Doublet Group distance statistics: 50043

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 24, 29, 15, 16, 8, 6, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.027 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.022, 0.041, 0.059, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.041 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.010, 0.032, 0.055, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.009, 0.036, 0.063, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.036 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.025, 0.054, 0.083, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.054 std_dev=0.029
C5	B	0, 0.192, 0.367, 0.542, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.367 std_dev=0.175
C6	B	0, 0.170, 0.347, 0.524, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.347 std_dev=0.177
N1	B	0, 0.185, 0.373, 0.561, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.373 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.206, 0.395, 0.584, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.395 std_dev=0.189
C2	B	0, 0.236, 0.429, 0.623, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.429 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.233, 0.432, 0.631, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.432 std_dev=0.199
C1'	B	0, 0.217, 0.440, 0.663, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.440 std_dev=0.223
N4	B	0, 0.241, 0.471, 0.701, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.471 std_dev=0.230
O4'	B	0, 0.195, 0.427, 0.659, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.427 std_dev=0.232
O2	B	0, 0.287, 0.529, 0.771, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.529 std_dev=0.242
C2'	B	0, 0.242, 0.516, 0.790, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.516 std_dev=0.274
C4'	B	0, 0.188, 0.468, 0.748, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.468 std_dev=0.280
C3'	B	0, 0.216, 0.496, 0.777, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.496 std_dev=0.281
O4'	A	0, -0.137, 0.174, 0.484, 2.147 max_d=2.147 avg_d=0.174 std_dev=0.311
C5'	B	0, 0.170, 0.487, 0.804, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.487 std_dev=0.317
C2'	A	0, -0.118, 0.200, 0.519, 2.250 max_d=2.250 avg_d=0.200 std_dev=0.318
O2'	B	0, 0.312, 0.655, 0.998, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.655 std_dev=0.343
O3'	B	0, 0.251, 0.630, 1.009, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.630 std_dev=0.379
C3'	A	0, -0.086, 0.318, 0.722, 2.658 max_d=2.658 avg_d=0.318 std_dev=0.404
O5'	B	0, 0.043, 0.476, 0.909, 3.117 max_d=3.117 avg_d=0.476 std_dev=0.433
C4'	A	0, -0.143, 0.293, 0.730, 3.000 max_d=3.000 avg_d=0.293 std_dev=0.437
O3'	A	0, -0.039, 0.422, 0.883, 2.751 max_d=2.751 avg_d=0.422 std_dev=0.461
O2'	A	0, -0.170, 0.299, 0.768, 3.402 max_d=3.402 avg_d=0.299 std_dev=0.469
P	B	0, -0.014, 0.482, 0.977, 3.905 max_d=3.905 avg_d=0.482 std_dev=0.495
OP1	B	0, 0.043, 0.613, 1.182, 4.473 max_d=4.473 avg_d=0.613 std_dev=0.569
OP2	B	0, -0.001, 0.579, 1.160, 4.466 max_d=4.466 avg_d=0.579 std_dev=0.581
C5'	A	0, -0.179, 0.508, 1.194, 4.599 max_d=4.599 avg_d=0.508 std_dev=0.687
O5'	A	0, -0.296, 0.598, 1.493, 6.817 max_d=6.817 avg_d=0.598 std_dev=0.895
P	A	0, -0.359, 0.828, 2.015, 8.872 max_d=8.872 avg_d=0.828 std_dev=1.187
OP1	A	0, -0.366, 1.039, 2.443, 10.628 max_d=10.628 avg_d=1.039 std_dev=1.405
OP2	A	0, -0.463, 0.946, 2.355, 10.149 max_d=10.149 avg_d=0.946 std_dev=1.409

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.18	0.02	0.22	0.25	0.16
C2	0.04	0.00	0.19	0.15	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.16	0.18	0.26	0.01	0.38	0.42	0.26
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.02	0.06	0.09	0.09	0.11	0.15	0.22	0.18	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.18	0.08	0.26	0.22	0.17
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.03	0.17	0.16	0.16	0.17	0.14	0.17	0.10	0.02	0.01	0.02	0.19	0.18	0.28	0.16	0.15
C4	0.02	0.01	0.10	0.13	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.09	0.28	0.01	0.30	0.47	0.28
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.14	0.09	0.17	0.12	0.13	0.06	0.13	0.03	0.01	0.03	0.08	0.17	0.18	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.10	0.05	0.38	0.01	0.37	0.65	0.41
C5'	0.05	0.21	0.09	0.03	0.15	0.01	0.17	0.00	0.18	0.22	0.19	0.25	0.19	0.22	0.12	0.07	0.10	0.02	0.01	0.20	0.17	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.08	0.37	0.01	0.38	0.68	0.40
C8	0.01	0.01	0.11	0.16	0.01	0.14	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.23	0.13	0.10	0.47	0.02	0.44	0.68	0.50
N1	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.14	0.30	0.01	0.36	0.55	0.31
N2	0.05	0.00	0.22	0.17	0.02	0.17	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.21	0.23	0.26	0.02	0.47	0.37	0.29
N3	0.03	0.01	0.18	0.14	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.18	0.23	0.01	0.35	0.36	0.23
N7	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.13	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.14	0.06	0.49	0.02	0.48	0.80	0.55
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.30	0.02	0.28	0.45	0.29
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.08	0.13	0.11	0.07	0.10	0.23	0.13	0.26	0.19	0.20	0.09	0.00	0.06	0.10	0.13	0.12	0.23	0.21	0.13
O3'	0.12	0.16	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.10	0.11	0.13	0.13	0.21	0.16	0.14	0.06	0.06	0.00	0.09	0.21	0.13	0.37	0.21	0.22
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.10	0.14	0.23	0.18	0.06	0.01	0.10	0.09	0.00	0.16	0.06	0.23	0.25	0.17
O5'	0.18	0.26	0.18	0.19	0.28	0.03	0.38	0.01	0.37	0.47	0.30	0.26	0.23	0.49	0.30	0.13	0.21	0.16	0.00	0.42	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.13	0.06	0.42	0.00	0.44	0.79	0.48
OP1	0.22	0.38	0.26	0.28	0.30	0.17	0.37	0.17	0.38	0.44	0.36	0.47	0.35	0.48	0.28	0.23	0.37	0.23	0.03	0.44	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.42	0.22	0.16	0.47	0.18	0.65	0.21	0.68	0.68	0.55	0.37	0.36	0.80	0.45	0.21	0.21	0.25	0.02	0.79	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.26	0.17	0.15	0.28	0.06	0.41	0.02	0.40	0.50	0.31	0.29	0.23	0.55	0.29	0.13	0.22	0.17	0.01	0.48	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.20	0.22	0.21	0.20	0.24	0.21	0.27	0.20	0.18	0.20	0.23	0.24	0.26	0.22	0.23	0.27	0.38	0.35	0.37
C2	0.31	0.19	0.33	0.28	0.21	0.30	0.21	0.26	0.21	0.21	0.19	0.28	0.28	0.40	0.30	0.30	0.29	0.29	0.28	0.30
C2'	0.26	0.24	0.24	0.24	0.24	0.25	0.24	0.28	0.24	0.23	0.24	0.25	0.25	0.26	0.24	0.26	0.43	0.52	0.45	0.50
C3'	0.25	0.28	0.24	0.25	0.36	0.21	0.38	0.24	0.34	0.28	0.32	0.38	0.26	0.22	0.25	0.24	0.44	0.67	0.70	0.68
C4	0.27	0.21	0.25	0.22	0.17	0.24	0.20	0.23	0.21	0.21	0.19	0.22	0.26	0.30	0.22	0.26	0.31	0.35	0.36	0.37
C4'	0.20	0.21	0.16	0.17	0.29	0.16	0.32	0.22	0.25	0.19	0.24	0.35	0.22	0.22	0.19	0.19	0.38	0.71	0.73	0.68
C5	0.29	0.26	0.27	0.23	0.15	0.24	0.20	0.22	0.23	0.24	0.21	0.20	0.31	0.31	0.23	0.26	0.35	0.39	0.43	0.40
C5'	0.25	0.30	0.23	0.25	0.42	0.20	0.45	0.24	0.36	0.28	0.35	0.49	0.28	0.24	0.26	0.23	0.48	0.87	0.95	0.82
C6	0.32	0.28	0.32	0.26	0.15	0.26	0.21	0.23	0.23	0.27	0.20	0.22	0.36	0.37	0.27	0.28	0.36	0.36	0.41	0.38
C8	0.24	0.23	0.22	0.20	0.21	0.22	0.21	0.25	0.22	0.22	0.24	0.26	0.26	0.25	0.21	0.24	0.36	0.46	0.50	0.46
N1	0.33	0.23	0.34	0.29	0.18	0.29	0.21	0.25	0.22	0.24	0.16	0.28	0.34	0.41	0.31	0.30	0.33	0.31	0.34	0.33
N2	0.31	0.20	0.36	0.32	0.24	0.33	0.22	0.30	0.21	0.20	0.24	0.31	0.28	0.45	0.36	0.31	0.27	0.27	0.24	0.27
N3	0.28	0.20	0.28	0.24	0.19	0.27	0.21	0.26	0.21	0.20	0.20	0.25	0.26	0.34	0.26	0.27	0.27	0.30	0.28	0.31
N7	0.27	0.27	0.24	0.21	0.21	0.22	0.21	0.23	0.23	0.25	0.26	0.24	0.30	0.28	0.22	0.25	0.38	0.45	0.51	0.46
N9	0.24	0.21	0.22	0.20	0.19	0.22	0.20	0.24	0.21	0.20	0.20	0.23	0.24	0.26	0.20	0.24	0.31	0.40	0.41	0.40
O2'	0.30	0.29	0.29	0.28	0.31	0.29	0.33	0.33	0.30	0.28	0.29	0.34	0.31	0.32	0.28	0.29	0.35	0.35	0.19	0.28
O3'	0.20	0.21	0.18	0.21	0.28	0.18	0.30	0.22	0.26	0.20	0.24	0.31	0.20	0.19	0.23	0.21	0.37	0.71	0.64	0.69
O4'	0.27	0.23	0.24	0.19	0.23	0.23	0.24	0.23	0.21	0.21	0.23	0.28	0.29	0.31	0.21	0.25	0.29	0.53	0.54	0.51
O5'	0.29	0.39	0.30	0.34	0.59	0.24	0.62	0.28	0.49	0.38	0.49	0.68	0.34	0.26	0.34	0.26	0.56	0.88	1.06	0.87
O6	0.33	0.32	0.33	0.27	0.18	0.27	0.22	0.23	0.24	0.29	0.25	0.22	0.41	0.39	0.29	0.29	0.38	0.39	0.44	0.40
OP1	0.41	0.49	0.46	0.50	0.71	0.41	0.71	0.44	0.56	0.46	0.60	0.84	0.47	0.47	0.54	0.38	0.66	1.04	1.22	0.98
OP2	0.45	0.68	0.48	0.47	0.96	0.33	0.92	0.31	0.72	0.61	0.84	1.12	0.60	0.39	0.45	0.36	0.58	0.82	1.12	0.83
P	0.32	0.46	0.35	0.38	0.71	0.27	0.71	0.30	0.55	0.43	0.59	0.84	0.40	0.31	0.39	0.28	0.57	0.90	1.13	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.16	0.12	0.16	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.11	0.03	0.27	0.21	0.24	0.23
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.06	0.13	0.01	0.03	0.01	0.12	0.12	0.25	0.09
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.02	0.12	0.07	0.10	0.11	0.12	0.03	0.01	0.02	0.15	0.17	0.32	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.05	0.39	0.37	0.40	0.37
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.09	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.08	0.22	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.06	0.41	0.40	0.41	0.40
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.09	0.12	0.18	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.16	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.06	0.37	0.32	0.29	0.32
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.03	0.27	0.22	0.21	0.22
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.33	0.29	0.32	0.30
N4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.05	0.41	0.41	0.46	0.41
O2	0.04	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.16	0.06	0.21	0.15	0.21	0.16
O2'	0.02	0.09	0.01	0.03	0.06	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.09	0.07	0.15	0.00	0.07	0.05	0.08	0.15	0.30	0.13
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.13	0.03	0.15	0.04	0.14	0.07	0.13	0.15	0.16	0.07	0.00	0.02	0.20	0.31	0.48	0.31
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.16	0.18	0.16	0.16
O5'	0.16	0.27	0.12	0.15	0.39	0.02	0.41	0.01	0.37	0.27	0.33	0.41	0.21	0.08	0.20	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.21	0.12	0.17	0.37	0.08	0.40	0.16	0.32	0.22	0.29	0.41	0.15	0.15	0.31	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.24	0.25	0.32	0.40	0.22	0.41	0.20	0.29	0.21	0.32	0.46	0.21	0.30	0.48	0.16	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.23	0.09	0.16	0.37	0.05	0.40	0.02	0.32	0.22	0.30	0.41	0.16	0.13	0.31	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00