Doublet Group distance statistics: 49995

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.002, 0.022, 0.041, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C2	A	0, -0.006, 0.018, 0.043, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.024
N9	A	0, -0.002, 0.023, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.025
N1	A	0, -0.004, 0.021, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.034 std_dev=0.029
C1'	A	0, -0.006, 0.026, 0.058, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.003, 0.036, 0.068, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.032
C1'	B	0, 0.057, 0.197, 0.337, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.197 std_dev=0.140
N9	B	0, 0.065, 0.288, 0.510, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.288 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.005, 0.271, 0.538, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.271 std_dev=0.267
C8	B	0, 0.056, 0.342, 0.629, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.342 std_dev=0.286
C4	B	0, 0.045, 0.422, 0.800, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.422 std_dev=0.378
C2'	A	0, -0.013, 0.374, 0.761, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.374 std_dev=0.387
O5'	A	0, 0.173, 0.626, 1.079, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.626 std_dev=0.453
N7	B	0, 0.040, 0.499, 0.958, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.499 std_dev=0.459
N3	B	0, 0.022, 0.485, 0.948, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.485 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.036, 0.540, 1.043, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.540 std_dev=0.504
C4'	A	0, -0.041, 0.486, 1.014, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.486 std_dev=0.528
C3'	A	0, -0.031, 0.568, 1.168, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.568 std_dev=0.600
C5'	A	0, 0.040, 0.665, 1.290, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.665 std_dev=0.625
C2	B	0, 0.005, 0.634, 1.263, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.634 std_dev=0.629
C6	B	0, 0.020, 0.719, 1.418, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.719 std_dev=0.699
N1	B	0, 0.007, 0.740, 1.472, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.740 std_dev=0.733
N2	B	0, -0.011, 0.724, 1.460, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.724 std_dev=0.736
O2'	A	0, -0.116, 0.731, 1.579, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.731 std_dev=0.847
O6	B	0, 0.011, 0.879, 1.747, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.879 std_dev=0.868
O3'	B	0, -0.048, 0.828, 1.703, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.828 std_dev=0.876
P	A	0, 0.349, 1.248, 2.146, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.248 std_dev=0.899
O3'	A	0, -0.068, 0.867, 1.801, 2.164 max_d=2.164 avg_d=0.867 std_dev=0.935
OP1	A	0, 0.286, 1.308, 2.331, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.308 std_dev=1.023
C3'	B	0, -0.128, 0.986, 2.100, 2.543 max_d=2.543 avg_d=0.986 std_dev=1.114
O4'	B	0, -0.187, 0.951, 2.088, 2.550 max_d=2.550 avg_d=0.951 std_dev=1.137
C4'	B	0, -0.188, 1.007, 2.202, 2.686 max_d=2.686 avg_d=1.007 std_dev=1.195
C2'	B	0, -0.197, 1.019, 2.236, 2.729 max_d=2.729 avg_d=1.019 std_dev=1.217
OP2	A	0, 0.488, 1.989, 3.489, 3.624 max_d=3.624 avg_d=1.989 std_dev=1.501
O2'	B	0, -0.464, 1.569, 3.603, 4.441 max_d=4.441 avg_d=1.569 std_dev=2.033
C5'	B	0, -0.531, 1.938, 4.408, 5.423 max_d=5.423 avg_d=1.938 std_dev=2.469
O5'	B	0, -0.729, 2.646, 6.021, 7.410 max_d=7.410 avg_d=2.646 std_dev=3.375
P	B	0, -0.991, 3.644, 8.279, 10.184 max_d=10.184 avg_d=3.644 std_dev=4.635
OP1	B	0, -1.057, 3.836, 8.728, 10.741 max_d=10.741 avg_d=3.836 std_dev=4.893
OP2	B	0, -1.017, 3.914, 8.845, 10.869 max_d=10.869 avg_d=3.914 std_dev=4.931

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.27	0.04	0.47	0.04	0.05
C2	0.05	0.00	0.22	0.23	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.12	0.01	0.31	0.00	0.52	0.18	0.01
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.10	0.01	0.04	0.14	0.08	0.10	0.17	0.28	0.22	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.60	0.06	0.17	0.59	0.60
C3'	0.03	0.23	0.01	0.00	0.25	0.01	0.33	0.02	0.33	0.33	0.30	0.20	0.20	0.36	0.23	0.03	0.01	0.03	0.35	0.37	0.08	0.70	0.45
C4	0.03	0.01	0.10	0.25	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.03	0.00	0.37	0.02	0.47	0.14	0.03
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.13	0.17	0.11	0.06	0.06	0.17	0.10	0.32	0.04	0.00	0.03	0.15	0.45	0.20	0.08
C5	0.03	0.00	0.04	0.33	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.34	0.12	0.03	0.44	0.01	0.43	0.20	0.08
C5'	0.02	0.07	0.14	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.06	0.06	0.16	0.07	0.16	0.23	0.01	0.00	0.15	0.32	0.40	0.00
C6	0.03	0.00	0.08	0.33	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.35	0.11	0.02	0.44	0.01	0.43	0.22	0.08
C8	0.00	0.01	0.10	0.33	0.00	0.17	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.21	0.07	0.47	0.01	0.39	0.21	0.12
N1	0.05	0.00	0.17	0.30	0.02	0.11	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.27	0.03	0.01	0.37	0.00	0.48	0.21	0.03
N2	0.06	0.00	0.28	0.20	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.19	0.02	0.26	0.01	0.55	0.21	0.05
N3	0.05	0.01	0.22	0.20	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.15	0.01	0.29	0.01	0.52	0.16	0.03
N7	0.01	0.00	0.06	0.36	0.00	0.17	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.37	0.24	0.05	0.49	0.01	0.36	0.26	0.14
N9	0.01	0.02	0.01	0.23	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.21	0.02	0.02	0.38	0.02	0.46	0.10	0.04
O2'	0.03	0.17	0.00	0.03	0.24	0.32	0.34	0.16	0.35	0.30	0.27	0.08	0.13	0.37	0.21	0.00	0.01	0.21	0.20	0.38	0.15	0.27	0.33
O3'	0.19	0.12	0.01	0.01	0.03	0.04	0.12	0.23	0.11	0.21	0.03	0.19	0.15	0.24	0.02	0.01	0.00	0.10	0.08	0.17	0.26	0.55	0.19
O4'	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.21	0.10	0.00	0.07	0.03	0.73	0.25	0.29
O5'	0.27	0.31	0.60	0.35	0.37	0.03	0.44	0.00	0.44	0.47	0.37	0.26	0.29	0.49	0.38	0.20	0.08	0.07	0.00	0.46	0.01	0.03	0.01
O6	0.04	0.00	0.06	0.37	0.02	0.15	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.38	0.17	0.03	0.46	0.00	0.39	0.27	0.11
OP1	0.47	0.52	0.17	0.08	0.47	0.45	0.43	0.32	0.43	0.39	0.48	0.55	0.52	0.36	0.46	0.15	0.26	0.73	0.01	0.39	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.18	0.59	0.70	0.14	0.20	0.20	0.40	0.22	0.21	0.21	0.21	0.16	0.26	0.10	0.27	0.55	0.25	0.03	0.27	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.01	0.60	0.45	0.03	0.08	0.08	0.00	0.08	0.12	0.03	0.05	0.03	0.14	0.04	0.33	0.19	0.29	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.29	0.67	0.65	0.03	0.06	0.14	0.19	0.17	0.17	0.11	0.50	0.24	0.26	0.03	0.42	0.26	0.32	0.43	0.34	1.54	0.87	0.81
C2	0.15	0.50	0.35	0.16	0.32	0.49	0.30	0.64	0.42	0.05	0.52	0.53	0.41	0.11	0.17	0.47	0.08	0.69	0.71	0.39	0.19	1.07	0.84
C2'	0.11	0.39	0.48	0.56	0.01	0.06	0.27	0.40	0.34	0.27	0.06	0.76	0.32	0.42	0.05	0.08	0.09	0.18	0.79	0.64	1.84	1.35	1.22
C3'	0.42	0.34	1.05	1.22	0.52	0.70	0.69	1.14	0.76	0.66	0.58	0.08	0.33	0.75	0.53	0.57	0.72	0.41	1.56	0.90	2.76	2.28	2.11
C4	0.09	0.34	0.63	0.47	0.11	0.26	0.07	0.22	0.10	0.12	0.23	0.44	0.29	0.18	0.02	0.58	0.18	0.52	0.15	0.17	0.74	0.06	0.03
C4'	0.23	0.24	0.99	1.08	0.35	0.42	0.49	0.80	0.57	0.45	0.44	0.08	0.21	0.54	0.34	0.62	0.63	0.11	1.14	0.71	2.48	1.91	1.73
C5	0.06	0.17	0.74	0.47	0.05	0.32	0.13	0.33	0.14	0.14	0.10	0.24	0.17	0.20	0.03	0.78	0.21	0.59	0.31	0.20	0.59	0.25	0.14
C5'	0.27	0.41	1.08	1.20	0.43	0.53	0.56	0.97	0.66	0.48	0.59	0.30	0.32	0.58	0.39	0.69	0.74	0.20	1.34	0.79	2.86	2.29	2.08
C6	0.08	0.21	0.61	0.24	0.13	0.54	0.10	0.71	0.13	0.07	0.18	0.23	0.20	0.11	0.05	0.86	0.10	0.79	0.85	0.13	0.14	1.05	0.85
C8	0.01	0.09	0.87	0.75	0.15	0.04	0.30	0.16	0.37	0.23	0.27	0.09	0.03	0.32	0.12	0.70	0.37	0.33	0.35	0.45	1.57	0.81	0.79
N1	0.13	0.38	0.39	0.10	0.28	0.60	0.26	0.83	0.33	0.06	0.38	0.39	0.33	0.13	0.16	0.64	0.08	0.80	0.99	0.30	0.49	1.43	1.15
N2	0.18	0.56	0.20	0.07	0.38	0.55	0.41	0.76	0.57	0.13	0.63	0.59	0.46	0.22	0.22	0.34	0.13	0.70	0.86	0.60	0.52	1.41	1.12
N3	0.13	0.50	0.46	0.32	0.25	0.35	0.17	0.37	0.29	0.03	0.47	0.57	0.40	0.06	0.11	0.44	0.10	0.58	0.33	0.22	0.37	0.43	0.30
N7	0.01	0.13	0.93	0.70	0.17	0.15	0.28	0.05	0.33	0.22	0.26	0.06	0.06	0.30	0.13	0.87	0.35	0.44	0.05	0.38	1.17	0.36	0.40
N9	0.06	0.21	0.73	0.63	0.02	0.11	0.17	0.08	0.21	0.18	0.08	0.38	0.19	0.26	0.04	0.56	0.27	0.38	0.24	0.34	1.32	0.58	0.58
O2'	0.75	1.17	0.23	0.11	0.77	0.54	0.53	0.20	0.54	0.43	0.96	1.40	1.04	0.32	0.66	0.66	0.55	0.78	0.21	0.23	1.21	0.70	0.61
O3'	0.38	0.32	0.95	1.21	0.44	0.75	0.55	1.24	0.61	0.53	0.48	0.16	0.31	0.59	0.45	0.43	0.74	0.44	1.68	0.73	2.84	2.44	2.24
O4'	0.06	0.02	0.86	0.86	0.13	0.12	0.27	0.36	0.33	0.25	0.19	0.15	0.04	0.33	0.14	0.63	0.47	0.22	0.60	0.46	1.89	1.20	1.10
O5'	0.65	0.51	0.29	0.38	0.45	0.42	0.23	0.25	0.09	0.33	0.22	0.68	0.62	0.18	0.49	0.28	0.33	0.71	0.56	0.14	2.12	1.53	1.33
O6	0.04	0.09	0.66	0.15	0.07	0.69	0.09	0.97	0.10	0.08	0.10	0.10	0.08	0.10	0.04	1.11	0.09	0.93	1.22	0.12	0.52	1.46	1.23
OP1	0.24	0.26	0.85	0.90	0.25	0.41	0.37	0.76	0.45	0.31	0.35	0.36	0.27	0.42	0.22	0.49	0.53	0.33	1.10	0.61	2.75	2.05	1.91
OP2	0.45	0.49	0.66	0.76	0.32	0.42	0.14	0.59	0.07	0.18	0.26	0.72	0.51	0.10	0.32	0.41	0.55	0.51	0.87	0.12	2.50	1.76	1.64
P	0.50	0.47	0.47	0.59	0.35	0.34	0.17	0.49	0.08	0.21	0.22	0.67	0.53	0.10	0.36	0.22	0.36	0.53	0.83	0.12	2.48	1.78	1.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.03	0.24	0.00	0.14	0.03	0.38	0.31	0.05
C2	0.05	0.00	0.55	0.93	0.02	0.64	0.01	1.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.43	0.32	1.64	0.01	2.51	1.98	2.01
C2'	0.00	0.55	0.00	0.01	0.27	0.00	0.13	0.14	0.24	0.21	0.42	0.66	0.53	0.10	0.02	0.01	0.05	0.05	0.13	0.17	0.47	0.33	0.09
C3'	0.02	0.93	0.01	0.00	0.50	0.00	0.37	0.01	0.54	0.10	0.79	1.10	0.86	0.07	0.14	0.02	0.01	0.01	0.32	0.48	0.76	0.10	0.43
C4	0.02	0.02	0.27	0.50	0.00	0.33	0.00	0.55	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.11	0.16	0.90	0.01	1.30	0.68	0.91
C4'	0.00	0.64	0.00	0.00	0.33	0.00	0.22	0.00	0.34	0.14	0.53	0.77	0.58	0.02	0.07	0.23	0.01	0.01	0.00	0.29	0.25	0.25	0.03
C5	0.02	0.01	0.13	0.37	0.00	0.22	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.24	0.05	0.09	0.72	0.00	1.01	0.44	0.65
C5'	0.01	1.11	0.14	0.01	0.55	0.00	0.40	0.00	0.63	0.22	0.96	1.36	0.97	0.03	0.13	0.07	0.12	0.04	0.01	0.54	0.05	0.22	0.03
C6	0.04	0.01	0.24	0.54	0.02	0.34	0.01	0.63	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.23	0.18	0.16	1.03	0.00	1.48	1.00	1.10
C8	0.01	0.02	0.21	0.10	0.00	0.14	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.24	0.23	0.13	0.10	0.00	0.09	0.81	0.40
N1	0.05	0.01	0.42	0.79	0.03	0.53	0.01	0.96	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.15	0.35	0.26	1.44	0.01	2.17	1.72	1.73
N2	0.06	0.01	0.66	1.10	0.03	0.77	0.02	1.36	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.59	0.37	1.93	0.02	3.15	2.59	2.56
N3	0.04	0.01	0.53	0.86	0.01	0.58	0.01	0.97	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.34	0.30	1.42	0.01	2.13	1.49	1.66
N7	0.02	0.01	0.10	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.29	0.13	0.05	0.19	0.01	0.22	0.44	0.11
N9	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.16	0.12	0.02	0.33	0.02	0.53	0.15	0.19
O2'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.15	0.23	0.24	0.07	0.23	0.24	0.15	0.01	0.04	0.29	0.16	0.00	0.12	0.14	0.23	0.28	0.56	0.33	0.17
O3'	0.24	0.43	0.05	0.01	0.11	0.01	0.05	0.12	0.18	0.23	0.35	0.59	0.34	0.13	0.12	0.12	0.00	0.13	0.32	0.15	1.07	0.27	0.62
O4'	0.00	0.32	0.05	0.01	0.16	0.01	0.09	0.04	0.16	0.13	0.26	0.37	0.30	0.05	0.02	0.14	0.13	0.00	0.02	0.11	0.13	0.44	0.13
O5'	0.14	1.64	0.13	0.32	0.90	0.00	0.72	0.01	1.03	0.10	1.44	1.93	1.42	0.19	0.33	0.23	0.32	0.02	0.00	0.92	0.03	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.17	0.48	0.01	0.29	0.00	0.54	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.28	0.15	0.11	0.92	0.00	1.30	0.85	0.94
OP1	0.38	2.51	0.47	0.76	1.30	0.25	1.01	0.05	1.48	0.09	2.17	3.15	2.13	0.22	0.53	0.56	1.07	0.13	0.03	1.30	0.00	0.03	0.01
OP2	0.31	1.98	0.33	0.10	0.68	0.25	0.44	0.22	1.00	0.81	1.72	2.59	1.49	0.44	0.15	0.33	0.27	0.44	0.03	0.85	0.03	0.00	0.02
P	0.05	2.01	0.09	0.43	0.91	0.03	0.65	0.03	1.10	0.40	1.73	2.56	1.66	0.11	0.19	0.17	0.62	0.13	0.01	0.94	0.01	0.02	0.00