Doublet Group distance statistics: 50010

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 4, 3, 2, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.031 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.033 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.001, 0.039, 0.077, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.039 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.002, 0.044, 0.085, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.044 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.035, 0.092, 0.149, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.092 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.065, 0.138, 0.211, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.138 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.055, 0.167, 0.279, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.167 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.077, 0.193, 0.310, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.193 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.122, 0.260, 0.399, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.260 std_dev=0.139
C5	B	0, 0.111, 0.254, 0.396, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.254 std_dev=0.142
C6	B	0, 0.148, 0.319, 0.489, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.319 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.145, 0.318, 0.491, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.318 std_dev=0.173
C4	B	0, 0.136, 0.335, 0.533, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.335 std_dev=0.199
N7	B	0, 0.116, 0.324, 0.533, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.324 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.213, 0.438, 0.662, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.438 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.189, 0.429, 0.670, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.429 std_dev=0.241
N6	B	0, 0.163, 0.406, 0.649, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.406 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.180, 0.433, 0.687, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.433 std_dev=0.253
C8	B	0, 0.124, 0.402, 0.681, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.402 std_dev=0.278
N3	B	0, 0.147, 0.438, 0.729, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.438 std_dev=0.291
C2	B	0, 0.149, 0.462, 0.775, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.462 std_dev=0.313
P	B	0, 0.237, 0.555, 0.873, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.555 std_dev=0.318
O5'	B	0, 0.284, 0.618, 0.953, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.618 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.257, 0.601, 0.946, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.601 std_dev=0.344
OP2	B	0, 0.368, 0.722, 1.076, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.722 std_dev=0.354
O5'	A	0, 0.307, 0.683, 1.060, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.683 std_dev=0.376
C2'	B	0, 0.300, 0.699, 1.097, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.699 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.263, 0.696, 1.129, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.696 std_dev=0.433
C3'	B	0, 0.336, 0.788, 1.240, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.788 std_dev=0.452
P	A	0, 0.546, 1.014, 1.481, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.014 std_dev=0.467
OP1	B	0, 0.462, 0.947, 1.432, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.947 std_dev=0.485
O2'	B	0, 0.343, 0.838, 1.334, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.838 std_dev=0.496
O3'	B	0, 0.441, 0.954, 1.467, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.954 std_dev=0.513
C4'	B	0, 0.276, 0.792, 1.308, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.792 std_dev=0.516
C5'	B	0, 0.285, 0.854, 1.423, 2.405 max_d=2.405 avg_d=0.854 std_dev=0.569
OP2	A	0, 0.700, 1.353, 2.006, 2.844 max_d=2.844 avg_d=1.353 std_dev=0.653
OP1	A	0, 0.574, 1.368, 2.161, 3.210 max_d=3.210 avg_d=1.368 std_dev=0.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.01	0.20	0.34	0.16
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.02	0.29	0.01	0.58	0.57	0.38
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.07	0.09	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.06	0.20	0.22	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.09	0.06	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.19	0.08	0.20	0.14	0.16
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.01	0.29	0.01	0.53	0.56	0.37
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.14	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.35	0.01	0.69	0.68	0.47
C5'	0.03	0.11	0.03	0.04	0.13	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.16	0.09	0.09	0.23	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.23	0.25	0.26	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.37	0.00	0.78	0.72	0.51
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.33	0.01	0.53	0.62	0.41
N1	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.02	0.34	0.00	0.71	0.66	0.46
N2	0.04	0.01	0.09	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.04	0.27	0.02	0.54	0.54	0.36
N3	0.03	0.00	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.08	0.03	0.26	0.01	0.48	0.51	0.33
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.37	0.01	0.71	0.73	0.50
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.26	0.01	0.41	0.50	0.31
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.05	0.08	0.06	0.10	0.03	0.13	0.17	0.13	0.05	0.04	0.00	0.04	0.04	0.06	0.10	0.12	0.19	0.07
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.04	0.08	0.10	0.09	0.12	0.08	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.17	0.10	0.20	0.19	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.02	0.16	0.31	0.10
O5'	0.14	0.29	0.15	0.19	0.29	0.02	0.35	0.01	0.37	0.33	0.34	0.27	0.26	0.37	0.26	0.06	0.17	0.12	0.00	0.40	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.40	0.00	0.88	0.78	0.56
OP1	0.20	0.58	0.20	0.20	0.53	0.14	0.69	0.25	0.78	0.53	0.71	0.54	0.48	0.71	0.41	0.12	0.20	0.16	0.02	0.88	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.57	0.22	0.14	0.56	0.22	0.68	0.26	0.72	0.62	0.66	0.54	0.51	0.73	0.50	0.19	0.19	0.31	0.01	0.78	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.38	0.16	0.16	0.37	0.04	0.47	0.02	0.51	0.41	0.46	0.36	0.33	0.50	0.31	0.07	0.13	0.10	0.01	0.56	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.25	0.28	0.29	0.19	0.31	0.15	0.33	0.18	0.22	0.22	0.25	0.23	0.19	0.22	0.32	0.30	0.33	0.16	0.03	0.09	0.05
C2	0.29	0.36	0.28	0.25	0.23	0.27	0.13	0.26	0.21	0.25	0.33	0.32	0.19	0.19	0.24	0.33	0.25	0.29	0.24	0.15	0.20	0.14
C2'	0.27	0.19	0.25	0.29	0.16	0.29	0.15	0.33	0.17	0.21	0.18	0.20	0.22	0.20	0.19	0.28	0.30	0.30	0.17	0.08	0.11	0.08
C3'	0.22	0.15	0.20	0.24	0.14	0.22	0.15	0.24	0.16	0.18	0.15	0.16	0.22	0.18	0.17	0.21	0.27	0.26	0.08	0.03	0.05	0.01
C4	0.28	0.28	0.26	0.25	0.20	0.26	0.14	0.25	0.19	0.24	0.26	0.26	0.23	0.18	0.23	0.30	0.25	0.30	0.19	0.07	0.15	0.08
C4'	0.23	0.17	0.21	0.25	0.15	0.22	0.14	0.26	0.17	0.19	0.17	0.18	0.23	0.19	0.17	0.22	0.27	0.26	0.07	0.07	0.10	0.04
C5	0.25	0.23	0.22	0.22	0.16	0.22	0.12	0.20	0.18	0.23	0.23	0.21	0.23	0.18	0.20	0.25	0.22	0.27	0.20	0.10	0.17	0.10
C5'	0.25	0.23	0.22	0.25	0.22	0.20	0.23	0.20	0.25	0.24	0.24	0.23	0.29	0.25	0.23	0.22	0.28	0.26	0.10	0.17	0.22	0.13
C6	0.22	0.22	0.19	0.19	0.14	0.20	0.10	0.18	0.15	0.23	0.23	0.18	0.20	0.20	0.19	0.23	0.19	0.24	0.22	0.12	0.19	0.12
C8	0.27	0.22	0.24	0.26	0.17	0.25	0.14	0.23	0.19	0.22	0.22	0.21	0.26	0.18	0.21	0.27	0.27	0.31	0.20	0.13	0.17	0.13
N1	0.24	0.30	0.22	0.20	0.17	0.22	0.10	0.21	0.17	0.24	0.29	0.24	0.18	0.20	0.20	0.27	0.20	0.25	0.23	0.14	0.20	0.13
N2	0.32	0.45	0.33	0.29	0.26	0.31	0.15	0.30	0.23	0.25	0.38	0.40	0.18	0.18	0.26	0.40	0.30	0.32	0.27	0.20	0.23	0.18
N3	0.31	0.34	0.30	0.28	0.23	0.30	0.15	0.29	0.21	0.26	0.30	0.32	0.20	0.19	0.25	0.35	0.27	0.32	0.22	0.13	0.18	0.12
N7	0.25	0.20	0.22	0.23	0.16	0.22	0.13	0.20	0.18	0.22	0.21	0.19	0.26	0.18	0.20	0.24	0.25	0.28	0.21	0.14	0.19	0.14
N9	0.29	0.25	0.26	0.27	0.19	0.27	0.15	0.27	0.19	0.23	0.23	0.24	0.24	0.18	0.22	0.30	0.27	0.32	0.18	0.06	0.12	0.06
O2'	0.29	0.24	0.30	0.34	0.20	0.36	0.18	0.43	0.19	0.24	0.21	0.25	0.22	0.23	0.22	0.34	0.35	0.32	0.21	0.14	0.12	0.12
O3'	0.17	0.13	0.15	0.21	0.13	0.16	0.16	0.19	0.17	0.16	0.15	0.13	0.22	0.19	0.13	0.15	0.25	0.21	0.02	0.01	0.02	0.01
O4'	0.28	0.22	0.25	0.27	0.17	0.28	0.15	0.30	0.18	0.21	0.21	0.22	0.25	0.19	0.20	0.29	0.29	0.31	0.11	0.04	0.08	0.03
O5'	0.33	0.39	0.32	0.34	0.36	0.27	0.39	0.25	0.42	0.36	0.41	0.37	0.47	0.39	0.34	0.30	0.36	0.32	0.29	0.31	0.42	0.30
O6	0.20	0.18	0.18	0.19	0.12	0.18	0.11	0.16	0.12	0.22	0.19	0.14	0.19	0.21	0.17	0.20	0.20	0.22	0.23	0.15	0.21	0.14
OP1	0.48	0.78	0.52	0.50	0.69	0.35	0.77	0.29	0.87	0.61	0.86	0.70	0.95	0.74	0.59	0.46	0.52	0.38	0.40	0.38	0.57	0.37
OP2	0.40	0.51	0.31	0.24	0.46	0.27	0.49	0.25	0.54	0.41	0.54	0.48	0.58	0.46	0.42	0.31	0.26	0.38	0.22	0.47	0.32	0.29
P	0.35	0.47	0.34	0.33	0.43	0.26	0.46	0.21	0.51	0.39	0.51	0.43	0.56	0.45	0.39	0.31	0.35	0.33	0.27	0.32	0.40	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.09	0.19	0.08
C2	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.19	0.03	0.18	0.19	0.24	0.16
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.06	0.11	0.14	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.20	0.10	0.09
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.12	0.13	0.13	0.11	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.20	0.26	0.11	0.17
C4	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.17	0.16	0.23	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.06	0.06	0.09	0.09	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.03	0.22	0.20	0.25	0.18
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.11	0.06	0.18	0.18	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.14	0.03	0.23	0.22	0.27	0.21
C8	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.21	0.17	0.23	0.16
N1	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.17	0.03	0.21	0.21	0.27	0.19
N3	0.03	0.00	0.14	0.13	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.16	0.03	0.15	0.17	0.23	0.13
N6	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.15	0.05	0.26	0.26	0.30	0.25
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.25	0.21	0.26	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.15	0.13	0.21	0.11
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.15	0.16	0.09	0.03	0.03	0.00	0.04	0.04	0.10	0.22	0.10	0.09
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.01	0.11	0.04	0.14	0.13	0.17	0.16	0.15	0.13	0.06	0.04	0.00	0.02	0.22	0.38	0.21	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.08	0.24	0.13
O5'	0.08	0.18	0.13	0.20	0.17	0.01	0.22	0.01	0.23	0.21	0.21	0.15	0.26	0.25	0.15	0.10	0.22	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.19	0.20	0.26	0.16	0.10	0.20	0.08	0.22	0.17	0.21	0.17	0.26	0.21	0.13	0.22	0.38	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.24	0.10	0.11	0.23	0.14	0.25	0.16	0.27	0.23	0.27	0.23	0.30	0.26	0.21	0.10	0.21	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.09	0.17	0.14	0.01	0.18	0.01	0.21	0.16	0.19	0.13	0.25	0.20	0.11	0.09	0.26	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00