Doublet Group distance statistics: 50013

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 2, 0, 0, 3, 2, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.022, 0.048, 0.073, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.048 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.022, 0.048, 0.074, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.048 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.023, 0.052, 0.081, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.052 std_dev=0.029
C5	B	0, 0.126, 0.333, 0.540, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.333 std_dev=0.207
N7	B	0, 0.169, 0.387, 0.606, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.387 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.078, 0.331, 0.585, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.331 std_dev=0.253
C8	B	0, 0.110, 0.397, 0.684, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.397 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.154, 0.460, 0.767, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.460 std_dev=0.307
C6	B	0, 0.138, 0.447, 0.756, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.447 std_dev=0.309
N9	B	0, 0.077, 0.389, 0.700, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.389 std_dev=0.312
C2	B	0, 0.197, 0.525, 0.854, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.525 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.193, 0.538, 0.883, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.538 std_dev=0.345
O4'	A	0, -0.045, 0.367, 0.779, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.367 std_dev=0.412
N6	B	0, 0.160, 0.584, 1.008, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.584 std_dev=0.424
C2'	A	0, -0.008, 0.417, 0.842, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.417 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.106, 0.560, 1.014, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.560 std_dev=0.454
O4'	B	0, 0.107, 0.630, 1.153, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.630 std_dev=0.523
C2'	B	0, 0.151, 0.714, 1.277, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.714 std_dev=0.563
C3'	A	0, 0.018, 0.590, 1.163, 2.381 max_d=2.381 avg_d=0.590 std_dev=0.573
C3'	B	0, 0.204, 0.814, 1.423, 2.197 max_d=2.197 avg_d=0.814 std_dev=0.609
C4'	A	0, -0.065, 0.547, 1.160, 2.636 max_d=2.636 avg_d=0.547 std_dev=0.613
C4'	B	0, 0.193, 0.805, 1.418, 2.019 max_d=2.019 avg_d=0.805 std_dev=0.613
O2'	A	0, -0.056, 0.567, 1.190, 2.695 max_d=2.695 avg_d=0.567 std_dev=0.623
C5'	B	0, 0.192, 0.828, 1.464, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.828 std_dev=0.636
O3'	A	0, 0.097, 0.751, 1.406, 2.598 max_d=2.598 avg_d=0.751 std_dev=0.655
O2'	B	0, 0.232, 0.904, 1.576, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.904 std_dev=0.672
O3'	B	0, 0.259, 1.067, 1.875, 3.101 max_d=3.101 avg_d=1.067 std_dev=0.808
O5'	B	0, -0.028, 0.793, 1.614, 3.330 max_d=3.330 avg_d=0.793 std_dev=0.821
O5'	A	0, 0.270, 1.186, 2.103, 3.698 max_d=3.698 avg_d=1.186 std_dev=0.916
P	A	0, 0.056, 0.986, 1.916, 4.040 max_d=4.040 avg_d=0.986 std_dev=0.930
C5'	A	0, 0.039, 0.978, 1.917, 3.979 max_d=3.979 avg_d=0.978 std_dev=0.939
P	B	0, -0.153, 0.812, 1.777, 3.941 max_d=3.941 avg_d=0.812 std_dev=0.965
OP2	B	0, -0.296, 0.825, 1.946, 4.610 max_d=4.610 avg_d=0.825 std_dev=1.121
OP1	A	0, -0.110, 1.044, 2.197, 4.989 max_d=4.989 avg_d=1.044 std_dev=1.153
OP1	B	0, -0.207, 1.069, 2.345, 5.241 max_d=5.241 avg_d=1.069 std_dev=1.276
OP2	A	0, -0.112, 1.296, 2.704, 6.185 max_d=6.185 avg_d=1.296 std_dev=1.408

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.20	0.01	0.24	0.02	0.14	0.50	0.16
C2	0.03	0.00	0.25	0.18	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.21	0.20	0.41	0.01	0.22	0.64	0.30
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.12	0.11	0.12	0.19	0.31	0.25	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.27	0.09	0.34	0.33	0.25
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.03	0.20	0.20	0.19	0.19	0.16	0.22	0.13	0.02	0.01	0.01	0.35	0.22	0.43	0.29	0.29
C4	0.02	0.00	0.13	0.16	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.11	0.48	0.01	0.27	0.72	0.37
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.14	0.07	0.15	0.10	0.12	0.05	0.16	0.03	0.00	0.02	0.07	0.17	0.44	0.09
C5	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.06	0.06	0.64	0.02	0.38	0.95	0.54
C5'	0.05	0.14	0.12	0.03	0.09	0.00	0.11	0.00	0.12	0.16	0.13	0.18	0.13	0.16	0.07	0.05	0.12	0.01	0.01	0.14	0.21	0.42	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.20	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.07	0.10	0.63	0.01	0.39	0.98	0.55
C8	0.01	0.01	0.12	0.20	0.00	0.14	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.12	0.11	0.71	0.03	0.42	0.96	0.57
N1	0.02	0.00	0.19	0.19	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.16	0.52	0.01	0.30	0.82	0.44
N2	0.04	0.01	0.31	0.19	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.28	0.23	0.34	0.01	0.19	0.55	0.23
N3	0.03	0.00	0.25	0.16	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.23	0.19	0.36	0.01	0.19	0.58	0.25
N7	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.12	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.12	0.06	0.76	0.03	0.48	1.11	0.67
N9	0.00	0.01	0.02	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.49	0.02	0.27	0.70	0.35
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.06	0.16	0.12	0.05	0.09	0.25	0.10	0.27	0.18	0.23	0.10	0.00	0.04	0.12	0.08	0.13	0.25	0.45	0.22
O3'	0.20	0.21	0.02	0.01	0.12	0.03	0.06	0.12	0.07	0.12	0.14	0.28	0.23	0.12	0.09	0.04	0.00	0.15	0.27	0.08	0.55	0.31	0.29
O4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.11	0.16	0.23	0.19	0.06	0.01	0.12	0.15	0.00	0.22	0.08	0.19	0.64	0.31
O5'	0.24	0.41	0.27	0.35	0.48	0.02	0.64	0.01	0.63	0.71	0.52	0.34	0.36	0.76	0.49	0.08	0.27	0.22	0.00	0.70	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.22	0.01	0.07	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.08	0.08	0.70	0.00	0.46	1.12	0.65
OP1	0.14	0.22	0.34	0.43	0.27	0.17	0.38	0.21	0.39	0.42	0.30	0.19	0.19	0.48	0.27	0.25	0.55	0.19	0.02	0.46	0.00	0.01	0.00
OP2	0.50	0.64	0.33	0.29	0.72	0.44	0.95	0.42	0.98	0.96	0.82	0.55	0.58	1.11	0.70	0.45	0.31	0.64	0.02	1.12	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.30	0.25	0.29	0.37	0.09	0.54	0.01	0.55	0.57	0.44	0.23	0.25	0.67	0.35	0.22	0.29	0.31	0.00	0.65	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.21	0.29	0.29	0.20	0.36	0.21	0.41	0.23	0.27	0.22	0.22	0.29	0.27	0.23	0.32	0.33	0.33	0.17	0.20	0.13	0.13
C2	0.25	0.17	0.25	0.22	0.14	0.26	0.11	0.29	0.13	0.23	0.17	0.16	0.18	0.19	0.21	0.29	0.25	0.26	0.26	0.18	0.34	0.13
C2'	0.29	0.32	0.26	0.24	0.29	0.23	0.28	0.26	0.30	0.25	0.31	0.32	0.31	0.29	0.26	0.27	0.24	0.28	0.27	0.06	0.20	0.11
C3'	0.18	0.35	0.16	0.18	0.33	0.13	0.42	0.19	0.45	0.37	0.41	0.30	0.51	0.47	0.27	0.12	0.17	0.15	0.13	0.07	0.05	0.01
C4	0.23	0.20	0.21	0.19	0.15	0.26	0.16	0.29	0.22	0.22	0.22	0.18	0.27	0.20	0.19	0.25	0.21	0.26	0.25	0.08	0.34	0.12
C4'	0.19	0.23	0.16	0.17	0.20	0.23	0.31	0.26	0.35	0.26	0.30	0.19	0.46	0.38	0.17	0.24	0.22	0.22	0.06	0.18	0.14	0.08
C5	0.19	0.22	0.17	0.16	0.14	0.22	0.16	0.26	0.25	0.20	0.26	0.17	0.33	0.19	0.16	0.21	0.17	0.22	0.33	0.13	0.49	0.24
C5'	0.19	0.33	0.18	0.21	0.31	0.17	0.45	0.20	0.50	0.37	0.43	0.27	0.62	0.52	0.25	0.19	0.22	0.19	0.20	0.18	0.35	0.21
C6	0.18	0.22	0.17	0.16	0.13	0.19	0.15	0.23	0.22	0.21	0.26	0.16	0.31	0.21	0.16	0.20	0.18	0.20	0.36	0.14	0.54	0.25
C8	0.22	0.22	0.20	0.19	0.16	0.27	0.20	0.30	0.28	0.19	0.27	0.18	0.37	0.20	0.18	0.23	0.21	0.27	0.31	0.20	0.44	0.26
N1	0.20	0.18	0.19	0.17	0.11	0.21	0.12	0.24	0.17	0.20	0.20	0.15	0.24	0.20	0.16	0.23	0.19	0.21	0.32	0.11	0.46	0.18
N2	0.30	0.17	0.31	0.28	0.16	0.31	0.13	0.32	0.13	0.24	0.16	0.18	0.17	0.19	0.24	0.36	0.32	0.31	0.26	0.28	0.30	0.16
N3	0.28	0.19	0.27	0.25	0.17	0.30	0.15	0.33	0.16	0.26	0.18	0.19	0.20	0.21	0.24	0.31	0.28	0.30	0.21	0.20	0.26	0.10
N7	0.20	0.23	0.18	0.19	0.15	0.24	0.19	0.27	0.28	0.20	0.29	0.18	0.38	0.19	0.17	0.20	0.20	0.24	0.37	0.24	0.55	0.32
N9	0.24	0.20	0.22	0.21	0.17	0.29	0.19	0.33	0.24	0.22	0.23	0.19	0.31	0.23	0.20	0.26	0.23	0.28	0.22	0.07	0.28	0.12
O2'	0.30	0.20	0.28	0.29	0.19	0.32	0.24	0.39	0.25	0.30	0.19	0.23	0.33	0.37	0.20	0.34	0.33	0.34	0.27	0.10	0.37	0.17
O3'	0.21	0.25	0.19	0.21	0.24	0.23	0.31	0.22	0.32	0.29	0.29	0.22	0.38	0.36	0.22	0.23	0.24	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00
O4'	0.35	0.26	0.32	0.28	0.24	0.38	0.25	0.36	0.28	0.25	0.26	0.27	0.37	0.29	0.26	0.41	0.34	0.38	0.10	0.22	0.08	0.10
O5'	0.40	0.53	0.38	0.36	0.51	0.35	0.62	0.30	0.67	0.52	0.62	0.48	0.78	0.65	0.45	0.39	0.34	0.38	0.37	0.39	0.45	0.36
O6	0.17	0.24	0.17	0.19	0.14	0.19	0.17	0.23	0.24	0.23	0.28	0.17	0.34	0.25	0.16	0.18	0.21	0.19	0.41	0.21	0.62	0.32
OP1	0.47	0.49	0.51	0.55	0.49	0.55	0.58	0.58	0.64	0.53	0.58	0.45	0.78	0.62	0.48	0.50	0.56	0.51	0.61	0.72	0.64	0.64
OP2	0.30	0.74	0.25	0.23	0.59	0.38	0.80	0.41	0.97	0.51	0.92	0.57	1.18	0.77	0.43	0.31	0.32	0.33	0.37	0.69	0.48	0.48
P	0.28	0.45	0.28	0.29	0.38	0.36	0.52	0.37	0.63	0.37	0.58	0.36	0.79	0.54	0.31	0.32	0.33	0.33	0.36	0.54	0.48	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.22	0.10	0.29	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.39	0.23	0.52	0.30
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.11	0.08	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.23	0.18	0.26	0.13
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.06	0.01	0.00	0.02	0.26	0.27	0.21	0.19
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.02	0.41	0.24	0.49	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.04	0.08	0.07	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.11	0.21	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.02	0.50	0.35	0.61	0.41
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.00	0.15	0.00	0.16	0.15	0.13	0.09	0.18	0.17	0.10	0.05	0.05	0.01	0.01	0.20	0.25	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.50	0.37	0.65	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.50	0.33	0.52	0.38
N1	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.46	0.31	0.60	0.38
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.35	0.18	0.45	0.24
N6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.16	0.04	0.54	0.44	0.72	0.50
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.54	0.42	0.65	0.47
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.38	0.20	0.42	0.25
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.04	0.02	0.00	0.07	0.04	0.09	0.20	0.16	0.05
O3'	0.03	0.16	0.03	0.00	0.10	0.03	0.12	0.05	0.15	0.13	0.16	0.14	0.16	0.14	0.06	0.07	0.00	0.04	0.19	0.30	0.15	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.04	0.00	0.15	0.13	0.29	0.11
O5'	0.22	0.39	0.23	0.26	0.41	0.01	0.50	0.01	0.50	0.50	0.46	0.35	0.54	0.54	0.38	0.09	0.19	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.23	0.18	0.27	0.24	0.11	0.35	0.20	0.37	0.33	0.31	0.18	0.44	0.42	0.20	0.20	0.30	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.52	0.26	0.21	0.49	0.21	0.61	0.25	0.65	0.52	0.60	0.45	0.72	0.65	0.42	0.16	0.15	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.30	0.13	0.19	0.30	0.07	0.41	0.01	0.44	0.38	0.38	0.24	0.50	0.47	0.25	0.05	0.18	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00