Doublet Group distance statistics: 50042

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.039 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	max_d=0.074 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	max_d=0.067 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	max_d=0.092 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	max_d=0.086 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	max_d=0.084 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	max_d=0.097 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O6	A	max_d=0.134 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N7	A	max_d=0.140 avg_d=0.026 std_dev=0.022
N2	A	max_d=0.189 avg_d=0.034 std_dev=0.024
C8	A	max_d=0.154 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O4'	A	max_d=0.519 avg_d=0.155 std_dev=0.110
C2'	A	max_d=0.542 avg_d=0.190 std_dev=0.117
C4'	A	max_d=0.847 avg_d=0.272 std_dev=0.165
O2'	A	max_d=1.437 avg_d=0.271 std_dev=0.181
C3'	A	max_d=0.885 avg_d=0.299 std_dev=0.185
C6	B	max_d=0.977 avg_d=0.406 std_dev=0.195
C5	B	max_d=1.015 avg_d=0.453 std_dev=0.209
O4'	B	max_d=1.059 avg_d=0.524 std_dev=0.223
N1	B	max_d=0.931 avg_d=0.462 std_dev=0.224
C1'	B	max_d=1.112 avg_d=0.548 std_dev=0.246
O5'	B	max_d=1.697 avg_d=0.478 std_dev=0.258
C3'	B	max_d=1.257 avg_d=0.592 std_dev=0.258
C4'	B	max_d=1.222 avg_d=0.583 std_dev=0.262
O3'	A	max_d=1.648 avg_d=0.450 std_dev=0.275
C2	B	max_d=1.281 avg_d=0.585 std_dev=0.275
C4	B	max_d=1.150 avg_d=0.506 std_dev=0.276
C2'	B	max_d=1.302 avg_d=0.617 std_dev=0.287
P	B	max_d=2.076 avg_d=0.463 std_dev=0.290
C5'	A	max_d=1.399 avg_d=0.481 std_dev=0.298
N3	B	max_d=1.371 avg_d=0.583 std_dev=0.305
OP2	B	max_d=2.472 avg_d=0.482 std_dev=0.320
C5'	B	max_d=1.759 avg_d=0.595 std_dev=0.332
O2	B	max_d=1.710 avg_d=0.763 std_dev=0.338
N4	B	max_d=1.538 avg_d=0.610 std_dev=0.349
O3'	B	max_d=1.657 avg_d=0.758 std_dev=0.357
O2'	B	max_d=1.707 avg_d=0.776 std_dev=0.369
OP1	B	max_d=2.915 avg_d=0.609 std_dev=0.396
O5'	A	max_d=2.879 avg_d=0.701 std_dev=0.576
P	A	max_d=3.311 avg_d=1.093 std_dev=0.698
OP1	A	max_d=3.906 avg_d=1.418 std_dev=0.815
OP2	A	max_d=4.929 avg_d=1.272 std_dev=1.001

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.17	0.02	0.32	0.26	0.18
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.15	0.04	0.37	0.01	0.56	0.57	0.41
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.13	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.06	0.36	0.24	0.21
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.10	0.10	0.12	0.15	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.30	0.11	0.40	0.22	0.25
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.39	0.01	0.55	0.53	0.41
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.08	0.19	0.22	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.02	0.48	0.01	0.68	0.70	0.53
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.17	0.13	0.10	0.09	0.19	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.18	0.21	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.50	0.00	0.73	0.77	0.57
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.04	0.47	0.02	0.61	0.58	0.48
N1	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.14	0.03	0.45	0.01	0.66	0.69	0.51
N2	0.05	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.19	0.05	0.34	0.02	0.53	0.53	0.37
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.04	0.32	0.01	0.50	0.47	0.35
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.04	0.53	0.02	0.72	0.75	0.58
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.35	0.02	0.48	0.44	0.35
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.10	0.07	0.10	0.06	0.12	0.05	0.14	0.17	0.14	0.07	0.05	0.00	0.05	0.06	0.09	0.12	0.27	0.18	0.09
O3'	0.03	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.04	0.11	0.11	0.14	0.19	0.13	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.27	0.12	0.44	0.26	0.25
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.03	0.26	0.28	0.16
O5'	0.17	0.37	0.22	0.30	0.39	0.02	0.48	0.01	0.50	0.47	0.45	0.34	0.32	0.53	0.35	0.09	0.27	0.11	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.12	0.03	0.54	0.00	0.80	0.86	0.64
OP1	0.32	0.56	0.36	0.40	0.55	0.19	0.68	0.21	0.73	0.61	0.66	0.53	0.50	0.72	0.48	0.27	0.44	0.26	0.02	0.80	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.57	0.24	0.22	0.53	0.22	0.70	0.30	0.77	0.58	0.69	0.53	0.47	0.75	0.44	0.18	0.26	0.28	0.02	0.86	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.41	0.21	0.25	0.41	0.06	0.53	0.02	0.57	0.48	0.51	0.37	0.35	0.58	0.35	0.09	0.25	0.16	0.01	0.64	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.18	0.17	0.24	0.21	0.24	0.27	0.20	0.17	0.22	0.29	0.22	0.24	0.18	0.22	0.19	0.06	0.10	0.06
C2	0.27	0.19	0.27	0.23	0.27	0.30	0.23	0.29	0.19	0.17	0.26	0.34	0.27	0.35	0.25	0.30	0.25	0.17	0.20	0.14
C2'	0.19	0.20	0.16	0.17	0.25	0.18	0.25	0.27	0.22	0.18	0.23	0.28	0.21	0.20	0.18	0.19	0.21	0.09	0.14	0.10
C3'	0.19	0.23	0.15	0.16	0.31	0.13	0.31	0.18	0.26	0.21	0.27	0.35	0.22	0.17	0.18	0.19	0.09	0.04	0.06	0.02
C4	0.24	0.18	0.21	0.18	0.20	0.24	0.20	0.25	0.19	0.17	0.20	0.28	0.23	0.28	0.18	0.26	0.22	0.09	0.19	0.10
C4'	0.18	0.21	0.13	0.15	0.32	0.13	0.32	0.19	0.25	0.19	0.27	0.38	0.21	0.18	0.17	0.18	0.06	0.11	0.13	0.06
C5	0.27	0.23	0.24	0.20	0.16	0.24	0.18	0.23	0.21	0.22	0.21	0.25	0.28	0.30	0.19	0.28	0.24	0.13	0.25	0.15
C5'	0.21	0.30	0.18	0.20	0.44	0.14	0.42	0.16	0.32	0.27	0.38	0.52	0.28	0.18	0.22	0.20	0.10	0.21	0.26	0.15
C6	0.31	0.26	0.28	0.23	0.14	0.27	0.19	0.24	0.22	0.25	0.21	0.25	0.33	0.35	0.23	0.30	0.26	0.16	0.27	0.17
C8	0.23	0.21	0.19	0.17	0.24	0.21	0.21	0.22	0.21	0.20	0.24	0.31	0.24	0.24	0.18	0.25	0.22	0.15	0.23	0.16
N1	0.31	0.21	0.29	0.24	0.22	0.29	0.21	0.27	0.20	0.21	0.20	0.33	0.31	0.37	0.25	0.31	0.26	0.16	0.24	0.16
N2	0.26	0.25	0.29	0.26	0.32	0.33	0.25	0.33	0.20	0.18	0.34	0.39	0.31	0.39	0.30	0.32	0.26	0.22	0.20	0.17
N3	0.24	0.20	0.23	0.20	0.25	0.27	0.23	0.29	0.20	0.16	0.25	0.31	0.25	0.31	0.22	0.27	0.23	0.14	0.17	0.12
N7	0.26	0.25	0.23	0.19	0.22	0.22	0.20	0.22	0.23	0.23	0.26	0.28	0.29	0.27	0.19	0.27	0.24	0.17	0.28	0.18
N9	0.22	0.18	0.19	0.17	0.22	0.21	0.22	0.24	0.20	0.17	0.21	0.29	0.21	0.24	0.17	0.24	0.20	0.07	0.17	0.09
O2'	0.30	0.29	0.28	0.28	0.28	0.29	0.28	0.37	0.27	0.28	0.29	0.30	0.31	0.31	0.29	0.29	0.30	0.16	0.16	0.16
O3'	0.20	0.23	0.16	0.18	0.30	0.14	0.31	0.17	0.26	0.22	0.27	0.33	0.22	0.18	0.21	0.21	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.19	0.15	0.14	0.27	0.17	0.27	0.22	0.21	0.17	0.23	0.34	0.21	0.21	0.16	0.19	0.12	0.07	0.11	0.03
O5'	0.44	0.54	0.45	0.44	0.64	0.36	0.62	0.34	0.54	0.51	0.60	0.70	0.52	0.41	0.44	0.40	0.42	0.34	0.51	0.38
O6	0.33	0.31	0.31	0.25	0.17	0.27	0.22	0.24	0.24	0.28	0.26	0.23	0.39	0.37	0.25	0.31	0.27	0.19	0.30	0.19
OP1	0.60	0.75	0.63	0.62	0.89	0.52	0.83	0.49	0.72	0.69	0.85	0.99	0.73	0.58	0.63	0.54	0.58	0.58	0.72	0.57
OP2	0.57	0.76	0.60	0.56	0.91	0.43	0.82	0.37	0.69	0.67	0.86	1.01	0.74	0.54	0.57	0.47	0.47	0.42	0.54	0.39
P	0.46	0.60	0.48	0.47	0.74	0.36	0.69	0.32	0.58	0.55	0.69	0.83	0.58	0.43	0.47	0.40	0.42	0.35	0.52	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.19	0.09
C2	0.03	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.20	0.17	0.26	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.02	0.09	0.03	0.07	0.06	0.16	0.00	0.02	0.01	0.14	0.18	0.14	0.11
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.14	0.02	0.14	0.07	0.11	0.12	0.15	0.02	0.01	0.01	0.20	0.25	0.13	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.04	0.30	0.28	0.36	0.29
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.06	0.09	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.16	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.05	0.31	0.29	0.35	0.30
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.12	0.18	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.12	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.05	0.27	0.22	0.27	0.23
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.19	0.15	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.04	0.26	0.23	0.32	0.24
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.16	0.04	0.32	0.33	0.41	0.33
O2	0.04	0.01	0.16	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.16	0.19	0.07	0.17	0.14	0.24	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.09	0.07	0.16	0.00	0.05	0.05	0.07	0.15	0.14	0.07
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.14	0.02	0.17	0.04	0.16	0.07	0.14	0.16	0.19	0.05	0.00	0.02	0.20	0.34	0.19	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.08	0.09	0.24	0.13
O5'	0.09	0.20	0.14	0.20	0.30	0.02	0.31	0.01	0.27	0.19	0.26	0.32	0.17	0.07	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.17	0.18	0.25	0.28	0.10	0.29	0.12	0.22	0.15	0.23	0.33	0.14	0.15	0.34	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.26	0.14	0.13	0.36	0.16	0.35	0.19	0.27	0.23	0.32	0.41	0.24	0.14	0.19	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.11	0.16	0.29	0.04	0.30	0.02	0.23	0.16	0.24	0.33	0.15	0.07	0.21	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00