Doublet Group distance statistics: 50006

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 4, 7, 14, 7, 9, 6, 3, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.023, 0.044, 0.065, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.044 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.022, 0.048, 0.074, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.048 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.025, 0.054, 0.083, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.054 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.010, 0.040, 0.070, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.040 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.046, 0.084, 0.123, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.084 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.045, 0.091, 0.138, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.091 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.047, 0.101, 0.156, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.101 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.178, 0.329, 0.481, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.329 std_dev=0.152
O4'	A	0, 0.158, 0.335, 0.511, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.335 std_dev=0.177
O2'	A	0, 0.131, 0.326, 0.522, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.326 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.339, 0.570, 0.800, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.570 std_dev=0.230
N3	B	0, 0.417, 0.659, 0.902, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.659 std_dev=0.242
C4'	A	0, 0.337, 0.580, 0.824, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.580 std_dev=0.243
N9	B	0, 0.392, 0.636, 0.880, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.636 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.349, 0.601, 0.853, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.601 std_dev=0.252
C2	B	0, 0.409, 0.671, 0.933, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.671 std_dev=0.262
C8	B	0, 0.336, 0.606, 0.877, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.606 std_dev=0.271
N1	B	0, 0.341, 0.618, 0.894, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.618 std_dev=0.277
C5	B	0, 0.194, 0.472, 0.750, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.472 std_dev=0.278
N7	B	0, 0.218, 0.509, 0.800, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.509 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.198, 0.498, 0.799, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.498 std_dev=0.300
C1'	B	0, 0.472, 0.779, 1.086, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.779 std_dev=0.307
O4'	B	0, 0.389, 0.697, 1.005, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.697 std_dev=0.308
N6	B	0, 0.238, 0.551, 0.864, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.551 std_dev=0.313
O3'	A	0, 0.515, 0.861, 1.206, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.861 std_dev=0.346
C4'	B	0, 0.553, 0.915, 1.276, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.915 std_dev=0.362
C5'	B	0, 0.607, 0.978, 1.348, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.978 std_dev=0.371
O5'	B	0, 0.621, 1.028, 1.436, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.028 std_dev=0.408
C2'	B	0, 0.616, 1.028, 1.441, 2.032 max_d=2.032 avg_d=1.028 std_dev=0.412
C3'	B	0, 0.663, 1.088, 1.512, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.088 std_dev=0.424
P	B	0, 0.620, 1.044, 1.469, 2.350 max_d=2.350 avg_d=1.044 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.490, 0.944, 1.398, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.944 std_dev=0.454
O5'	A	0, 1.007, 1.468, 1.930, 2.734 max_d=2.734 avg_d=1.468 std_dev=0.461
OP2	B	0, 0.591, 1.069, 1.546, 3.149 max_d=3.149 avg_d=1.069 std_dev=0.477
OP1	B	0, 0.763, 1.306, 1.849, 3.320 max_d=3.320 avg_d=1.306 std_dev=0.543
O3'	B	0, 0.801, 1.354, 1.907, 2.722 max_d=2.722 avg_d=1.354 std_dev=0.553
O2'	B	0, 0.627, 1.183, 1.739, 2.535 max_d=2.535 avg_d=1.183 std_dev=0.556
P	A	0, 0.596, 1.305, 2.013, 3.290 max_d=3.290 avg_d=1.305 std_dev=0.709
OP2	A	0, 0.658, 1.425, 2.192, 3.634 max_d=3.634 avg_d=1.425 std_dev=0.767
OP1	A	0, 0.397, 1.500, 2.602, 4.221 max_d=4.221 avg_d=1.500 std_dev=1.102

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.33	0.24	0.14
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.05	0.22	0.01	0.70	0.44	0.28
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.09	0.09	0.15	0.12	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.11	0.07	0.20	0.15	0.10
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.16	0.12	0.17	0.13	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.15	0.13	0.25	0.20	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.02	0.21	0.01	0.67	0.45	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.17	0.24	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.24	0.02	0.84	0.60	0.32
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.14	0.12	0.10	0.08	0.16	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.17	0.26	0.36	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.14	0.03	0.26	0.01	0.90	0.65	0.35
C8	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.05	0.23	0.03	0.73	0.57	0.30
N1	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.24	0.01	0.82	0.56	0.32
N2	0.05	0.01	0.15	0.17	0.01	0.07	0.02	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.22	0.06	0.21	0.02	0.66	0.40	0.27
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.05	0.19	0.01	0.60	0.38	0.24
N7	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.19	0.05	0.26	0.03	0.90	0.70	0.35
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.17	0.02	0.57	0.40	0.23
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.11	0.17	0.13	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.19	0.16	0.07
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.14	0.18	0.15	0.22	0.15	0.19	0.08	0.04	0.00	0.02	0.18	0.17	0.47	0.36	0.23
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.06	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.04	0.29	0.28	0.17
O5'	0.09	0.22	0.11	0.15	0.21	0.02	0.24	0.01	0.26	0.23	0.24	0.21	0.19	0.26	0.17	0.06	0.18	0.10	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.17	0.04	0.28	0.00	1.00	0.73	0.38
OP1	0.33	0.70	0.20	0.25	0.67	0.17	0.84	0.26	0.90	0.73	0.82	0.66	0.60	0.90	0.57	0.19	0.47	0.29	0.02	1.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.44	0.15	0.20	0.45	0.24	0.60	0.36	0.65	0.57	0.56	0.40	0.38	0.70	0.40	0.16	0.36	0.28	0.02	0.73	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.10	0.15	0.26	0.03	0.32	0.02	0.35	0.30	0.32	0.27	0.24	0.35	0.23	0.07	0.23	0.17	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.29	0.19	0.25	0.19	0.24	0.24	0.30	0.31	0.18	0.32	0.24	0.37	0.24	0.15	0.26	0.21	0.24	0.22	0.04	0.16	0.07
C2	0.25	0.27	0.26	0.24	0.12	0.24	0.12	0.24	0.17	0.25	0.24	0.23	0.21	0.22	0.19	0.32	0.20	0.24	0.19	0.14	0.22	0.12
C2'	0.20	0.25	0.16	0.24	0.20	0.22	0.24	0.30	0.29	0.20	0.28	0.22	0.33	0.26	0.16	0.24	0.21	0.21	0.25	0.09	0.17	0.12
C3'	0.25	0.27	0.17	0.23	0.24	0.18	0.28	0.20	0.31	0.24	0.30	0.25	0.36	0.29	0.22	0.23	0.22	0.26	0.08	0.04	0.10	0.03
C4	0.22	0.31	0.19	0.24	0.16	0.21	0.17	0.24	0.28	0.21	0.33	0.25	0.32	0.19	0.15	0.23	0.15	0.23	0.20	0.09	0.26	0.12
C4'	0.22	0.28	0.15	0.22	0.22	0.19	0.28	0.24	0.34	0.22	0.32	0.24	0.40	0.29	0.19	0.24	0.21	0.23	0.06	0.13	0.18	0.08
C5	0.23	0.34	0.20	0.28	0.16	0.23	0.14	0.26	0.27	0.24	0.36	0.26	0.32	0.20	0.18	0.21	0.20	0.24	0.25	0.19	0.37	0.22
C5'	0.26	0.34	0.20	0.25	0.30	0.21	0.36	0.22	0.41	0.30	0.39	0.30	0.49	0.37	0.27	0.24	0.25	0.27	0.10	0.24	0.33	0.19
C6	0.24	0.33	0.24	0.29	0.16	0.23	0.12	0.24	0.17	0.28	0.32	0.26	0.21	0.27	0.21	0.24	0.21	0.24	0.25	0.20	0.38	0.23
C8	0.22	0.33	0.18	0.31	0.20	0.26	0.23	0.32	0.35	0.19	0.38	0.26	0.43	0.19	0.17	0.20	0.27	0.26	0.29	0.25	0.41	0.27
N1	0.25	0.30	0.26	0.27	0.14	0.23	0.13	0.22	0.12	0.27	0.24	0.25	0.18	0.26	0.21	0.29	0.19	0.24	0.21	0.14	0.30	0.16
N2	0.27	0.24	0.32	0.27	0.15	0.29	0.16	0.28	0.17	0.25	0.21	0.22	0.21	0.23	0.21	0.40	0.30	0.27	0.22	0.21	0.21	0.17
N3	0.23	0.28	0.22	0.22	0.14	0.22	0.16	0.25	0.23	0.22	0.28	0.24	0.26	0.21	0.15	0.29	0.15	0.23	0.19	0.13	0.19	0.10
N7	0.22	0.35	0.20	0.32	0.19	0.26	0.19	0.30	0.33	0.23	0.39	0.26	0.40	0.19	0.18	0.19	0.27	0.26	0.31	0.28	0.46	0.31
N9	0.21	0.31	0.18	0.26	0.18	0.23	0.22	0.28	0.32	0.18	0.35	0.25	0.38	0.21	0.15	0.22	0.20	0.24	0.22	0.10	0.27	0.14
O2'	0.25	0.28	0.25	0.29	0.23	0.30	0.26	0.40	0.29	0.25	0.29	0.25	0.33	0.28	0.22	0.34	0.29	0.25	0.35	0.17	0.17	0.17
O3'	0.28	0.27	0.20	0.23	0.26	0.22	0.27	0.21	0.29	0.26	0.28	0.27	0.32	0.29	0.25	0.26	0.26	0.31	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.21	0.30	0.16	0.23	0.20	0.21	0.26	0.27	0.34	0.18	0.35	0.25	0.42	0.25	0.16	0.25	0.19	0.23	0.13	0.08	0.17	0.05
O5'	0.33	0.47	0.31	0.38	0.42	0.28	0.49	0.29	0.54	0.41	0.52	0.42	0.62	0.49	0.38	0.29	0.37	0.32	0.27	0.29	0.42	0.28
O6	0.25	0.33	0.25	0.32	0.19	0.25	0.18	0.25	0.15	0.31	0.31	0.25	0.17	0.31	0.23	0.24	0.25	0.24	0.30	0.27	0.45	0.28
OP1	0.48	0.89	0.45	0.50	0.73	0.41	0.86	0.48	1.01	0.60	1.01	0.75	1.15	0.78	0.58	0.42	0.56	0.42	0.45	0.75	0.58	0.55
OP2	0.40	0.52	0.43	0.55	0.46	0.43	0.51	0.46	0.60	0.45	0.59	0.46	0.69	0.50	0.42	0.39	0.59	0.39	0.48	0.65	0.70	0.55
P	0.38	0.55	0.38	0.46	0.49	0.34	0.57	0.35	0.64	0.47	0.62	0.49	0.73	0.56	0.44	0.35	0.47	0.36	0.35	0.43	0.52	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.07	0.10	0.20	0.13
C2	0.06	0.00	0.18	0.20	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.20	0.23	0.07	0.17	0.18	0.29	0.20
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.10	0.02	0.07	0.11	0.11	0.07	0.15	0.17	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.14	0.20	0.10
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.15	0.00	0.18	0.02	0.20	0.18	0.20	0.18	0.21	0.19	0.11	0.02	0.01	0.02	0.20	0.22	0.13	0.17
C4	0.03	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.17	0.18	0.27	0.19
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.08	0.09	0.09	0.11	0.05	0.14	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.03	0.24	0.25	0.34	0.26
C5'	0.06	0.11	0.11	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.15	0.19	0.13	0.11	0.18	0.20	0.11	0.06	0.10	0.02	0.01	0.09	0.18	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.20	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.04	0.24	0.27	0.37	0.27
C8	0.02	0.02	0.07	0.18	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.16	0.06	0.25	0.24	0.29	0.24
N1	0.05	0.00	0.15	0.20	0.02	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.19	0.22	0.06	0.21	0.23	0.34	0.24
N3	0.06	0.01	0.17	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.21	0.07	0.15	0.16	0.26	0.18
N6	0.02	0.02	0.09	0.21	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.16	0.22	0.04	0.28	0.33	0.42	0.32
N7	0.01	0.01	0.06	0.19	0.01	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.11	0.19	0.05	0.28	0.30	0.37	0.30
N9	0.01	0.02	0.03	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.16	0.16	0.24	0.17
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.12	0.14	0.13	0.06	0.16	0.09	0.19	0.18	0.16	0.11	0.07	0.00	0.04	0.10	0.10	0.14	0.18	0.06
O3'	0.11	0.23	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.10	0.19	0.16	0.22	0.21	0.22	0.19	0.08	0.04	0.00	0.11	0.24	0.39	0.26	0.27
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.06	0.07	0.04	0.05	0.02	0.10	0.11	0.00	0.09	0.14	0.22	0.17
O5'	0.07	0.17	0.10	0.20	0.17	0.02	0.24	0.01	0.24	0.25	0.21	0.15	0.28	0.28	0.16	0.10	0.24	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.18	0.14	0.22	0.18	0.08	0.25	0.09	0.27	0.24	0.23	0.16	0.33	0.30	0.16	0.14	0.39	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.29	0.20	0.13	0.27	0.13	0.34	0.18	0.37	0.29	0.34	0.26	0.42	0.37	0.24	0.18	0.26	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.20	0.10	0.17	0.19	0.05	0.26	0.02	0.27	0.24	0.24	0.18	0.32	0.30	0.17	0.06	0.27	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00