Doublet Group distance statistics: 50012

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 2, 1, 3, 0, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.012, 0.019, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.019 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.020, 0.029, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.016, 0.026, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.023, 0.034, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.017, 0.028, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.017, 0.029, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.002, 0.033, 0.063, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.033 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.026, 0.139, 0.252, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.139 std_dev=0.113
C2'	A	0, 0.040, 0.163, 0.286, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.163 std_dev=0.123
O2'	A	0, 0.143, 0.268, 0.394, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.268 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.056, 0.243, 0.430, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.243 std_dev=0.187
C3'	A	0, 0.045, 0.257, 0.468, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.257 std_dev=0.211
N7	B	0, 0.363, 0.617, 0.871, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.617 std_dev=0.254
C5	B	0, 0.319, 0.582, 0.846, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.582 std_dev=0.264
N6	B	0, 0.392, 0.667, 0.942, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.667 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.325, 0.612, 0.898, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.612 std_dev=0.286
C5'	A	0, 0.095, 0.393, 0.691, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.393 std_dev=0.298
C8	B	0, 0.326, 0.627, 0.929, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.627 std_dev=0.302
O3'	A	0, 0.101, 0.431, 0.761, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.431 std_dev=0.330
C4	B	0, 0.237, 0.572, 0.907, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.572 std_dev=0.335
N1	B	0, 0.345, 0.689, 1.033, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.689 std_dev=0.344
N9	B	0, 0.242, 0.590, 0.939, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.590 std_dev=0.349
O5'	B	0, 0.200, 0.557, 0.914, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.557 std_dev=0.357
C2	B	0, 0.353, 0.716, 1.078, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.716 std_dev=0.362
N3	B	0, 0.285, 0.650, 1.016, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.650 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.242, 0.616, 0.991, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.616 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.272, 0.657, 1.043, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.657 std_dev=0.385
P	B	0, 0.114, 0.504, 0.894, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.504 std_dev=0.390
C1'	B	0, 0.258, 0.672, 1.086, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.672 std_dev=0.414
C5'	B	0, 0.226, 0.646, 1.066, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.646 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.180, 0.601, 1.021, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.601 std_dev=0.420
C3'	B	0, 0.265, 0.767, 1.270, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.767 std_dev=0.503
C2'	B	0, 0.237, 0.776, 1.315, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.776 std_dev=0.539
OP2	A	0, 0.340, 0.908, 1.477, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.908 std_dev=0.569
O3'	B	0, 0.362, 0.939, 1.516, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.939 std_dev=0.577
P	A	0, 0.182, 0.767, 1.352, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.767 std_dev=0.585
OP1	B	0, 0.239, 0.845, 1.451, 2.219 max_d=2.219 avg_d=0.845 std_dev=0.606
O2'	B	0, 0.290, 0.922, 1.553, 2.285 max_d=2.285 avg_d=0.922 std_dev=0.632
OP2	B	0, 0.047, 0.756, 1.466, 2.893 max_d=2.893 avg_d=0.756 std_dev=0.709
OP1	A	0, 0.367, 1.077, 1.787, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.077 std_dev=0.710

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.02	0.15	0.20	0.11
C2	0.04	0.00	0.16	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.16	0.19	0.03	0.28	0.01	0.24	0.28	0.26
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.01	0.08	0.05	0.13	0.18	0.15	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.17	0.07	0.23	0.19	0.16
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.10	0.09	0.14	0.18	0.14	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.25	0.10	0.30	0.20	0.23
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.30	0.01	0.25	0.27	0.26
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.19	0.22	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.37	0.01	0.32	0.33	0.33
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.06	0.05	0.08	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.27	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.38	0.00	0.35	0.35	0.35
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.38	0.02	0.29	0.28	0.30
N1	0.03	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.03	0.33	0.01	0.31	0.33	0.31
N2	0.05	0.00	0.18	0.18	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.23	0.04	0.25	0.02	0.22	0.28	0.24
N3	0.04	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.16	0.03	0.25	0.01	0.21	0.25	0.22
N7	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.12	0.03	0.41	0.02	0.35	0.34	0.36
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.28	0.01	0.22	0.24	0.22
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.06	0.06	0.07	0.09	0.04	0.13	0.19	0.14	0.04	0.03	0.00	0.03	0.05	0.09	0.08	0.20	0.19	0.10
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.02	0.14	0.11	0.17	0.23	0.16	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.30	0.14	0.39	0.26	0.31
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.14	0.04	0.20	0.26	0.13
O5'	0.15	0.28	0.17	0.25	0.30	0.01	0.37	0.01	0.38	0.38	0.33	0.25	0.25	0.41	0.28	0.09	0.30	0.14	0.00	0.41	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.14	0.04	0.41	0.00	0.40	0.39	0.39
OP1	0.15	0.24	0.23	0.30	0.25	0.19	0.32	0.27	0.35	0.29	0.31	0.22	0.21	0.35	0.22	0.20	0.39	0.20	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.28	0.19	0.20	0.27	0.22	0.33	0.26	0.35	0.28	0.33	0.28	0.25	0.34	0.24	0.19	0.26	0.26	0.01	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.26	0.16	0.23	0.26	0.03	0.33	0.01	0.35	0.30	0.31	0.24	0.22	0.36	0.22	0.10	0.31	0.13	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.31	0.22	0.23	0.15	0.25	0.21	0.37	0.25	0.36	0.30	0.26	0.31	0.35	0.19	0.36	0.23	0.24	0.25	0.26	0.31	0.07
C2	0.37	0.31	0.40	0.35	0.17	0.31	0.23	0.33	0.29	0.39	0.35	0.22	0.38	0.36	0.31	0.47	0.36	0.32	0.23	0.42	0.49	0.19
C2'	0.26	0.29	0.24	0.21	0.17	0.23	0.19	0.38	0.21	0.34	0.25	0.27	0.25	0.32	0.17	0.38	0.21	0.22	0.30	0.20	0.27	0.13
C3'	0.36	0.29	0.30	0.17	0.22	0.24	0.15	0.22	0.17	0.26	0.23	0.31	0.18	0.23	0.24	0.41	0.19	0.34	0.09	0.23	0.23	0.01
C4	0.30	0.30	0.28	0.28	0.13	0.26	0.20	0.31	0.25	0.39	0.30	0.24	0.33	0.38	0.25	0.37	0.25	0.26	0.21	0.43	0.50	0.16
C4'	0.32	0.30	0.28	0.18	0.19	0.25	0.14	0.26	0.18	0.27	0.25	0.28	0.21	0.24	0.21	0.40	0.22	0.30	0.06	0.24	0.28	0.11
C5	0.29	0.30	0.27	0.29	0.18	0.25	0.19	0.28	0.21	0.35	0.27	0.26	0.32	0.35	0.25	0.34	0.24	0.25	0.19	0.53	0.60	0.20
C5'	0.37	0.32	0.32	0.20	0.24	0.29	0.19	0.22	0.21	0.29	0.28	0.31	0.22	0.24	0.27	0.41	0.22	0.37	0.16	0.36	0.45	0.22
C6	0.33	0.31	0.33	0.34	0.23	0.27	0.21	0.28	0.20	0.34	0.27	0.29	0.33	0.33	0.29	0.37	0.28	0.27	0.20	0.55	0.62	0.22
C8	0.24	0.28	0.19	0.24	0.14	0.21	0.16	0.28	0.21	0.31	0.26	0.24	0.28	0.32	0.18	0.28	0.19	0.23	0.19	0.51	0.56	0.17
N1	0.36	0.30	0.40	0.37	0.22	0.31	0.22	0.31	0.23	0.36	0.28	0.27	0.37	0.34	0.32	0.43	0.34	0.31	0.23	0.50	0.57	0.21
N2	0.39	0.33	0.46	0.38	0.18	0.35	0.24	0.35	0.31	0.38	0.38	0.18	0.39	0.34	0.32	0.54	0.43	0.36	0.26	0.39	0.45	0.20
N3	0.33	0.33	0.35	0.31	0.14	0.29	0.24	0.34	0.29	0.41	0.35	0.23	0.36	0.38	0.28	0.45	0.31	0.30	0.23	0.38	0.44	0.16
N7	0.26	0.29	0.21	0.26	0.17	0.22	0.17	0.26	0.20	0.30	0.27	0.25	0.28	0.31	0.21	0.29	0.20	0.24	0.18	0.57	0.63	0.21
N9	0.26	0.30	0.22	0.24	0.13	0.23	0.19	0.32	0.24	0.37	0.29	0.24	0.31	0.36	0.20	0.33	0.20	0.23	0.22	0.40	0.46	0.13
O2'	0.27	0.35	0.29	0.30	0.25	0.35	0.27	0.52	0.29	0.38	0.32	0.32	0.31	0.35	0.25	0.42	0.33	0.31	0.40	0.17	0.15	0.18
O3'	0.42	0.30	0.39	0.22	0.26	0.31	0.19	0.19	0.18	0.26	0.23	0.33	0.18	0.23	0.28	0.46	0.25	0.43	0.01	0.01	0.02	0.01
O4'	0.27	0.31	0.24	0.19	0.15	0.24	0.16	0.31	0.22	0.31	0.29	0.26	0.27	0.29	0.18	0.38	0.21	0.24	0.13	0.27	0.30	0.05
O5'	0.21	0.32	0.24	0.34	0.25	0.30	0.39	0.40	0.45	0.41	0.41	0.24	0.56	0.49	0.24	0.28	0.37	0.25	0.30	0.61	0.49	0.35
O6	0.32	0.35	0.34	0.35	0.27	0.28	0.23	0.27	0.21	0.30	0.30	0.33	0.29	0.29	0.29	0.36	0.29	0.27	0.20	0.60	0.66	0.23
OP1	0.38	0.37	0.44	0.52	0.39	0.45	0.50	0.51	0.53	0.54	0.46	0.33	0.64	0.61	0.41	0.43	0.59	0.39	0.43	0.77	0.57	0.49
OP2	0.37	0.44	0.35	0.44	0.39	0.38	0.48	0.39	0.54	0.45	0.51	0.39	0.65	0.53	0.38	0.38	0.48	0.38	0.35	0.78	0.53	0.36
P	0.27	0.33	0.29	0.39	0.28	0.35	0.40	0.42	0.46	0.43	0.42	0.26	0.58	0.50	0.29	0.32	0.44	0.30	0.33	0.73	0.51	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.12	0.21	0.31	0.21
C2	0.02	0.00	0.21	0.19	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.14	0.27	0.13	0.13	0.45	0.49	0.19
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.01	0.06	0.13	0.10	0.12	0.17	0.21	0.08	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.27	0.26	0.37	0.28
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.16	0.00	0.20	0.01	0.21	0.21	0.21	0.16	0.24	0.22	0.13	0.02	0.00	0.01	0.16	0.13	0.20	0.11
C4	0.02	0.01	0.11	0.16	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.15	0.07	0.13	0.41	0.48	0.19
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.12	0.04	0.04	0.09	0.12	0.05	0.17	0.02	0.00	0.01	0.19	0.11	0.12
C5	0.01	0.01	0.06	0.20	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.03	0.16	0.53	0.59	0.24
C5'	0.05	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.10	0.08	0.14	0.15	0.08	0.05	0.12	0.01	0.01	0.24	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.21	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.16	0.05	0.16	0.59	0.62	0.25
C8	0.01	0.02	0.12	0.21	0.01	0.12	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.22	0.15	0.08	0.16	0.43	0.54	0.24
N1	0.02	0.01	0.17	0.21	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.22	0.10	0.15	0.54	0.56	0.21
N3	0.03	0.00	0.21	0.16	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.26	0.13	0.12	0.38	0.44	0.18
N6	0.02	0.02	0.08	0.24	0.00	0.09	0.01	0.14	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.20	0.16	0.04	0.19	0.68	0.68	0.29
N7	0.01	0.02	0.07	0.22	0.01	0.12	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.23	0.15	0.05	0.18	0.57	0.65	0.29
N9	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.08	0.01	0.11	0.32	0.42	0.18
O2'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.12	0.17	0.17	0.05	0.17	0.22	0.14	0.14	0.20	0.23	0.12	0.00	0.03	0.12	0.19	0.22	0.36	0.25
O3'	0.19	0.27	0.03	0.00	0.15	0.02	0.12	0.12	0.16	0.15	0.22	0.26	0.16	0.15	0.08	0.03	0.00	0.14	0.23	0.34	0.33	0.22
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.10	0.13	0.04	0.05	0.01	0.12	0.14	0.00	0.12	0.25	0.27	0.25
O5'	0.12	0.13	0.27	0.16	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.15	0.12	0.19	0.18	0.11	0.19	0.23	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.21	0.45	0.26	0.13	0.41	0.19	0.53	0.24	0.59	0.43	0.54	0.38	0.68	0.57	0.32	0.22	0.34	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.49	0.37	0.20	0.48	0.11	0.59	0.17	0.62	0.54	0.56	0.44	0.68	0.65	0.42	0.36	0.33	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.19	0.28	0.11	0.19	0.12	0.24	0.02	0.25	0.24	0.21	0.18	0.29	0.29	0.18	0.25	0.22	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00