Doublet Group distance statistics: 50015

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 2, 2, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.023, 0.036, 0.049, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.036 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.029, 0.045, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.045 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.032, 0.049, 0.065, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.049 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.032, 0.051, 0.070, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.051 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.033, 0.052, 0.072, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.052 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.026, 0.046, 0.066, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.046 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.041, 0.061, 0.081, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.061 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.043, 0.065, 0.088, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.065 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.044, 0.071, 0.099, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.071 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.106, 0.215, 0.324, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.215 std_dev=0.109
C2'	A	0, 0.167, 0.304, 0.442, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.304 std_dev=0.138
N9	B	0, 0.194, 0.333, 0.472, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.333 std_dev=0.139
C4	B	0, 0.204, 0.346, 0.488, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.346 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.224, 0.389, 0.555, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.389 std_dev=0.166
C1'	B	0, 0.236, 0.417, 0.599, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.417 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.225, 0.408, 0.592, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.408 std_dev=0.183
O2'	A	0, 0.181, 0.375, 0.569, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.375 std_dev=0.194
C3'	A	0, 0.247, 0.443, 0.638, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.443 std_dev=0.195
C8	B	0, 0.194, 0.394, 0.593, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.394 std_dev=0.200
C5	B	0, 0.241, 0.446, 0.652, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.446 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.344, 0.568, 0.793, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.568 std_dev=0.225
O4'	B	0, 0.232, 0.458, 0.683, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.458 std_dev=0.226
C4'	B	0, 0.327, 0.556, 0.786, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.556 std_dev=0.230
N7	B	0, 0.207, 0.452, 0.697, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.452 std_dev=0.245
C5'	B	0, 0.435, 0.682, 0.929, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.682 std_dev=0.247
OP2	B	0, 0.337, 0.584, 0.831, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.584 std_dev=0.247
C3'	B	0, 0.362, 0.611, 0.861, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.611 std_dev=0.250
P	B	0, 0.225, 0.478, 0.731, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.478 std_dev=0.253
O3'	A	0, 0.364, 0.643, 0.923, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.643 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.403, 0.686, 0.969, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.686 std_dev=0.283
OP1	B	0, 0.220, 0.506, 0.793, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.506 std_dev=0.287
C2'	B	0, 0.248, 0.539, 0.830, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.539 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.359, 0.656, 0.952, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.656 std_dev=0.296
C5'	A	0, 0.344, 0.649, 0.954, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.649 std_dev=0.305
O5'	B	0, 0.387, 0.706, 1.026, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.706 std_dev=0.320
O3'	B	0, 0.498, 0.882, 1.267, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.882 std_dev=0.385
N6	B	0, 0.393, 0.800, 1.206, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.800 std_dev=0.407
O2'	B	0, 0.200, 0.629, 1.057, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.629 std_dev=0.428
O5'	A	0, 1.488, 2.404, 3.319, 3.190 max_d=3.190 avg_d=2.404 std_dev=0.915
OP1	A	0, 1.606, 2.706, 3.805, 3.810 max_d=3.810 avg_d=2.706 std_dev=1.100
P	A	0, 1.902, 3.134, 4.365, 4.238 max_d=4.238 avg_d=3.134 std_dev=1.231
OP2	A	0, 3.209, 5.364, 7.518, 7.005 max_d=7.005 avg_d=5.364 std_dev=2.154

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.03	0.08	0.43	0.26
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.47	0.01	0.26	0.92	0.53
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.09	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.17	0.05	0.11	0.27	0.17
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.10	0.09	0.10	0.10	0.09	0.11	0.06	0.03	0.00	0.01	0.12	0.11	0.17	0.18	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.50	0.02	0.26	0.92	0.55
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.08	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.61	0.02	0.38	1.18	0.70
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.10	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.11	0.07	0.07	0.17	0.09	0.04	0.05	0.02	0.01	0.16	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.03	0.62	0.01	0.42	1.26	0.73
C8	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.62	0.02	0.35	1.08	0.66
N1	0.03	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.12	0.03	0.55	0.01	0.35	1.12	0.65
N2	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.04	0.42	0.02	0.22	0.84	0.48
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.42	0.02	0.20	0.79	0.46
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.67	0.02	0.45	1.30	0.78
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.48	0.02	0.22	0.81	0.49
O2'	0.01	0.12	0.00	0.03	0.07	0.05	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.09	0.04	0.06	0.07	0.09	0.10	0.05
O3'	0.02	0.11	0.03	0.00	0.08	0.01	0.11	0.05	0.13	0.11	0.12	0.13	0.09	0.13	0.06	0.09	0.00	0.01	0.11	0.14	0.22	0.19	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.22	0.03	0.11	0.29	0.19
O5'	0.28	0.47	0.17	0.12	0.50	0.01	0.61	0.01	0.62	0.62	0.55	0.42	0.42	0.67	0.48	0.06	0.11	0.22	0.00	0.66	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.11	0.02	0.06	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.14	0.03	0.66	0.00	0.49	1.40	0.81
OP1	0.08	0.26	0.11	0.17	0.26	0.08	0.38	0.05	0.42	0.35	0.35	0.22	0.20	0.45	0.22	0.09	0.22	0.11	0.02	0.49	0.00	0.01	0.00
OP2	0.43	0.92	0.27	0.18	0.92	0.02	1.18	0.01	1.26	1.08	1.12	0.84	0.79	1.30	0.81	0.10	0.19	0.29	0.01	1.40	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.53	0.17	0.13	0.55	0.01	0.70	0.01	0.73	0.66	0.65	0.48	0.46	0.78	0.49	0.05	0.11	0.19	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.17	0.19	0.15	0.14	0.20	0.24	0.29	0.29	0.21	0.24	0.13	0.38	0.29	0.14	0.28	0.18	0.19	0.14	0.06	0.16	0.07
C2	0.33	0.20	0.42	0.33	0.14	0.30	0.20	0.27	0.29	0.21	0.28	0.16	0.35	0.22	0.21	0.53	0.39	0.28	0.23	0.18	0.34	0.18
C2'	0.17	0.16	0.14	0.16	0.14	0.19	0.22	0.31	0.25	0.21	0.21	0.12	0.31	0.28	0.12	0.19	0.18	0.17	0.16	0.09	0.23	0.12
C3'	0.12	0.12	0.11	0.20	0.10	0.17	0.20	0.29	0.24	0.15	0.19	0.07	0.31	0.25	0.07	0.11	0.23	0.16	0.09	0.02	0.07	0.01
C4	0.28	0.16	0.29	0.20	0.12	0.23	0.23	0.24	0.30	0.20	0.26	0.12	0.39	0.26	0.17	0.37	0.23	0.24	0.21	0.12	0.27	0.13
C4'	0.15	0.13	0.10	0.18	0.10	0.17	0.21	0.30	0.26	0.16	0.21	0.08	0.36	0.27	0.09	0.15	0.21	0.16	0.05	0.05	0.11	0.04
C5	0.29	0.12	0.28	0.20	0.12	0.23	0.19	0.21	0.30	0.17	0.24	0.12	0.41	0.21	0.19	0.36	0.22	0.25	0.27	0.16	0.29	0.17
C5'	0.15	0.20	0.15	0.25	0.17	0.19	0.28	0.29	0.34	0.20	0.29	0.14	0.44	0.32	0.14	0.12	0.28	0.18	0.13	0.16	0.31	0.16
C6	0.31	0.13	0.34	0.26	0.15	0.25	0.16	0.22	0.28	0.17	0.25	0.16	0.40	0.16	0.22	0.41	0.29	0.26	0.29	0.19	0.33	0.20
C8	0.24	0.12	0.19	0.13	0.10	0.19	0.20	0.21	0.28	0.14	0.22	0.10	0.40	0.24	0.15	0.26	0.13	0.23	0.24	0.13	0.20	0.14
N1	0.33	0.17	0.41	0.32	0.15	0.29	0.17	0.25	0.28	0.18	0.27	0.17	0.36	0.17	0.23	0.49	0.37	0.28	0.27	0.19	0.35	0.20
N2	0.33	0.22	0.48	0.39	0.15	0.33	0.19	0.29	0.27	0.21	0.28	0.17	0.33	0.21	0.21	0.62	0.49	0.30	0.25	0.21	0.37	0.20
N3	0.30	0.20	0.35	0.26	0.14	0.27	0.23	0.27	0.30	0.22	0.28	0.15	0.37	0.26	0.18	0.46	0.31	0.25	0.20	0.15	0.31	0.15
N7	0.26	0.11	0.22	0.16	0.11	0.20	0.17	0.20	0.28	0.15	0.22	0.11	0.42	0.19	0.18	0.29	0.16	0.24	0.29	0.17	0.26	0.18
N9	0.24	0.15	0.21	0.14	0.12	0.20	0.23	0.24	0.30	0.19	0.24	0.11	0.39	0.28	0.14	0.30	0.16	0.22	0.17	0.08	0.20	0.09
O2'	0.21	0.21	0.20	0.21	0.18	0.24	0.23	0.38	0.26	0.22	0.24	0.19	0.31	0.27	0.17	0.26	0.25	0.18	0.32	0.19	0.26	0.21
O3'	0.09	0.12	0.12	0.24	0.11	0.15	0.19	0.29	0.23	0.16	0.18	0.08	0.29	0.24	0.08	0.08	0.29	0.13	0.01	0.02	0.02	0.00
O4'	0.20	0.14	0.15	0.14	0.12	0.18	0.22	0.29	0.28	0.19	0.23	0.10	0.38	0.28	0.12	0.24	0.16	0.18	0.09	0.03	0.09	0.02
O5'	0.40	0.53	0.38	0.39	0.49	0.31	0.53	0.31	0.58	0.45	0.56	0.49	0.62	0.52	0.44	0.34	0.38	0.37	0.28	0.20	0.36	0.19
O6	0.29	0.15	0.33	0.26	0.18	0.24	0.13	0.21	0.26	0.16	0.24	0.20	0.39	0.12	0.22	0.39	0.29	0.25	0.33	0.22	0.35	0.22
OP1	0.44	0.56	0.52	0.59	0.52	0.45	0.59	0.46	0.64	0.52	0.62	0.51	0.72	0.59	0.48	0.45	0.62	0.42	0.49	0.47	0.78	0.49
OP2	0.77	1.24	0.76	0.68	1.09	0.51	1.21	0.40	1.34	0.94	1.33	1.12	1.44	1.13	0.93	0.69	0.64	0.62	0.52	0.37	0.55	0.33
P	0.48	0.70	0.49	0.49	0.63	0.38	0.70	0.35	0.77	0.57	0.75	0.64	0.84	0.67	0.55	0.43	0.49	0.43	0.38	0.24	0.51	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.09	0.39	0.10
C2	0.02	0.00	0.16	0.19	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.04	0.31	0.19	0.33	0.17
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.09	0.06	0.13	0.16	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.23	0.23	0.08
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.02	0.13	0.11	0.17	0.17	0.12	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.31	0.33	0.15	0.17
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.32	0.17	0.33	0.15
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.13	0.35	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.41	0.23	0.31	0.22
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.13	0.15	0.11	0.17	0.15	0.08	0.05	0.02	0.02	0.01	0.15	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.42	0.25	0.32	0.25
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.41	0.19	0.32	0.18
N1	0.02	0.00	0.13	0.17	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.04	0.37	0.23	0.32	0.22
N3	0.02	0.01	0.16	0.17	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.03	0.26	0.16	0.34	0.13
N6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.14	0.04	0.47	0.29	0.33	0.29
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.46	0.25	0.30	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.29	0.14	0.35	0.12
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.08	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.14	0.14	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.09	0.21	0.28	0.04
O3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.02	0.15	0.13	0.21	0.21	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.27	0.43	0.13	0.23
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.08	0.49	0.19
O5'	0.13	0.31	0.22	0.31	0.32	0.02	0.41	0.01	0.42	0.41	0.37	0.26	0.47	0.46	0.29	0.09	0.27	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.19	0.23	0.33	0.17	0.13	0.23	0.15	0.25	0.19	0.23	0.16	0.29	0.25	0.14	0.21	0.43	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.33	0.23	0.15	0.33	0.35	0.31	0.34	0.32	0.32	0.32	0.34	0.33	0.30	0.35	0.28	0.13	0.49	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.08	0.17	0.15	0.06	0.22	0.01	0.25	0.18	0.22	0.13	0.29	0.25	0.12	0.04	0.23	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00