Doublet Group distance statistics: 49996

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C6	B	0, 0.059, 0.213, 0.366, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.213 std_dev=0.153
O3'	B	0, 0.074, 0.254, 0.434, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.254 std_dev=0.180
O6	B	0, 0.065, 0.246, 0.426, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.246 std_dev=0.181
N1	B	0, 0.069, 0.251, 0.432, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.251 std_dev=0.182
C2'	A	0, -0.029, 0.213, 0.455, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.213 std_dev=0.242
O4'	A	0, -0.055, 0.200, 0.456, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.200 std_dev=0.256
O2'	A	0, 0.005, 0.297, 0.589, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.297 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.054, 0.384, 0.714, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.384 std_dev=0.330
C4'	A	0, -0.058, 0.301, 0.660, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.301 std_dev=0.359
C2	B	0, 0.038, 0.403, 0.767, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.403 std_dev=0.365
C3'	A	0, -0.028, 0.346, 0.721, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.346 std_dev=0.375
N2	B	0, 0.060, 0.539, 1.017, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.539 std_dev=0.478
N7	B	0, 0.049, 0.528, 1.007, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.528 std_dev=0.479
C4	B	0, -0.007, 0.479, 0.966, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.479 std_dev=0.487
N3	B	0, -0.019, 0.496, 1.010, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.496 std_dev=0.514
O3'	A	0, -0.001, 0.580, 1.161, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.580 std_dev=0.581
OP2	B	0, 0.059, 0.664, 1.269, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.664 std_dev=0.605
C5'	A	0, -0.128, 0.490, 1.108, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.490 std_dev=0.618
O5'	B	0, 0.001, 0.634, 1.267, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.634 std_dev=0.633
O5'	A	0, -0.080, 0.566, 1.211, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.566 std_dev=0.646
C8	B	0, -0.005, 0.659, 1.324, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.659 std_dev=0.665
C3'	B	0, 0.010, 0.675, 1.341, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.675 std_dev=0.665
P	B	0, 0.033, 0.716, 1.399, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.716 std_dev=0.683
N9	B	0, -0.051, 0.643, 1.337, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.643 std_dev=0.694
C4'	B	0, -0.084, 0.822, 1.729, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.822 std_dev=0.906
O4'	B	0, -0.109, 0.807, 1.722, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.807 std_dev=0.915
C1'	B	0, -0.116, 0.815, 1.746, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.815 std_dev=0.931
OP1	B	0, 0.012, 1.111, 2.210, 2.608 max_d=2.608 avg_d=1.111 std_dev=1.099
C5'	B	0, -0.147, 0.970, 2.088, 2.536 max_d=2.536 avg_d=0.970 std_dev=1.117
C2'	B	0, -0.136, 1.023, 2.183, 2.645 max_d=2.645 avg_d=1.023 std_dev=1.159
P	A	0, -0.233, 0.997, 2.226, 2.729 max_d=2.729 avg_d=0.997 std_dev=1.230
OP2	A	0, -0.214, 1.071, 2.356, 2.878 max_d=2.878 avg_d=1.071 std_dev=1.285
OP1	A	0, -0.306, 1.291, 2.888, 3.541 max_d=3.541 avg_d=1.291 std_dev=1.597
O2'	B	0, -0.235, 1.365, 2.966, 3.612 max_d=3.612 avg_d=1.365 std_dev=1.601

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.16	0.26	0.25
C2	0.01	0.00	0.18	0.14	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.24	0.07	0.23	0.01	0.36	0.56	0.49
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.03	0.08	0.07	0.14	0.21	0.19	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.06	0.04	0.19	0.15
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.12	0.09	0.17	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.03	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.11	0.04	0.24	0.01	0.36	0.52	0.47
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.07
C5	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.02	0.28	0.01	0.44	0.61	0.53
C5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.16	0.18	0.13	0.07	0.08	0.19	0.12	0.03	0.02	0.03	0.01	0.18	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.04	0.29	0.00	0.47	0.66	0.57
C8	0.00	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.29	0.01	0.40	0.50	0.46
N1	0.01	0.00	0.14	0.09	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.18	0.06	0.27	0.00	0.43	0.63	0.55
N2	0.01	0.00	0.21	0.17	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.30	0.09	0.21	0.01	0.34	0.55	0.48
N3	0.01	0.00	0.19	0.13	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.22	0.07	0.20	0.01	0.31	0.49	0.44
N7	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.31	0.01	0.47	0.61	0.53
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.22	0.01	0.31	0.43	0.40
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.13	0.03	0.08	0.03	0.12	0.05	0.19	0.29	0.23	0.01	0.03	0.00	0.04	0.04	0.07	0.09	0.05	0.15	0.11
O3'	0.02	0.24	0.03	0.01	0.11	0.01	0.05	0.02	0.09	0.13	0.18	0.30	0.22	0.09	0.01	0.04	0.00	0.02	0.05	0.06	0.15	0.03	0.01
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.16	0.15	0.18
O5'	0.12	0.23	0.10	0.08	0.24	0.03	0.28	0.01	0.29	0.29	0.27	0.21	0.20	0.31	0.22	0.07	0.05	0.04	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.03	0.31	0.00	0.52	0.70	0.60
OP1	0.16	0.36	0.04	0.03	0.36	0.04	0.44	0.04	0.47	0.40	0.43	0.34	0.31	0.47	0.31	0.05	0.15	0.16	0.02	0.52	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.56	0.19	0.10	0.52	0.07	0.61	0.02	0.66	0.50	0.63	0.55	0.49	0.61	0.43	0.15	0.03	0.15	0.02	0.70	0.02	0.00	0.01
P	0.25	0.49	0.15	0.07	0.47	0.07	0.53	0.02	0.57	0.46	0.55	0.48	0.44	0.53	0.40	0.11	0.01	0.18	0.01	0.60	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.23	0.13	0.26	0.02	0.17	0.17	0.48	0.11	0.40	0.10	0.37	0.20	0.40	0.15	0.29	0.06	0.13	0.05	0.22	0.08	0.17	0.01
C2	0.74	0.14	0.76	0.60	0.31	0.70	0.31	0.85	0.11	0.67	0.09	0.37	0.08	0.52	0.60	0.90	0.04	0.79	0.45	0.12	0.48	0.05	0.28
C2'	0.07	0.19	0.11	0.28	0.03	0.15	0.16	0.49	0.11	0.36	0.08	0.31	0.18	0.36	0.12	0.31	0.07	0.07	0.02	0.20	0.10	0.17	0.02
C3'	0.01	0.16	0.04	0.34	0.02	0.11	0.13	0.36	0.11	0.29	0.05	0.26	0.17	0.32	0.06	0.19	0.27	0.04	0.06	0.21	0.03	0.08	0.01
C4	0.39	0.18	0.40	0.44	0.15	0.41	0.25	0.61	0.12	0.56	0.09	0.35	0.09	0.48	0.38	0.46	0.07	0.44	0.31	0.18	0.24	0.16	0.12
C4'	0.03	0.19	0.06	0.33	0.02	0.13	0.15	0.40	0.12	0.31	0.07	0.31	0.18	0.34	0.08	0.22	0.22	0.01	0.03	0.23	0.02	0.02	0.01
C5	0.32	0.16	0.32	0.39	0.15	0.31	0.24	0.44	0.11	0.48	0.08	0.30	0.08	0.43	0.33	0.28	0.11	0.32	0.31	0.16	0.15	0.25	0.07
C5'	0.08	0.27	0.04	0.32	0.12	0.06	0.05	0.29	0.05	0.17	0.15	0.38	0.26	0.21	0.04	0.08	0.27	0.10	0.05	0.14	0.05	0.04	0.01
C6	0.48	0.12	0.48	0.45	0.27	0.42	0.27	0.50	0.10	0.50	0.08	0.29	0.09	0.41	0.45	0.41	0.13	0.45	0.38	0.10	0.24	0.22	0.12
C8	0.02	0.20	0.01	0.22	0.05	0.04	0.12	0.20	0.10	0.25	0.08	0.29	0.20	0.31	0.04	0.01	0.12	0.03	0.10	0.22	0.13	0.38	0.15
N1	0.69	0.12	0.70	0.55	0.35	0.60	0.31	0.69	0.10	0.60	0.09	0.34	0.14	0.47	0.58	0.73	0.08	0.67	0.44	0.08	0.39	0.12	0.22
N2	0.84	0.12	0.91	0.66	0.35	0.82	0.33	0.97	0.11	0.69	0.09	0.38	0.12	0.53	0.65	1.15	0.03	0.89	0.48	0.10	0.60	0.04	0.36
N3	0.59	0.17	0.61	0.54	0.23	0.62	0.29	0.83	0.12	0.65	0.09	0.38	0.04	0.52	0.50	0.76	0.04	0.69	0.39	0.16	0.42	0.05	0.25
N7	0.06	0.17	0.07	0.26	0.02	0.10	0.13	0.21	0.09	0.26	0.07	0.25	0.15	0.30	0.09	0.04	0.15	0.05	0.19	0.19	0.08	0.38	0.12
N9	0.15	0.21	0.17	0.31	0.03	0.21	0.19	0.44	0.12	0.43	0.09	0.34	0.17	0.41	0.19	0.25	0.08	0.17	0.16	0.21	0.07	0.23	0.02
O2'	0.11	0.18	0.15	0.23	0.05	0.18	0.17	0.55	0.12	0.37	0.08	0.31	0.17	0.36	0.15	0.44	0.08	0.14	0.17	0.21	0.15	0.14	0.05
O3'	0.04	0.13	0.02	0.36	0.02	0.08	0.10	0.29	0.09	0.21	0.03	0.21	0.14	0.25	0.03	0.21	0.46	0.09	0.02	0.18	0.01	0.01	0.00
O4'	0.09	0.18	0.12	0.32	0.04	0.16	0.21	0.45	0.17	0.40	0.06	0.33	0.16	0.43	0.16	0.26	0.07	0.09	0.08	0.29	0.04	0.05	0.02
O5'	0.21	0.35	0.16	0.26	0.23	0.04	0.09	0.15	0.10	0.05	0.24	0.45	0.36	0.12	0.16	0.12	0.19	0.23	0.08	0.09	0.10	0.02	0.03
O6	0.40	0.08	0.42	0.40	0.27	0.35	0.23	0.39	0.07	0.38	0.08	0.20	0.16	0.31	0.37	0.27	0.16	0.35	0.37	0.04	0.19	0.27	0.10
OP1	0.16	0.42	0.06	0.45	0.26	0.10	0.16	0.30	0.21	0.06	0.34	0.52	0.38	0.09	0.16	0.06	0.49	0.16	0.27	0.16	0.17	0.36	0.24
OP2	0.40	0.59	0.32	0.19	0.47	0.16	0.35	0.05	0.37	0.23	0.50	0.67	0.58	0.20	0.39	0.42	0.13	0.40	0.14	0.26	0.06	0.06	0.02
P	0.29	0.53	0.21	0.26	0.37	0.07	0.24	0.14	0.27	0.11	0.42	0.63	0.51	0.09	0.28	0.24	0.20	0.30	0.14	0.17	0.00	0.13	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.32	0.01	0.08	0.01	0.04	0.51	0.14
C2	0.02	0.00	0.10	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.45	0.08	0.17	0.00	0.04	0.40	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.20	0.02	0.06	0.06	0.12	0.10	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.13	0.02	0.06	0.43	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.16	0.01	0.27	0.00	0.25	0.37	0.15	0.03	0.03	0.37	0.20	0.01	0.00	0.02	0.39	0.29	0.45	0.11	0.33
C4	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.23	0.04	0.26	0.00	0.05	0.39	0.06
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.08	0.18	0.02	0.09	0.05	0.17	0.08	0.30	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.33	0.04
C5	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.05	0.01	0.41	0.00	0.10	0.25	0.07
C5'	0.08	0.06	0.20	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.10	0.02	0.10	0.08	0.12	0.02	0.09	0.22	0.01	0.00	0.09	0.10	0.34	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.25	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.11	0.01	0.41	0.00	0.11	0.20	0.08
C8	0.00	0.00	0.06	0.37	0.00	0.18	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.17	0.07	0.50	0.00	0.11	0.29	0.11
N1	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.29	0.05	0.29	0.00	0.06	0.29	0.02
N2	0.02	0.00	0.12	0.03	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.58	0.10	0.09	0.00	0.05	0.44	0.16
N3	0.02	0.00	0.10	0.03	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.46	0.08	0.12	0.00	0.04	0.45	0.14
N7	0.00	0.00	0.05	0.37	0.00	0.17	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.16	0.05	0.55	0.00	0.14	0.17	0.17
N9	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.11	0.00	0.27	0.00	0.05	0.43	0.05
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.27	0.30	0.38	0.09	0.42	0.29	0.36	0.19	0.19	0.38	0.21	0.00	0.02	0.20	0.29	0.47	0.29	0.37	0.09
O3'	0.32	0.45	0.02	0.00	0.23	0.01	0.05	0.22	0.11	0.17	0.29	0.58	0.46	0.16	0.11	0.02	0.00	0.22	0.46	0.02	0.89	0.37	0.57
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.10	0.08	0.05	0.00	0.20	0.22	0.00	0.07	0.02	0.07	0.60	0.23
O5'	0.08	0.17	0.13	0.39	0.26	0.01	0.41	0.00	0.41	0.50	0.29	0.09	0.12	0.55	0.27	0.29	0.46	0.07	0.00	0.49	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.29	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.02	0.02	0.49	0.00	0.14	0.10	0.16
OP1	0.04	0.04	0.06	0.45	0.05	0.13	0.10	0.10	0.11	0.11	0.06	0.05	0.04	0.14	0.05	0.29	0.89	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00
OP2	0.51	0.40	0.43	0.11	0.39	0.33	0.25	0.34	0.20	0.29	0.29	0.44	0.45	0.17	0.43	0.37	0.37	0.60	0.00	0.10	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.11	0.08	0.33	0.06	0.04	0.07	0.01	0.08	0.11	0.02	0.16	0.14	0.17	0.05	0.09	0.57	0.23	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00