.20	0.34	0.27	0.10	0.02	0.18	0.11	0.00	0.11	0.08	0.09	0.19	0.12
O5'	0.22	0.16	0.39	0.06	0.16	0.02	0.24	0.01	0.24	0.30	0.17	0.18	0.18	0.35	0.17	0.27	0.25	0.11	0.00	0.31	0.02	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.13	0.39	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.31	0.26	0.08	0.31	0.00	0.29	0.29	0.28
OP1	0.21	0.17	0.42	0.13	0.17	0.08	0.21	0.08	0.22	0.24	0.16	0.21	0.20	0.29	0.18	0.27	0.43	0.09	0.02	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.21	0.54	0.12	0.22	0.06	0.21	0.03	0.23	0.22	0.19	0.23	0.25	0.26	0.25	0.56	0.34	0.19	0.03	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.20	0.44	0.07	0.19	0.02	0.21	0.02	0.22	0.23	0.18	0.24	0.23	0.29	0.19	0.33	0.31	0.12	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00