Doublet Group distance statistics: 50009

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 3, 6, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.016, 0.040, 0.063, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.010, 0.038, 0.066, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.038 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.009, 0.040, 0.070, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.040 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.008, 0.044, 0.079, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.044 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.057, 0.167, 0.277, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.167 std_dev=0.110
C4	B	0, 0.163, 0.289, 0.414, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.289 std_dev=0.126
N9	B	0, 0.202, 0.350, 0.499, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.350 std_dev=0.149
C4'	A	0, 0.104, 0.261, 0.417, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.261 std_dev=0.156
C2'	A	0, 0.007, 0.164, 0.321, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.164 std_dev=0.157
C5	B	0, 0.173, 0.367, 0.561, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.367 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.264, 0.468, 0.673, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.468 std_dev=0.205
C3'	A	0, 0.090, 0.297, 0.504, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.297 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.050, 0.266, 0.483, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.266 std_dev=0.217
C1'	B	0, 0.316, 0.533, 0.751, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.533 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.280, 0.535, 0.790, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.535 std_dev=0.255
N7	B	0, 0.267, 0.522, 0.778, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.522 std_dev=0.256
C8	B	0, 0.223, 0.481, 0.739, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.481 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.341, 0.601, 0.862, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.601 std_dev=0.261
N1	B	0, 0.316, 0.610, 0.905, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.610 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.169, 0.464, 0.760, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.464 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.204, 0.500, 0.796, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.500 std_dev=0.296
O3'	A	0, 0.161, 0.467, 0.773, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.467 std_dev=0.306
O2'	B	0, 0.367, 0.691, 1.014, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.691 std_dev=0.323
O4'	B	0, 0.369, 0.728, 1.088, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.728 std_dev=0.360
O5'	B	0, 0.464, 0.826, 1.187, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.826 std_dev=0.362
C3'	B	0, 0.234, 0.621, 1.007, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.621 std_dev=0.386
N6	B	0, 0.307, 0.695, 1.083, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.695 std_dev=0.388
P	B	0, 0.433, 0.838, 1.243, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.838 std_dev=0.405
C4'	B	0, 0.364, 0.773, 1.183, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.773 std_dev=0.410
O3'	B	0, 0.266, 0.753, 1.240, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.753 std_dev=0.487
OP2	B	0, 0.556, 1.049, 1.543, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.049 std_dev=0.494
C5'	B	0, 0.404, 0.898, 1.392, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.898 std_dev=0.494
O5'	A	0, 0.169, 0.694, 1.220, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.694 std_dev=0.526
OP2	A	0, 0.317, 0.851, 1.385, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.851 std_dev=0.534
P	A	0, 0.258, 0.861, 1.464, 2.373 max_d=2.373 avg_d=0.861 std_dev=0.603
OP1	B	0, 0.627, 1.327, 2.027, 3.309 max_d=3.309 avg_d=1.327 std_dev=0.700
OP1	A	0, 0.215, 1.065, 1.916, 2.895 max_d=2.895 avg_d=1.065 std_dev=0.850

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.02	0.19	0.11	0.14
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.15	0.04	0.27	0.04	0.33	0.30	0.28
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.34	0.18	0.19
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.13	0.11	0.15	0.11	0.13	0.07	0.03	0.01	0.01	0.26	0.12	0.44	0.21	0.27
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.28	0.02	0.32	0.27	0.27
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.07	0.05	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.16	0.17	0.03
C5	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.35	0.01	0.39	0.35	0.35
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.16	0.17	0.12	0.08	0.07	0.19	0.10	0.06	0.04	0.01	0.01	0.18	0.16	0.28	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.07	0.12	0.03	0.36	0.01	0.42	0.40	0.38
C8	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.03	0.35	0.02	0.35	0.27	0.32
N1	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.12	0.03	0.32	0.03	0.39	0.37	0.34
N2	0.04	0.01	0.13	0.15	0.02	0.07	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.19	0.04	0.24	0.05	0.31	0.28	0.26
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.13	0.03	0.23	0.03	0.29	0.24	0.24
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.02	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.39	0.02	0.41	0.37	0.38
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.25	0.02	0.29	0.20	0.24
O2'	0.02	0.14	0.01	0.03	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.04	0.11	0.18	0.14	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.07	0.28	0.16	0.10
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.11	0.04	0.12	0.15	0.12	0.19	0.13	0.16	0.07	0.06	0.00	0.01	0.24	0.15	0.55	0.30	0.32
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.03	0.13	0.18	0.16
O5'	0.12	0.27	0.18	0.26	0.28	0.02	0.35	0.01	0.36	0.35	0.32	0.24	0.23	0.39	0.25	0.07	0.24	0.10	0.00	0.40	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.04	0.05	0.12	0.02	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.07	0.15	0.03	0.40	0.00	0.47	0.46	0.42
OP1	0.19	0.33	0.34	0.44	0.32	0.16	0.39	0.16	0.42	0.35	0.39	0.31	0.29	0.41	0.29	0.28	0.55	0.13	0.02	0.47	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.30	0.18	0.21	0.27	0.17	0.35	0.28	0.40	0.27	0.37	0.28	0.24	0.37	0.20	0.16	0.30	0.18	0.02	0.46	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.19	0.27	0.27	0.03	0.35	0.02	0.38	0.32	0.34	0.26	0.24	0.38	0.24	0.10	0.32	0.16	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.22	0.15	0.15	0.15	0.16	0.20	0.21	0.24	0.18	0.23	0.21	0.31	0.25	0.11	0.21	0.16	0.17	0.17	0.21	0.23	0.05
C2	0.16	0.28	0.19	0.16	0.14	0.18	0.14	0.20	0.16	0.20	0.22	0.26	0.17	0.21	0.13	0.25	0.19	0.17	0.21	0.29	0.34	0.17
C2'	0.15	0.19	0.13	0.15	0.15	0.15	0.22	0.22	0.24	0.23	0.21	0.17	0.30	0.29	0.13	0.17	0.16	0.16	0.18	0.15	0.16	0.08
C3'	0.17	0.26	0.14	0.14	0.24	0.14	0.33	0.15	0.36	0.28	0.31	0.23	0.43	0.38	0.20	0.13	0.14	0.19	0.08	0.18	0.18	0.02
C4	0.17	0.28	0.16	0.12	0.17	0.14	0.17	0.15	0.22	0.15	0.26	0.25	0.25	0.20	0.11	0.22	0.13	0.16	0.18	0.32	0.36	0.12
C4'	0.16	0.26	0.13	0.14	0.22	0.14	0.31	0.16	0.36	0.25	0.32	0.22	0.45	0.36	0.17	0.14	0.15	0.18	0.06	0.20	0.18	0.04
C5	0.19	0.31	0.18	0.16	0.18	0.16	0.14	0.15	0.23	0.15	0.29	0.27	0.24	0.13	0.14	0.23	0.16	0.19	0.23	0.41	0.46	0.18
C5'	0.18	0.33	0.16	0.16	0.28	0.14	0.39	0.14	0.45	0.27	0.41	0.28	0.56	0.41	0.21	0.14	0.16	0.19	0.06	0.32	0.26	0.11
C6	0.18	0.33	0.18	0.16	0.16	0.15	0.09	0.15	0.17	0.19	0.29	0.28	0.16	0.17	0.14	0.23	0.17	0.16	0.23	0.41	0.48	0.19
C8	0.21	0.28	0.19	0.20	0.19	0.21	0.20	0.19	0.28	0.13	0.30	0.25	0.34	0.16	0.16	0.23	0.20	0.24	0.26	0.44	0.48	0.21
N1	0.16	0.31	0.18	0.14	0.13	0.15	0.10	0.16	0.14	0.17	0.24	0.27	0.14	0.18	0.11	0.25	0.16	0.14	0.21	0.34	0.41	0.17
N2	0.21	0.26	0.25	0.24	0.15	0.26	0.16	0.28	0.16	0.24	0.21	0.24	0.16	0.22	0.18	0.31	0.28	0.25	0.25	0.29	0.32	0.22
N3	0.16	0.26	0.17	0.14	0.16	0.17	0.17	0.21	0.19	0.22	0.22	0.24	0.21	0.23	0.13	0.23	0.17	0.15	0.19	0.26	0.30	0.14
N7	0.22	0.31	0.20	0.21	0.20	0.21	0.17	0.19	0.27	0.17	0.32	0.26	0.31	0.12	0.18	0.23	0.21	0.24	0.27	0.48	0.53	0.23
N9	0.19	0.26	0.16	0.15	0.17	0.16	0.19	0.17	0.25	0.14	0.26	0.24	0.30	0.21	0.12	0.21	0.15	0.19	0.20	0.32	0.35	0.11
O2'	0.16	0.17	0.16	0.20	0.14	0.21	0.20	0.33	0.21	0.24	0.17	0.17	0.27	0.28	0.14	0.23	0.22	0.17	0.22	0.18	0.09	0.13
O3'	0.18	0.26	0.16	0.18	0.26	0.15	0.35	0.17	0.38	0.32	0.33	0.23	0.45	0.41	0.23	0.11	0.18	0.19	0.02	0.02	0.03	0.01
O4'	0.17	0.25	0.13	0.13	0.18	0.15	0.24	0.18	0.30	0.18	0.28	0.22	0.38	0.28	0.13	0.18	0.14	0.18	0.12	0.23	0.23	0.03
O5'	0.46	0.44	0.45	0.43	0.43	0.42	0.43	0.37	0.45	0.42	0.44	0.44	0.49	0.43	0.44	0.45	0.41	0.48	0.41	0.58	0.62	0.41
O6	0.19	0.33	0.20	0.20	0.17	0.18	0.14	0.17	0.17	0.24	0.31	0.26	0.14	0.24	0.18	0.24	0.21	0.19	0.26	0.46	0.54	0.24
OP1	0.63	0.57	0.71	0.76	0.58	0.68	0.58	0.66	0.58	0.61	0.57	0.58	0.60	0.59	0.61	0.68	0.81	0.63	0.75	0.85	0.93	0.75
OP2	0.54	0.53	0.58	0.59	0.53	0.53	0.54	0.49	0.55	0.54	0.55	0.53	0.59	0.55	0.54	0.56	0.60	0.54	0.54	0.72	0.77	0.50
P	0.50	0.47	0.53	0.55	0.48	0.50	0.49	0.47	0.50	0.49	0.49	0.47	0.54	0.49	0.49	0.51	0.57	0.51	0.53	0.69	0.75	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.16	0.22	0.11
C2	0.05	0.00	0.13	0.17	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.15	0.22	0.06	0.28	0.45	0.45	0.29
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.06	0.11	0.13	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.15	0.20	0.16	0.13
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.03	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.14	0.08	0.03	0.01	0.02	0.18	0.25	0.12	0.15
C4	0.02	0.02	0.08	0.12	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.30	0.43	0.41	0.28
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.06	0.06	0.09	0.10	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.15	0.17	0.03
C5	0.01	0.02	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.39	0.57	0.52	0.39
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.11	0.01	0.17	0.00	0.17	0.18	0.13	0.08	0.20	0.21	0.10	0.06	0.03	0.02	0.01	0.22	0.24	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.03	0.40	0.62	0.58	0.42
C8	0.02	0.03	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.14	0.05	0.38	0.48	0.41	0.33
N1	0.03	0.00	0.11	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.12	0.22	0.04	0.35	0.56	0.53	0.37
N3	0.05	0.00	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.06	0.24	0.37	0.38	0.24
N6	0.02	0.02	0.08	0.16	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.21	0.05	0.45	0.72	0.67	0.49
N7	0.02	0.02	0.06	0.14	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.44	0.62	0.55	0.43
N9	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.27	0.35	0.32	0.23
O2'	0.02	0.15	0.01	0.03	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.12	0.13	0.09	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.05	0.16	0.13	0.04
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.14	0.03	0.16	0.03	0.19	0.14	0.22	0.18	0.21	0.16	0.08	0.06	0.00	0.02	0.15	0.34	0.20	0.18
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.09	0.24	0.11
O5'	0.12	0.28	0.15	0.18	0.30	0.01	0.39	0.01	0.40	0.38	0.35	0.24	0.45	0.44	0.27	0.05	0.15	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.45	0.20	0.25	0.43	0.15	0.57	0.22	0.62	0.48	0.56	0.37	0.72	0.62	0.35	0.16	0.34	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.45	0.16	0.12	0.41	0.17	0.52	0.24	0.58	0.41	0.53	0.38	0.67	0.55	0.32	0.13	0.20	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.29	0.13	0.15	0.28	0.03	0.39	0.01	0.42	0.33	0.37	0.24	0.49	0.43	0.23	0.04	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00