Doublet Group distance statistics: 50005

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 4, 7, 12, 18, 16, 12, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.016 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.017, 0.033, 0.050, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.017, 0.037, 0.056, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.018, 0.038, 0.059, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.038 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.016, 0.043, 0.070, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.043 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.038 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.025, 0.058, 0.091, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.058 std_dev=0.033
N2	A	0, -0.002, 0.045, 0.092, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.045 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.049, 0.178, 0.307, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.178 std_dev=0.129
C2'	A	0, 0.089, 0.242, 0.396, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.242 std_dev=0.154
C4	B	0, 0.274, 0.433, 0.592, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.433 std_dev=0.159
N9	B	0, 0.208, 0.388, 0.569, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.388 std_dev=0.181
O2'	A	0, 0.190, 0.376, 0.563, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.376 std_dev=0.186
C4'	A	0, 0.250, 0.438, 0.626, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.438 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.427, 0.624, 0.822, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.624 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.180, 0.386, 0.593, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.386 std_dev=0.207
N7	B	0, 0.440, 0.675, 0.909, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.675 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.379, 0.614, 0.848, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.614 std_dev=0.235
C1'	B	0, 0.388, 0.632, 0.876, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.632 std_dev=0.244
C8	B	0, 0.288, 0.539, 0.790, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.539 std_dev=0.251
O3'	A	0, 0.227, 0.484, 0.741, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.484 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.658, 0.922, 1.186, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.922 std_dev=0.264
P	B	0, 0.326, 0.618, 0.911, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.618 std_dev=0.293
C2	B	0, 0.593, 0.885, 1.178, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.885 std_dev=0.293
OP2	B	0, 0.493, 0.798, 1.103, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.798 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.724, 1.030, 1.336, 1.562 max_d=1.562 avg_d=1.030 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.406, 0.712, 1.018, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.712 std_dev=0.306
C5'	B	0, 0.333, 0.646, 0.959, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.646 std_dev=0.313
O5'	B	0, 0.277, 0.600, 0.923, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.600 std_dev=0.323
OP1	B	0, 0.371, 0.695, 1.019, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.695 std_dev=0.324
N6	B	0, 0.865, 1.202, 1.539, 1.897 max_d=1.897 avg_d=1.202 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.388, 0.726, 1.064, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.726 std_dev=0.338
C2'	B	0, 0.486, 0.844, 1.201, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.844 std_dev=0.357
C5'	A	0, 0.638, 1.011, 1.383, 1.880 max_d=1.880 avg_d=1.011 std_dev=0.373
O5'	A	0, 0.687, 1.068, 1.448, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.068 std_dev=0.381
C3'	B	0, 0.452, 0.846, 1.240, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.846 std_dev=0.394
O2'	B	0, 0.618, 1.049, 1.479, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.049 std_dev=0.431
O3'	B	0, 0.467, 0.990, 1.512, 2.992 max_d=2.992 avg_d=0.990 std_dev=0.522
P	A	0, 0.980, 1.549, 2.119, 3.355 max_d=3.355 avg_d=1.549 std_dev=0.569
OP2	A	0, 1.127, 1.835, 2.542, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.835 std_dev=0.708
OP1	A	0, 1.104, 2.061, 3.018, 5.105 max_d=5.105 avg_d=2.061 std_dev=0.957

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.18	0.02	0.24	0.34	0.20
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.02	0.07	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.16	0.04	0.38	0.02	0.54	0.65	0.46
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.13	0.10	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.24	0.06	0.25	0.32	0.20
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.10	0.12	0.12	0.16	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.32	0.11	0.30	0.30	0.25
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.39	0.02	0.53	0.63	0.47
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.07	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.03	0.09	0.21	0.30	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.48	0.02	0.70	0.80	0.61
C5'	0.05	0.14	0.02	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.16	0.14	0.12	0.20	0.12	0.06	0.06	0.03	0.01	0.21	0.25	0.34	0.03
C6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.12	0.03	0.50	0.01	0.76	0.87	0.65
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.09	0.02	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.05	0.47	0.03	0.60	0.70	0.56
N1	0.03	0.01	0.08	0.12	0.02	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.04	0.45	0.02	0.68	0.78	0.57
N2	0.05	0.01	0.13	0.16	0.02	0.08	0.01	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.15	0.20	0.05	0.35	0.03	0.50	0.60	0.42
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.14	0.04	0.34	0.02	0.46	0.55	0.39
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.20	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.06	0.52	0.04	0.76	0.87	0.67
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.02	0.35	0.02	0.44	0.54	0.40
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.11	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.08	0.27	0.30	0.12
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.06	0.12	0.13	0.14	0.20	0.14	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.28	0.13	0.35	0.31	0.21
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.00	0.13	0.04	0.21	0.34	0.16
O5'	0.18	0.38	0.24	0.32	0.39	0.03	0.48	0.01	0.50	0.47	0.45	0.35	0.34	0.52	0.35	0.08	0.28	0.13	0.00	0.55	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.09	0.02	0.21	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.08	0.13	0.04	0.55	0.00	0.87	0.98	0.74
OP1	0.24	0.54	0.25	0.30	0.53	0.21	0.70	0.25	0.76	0.60	0.68	0.50	0.46	0.76	0.44	0.27	0.35	0.21	0.03	0.87	0.00	0.02	0.01
OP2	0.34	0.65	0.32	0.30	0.63	0.30	0.80	0.34	0.87	0.70	0.78	0.60	0.55	0.87	0.54	0.30	0.31	0.34	0.02	0.98	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.46	0.20	0.25	0.47	0.08	0.61	0.03	0.65	0.56	0.57	0.42	0.39	0.67	0.40	0.12	0.21	0.16	0.01	0.74	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.24	0.22	0.18	0.20	0.22	0.21	0.22	0.23	0.19	0.23	0.24	0.27	0.24	0.19	0.28	0.19	0.26	0.18	0.06	0.11	0.06
C2	0.22	0.29	0.23	0.17	0.18	0.20	0.15	0.21	0.20	0.15	0.25	0.29	0.23	0.18	0.15	0.30	0.21	0.21	0.19	0.16	0.19	0.16
C2'	0.21	0.20	0.19	0.17	0.19	0.20	0.21	0.22	0.23	0.21	0.21	0.20	0.26	0.25	0.18	0.22	0.18	0.23	0.19	0.08	0.12	0.10
C3'	0.18	0.21	0.17	0.14	0.20	0.14	0.26	0.16	0.28	0.24	0.25	0.19	0.32	0.30	0.19	0.16	0.15	0.20	0.08	0.04	0.08	0.02
C4	0.23	0.25	0.20	0.15	0.19	0.19	0.17	0.19	0.22	0.14	0.23	0.25	0.26	0.19	0.17	0.26	0.15	0.23	0.18	0.11	0.17	0.12
C4'	0.19	0.21	0.16	0.13	0.20	0.16	0.26	0.18	0.29	0.23	0.25	0.19	0.36	0.31	0.18	0.19	0.15	0.21	0.07	0.10	0.16	0.06
C5	0.23	0.24	0.20	0.17	0.17	0.20	0.14	0.20	0.20	0.15	0.23	0.23	0.25	0.15	0.17	0.25	0.16	0.24	0.22	0.16	0.23	0.17
C5'	0.20	0.29	0.20	0.16	0.27	0.14	0.36	0.17	0.40	0.30	0.36	0.25	0.48	0.40	0.23	0.18	0.19	0.20	0.09	0.18	0.27	0.13
C6	0.22	0.25	0.20	0.18	0.17	0.20	0.12	0.20	0.17	0.17	0.23	0.24	0.22	0.16	0.18	0.25	0.17	0.22	0.23	0.18	0.24	0.18
C8	0.24	0.22	0.21	0.20	0.18	0.23	0.18	0.23	0.23	0.17	0.23	0.22	0.28	0.19	0.19	0.25	0.19	0.27	0.24	0.18	0.24	0.19
N1	0.22	0.28	0.21	0.17	0.17	0.20	0.10	0.20	0.17	0.15	0.24	0.26	0.22	0.15	0.16	0.27	0.19	0.21	0.21	0.17	0.22	0.17
N2	0.24	0.33	0.28	0.22	0.20	0.24	0.17	0.24	0.21	0.19	0.27	0.32	0.23	0.19	0.17	0.36	0.28	0.24	0.21	0.20	0.21	0.20
N3	0.24	0.28	0.23	0.16	0.20	0.20	0.19	0.20	0.22	0.17	0.25	0.28	0.25	0.21	0.17	0.30	0.19	0.21	0.17	0.13	0.16	0.13
N7	0.24	0.23	0.20	0.20	0.18	0.23	0.16	0.23	0.21	0.18	0.23	0.22	0.27	0.16	0.19	0.24	0.19	0.26	0.25	0.20	0.27	0.21
N9	0.24	0.24	0.21	0.17	0.19	0.21	0.19	0.21	0.23	0.16	0.23	0.24	0.28	0.21	0.18	0.26	0.16	0.25	0.19	0.10	0.16	0.11
O2'	0.29	0.26	0.29	0.28	0.24	0.30	0.23	0.32	0.23	0.23	0.24	0.28	0.25	0.25	0.24	0.33	0.30	0.30	0.26	0.13	0.13	0.13
O3'	0.17	0.20	0.18	0.16	0.20	0.14	0.25	0.16	0.26	0.23	0.23	0.18	0.31	0.28	0.18	0.15	0.18	0.19	0.05	0.05	0.05	0.01
O4'	0.23	0.23	0.19	0.14	0.19	0.19	0.23	0.20	0.26	0.20	0.24	0.22	0.32	0.27	0.18	0.25	0.15	0.24	0.12	0.07	0.12	0.03
O5'	0.41	0.52	0.41	0.42	0.49	0.36	0.53	0.34	0.57	0.47	0.56	0.49	0.61	0.54	0.45	0.38	0.43	0.39	0.43	0.31	0.53	0.39
O6	0.23	0.25	0.21	0.20	0.19	0.21	0.16	0.21	0.18	0.21	0.23	0.24	0.21	0.21	0.20	0.26	0.20	0.23	0.25	0.22	0.28	0.22
OP1	0.48	0.76	0.51	0.51	0.68	0.40	0.78	0.39	0.88	0.62	0.85	0.68	0.98	0.76	0.58	0.44	0.53	0.42	0.47	0.47	0.67	0.48
OP2	0.55	0.80	0.57	0.53	0.72	0.45	0.80	0.41	0.89	0.65	0.88	0.73	0.97	0.77	0.63	0.53	0.52	0.49	0.47	0.42	0.59	0.42
P	0.41	0.61	0.42	0.41	0.55	0.32	0.62	0.29	0.69	0.51	0.68	0.55	0.76	0.61	0.48	0.37	0.41	0.36	0.38	0.29	0.54	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.11	0.17	0.10
C2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.19	0.04	0.20	0.21	0.26	0.20
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.06	0.08	0.07	0.10	0.12	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.17	0.20	0.22	0.17
C3'	0.03	0.14	0.00	0.00	0.11	0.01	0.13	0.02	0.15	0.15	0.15	0.13	0.16	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.16	0.22	0.15	0.14
C4	0.02	0.02	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.02	0.20	0.19	0.22	0.18
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.09	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.10	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.11	0.12	0.02	0.25	0.24	0.27	0.24
C5'	0.03	0.09	0.06	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.14	0.11	0.08	0.15	0.15	0.08	0.06	0.07	0.02	0.01	0.10	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.15	0.02	0.26	0.27	0.31	0.26
C8	0.01	0.02	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.14	0.04	0.25	0.22	0.21	0.20
N1	0.03	0.01	0.10	0.15	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.17	0.03	0.24	0.25	0.29	0.24
N3	0.03	0.00	0.12	0.13	0.00	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.18	0.04	0.17	0.18	0.22	0.16
N6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.09	0.02	0.15	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.14	0.16	0.03	0.30	0.31	0.35	0.30
N7	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.09	0.00	0.15	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.15	0.04	0.29	0.26	0.27	0.26
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.18	0.16	0.18	0.15
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.11	0.09	0.11	0.06	0.13	0.08	0.15	0.14	0.14	0.09	0.07	0.00	0.07	0.07	0.11	0.16	0.21	0.12
O3'	0.08	0.19	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.07	0.15	0.14	0.17	0.18	0.16	0.15	0.07	0.07	0.00	0.05	0.17	0.32	0.21	0.20
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.07	0.05	0.00	0.10	0.11	0.20	0.12
O5'	0.09	0.20	0.17	0.16	0.20	0.02	0.25	0.01	0.26	0.25	0.24	0.17	0.30	0.29	0.18	0.11	0.17	0.10	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.11	0.21	0.20	0.22	0.19	0.10	0.24	0.10	0.27	0.22	0.25	0.18	0.31	0.26	0.16	0.16	0.32	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.26	0.22	0.15	0.22	0.13	0.27	0.15	0.31	0.21	0.29	0.22	0.35	0.27	0.18	0.21	0.21	0.20	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.17	0.14	0.18	0.03	0.24	0.02	0.26	0.20	0.24	0.16	0.30	0.26	0.15	0.12	0.20	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00