Doublet Group distance statistics: 49994

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.032, 0.064, 0.096, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.064 std_dev=0.032
N1	A	0, 0.032, 0.069, 0.106, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.069 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.039, 0.078, 0.117, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.078 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.040, 0.081, 0.122, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.081 std_dev=0.041
C4	A	0, 0.041, 0.082, 0.123, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.082 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.043, 0.085, 0.128, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.085 std_dev=0.043
N3	A	0, 0.044, 0.090, 0.137, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.090 std_dev=0.046
C2	A	0, 0.044, 0.091, 0.137, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.091 std_dev=0.046
O6	A	0, 0.053, 0.109, 0.165, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.109 std_dev=0.056
C1'	A	0, 0.059, 0.122, 0.186, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.122 std_dev=0.063
N2	A	0, 0.095, 0.195, 0.294, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.195 std_dev=0.100
O4'	A	0, 0.165, 0.351, 0.537, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.351 std_dev=0.186
C2'	A	0, 0.141, 0.353, 0.564, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.353 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.170, 0.407, 0.644, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.407 std_dev=0.237
C3'	A	0, 0.159, 0.454, 0.750, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.454 std_dev=0.296
C5	B	0, 0.215, 0.534, 0.853, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.534 std_dev=0.319
O2'	A	0, 0.261, 0.586, 0.911, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.586 std_dev=0.325
C4'	A	0, 0.293, 0.630, 0.967, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.630 std_dev=0.337
P	B	0, 0.105, 0.452, 0.799, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.452 std_dev=0.347
C2'	B	0, 0.334, 0.692, 1.051, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.692 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.144, 0.524, 0.904, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.524 std_dev=0.380
N3	B	0, 0.147, 0.538, 0.929, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.538 std_dev=0.391
N7	B	0, 0.284, 0.689, 1.094, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.689 std_dev=0.405
C8	B	0, 0.259, 0.667, 1.075, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.667 std_dev=0.408
C1'	B	0, 0.323, 0.802, 1.282, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.802 std_dev=0.479
C5'	A	0, 0.445, 0.933, 1.421, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.933 std_dev=0.488
C6	B	0, 0.295, 0.786, 1.278, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.786 std_dev=0.491
O5'	A	0, 0.434, 0.938, 1.443, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.938 std_dev=0.505
C3'	B	0, 0.390, 0.903, 1.416, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.903 std_dev=0.513
O3'	A	0, 0.206, 0.729, 1.251, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.729 std_dev=0.523
C2	B	0, 0.127, 0.668, 1.209, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.668 std_dev=0.541
N1	B	0, 0.252, 0.806, 1.361, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.806 std_dev=0.554
O4'	B	0, 0.497, 1.172, 1.848, 1.867 max_d=1.867 avg_d=1.172 std_dev=0.675
O6	B	0, 0.456, 1.132, 1.808, 1.986 max_d=1.986 avg_d=1.132 std_dev=0.676
C4'	B	0, 0.659, 1.379, 2.100, 1.954 max_d=1.954 avg_d=1.379 std_dev=0.721
N2	B	0, 0.233, 0.962, 1.691, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.962 std_dev=0.729
OP1	B	0, 0.425, 1.170, 1.915, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.170 std_dev=0.745
OP2	B	0, 0.681, 1.467, 2.253, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.467 std_dev=0.786
O3'	B	0, 0.369, 1.165, 1.961, 2.234 max_d=2.234 avg_d=1.165 std_dev=0.796
O5'	B	0, 0.510, 1.308, 2.106, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.308 std_dev=0.798
P	A	0, 0.454, 1.263, 2.072, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.263 std_dev=0.809
O2'	B	0, 0.497, 1.368, 2.240, 2.663 max_d=2.663 avg_d=1.368 std_dev=0.872
C5'	B	0, 1.009, 2.127, 3.246, 3.051 max_d=3.051 avg_d=2.127 std_dev=1.118
OP1	A	0, 0.142, 1.319, 2.497, 3.489 max_d=3.489 avg_d=1.319 std_dev=1.178
OP2	A	0, 0.247, 1.603, 2.959, 4.114 max_d=4.114 avg_d=1.603 std_dev=1.356

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.04	0.35	0.29	0.10
C2	0.05	0.00	0.16	0.15	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.21	0.07	0.34	0.02	0.11	0.86	0.33
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.02	0.08	0.09	0.13	0.20	0.16	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.26	0.07	0.32	0.37	0.05
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.13	0.12	0.19	0.14	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.35	0.07	0.17	0.40	0.14
C4	0.03	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.03	0.36	0.03	0.11	0.86	0.37
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.05	0.09	0.06	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.45	0.11	0.23
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.46	0.02	0.36	1.16	0.62
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.07	0.06	0.13	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.10	0.06	0.01
C6	0.04	0.01	0.08	0.07	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.09	0.04	0.48	0.01	0.40	1.26	0.67
C8	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.09	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.06	0.47	0.03	0.40	1.04	0.61
N1	0.05	0.01	0.13	0.12	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.15	0.17	0.06	0.42	0.01	0.22	1.09	0.52
N2	0.07	0.00	0.20	0.19	0.01	0.09	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.28	0.09	0.31	0.02	0.18	0.77	0.24
N3	0.05	0.01	0.16	0.14	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.19	0.07	0.30	0.02	0.16	0.72	0.23
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.53	0.04	0.56	1.31	0.79
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.33	0.03	0.08	0.72	0.31
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.04	0.06	0.03	0.10	0.05	0.15	0.22	0.17	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.09	0.68	0.12	0.32
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.14	0.17	0.28	0.19	0.11	0.03	0.02	0.00	0.01	0.31	0.08	0.27	0.27	0.06
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.06	0.09	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.42	0.14	0.24
O5'	0.13	0.34	0.26	0.35	0.36	0.01	0.46	0.01	0.48	0.47	0.42	0.31	0.30	0.53	0.33	0.09	0.31	0.06	0.00	0.52	0.02	0.03	0.00
O6	0.04	0.02	0.07	0.07	0.03	0.07	0.02	0.13	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.09	0.08	0.06	0.52	0.00	0.56	1.43	0.81
OP1	0.35	0.11	0.32	0.17	0.11	0.45	0.36	0.10	0.40	0.40	0.22	0.18	0.16	0.56	0.08	0.68	0.27	0.42	0.02	0.56	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.86	0.37	0.40	0.86	0.11	1.16	0.06	1.26	1.04	1.09	0.77	0.72	1.31	0.72	0.12	0.27	0.14	0.03	1.43	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.33	0.05	0.14	0.37	0.23	0.62	0.01	0.67	0.61	0.52	0.24	0.23	0.79	0.31	0.32	0.06	0.24	0.00	0.81	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.13	0.16	0.18	0.10	0.17	0.13	0.38	0.17	0.10	0.14	0.15	0.13	0.16	0.11	0.27	0.11	0.15	0.27	0.24	0.04	0.13	0.09
C2	0.19	0.20	0.22	0.16	0.15	0.19	0.18	0.30	0.22	0.18	0.24	0.23	0.14	0.18	0.17	0.26	0.41	0.21	0.14	0.23	0.16	0.29	0.12
C2'	0.21	0.16	0.17	0.21	0.13	0.18	0.17	0.42	0.20	0.14	0.17	0.17	0.16	0.20	0.12	0.30	0.15	0.15	0.35	0.25	0.11	0.22	0.18
C3'	0.27	0.13	0.20	0.35	0.14	0.22	0.18	0.37	0.22	0.17	0.17	0.12	0.14	0.23	0.18	0.31	0.35	0.27	0.07	0.29	0.01	0.08	0.03
C4	0.18	0.07	0.18	0.16	0.06	0.12	0.08	0.25	0.13	0.14	0.12	0.09	0.06	0.13	0.14	0.24	0.21	0.14	0.16	0.19	0.08	0.24	0.09
C4'	0.25	0.12	0.20	0.34	0.14	0.19	0.21	0.38	0.25	0.22	0.18	0.11	0.12	0.27	0.18	0.31	0.32	0.23	0.03	0.33	0.13	0.28	0.11
C5	0.23	0.12	0.23	0.21	0.16	0.13	0.14	0.18	0.13	0.20	0.12	0.12	0.16	0.16	0.21	0.32	0.21	0.17	0.15	0.18	0.09	0.28	0.10
C5'	0.31	0.20	0.30	0.48	0.24	0.28	0.31	0.37	0.34	0.33	0.28	0.18	0.20	0.37	0.28	0.33	0.52	0.31	0.18	0.43	0.25	0.50	0.25
C6	0.25	0.13	0.27	0.23	0.20	0.17	0.18	0.16	0.15	0.22	0.12	0.11	0.20	0.19	0.23	0.37	0.32	0.20	0.10	0.19	0.09	0.31	0.09
C8	0.24	0.18	0.20	0.23	0.19	0.15	0.20	0.24	0.23	0.20	0.21	0.17	0.18	0.20	0.21	0.30	0.11	0.20	0.26	0.28	0.16	0.24	0.18
N1	0.23	0.14	0.26	0.21	0.18	0.20	0.18	0.22	0.21	0.20	0.21	0.13	0.15	0.19	0.21	0.31	0.41	0.22	0.08	0.23	0.13	0.31	0.10
N2	0.20	0.30	0.24	0.16	0.21	0.23	0.22	0.34	0.26	0.20	0.31	0.35	0.23	0.20	0.19	0.30	0.52	0.26	0.17	0.26	0.23	0.30	0.16
N3	0.14	0.15	0.17	0.13	0.09	0.15	0.13	0.32	0.17	0.14	0.18	0.19	0.10	0.15	0.11	0.24	0.32	0.16	0.17	0.20	0.14	0.26	0.11
N7	0.25	0.22	0.24	0.24	0.22	0.14	0.22	0.19	0.23	0.23	0.24	0.22	0.23	0.20	0.24	0.36	0.14	0.20	0.24	0.26	0.16	0.29	0.17
N9	0.19	0.10	0.16	0.18	0.09	0.12	0.12	0.28	0.17	0.13	0.14	0.11	0.10	0.14	0.14	0.23	0.09	0.15	0.21	0.23	0.07	0.19	0.11
O2'	0.28	0.25	0.30	0.29	0.22	0.34	0.21	0.55	0.22	0.21	0.22	0.28	0.26	0.23	0.21	0.46	0.33	0.25	0.55	0.25	0.14	0.23	0.24
O3'	0.30	0.15	0.22	0.39	0.14	0.27	0.17	0.38	0.21	0.15	0.16	0.17	0.18	0.22	0.17	0.39	0.50	0.33	0.03	0.28	0.01	0.02	0.01
O4'	0.21	0.10	0.16	0.26	0.11	0.15	0.19	0.37	0.23	0.20	0.17	0.10	0.09	0.26	0.15	0.27	0.15	0.17	0.12	0.32	0.08	0.20	0.05
O5'	0.48	0.61	0.42	0.35	0.55	0.38	0.60	0.40	0.67	0.48	0.65	0.61	0.56	0.56	0.49	0.49	0.36	0.45	0.46	0.73	0.12	0.34	0.29
O6	0.27	0.25	0.30	0.26	0.26	0.18	0.23	0.13	0.19	0.24	0.19	0.25	0.29	0.22	0.26	0.45	0.33	0.21	0.12	0.21	0.10	0.34	0.10
OP1	0.30	0.63	0.24	0.34	0.51	0.29	0.68	0.36	0.85	0.44	0.79	0.62	0.50	0.66	0.38	0.31	0.50	0.33	0.30	1.03	0.41	0.42	0.23
OP2	0.97	1.49	0.95	0.70	1.32	0.66	1.45	0.56	1.63	1.12	1.61	1.50	1.35	1.34	1.13	1.02	0.63	0.79	0.69	1.77	0.11	0.56	0.38
P	0.49	0.86	0.45	0.35	0.73	0.30	0.86	0.31	1.01	0.62	0.98	0.86	0.74	0.81	0.60	0.51	0.38	0.40	0.40	1.15	0.15	0.42	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.09	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.20	0.00	0.10	0.04	0.33	0.59	0.28
C2	0.05	0.00	0.16	0.19	0.02	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.40	0.33	0.08	0.23	0.02	0.32	0.60	0.27
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.21	0.08	0.06	0.13	0.18	0.15	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.27	0.62	0.21
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.18	0.00	0.26	0.03	0.25	0.34	0.21	0.21	0.17	0.34	0.18	0.02	0.00	0.02	0.36	0.29	0.26	0.22	0.20
C4	0.02	0.02	0.08	0.18	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.30	0.14	0.05	0.21	0.01	0.29	0.60	0.26
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.15	0.12	0.10	0.09	0.15	0.08	0.26	0.02	0.00	0.02	0.15	0.28	0.34	0.15
C5	0.03	0.01	0.05	0.26	0.01	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.31	0.13	0.05	0.29	0.01	0.30	0.60	0.28
C5'	0.09	0.18	0.21	0.03	0.16	0.01	0.20	0.00	0.22	0.19	0.21	0.17	0.16	0.22	0.13	0.05	0.15	0.01	0.00	0.25	0.08	0.31	0.01
C6	0.04	0.01	0.08	0.25	0.01	0.13	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.38	0.15	0.06	0.31	0.01	0.31	0.60	0.31
C8	0.01	0.02	0.06	0.34	0.00	0.15	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.26	0.03	0.28	0.02	0.28	0.62	0.27
N1	0.05	0.00	0.13	0.21	0.02	0.12	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.41	0.22	0.08	0.27	0.02	0.31	0.60	0.28
N2	0.06	0.00	0.18	0.21	0.02	0.10	0.01	0.17	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.41	0.45	0.10	0.21	0.03	0.34	0.59	0.27
N3	0.04	0.01	0.15	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.35	0.33	0.07	0.19	0.01	0.33	0.60	0.26
N7	0.02	0.01	0.04	0.34	0.01	0.15	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.27	0.03	0.33	0.03	0.32	0.61	0.31
N9	0.01	0.03	0.01	0.18	0.01	0.08	0.02	0.13	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.17	0.04	0.02	0.18	0.03	0.28	0.61	0.25
O2'	0.02	0.40	0.00	0.02	0.30	0.26	0.31	0.05	0.38	0.15	0.41	0.41	0.35	0.24	0.17	0.00	0.03	0.20	0.19	0.38	0.37	0.58	0.19
O3'	0.20	0.33	0.01	0.00	0.14	0.02	0.13	0.15	0.15	0.26	0.22	0.45	0.33	0.27	0.04	0.03	0.00	0.15	0.50	0.18	0.61	0.24	0.44
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.07	0.03	0.02	0.20	0.15	0.00	0.22	0.06	0.38	0.56	0.34
O5'	0.10	0.23	0.08	0.36	0.21	0.02	0.29	0.00	0.31	0.28	0.27	0.21	0.19	0.33	0.18	0.19	0.50	0.22	0.00	0.35	0.01	0.03	0.01
O6	0.04	0.02	0.07	0.29	0.01	0.15	0.01	0.25	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.38	0.18	0.06	0.35	0.00	0.35	0.61	0.35
OP1	0.33	0.32	0.27	0.26	0.29	0.28	0.30	0.08	0.31	0.28	0.31	0.34	0.33	0.32	0.28	0.37	0.61	0.38	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00
OP2	0.59	0.60	0.62	0.22	0.60	0.34	0.60	0.31	0.60	0.62	0.60	0.59	0.60	0.61	0.61	0.58	0.24	0.56	0.03	0.61	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.27	0.21	0.20	0.26	0.15	0.28	0.01	0.31	0.27	0.28	0.27	0.26	0.31	0.25	0.19	0.44	0.34	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00