Doublet Group distance statistics: 50007

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 2, 2, 3, 1, 6, 12, 10, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.011, 0.033, 0.054, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.005, 0.030, 0.056, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.030 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.014, 0.039, 0.065, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.009, 0.036, 0.064, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.036 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.075, 0.218, 0.361, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.218 std_dev=0.143
O4'	A	0, 0.039, 0.190, 0.341, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.190 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.112, 0.283, 0.454, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.283 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.090, 0.325, 0.560, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.325 std_dev=0.235
C3'	A	0, 0.104, 0.342, 0.580, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.342 std_dev=0.238
C4	B	0, 0.417, 0.669, 0.920, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.669 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.395, 0.648, 0.902, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.648 std_dev=0.254
N9	B	0, 0.364, 0.618, 0.872, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.618 std_dev=0.254
N7	B	0, 0.361, 0.619, 0.876, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.619 std_dev=0.258
C8	B	0, 0.342, 0.600, 0.858, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.600 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.427, 0.719, 1.010, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.719 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.479, 0.781, 1.083, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.781 std_dev=0.302
O4'	B	0, 0.371, 0.678, 0.984, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.678 std_dev=0.307
N3	B	0, 0.512, 0.820, 1.129, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.820 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.200, 0.511, 0.823, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.511 std_dev=0.312
C4'	B	0, 0.425, 0.747, 1.070, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.747 std_dev=0.323
C5'	B	0, 0.379, 0.719, 1.060, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.719 std_dev=0.340
N6	B	0, 0.520, 0.865, 1.211, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.865 std_dev=0.346
C3'	B	0, 0.416, 0.762, 1.108, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.762 std_dev=0.346
C2'	B	0, 0.461, 0.811, 1.161, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.811 std_dev=0.350
N1	B	0, 0.563, 0.916, 1.268, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.916 std_dev=0.353
C2	B	0, 0.569, 0.925, 1.281, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.925 std_dev=0.356
C5'	A	0, 0.194, 0.556, 0.917, 2.232 max_d=2.232 avg_d=0.556 std_dev=0.361
O5'	B	0, 0.266, 0.653, 1.040, 2.728 max_d=2.728 avg_d=0.653 std_dev=0.387
O2'	B	0, 0.581, 0.993, 1.405, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.993 std_dev=0.412
O3'	B	0, 0.518, 0.931, 1.344, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.931 std_dev=0.413
P	B	0, 0.115, 0.629, 1.142, 3.678 max_d=3.678 avg_d=0.629 std_dev=0.514
OP1	B	0, 0.223, 0.830, 1.437, 4.112 max_d=4.112 avg_d=0.830 std_dev=0.607
OP2	B	0, 0.071, 0.678, 1.286, 4.401 max_d=4.401 avg_d=0.678 std_dev=0.608
O5'	A	0, 0.238, 0.933, 1.628, 2.843 max_d=2.843 avg_d=0.933 std_dev=0.695
P	A	0, 0.462, 1.312, 2.162, 3.709 max_d=3.709 avg_d=1.312 std_dev=0.850
OP1	A	0, 0.682, 1.648, 2.614, 3.889 max_d=3.889 avg_d=1.648 std_dev=0.966
OP2	A	0, 0.165, 1.773, 3.381, 6.313 max_d=6.313 avg_d=1.773 std_dev=1.608

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.02	0.38	0.34	0.23
C2	0.04	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.20	0.07	0.40	0.01	0.59	0.87	0.49
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.13	0.19	0.16	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.08	0.34	0.25	0.23
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.13	0.12	0.15	0.19	0.15	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.30	0.14	0.46	0.19	0.26
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.04	0.42	0.01	0.60	0.85	0.50
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.05	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.18	0.21	0.04
C5	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.52	0.02	0.73	1.12	0.63
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.13	0.14	0.10	0.08	0.06	0.15	0.07	0.06	0.05	0.01	0.01	0.16	0.28	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.15	0.04	0.53	0.00	0.75	1.21	0.67
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.05	0.52	0.03	0.71	0.99	0.59
N1	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.18	0.05	0.47	0.01	0.68	1.07	0.60
N2	0.04	0.00	0.19	0.19	0.02	0.08	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.24	0.08	0.36	0.01	0.54	0.78	0.45
N3	0.03	0.01	0.16	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.17	0.06	0.35	0.01	0.53	0.72	0.43
N7	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.09	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.58	0.03	0.80	1.23	0.70
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.39	0.03	0.56	0.72	0.44
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.13	0.20	0.15	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.09	0.08	0.23	0.14	0.10
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.15	0.13	0.18	0.24	0.17	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.27	0.17	0.60	0.32	0.27
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.14	0.05	0.37	0.19	0.17
O5'	0.20	0.40	0.24	0.30	0.42	0.02	0.52	0.01	0.53	0.52	0.47	0.36	0.35	0.58	0.39	0.09	0.27	0.14	0.00	0.58	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.17	0.05	0.58	0.00	0.82	1.37	0.75
OP1	0.38	0.59	0.34	0.46	0.60	0.18	0.73	0.28	0.75	0.71	0.68	0.54	0.53	0.80	0.56	0.23	0.60	0.37	0.02	0.82	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.87	0.25	0.19	0.85	0.21	1.12	0.37	1.21	0.99	1.07	0.78	0.72	1.23	0.72	0.14	0.32	0.19	0.02	1.37	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.49	0.23	0.26	0.50	0.04	0.63	0.02	0.67	0.59	0.60	0.45	0.43	0.70	0.44	0.10	0.27	0.17	0.01	0.75	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.31	0.17	0.14	0.22	0.17	0.26	0.18	0.32	0.19	0.33	0.26	0.36	0.25	0.15	0.24	0.15	0.19	0.31	0.40	0.36	0.38
C2	0.35	0.25	0.37	0.34	0.15	0.37	0.14	0.34	0.17	0.28	0.23	0.21	0.21	0.23	0.26	0.44	0.37	0.36	0.37	0.34	0.30	0.33
C2'	0.17	0.29	0.16	0.15	0.24	0.16	0.27	0.19	0.31	0.21	0.31	0.26	0.34	0.27	0.18	0.20	0.16	0.18	0.36	0.43	0.34	0.40
C3'	0.21	0.32	0.21	0.24	0.28	0.21	0.32	0.23	0.35	0.24	0.35	0.29	0.38	0.31	0.23	0.20	0.25	0.22	0.42	0.61	0.60	0.60
C4	0.22	0.30	0.20	0.17	0.14	0.22	0.16	0.21	0.25	0.22	0.31	0.24	0.29	0.20	0.14	0.27	0.19	0.24	0.34	0.37	0.37	0.37
C4'	0.15	0.31	0.14	0.18	0.24	0.16	0.30	0.21	0.36	0.20	0.35	0.26	0.42	0.29	0.16	0.17	0.20	0.18	0.37	0.63	0.65	0.60
C5	0.23	0.31	0.21	0.18	0.13	0.22	0.12	0.19	0.23	0.25	0.32	0.23	0.28	0.22	0.18	0.27	0.19	0.25	0.36	0.40	0.44	0.41
C5'	0.18	0.35	0.20	0.25	0.28	0.20	0.35	0.25	0.41	0.25	0.40	0.29	0.48	0.35	0.21	0.17	0.28	0.20	0.45	0.77	0.85	0.72
C6	0.30	0.29	0.29	0.26	0.19	0.28	0.16	0.24	0.15	0.31	0.25	0.25	0.22	0.28	0.26	0.35	0.27	0.30	0.38	0.37	0.41	0.39
C8	0.17	0.33	0.14	0.13	0.18	0.16	0.22	0.13	0.34	0.17	0.37	0.25	0.40	0.20	0.11	0.19	0.13	0.20	0.36	0.48	0.53	0.47
N1	0.35	0.24	0.36	0.33	0.20	0.34	0.17	0.30	0.15	0.31	0.20	0.24	0.22	0.27	0.29	0.43	0.35	0.34	0.38	0.34	0.35	0.35
N2	0.41	0.23	0.46	0.43	0.19	0.45	0.17	0.42	0.18	0.29	0.22	0.22	0.22	0.23	0.29	0.55	0.49	0.42	0.40	0.36	0.28	0.32
N3	0.27	0.28	0.28	0.26	0.14	0.31	0.16	0.31	0.22	0.24	0.27	0.23	0.25	0.21	0.19	0.35	0.29	0.30	0.36	0.34	0.29	0.33
N7	0.19	0.33	0.17	0.15	0.15	0.18	0.16	0.15	0.30	0.22	0.36	0.24	0.36	0.20	0.14	0.21	0.15	0.22	0.38	0.46	0.53	0.47
N9	0.17	0.32	0.15	0.12	0.18	0.16	0.23	0.15	0.31	0.17	0.34	0.25	0.35	0.22	0.11	0.22	0.13	0.19	0.33	0.41	0.42	0.41
O2'	0.26	0.30	0.26	0.26	0.28	0.25	0.30	0.29	0.32	0.29	0.31	0.28	0.34	0.31	0.26	0.30	0.26	0.25	0.34	0.33	0.16	0.26
O3'	0.23	0.29	0.25	0.30	0.27	0.26	0.30	0.29	0.33	0.26	0.32	0.27	0.35	0.31	0.25	0.23	0.31	0.24	0.40	0.66	0.58	0.63
O4'	0.17	0.31	0.13	0.12	0.21	0.15	0.27	0.17	0.34	0.16	0.35	0.25	0.40	0.26	0.13	0.22	0.13	0.18	0.32	0.52	0.53	0.50
O5'	0.51	0.62	0.53	0.53	0.58	0.45	0.63	0.42	0.67	0.59	0.66	0.58	0.71	0.64	0.55	0.49	0.52	0.48	0.63	0.83	1.03	0.83
O6	0.31	0.32	0.31	0.28	0.24	0.28	0.24	0.24	0.18	0.33	0.26	0.29	0.26	0.33	0.29	0.36	0.28	0.30	0.39	0.39	0.45	0.41
OP1	0.71	0.84	0.79	0.84	0.79	0.69	0.85	0.70	0.90	0.81	0.89	0.79	0.95	0.86	0.76	0.72	0.89	0.65	0.92	1.22	1.38	1.13
OP2	0.70	1.17	0.71	0.61	1.00	0.45	1.12	0.37	1.27	0.86	1.28	1.03	1.40	1.05	0.84	0.64	0.59	0.54	0.61	0.94	0.98	0.80
P	0.56	0.75	0.60	0.58	0.68	0.47	0.75	0.42	0.81	0.66	0.80	0.68	0.87	0.74	0.63	0.54	0.58	0.50	0.66	0.90	1.07	0.85

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.14	0.20	0.12
C2	0.03	0.00	0.15	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.05	0.28	0.19	0.20	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.08	0.12	0.15	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.15	0.23	0.09
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.10	0.13	0.13	0.14	0.10	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.19	0.20	0.29	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.31	0.23	0.21	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.11	0.25	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.03	0.40	0.33	0.30	0.34
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.05	0.12	0.13	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.17	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.03	0.40	0.33	0.31	0.35
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.03	0.43	0.37	0.31	0.36
N1	0.03	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.04	0.34	0.26	0.25	0.28
N3	0.03	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.18	0.05	0.24	0.16	0.19	0.17
N6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.14	0.03	0.45	0.40	0.39	0.41
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.47	0.42	0.39	0.42
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.31	0.24	0.20	0.23
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.09	0.05	0.07	0.04	0.10	0.05	0.14	0.16	0.09	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.16	0.29	0.12
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.04	0.14	0.14	0.18	0.18	0.14	0.14	0.05	0.04	0.00	0.02	0.22	0.31	0.44	0.28
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.15	0.15	0.26	0.15
O5'	0.16	0.28	0.15	0.19	0.31	0.02	0.40	0.01	0.40	0.43	0.34	0.24	0.45	0.47	0.31	0.07	0.22	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.19	0.15	0.20	0.23	0.11	0.33	0.17	0.33	0.37	0.26	0.16	0.40	0.42	0.24	0.16	0.31	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.20	0.23	0.29	0.21	0.25	0.30	0.22	0.31	0.31	0.25	0.19	0.39	0.39	0.20	0.29	0.44	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.21	0.09	0.15	0.24	0.05	0.34	0.01	0.35	0.36	0.28	0.17	0.41	0.42	0.23	0.12	0.28	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00