Doublet Group distance statistics: 50000

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.000, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	B	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.000, 0.039, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C2'	B	0, 0.000, 0.085, 0.170, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.085 std_dev=0.085
C1'	B	0, 0.000, 0.170, 0.339, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.170 std_dev=0.170
C8	B	0, 0.000, 0.173, 0.345, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.173 std_dev=0.173
C4	B	0, 0.000, 0.197, 0.394, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.197 std_dev=0.197
N7	B	0, 0.000, 0.287, 0.574, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.287 std_dev=0.287
C3'	B	0, 0.000, 0.293, 0.586, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.293 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
N3	B	0, 0.000, 0.333, 0.665, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.333 std_dev=0.333
O2'	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
O4'	A	0, 0.000, 0.351, 0.701, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.351 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.000, 0.353, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.353 std_dev=0.353
C4'	B	0, 0.000, 0.419, 0.838, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.419 std_dev=0.419
C2'	A	0, 0.000, 0.421, 0.843, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.421 std_dev=0.421
O3'	B	0, 0.000, 0.444, 0.887, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.444 std_dev=0.444
C4'	A	0, 0.000, 0.485, 0.969, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.485 std_dev=0.485
C2	B	0, 0.000, 0.553, 1.105, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.553 std_dev=0.553
C5'	B	0, 0.000, 0.556, 1.111, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.556 std_dev=0.556
OP1	A	0, 0.000, 0.559, 1.119, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.559 std_dev=0.559
C6	B	0, 0.000, 0.584, 1.168, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.584 std_dev=0.584
O2'	A	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
C3'	A	0, 0.000, 0.638, 1.275, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.638 std_dev=0.638
N1	B	0, 0.000, 0.663, 1.325, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.663 std_dev=0.663
P	A	0, 0.000, 0.671, 1.343, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.671 std_dev=0.671
N2	B	0, 0.000, 0.703, 1.406, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.703 std_dev=0.703
O5'	B	0, 0.000, 0.725, 1.451, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.725 std_dev=0.725
O6	B	0, 0.000, 0.799, 1.598, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.799 std_dev=0.799
OP2	A	0, 0.000, 0.814, 1.627, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.814 std_dev=0.814
C5'	A	0, 0.000, 0.897, 1.793, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.897 std_dev=0.897
P	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
O5'	A	0, 0.000, 0.928, 1.857, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.928 std_dev=0.928
O3'	A	0, 0.000, 0.952, 1.904, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.952 std_dev=0.952
OP2	B	0, 0.000, 1.050, 2.100, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.050 std_dev=1.050
OP1	B	0, 0.000, 1.147, 2.294, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.147 std_dev=1.147

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.06	0.32	0.09
C2	0.01	0.00	0.18	0.17	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.21	0.22	0.02	0.30	0.03	0.15	0.13	0.05
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04	0.11	0.13	0.23	0.18	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.26	0.01	0.32	0.14	0.10
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.12	0.24	0.16	0.14	0.05	0.03	0.02	0.02	0.35	0.02	0.47	0.03	0.25
C4	0.00	0.00	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.04	0.01	0.35	0.02	0.16	0.14	0.07
C4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.10	0.06	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.34	0.06
C5	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.45	0.01	0.21	0.03	0.15
C5'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.06	0.10	0.06	0.03	0.01	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.17	0.35	0.01
C6	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.46	0.01	0.23	0.02	0.17
C8	0.00	0.01	0.11	0.18	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.23	0.03	0.48	0.01	0.19	0.09	0.13
N1	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.01	0.38	0.02	0.19	0.05	0.11
N2	0.01	0.00	0.23	0.24	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.27	0.31	0.03	0.24	0.04	0.13	0.16	0.02
N3	0.00	0.00	0.18	0.16	0.00	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.20	0.20	0.03	0.26	0.03	0.13	0.18	0.02
N7	0.01	0.02	0.08	0.14	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.19	0.02	0.52	0.01	0.23	0.02	0.20
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.33	0.01	0.14	0.20	0.03
O2'	0.00	0.21	0.00	0.03	0.09	0.07	0.04	0.08	0.07	0.07	0.16	0.27	0.20	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.28	0.18	0.03
O3'	0.02	0.22	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.04	0.00	0.23	0.13	0.31	0.20	0.19	0.06	0.01	0.00	0.02	0.33	0.05	0.64	0.10	0.36
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.47	0.23
O5'	0.15	0.30	0.26	0.35	0.35	0.01	0.45	0.01	0.46	0.48	0.38	0.24	0.26	0.52	0.33	0.13	0.33	0.01	0.00	0.51	0.02	0.00	0.00
O6	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.51	0.00	0.26	0.10	0.23
OP1	0.06	0.15	0.32	0.47	0.16	0.14	0.21	0.17	0.23	0.19	0.19	0.13	0.13	0.23	0.14	0.28	0.64	0.08	0.02	0.26	0.00	0.00	0.01
OP2	0.32	0.13	0.14	0.03	0.14	0.34	0.03	0.35	0.02	0.09	0.05	0.16	0.18	0.02	0.20	0.18	0.10	0.47	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.05	0.10	0.25	0.07	0.06	0.15	0.01	0.17	0.13	0.11	0.02	0.02	0.20	0.03	0.03	0.36	0.23	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.15	0.05	0.06	0.08	0.06	0.17	0.23	0.24	0.03	0.21	0.15	0.07	0.14	0.00	0.17	0.08	0.03	0.36	0.33	0.11	0.05	0.13
C2	0.02	0.17	0.03	0.06	0.07	0.15	0.08	0.25	0.14	0.04	0.17	0.19	0.11	0.01	0.01	0.06	0.08	0.13	0.22	0.15	0.02	0.10	0.02
C2'	0.04	0.18	0.01	0.06	0.11	0.07	0.15	0.16	0.21	0.01	0.21	0.19	0.12	0.10	0.02	0.11	0.09	0.00	0.43	0.27	0.17	0.15	0.20
C3'	0.16	0.27	0.24	0.33	0.23	0.30	0.26	0.41	0.29	0.17	0.28	0.28	0.24	0.22	0.19	0.15	0.37	0.17	0.11	0.33	0.03	0.02	0.03
C4	0.07	0.20	0.04	0.04	0.10	0.08	0.17	0.20	0.25	0.01	0.25	0.21	0.12	0.10	0.00	0.11	0.05	0.01	0.35	0.31	0.13	0.20	0.16
C4'	0.12	0.26	0.21	0.34	0.24	0.29	0.31	0.45	0.35	0.23	0.31	0.25	0.21	0.30	0.19	0.08	0.38	0.15	0.05	0.43	0.07	0.27	0.10
C5	0.07	0.25	0.05	0.01	0.12	0.02	0.20	0.12	0.31	0.04	0.31	0.27	0.15	0.09	0.01	0.09	0.00	0.02	0.38	0.37	0.23	0.32	0.25
C5'	0.27	0.36	0.40	0.53	0.36	0.43	0.43	0.58	0.47	0.38	0.42	0.34	0.33	0.45	0.33	0.26	0.58	0.26	0.17	0.54	0.17	0.47	0.23
C6	0.04	0.29	0.04	0.02	0.12	0.03	0.17	0.11	0.30	0.08	0.34	0.31	0.19	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.34	0.33	0.20	0.32	0.22
C8	0.09	0.22	0.05	0.00	0.12	0.02	0.22	0.09	0.33	0.01	0.30	0.23	0.13	0.16	0.00	0.13	0.00	0.09	0.45	0.42	0.33	0.36	0.35
N1	0.01	0.25	0.03	0.02	0.09	0.10	0.10	0.18	0.19	0.07	0.25	0.28	0.16	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.26	0.19	0.07	0.21	0.11
N2	0.00	0.09	0.03	0.08	0.02	0.19	0.02	0.28	0.05	0.05	0.08	0.12	0.06	0.02	0.02	0.04	0.11	0.18	0.14	0.05	0.13	0.02	0.07
N3	0.05	0.15	0.04	0.07	0.07	0.15	0.12	0.27	0.18	0.02	0.19	0.17	0.09	0.06	0.01	0.10	0.10	0.10	0.25	0.22	0.01	0.07	0.03
N7	0.08	0.26	0.04	0.02	0.13	0.03	0.23	0.06	0.35	0.02	0.34	0.27	0.15	0.14	0.00	0.10	0.02	0.08	0.44	0.45	0.33	0.41	0.35
N9	0.08	0.19	0.04	0.05	0.11	0.05	0.19	0.19	0.28	0.02	0.26	0.20	0.11	0.14	0.01	0.13	0.06	0.03	0.39	0.36	0.18	0.20	0.21
O2'	0.13	0.13	0.13	0.05	0.05	0.04	0.10	0.05	0.17	0.05	0.17	0.15	0.06	0.05	0.05	0.24	0.03	0.07	0.48	0.23	0.18	0.11	0.20
O3'	0.16	0.23	0.25	0.33	0.19	0.28	0.18	0.30	0.21	0.10	0.22	0.26	0.22	0.13	0.15	0.19	0.39	0.15	0.03	0.24	0.01	0.01	0.01
O4'	0.02	0.21	0.10	0.23	0.18	0.20	0.28	0.38	0.34	0.17	0.29	0.20	0.15	0.28	0.12	0.05	0.26	0.07	0.18	0.43	0.01	0.15	0.01
O5'	0.32	0.21	0.20	0.09	0.26	0.14	0.22	0.02	0.16	0.30	0.18	0.20	0.25	0.24	0.30	0.28	0.01	0.31	0.35	0.08	0.15	0.13	0.23
O6	0.04	0.33	0.05	0.06	0.12	0.01	0.16	0.05	0.35	0.11	0.41	0.36	0.20	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.36	0.38	0.26	0.40	0.27
OP1	0.30	0.08	0.24	0.19	0.15	0.27	0.07	0.22	0.02	0.21	0.01	0.07	0.15	0.10	0.23	0.34	0.18	0.35	0.50	0.14	0.59	0.44	0.55
OP2	0.09	0.22	0.17	0.22	0.16	0.18	0.20	0.25	0.26	0.10	0.25	0.23	0.17	0.16	0.11	0.11	0.24	0.07	0.07	0.33	0.12	0.10	0.09
P	0.14	0.04	0.05	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.11	0.10	0.09	0.05	0.02	0.01	0.09	0.14	0.04	0.15	0.30	0.20	0.30	0.24	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.10	0.16	0.07
C2	0.01	0.00	0.18	0.17	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.22	0.07	0.14	0.05	0.09	0.17	0.06
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.03	0.17	0.19	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.02	0.05
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.18	0.18	0.14	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.04	0.05	0.14
C4	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.13	0.05	0.13	0.02	0.11	0.19	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.04	0.11	0.00	0.12	0.19	0.08
C5'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.05	0.05	0.04	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.00	0.10	0.15	0.05	0.00
C6	0.01	0.02	0.12	0.14	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.19	0.05	0.12	0.01	0.12	0.19	0.07
C8	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.12	0.02	0.16	0.23	0.12
N1	0.02	0.02	0.17	0.18	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.11	0.24	0.05	0.14	0.04	0.11	0.19	0.07
N2	0.01	0.00	0.19	0.18	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.24	0.08	0.13	0.07	0.07	0.16	0.04
N3	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.17	0.07	0.13	0.04	0.09	0.17	0.06
N7	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.02	0.15	0.22	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.13	0.20	0.09
O2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.07	0.03	0.11	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.03	0.05	0.01
O3'	0.00	0.22	0.01	0.01	0.13	0.00	0.13	0.03	0.19	0.01	0.24	0.24	0.17	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.37	0.18	0.16	0.16	0.25
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.08	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.07	0.15	0.21	0.12
O5'	0.13	0.14	0.06	0.21	0.13	0.00	0.11	0.00	0.12	0.12	0.14	0.13	0.13	0.10	0.13	0.00	0.37	0.23	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00
O6	0.00	0.05	0.11	0.12	0.02	0.01	0.00	0.10	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.00	0.06	0.18	0.07	0.08	0.00	0.09	0.15	0.04
OP1	0.10	0.09	0.00	0.04	0.11	0.06	0.12	0.15	0.12	0.16	0.11	0.07	0.09	0.15	0.13	0.03	0.16	0.15	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.17	0.02	0.05	0.19	0.05	0.19	0.05	0.19	0.23	0.19	0.16	0.17	0.22	0.20	0.05	0.16	0.21	0.02	0.15	0.00	0.00	0.01
P	0.07	0.06	0.05	0.14	0.07	0.03	0.08	0.00	0.07	0.12	0.07	0.04	0.06	0.10	0.09	0.01	0.25	0.12	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00