Doublet Group distance statistics: 50017

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.009, 0.029, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.004, 0.026, 0.048, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.026 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.005, 0.029, 0.054, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.029 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.019, 0.059, 0.098, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.059 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.024, 0.083, 0.143, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.083 std_dev=0.059
C4'	A	0, 0.020, 0.115, 0.210, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.115 std_dev=0.095
C3'	A	0, 0.017, 0.120, 0.222, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.120 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.040, 0.163, 0.286, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.163 std_dev=0.123
C5'	A	0, 0.019, 0.178, 0.337, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.178 std_dev=0.159
O3'	A	0, 0.033, 0.207, 0.382, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.207 std_dev=0.175
O5'	A	0, -0.038, 0.154, 0.346, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.154 std_dev=0.192
C4	B	0, 0.051, 0.262, 0.473, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.262 std_dev=0.211
N9	B	0, 0.054, 0.267, 0.481, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.267 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.049, 0.297, 0.544, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.297 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.062, 0.314, 0.567, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.314 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.003, 0.270, 0.537, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.270 std_dev=0.267
C2'	B	0, 0.074, 0.355, 0.637, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.355 std_dev=0.281
C8	B	0, 0.022, 0.305, 0.588, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.305 std_dev=0.283
P	A	0, -0.058, 0.238, 0.534, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.238 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.016, 0.322, 0.629, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.322 std_dev=0.306
C6	B	0, -0.025, 0.291, 0.607, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.291 std_dev=0.316
N1	B	0, -0.024, 0.301, 0.627, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.301 std_dev=0.325
N7	B	0, -0.017, 0.314, 0.645, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.314 std_dev=0.331
OP2	A	0, -0.007, 0.335, 0.677, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.335 std_dev=0.342
OP1	A	0, -0.051, 0.314, 0.679, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.314 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.022, 0.397, 0.772, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.397 std_dev=0.375
N6	B	0, -0.057, 0.346, 0.750, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.346 std_dev=0.403
C4'	B	0, 0.008, 0.483, 0.958, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.483 std_dev=0.475
C3'	B	0, -0.039, 0.575, 1.189, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.575 std_dev=0.614
O2'	B	0, -0.044, 0.592, 1.228, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.592 std_dev=0.636
C5'	B	0, -0.110, 0.750, 1.611, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.750 std_dev=0.861
O3'	B	0, -0.183, 0.760, 1.703, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.760 std_dev=0.943
O5'	B	0, -0.212, 0.890, 1.993, 3.060 max_d=3.060 avg_d=0.890 std_dev=1.103
P	B	0, -0.503, 1.339, 3.181, 4.945 max_d=4.945 avg_d=1.339 std_dev=1.842
OP2	B	0, -0.511, 1.367, 3.246, 5.067 max_d=5.067 avg_d=1.367 std_dev=1.879
OP1	B	0, -0.817, 1.837, 4.490, 6.864 max_d=6.864 avg_d=1.837 std_dev=2.653

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.09	0.04
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02	0.12	0.01	0.14	0.22	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.10	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.06	0.06	0.05	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.08	0.09	0.06
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.02	0.12	0.01	0.14	0.20	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.04	0.02	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.17	0.01	0.20	0.25	0.19
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.08	0.03	0.03	0.13	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.17	0.01	0.22	0.29	0.22
C8	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.03	0.17	0.01	0.18	0.20	0.17
N1	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.08	0.02	0.15	0.01	0.19	0.26	0.19
N2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.02	0.10	0.01	0.12	0.21	0.12
N3	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.18	0.11
N7	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.19	0.01	0.23	0.27	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.01	0.12	0.15	0.11
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.04	0.08	0.01	0.11	0.15	0.11	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.07	0.08	0.08	0.04
O3'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.08	0.08	0.11	0.08	0.09	0.03	0.04	0.00	0.01	0.05	0.10	0.12	0.11	0.08
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03
O5'	0.05	0.12	0.05	0.04	0.12	0.01	0.17	0.00	0.17	0.17	0.15	0.10	0.10	0.19	0.11	0.04	0.05	0.03	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.20	0.00	0.26	0.32	0.25
OP1	0.06	0.14	0.08	0.08	0.14	0.06	0.20	0.06	0.22	0.18	0.19	0.12	0.11	0.23	0.12	0.08	0.12	0.05	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.22	0.10	0.09	0.20	0.03	0.25	0.01	0.29	0.20	0.26	0.21	0.18	0.27	0.15	0.08	0.11	0.05	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.14	0.05	0.06	0.14	0.01	0.19	0.01	0.22	0.17	0.19	0.12	0.11	0.22	0.11	0.04	0.08	0.03	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.27	0.06	0.15	0.07	0.09	0.11	0.13	0.15	0.27	0.27	0.16	0.17	0.28	0.13	0.47	0.08	0.11	0.29	0.16	0.50	0.14
C2	0.10	0.25	0.10	0.09	0.12	0.10	0.13	0.14	0.22	0.17	0.27	0.19	0.22	0.11	0.09	0.44	0.38	0.12	0.33	0.22	0.51	0.16
C2'	0.16	0.25	0.07	0.25	0.11	0.18	0.14	0.07	0.17	0.30	0.28	0.15	0.21	0.30	0.17	0.37	0.06	0.18	0.13	0.23	0.28	0.21
C3'	0.11	0.27	0.07	0.24	0.09	0.11	0.13	0.08	0.14	0.26	0.28	0.17	0.17	0.28	0.13	0.43	0.08	0.11	0.19	0.18	0.32	0.16
C4	0.08	0.28	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.19	0.16	0.24	0.28	0.19	0.14	0.23	0.10	0.50	0.16	0.08	0.38	0.33	0.62	0.25
C4'	0.08	0.28	0.09	0.19	0.07	0.06	0.13	0.15	0.13	0.26	0.26	0.18	0.18	0.29	0.12	0.50	0.05	0.08	0.29	0.14	0.48	0.14
C5	0.07	0.27	0.12	0.06	0.06	0.07	0.05	0.28	0.10	0.22	0.24	0.20	0.07	0.22	0.08	0.54	0.10	0.07	0.50	0.57	0.80	0.44
C5'	0.04	0.32	0.18	0.13	0.08	0.07	0.10	0.28	0.11	0.21	0.26	0.23	0.19	0.25	0.06	0.59	0.06	0.06	0.40	0.32	0.62	0.30
C6	0.08	0.25	0.14	0.07	0.10	0.10	0.06	0.31	0.12	0.18	0.22	0.20	0.09	0.14	0.09	0.55	0.20	0.10	0.54	0.65	0.83	0.50
C8	0.06	0.27	0.10	0.13	0.03	0.05	0.12	0.28	0.07	0.25	0.23	0.17	0.13	0.28	0.10	0.53	0.05	0.06	0.46	0.53	0.78	0.43
N1	0.09	0.24	0.12	0.11	0.12	0.09	0.10	0.21	0.18	0.14	0.24	0.19	0.17	0.06	0.07	0.49	0.36	0.09	0.43	0.43	0.65	0.31
N2	0.13	0.25	0.11	0.13	0.15	0.13	0.17	0.12	0.25	0.15	0.28	0.18	0.27	0.12	0.11	0.37	0.50	0.16	0.26	0.11	0.41	0.11
N3	0.11	0.27	0.09	0.08	0.11	0.10	0.11	0.12	0.21	0.22	0.29	0.18	0.22	0.18	0.10	0.45	0.28	0.13	0.30	0.17	0.50	0.13
N7	0.06	0.27	0.13	0.10	0.05	0.09	0.11	0.35	0.07	0.23	0.21	0.19	0.11	0.26	0.10	0.55	0.05	0.09	0.56	0.71	0.92	0.57
N9	0.08	0.27	0.08	0.12	0.05	0.06	0.09	0.19	0.12	0.26	0.27	0.17	0.13	0.27	0.11	0.50	0.07	0.08	0.37	0.32	0.62	0.25
O2'	0.22	0.25	0.11	0.28	0.14	0.24	0.17	0.13	0.20	0.34	0.28	0.16	0.23	0.32	0.22	0.32	0.08	0.26	0.10	0.36	0.25	0.30
O3'	0.14	0.29	0.09	0.28	0.11	0.16	0.14	0.08	0.16	0.27	0.29	0.18	0.17	0.28	0.15	0.38	0.11	0.15	0.15	0.39	0.28	0.30
O4'	0.08	0.26	0.09	0.15	0.06	0.05	0.12	0.18	0.12	0.27	0.25	0.17	0.18	0.29	0.12	0.52	0.03	0.07	0.35	0.28	0.59	0.23
O5'	0.10	0.33	0.24	0.09	0.11	0.14	0.08	0.38	0.09	0.15	0.25	0.26	0.21	0.21	0.06	0.65	0.07	0.13	0.49	0.48	0.72	0.42
O6	0.14	0.23	0.19	0.12	0.15	0.18	0.12	0.41	0.12	0.18	0.18	0.22	0.10	0.16	0.15	0.60	0.16	0.17	0.67	0.90	0.99	0.70
OP1	0.19	0.38	0.34	0.09	0.17	0.26	0.07	0.52	0.08	0.09	0.26	0.34	0.16	0.14	0.12	0.71	0.10	0.25	0.59	0.63	0.81	0.58
OP2	0.28	0.40	0.41	0.11	0.22	0.36	0.09	0.65	0.07	0.11	0.24	0.38	0.18	0.12	0.19	0.78	0.10	0.36	0.75	0.94	1.07	0.83
P	0.19	0.37	0.34	0.07	0.16	0.26	0.06	0.54	0.07	0.10	0.25	0.33	0.20	0.16	0.11	0.73	0.08	0.25	0.64	0.76	0.93	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.31	0.00	0.19	0.11	0.18	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.41	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.30	0.41	0.08	0.23	0.21	0.29	0.19
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.21	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.43	0.61	0.55	0.42
C3'	0.02	0.41	0.00	0.00	0.26	0.00	0.23	0.02	0.30	0.05	0.37	0.38	0.28	0.12	0.11	0.01	0.00	0.01	0.04	0.37	0.05	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.26	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.07	0.04	0.16	0.08	0.12	0.10
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.10	0.10	0.08	0.04	0.03	0.24	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05
C5	0.00	0.00	0.04	0.23	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.04	0.02	0.09	0.27	0.06	0.26
C5'	0.07	0.20	0.21	0.02	0.11	0.01	0.08	0.00	0.11	0.04	0.16	0.19	0.09	0.04	0.06	0.04	0.19	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.30	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.13	0.04	0.09	0.28	0.05	0.26
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.35	0.03	0.09	0.33	0.12	0.31
N1	0.01	0.01	0.05	0.37	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.31	0.06	0.15	0.16	0.11	0.16
N3	0.01	0.00	0.05	0.38	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.26	0.34	0.07	0.27	0.23	0.32	0.18
N6	0.01	0.01	0.05	0.28	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.08	0.03	0.07	0.40	0.14	0.35
N7	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.24	0.02	0.06	0.40	0.14	0.36
N9	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.19	0.01	0.14	0.13	0.12	0.16
O2'	0.02	0.30	0.00	0.01	0.26	0.24	0.30	0.04	0.34	0.19	0.34	0.26	0.35	0.26	0.18	0.00	0.04	0.15	0.34	0.58	0.67	0.42
O3'	0.31	0.41	0.02	0.00	0.07	0.02	0.04	0.19	0.13	0.35	0.31	0.34	0.08	0.24	0.19	0.04	0.00	0.21	0.26	0.17	0.27	0.17
O4'	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.15	0.21	0.00	0.06	0.23	0.10	0.22
O5'	0.19	0.23	0.43	0.04	0.16	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.15	0.27	0.07	0.06	0.14	0.34	0.26	0.06	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.11	0.21	0.61	0.37	0.08	0.08	0.27	0.06	0.28	0.33	0.16	0.23	0.40	0.40	0.13	0.58	0.17	0.23	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.29	0.55	0.05	0.12	0.02	0.06	0.02	0.05	0.12	0.11	0.32	0.14	0.14	0.12	0.67	0.27	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.42	0.07	0.10	0.05	0.26	0.01	0.26	0.31	0.16	0.18	0.35	0.36	0.16	0.42	0.17	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00