Doublet Group distance statistics: 50016

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.002, 0.020, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.014, 0.044, 0.074, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.044 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.037 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.009, 0.040, 0.071, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.040 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.010, 0.074, 0.138, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.074 std_dev=0.064
C2'	A	0, 0.025, 0.090, 0.155, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.090 std_dev=0.065
O2'	A	0, 0.043, 0.161, 0.279, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.161 std_dev=0.118
C3'	A	0, 0.031, 0.162, 0.294, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.162 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.015, 0.150, 0.285, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.150 std_dev=0.135
C4'	B	0, 0.132, 0.288, 0.444, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.288 std_dev=0.156
N9	B	0, 0.130, 0.298, 0.466, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.298 std_dev=0.168
O4'	B	0, 0.149, 0.318, 0.488, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.318 std_dev=0.170
C8	B	0, 0.109, 0.295, 0.482, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.295 std_dev=0.187
C4	B	0, 0.084, 0.273, 0.461, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.273 std_dev=0.189
C1'	B	0, 0.180, 0.371, 0.562, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.371 std_dev=0.191
C5'	B	0, 0.135, 0.328, 0.520, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.328 std_dev=0.192
O5'	B	0, 0.100, 0.302, 0.504, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.302 std_dev=0.202
C3'	B	0, 0.135, 0.343, 0.551, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.343 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.048, 0.257, 0.466, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.257 std_dev=0.209
N7	B	0, 0.077, 0.291, 0.506, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.291 std_dev=0.215
N3	B	0, 0.081, 0.297, 0.512, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.297 std_dev=0.216
C5	B	0, 0.060, 0.276, 0.492, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.276 std_dev=0.216
C5'	A	0, 0.035, 0.257, 0.480, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.257 std_dev=0.222
O5'	A	0, 0.053, 0.283, 0.513, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.283 std_dev=0.230
C2	B	0, 0.070, 0.320, 0.569, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.320 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.188, 0.443, 0.698, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.443 std_dev=0.255
P	B	0, 0.060, 0.327, 0.594, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.327 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.038, 0.307, 0.576, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.307 std_dev=0.269
N1	B	0, 0.060, 0.332, 0.604, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.332 std_dev=0.272
OP2	B	0, 0.086, 0.367, 0.649, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.367 std_dev=0.281
O3'	B	0, 0.126, 0.427, 0.729, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.427 std_dev=0.301
N6	B	0, 0.020, 0.351, 0.681, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.351 std_dev=0.330
OP1	B	0, 0.109, 0.443, 0.776, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.443 std_dev=0.334
P	A	0, 0.084, 0.433, 0.782, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.433 std_dev=0.349
O2'	B	0, 0.258, 0.616, 0.974, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.616 std_dev=0.358
OP2	A	0, 0.138, 0.516, 0.894, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.516 std_dev=0.378
OP1	A	0, 0.089, 0.479, 0.869, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.479 std_dev=0.390

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.05	0.03	0.10	0.01	0.11	0.16	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.05	0.05	0.03	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.09	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02	0.11	0.01	0.12	0.14	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.03	0.02	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.03	0.15	0.01	0.17	0.20	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.04	0.04	0.15	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.14	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.16	0.01	0.19	0.23	0.19
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.16	0.02	0.16	0.15	0.15
N1	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.04	0.14	0.01	0.16	0.20	0.16
N2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.04	0.09	0.01	0.10	0.15	0.11
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.03	0.08	0.01	0.09	0.13	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.04	0.18	0.02	0.21	0.22	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.10	0.11	0.09
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.10	0.14	0.10	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.07	0.11	0.05	0.08	0.04	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.06	0.08	0.13	0.10	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.05	0.10	0.11	0.10
O5'	0.05	0.10	0.04	0.04	0.11	0.02	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14	0.09	0.08	0.18	0.10	0.04	0.06	0.07	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.08	0.05	0.19	0.00	0.23	0.27	0.23
OP1	0.06	0.11	0.08	0.09	0.12	0.07	0.17	0.07	0.19	0.16	0.16	0.10	0.09	0.21	0.10	0.09	0.13	0.10	0.02	0.23	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.16	0.06	0.07	0.14	0.02	0.20	0.02	0.23	0.15	0.20	0.15	0.13	0.22	0.11	0.05	0.10	0.11	0.02	0.27	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.04	0.05	0.11	0.02	0.17	0.01	0.19	0.15	0.16	0.11	0.09	0.20	0.09	0.04	0.08	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.12	0.10	0.09	0.11	0.10	0.14	0.15	0.13	0.16	0.10	0.19	0.10	0.12	0.17	0.09	0.14	0.09	0.03	0.05	0.03
C2	0.17	0.13	0.18	0.15	0.15	0.11	0.18	0.14	0.18	0.21	0.11	0.15	0.24	0.22	0.17	0.20	0.15	0.12	0.15	0.09	0.13	0.10
C2'	0.13	0.15	0.09	0.08	0.10	0.09	0.11	0.13	0.16	0.10	0.18	0.12	0.18	0.08	0.09	0.14	0.08	0.14	0.09	0.04	0.06	0.05
C3'	0.11	0.17	0.07	0.05	0.13	0.06	0.16	0.09	0.19	0.11	0.20	0.14	0.22	0.13	0.11	0.10	0.07	0.13	0.05	0.02	0.03	0.01
C4	0.16	0.16	0.14	0.12	0.11	0.10	0.09	0.13	0.11	0.18	0.16	0.13	0.14	0.16	0.15	0.17	0.11	0.12	0.13	0.08	0.11	0.09
C4'	0.11	0.16	0.06	0.05	0.12	0.06	0.16	0.11	0.20	0.12	0.20	0.12	0.24	0.15	0.10	0.11	0.09	0.12	0.05	0.04	0.06	0.03
C5	0.14	0.22	0.14	0.13	0.12	0.10	0.11	0.14	0.13	0.18	0.22	0.17	0.15	0.17	0.14	0.15	0.12	0.12	0.15	0.11	0.14	0.12
C5'	0.12	0.18	0.08	0.06	0.15	0.05	0.20	0.08	0.23	0.16	0.22	0.14	0.28	0.20	0.14	0.11	0.09	0.13	0.06	0.08	0.11	0.06
C6	0.14	0.21	0.15	0.14	0.12	0.10	0.12	0.14	0.10	0.19	0.19	0.17	0.15	0.20	0.14	0.15	0.14	0.10	0.16	0.12	0.16	0.13
C8	0.16	0.23	0.14	0.12	0.16	0.13	0.17	0.15	0.24	0.18	0.27	0.18	0.27	0.16	0.16	0.16	0.12	0.16	0.15	0.12	0.12	0.12
N1	0.15	0.18	0.17	0.16	0.15	0.11	0.18	0.15	0.17	0.21	0.13	0.17	0.25	0.23	0.16	0.17	0.16	0.11	0.16	0.11	0.15	0.12
N2	0.20	0.18	0.22	0.19	0.20	0.14	0.23	0.16	0.26	0.22	0.21	0.20	0.30	0.24	0.20	0.25	0.19	0.14	0.16	0.11	0.14	0.12
N3	0.17	0.09	0.17	0.13	0.11	0.10	0.13	0.13	0.11	0.19	0.09	0.11	0.17	0.18	0.16	0.20	0.12	0.11	0.13	0.07	0.11	0.08
N7	0.15	0.25	0.14	0.13	0.15	0.12	0.15	0.15	0.23	0.18	0.28	0.19	0.26	0.16	0.14	0.14	0.12	0.14	0.15	0.13	0.15	0.14
N9	0.16	0.18	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.14	0.17	0.16	0.20	0.14	0.20	0.13	0.14	0.17	0.10	0.15	0.12	0.07	0.09	0.08
O2'	0.15	0.17	0.12	0.10	0.13	0.10	0.13	0.14	0.16	0.10	0.18	0.15	0.17	0.09	0.12	0.18	0.10	0.14	0.09	0.05	0.06	0.05
O3'	0.08	0.16	0.05	0.07	0.12	0.04	0.14	0.07	0.18	0.08	0.18	0.13	0.19	0.11	0.09	0.07	0.11	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00
O4'	0.14	0.15	0.09	0.07	0.11	0.09	0.14	0.13	0.19	0.12	0.19	0.11	0.24	0.13	0.11	0.15	0.08	0.13	0.07	0.02	0.06	0.02
O5'	0.17	0.22	0.14	0.09	0.20	0.10	0.24	0.10	0.28	0.22	0.26	0.19	0.32	0.25	0.19	0.15	0.08	0.17	0.10	0.06	0.11	0.07
O6	0.13	0.23	0.14	0.15	0.13	0.11	0.12	0.15	0.11	0.18	0.21	0.18	0.13	0.20	0.13	0.14	0.15	0.10	0.17	0.14	0.18	0.14
OP1	0.21	0.24	0.20	0.17	0.23	0.16	0.28	0.15	0.31	0.27	0.28	0.21	0.36	0.30	0.23	0.20	0.15	0.22	0.18	0.17	0.24	0.18
OP2	0.23	0.29	0.21	0.17	0.26	0.16	0.31	0.14	0.34	0.29	0.33	0.25	0.39	0.32	0.25	0.21	0.13	0.21	0.16	0.13	0.19	0.14
P	0.19	0.24	0.17	0.12	0.22	0.12	0.27	0.11	0.30	0.25	0.29	0.21	0.36	0.29	0.21	0.17	0.10	0.18	0.13	0.11	0.17	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.08	0.12	0.11	0.18	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.08	0.11	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.04	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.11	0.09	0.08
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.04	0.10	0.09	0.16	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.07	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.11	0.12	0.18	0.13
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.12	0.06	0.12	0.10	0.12	0.09	0.06	0.07	0.05	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.13	0.15	0.21	0.15
C8	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.04	0.08	0.09	0.13	0.08
N1	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.07	0.13	0.14	0.21	0.15
N3	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.09	0.16	0.11
N6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.14	0.17	0.22	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.10	0.12	0.17	0.12
N9	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.07	0.12	0.08
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.07	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.07	0.08	0.07	0.05	0.09	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.10	0.17	0.12	0.13
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.08	0.10	0.09
O5'	0.04	0.12	0.06	0.07	0.10	0.01	0.11	0.01	0.13	0.08	0.13	0.10	0.14	0.10	0.08	0.04	0.10	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.03	0.11	0.08	0.11	0.09	0.04	0.12	0.05	0.15	0.09	0.14	0.09	0.17	0.12	0.07	0.07	0.17	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.18	0.11	0.09	0.16	0.03	0.18	0.02	0.21	0.13	0.21	0.16	0.22	0.17	0.12	0.08	0.12	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.07	0.08	0.11	0.01	0.13	0.02	0.15	0.08	0.15	0.11	0.17	0.12	0.08	0.04	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00