Doublet Group distance statistics: 50044

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 17, 9, 8, 9, 11, 6, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.019, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.021, 0.031, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.024, 0.036, 0.048, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.024, 0.039, 0.053, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.032, 0.049, 0.066, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.049 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.041, 0.062, 0.084, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.062 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.052, 0.080, 0.108, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.080 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.060, 0.092, 0.124, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.092 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.059, 0.152, 0.245, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.152 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.131, 0.232, 0.333, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.232 std_dev=0.101
C4'	A	0, 0.148, 0.272, 0.396, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.272 std_dev=0.124
O2'	A	0, 0.220, 0.358, 0.496, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.358 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.184, 0.337, 0.489, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.337 std_dev=0.153
C5'	A	0, 0.307, 0.537, 0.767, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.537 std_dev=0.230
O3'	A	0, 0.255, 0.489, 0.722, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.489 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.349, 0.589, 0.829, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.589 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.212, 0.456, 0.700, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.456 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.245, 0.493, 0.741, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.493 std_dev=0.248
N3	B	0, 0.206, 0.459, 0.712, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.459 std_dev=0.253
O2	B	0, 0.294, 0.553, 0.812, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.553 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.251, 0.513, 0.775, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.513 std_dev=0.262
C6	B	0, 0.322, 0.585, 0.849, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.585 std_dev=0.263
N4	B	0, 0.345, 0.613, 0.881, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.613 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.457, 0.725, 0.994, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.725 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.336, 0.607, 0.878, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.607 std_dev=0.271
O4'	B	0, 0.473, 0.745, 1.017, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.745 std_dev=0.272
C2'	B	0, 0.325, 0.604, 0.884, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.604 std_dev=0.280
O5'	B	0, 0.477, 0.768, 1.060, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.768 std_dev=0.292
P	B	0, 0.418, 0.724, 1.030, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.724 std_dev=0.306
C4'	B	0, 0.470, 0.784, 1.097, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.784 std_dev=0.314
C3'	B	0, 0.383, 0.709, 1.035, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.709 std_dev=0.326
C5'	B	0, 0.479, 0.851, 1.224, 2.550 max_d=2.550 avg_d=0.851 std_dev=0.372
OP2	B	0, 0.435, 0.820, 1.205, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.820 std_dev=0.385
O3'	B	0, 0.426, 0.859, 1.292, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.859 std_dev=0.433
OP1	B	0, 0.443, 0.916, 1.388, 2.711 max_d=2.711 avg_d=0.916 std_dev=0.472
O5'	A	0, 0.550, 1.222, 1.895, 3.030 max_d=3.030 avg_d=1.222 std_dev=0.672
P	A	0, 0.497, 1.510, 2.524, 3.868 max_d=3.868 avg_d=1.510 std_dev=1.014
OP1	A	0, 0.389, 1.636, 2.883, 4.199 max_d=4.199 avg_d=1.636 std_dev=1.247
OP2	A	0, 0.749, 2.000, 3.251, 5.600 max_d=5.600 avg_d=2.000 std_dev=1.251

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.20	0.02	0.29	0.35	0.18
C2	0.04	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.48	0.01	0.73	0.67	0.49
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.07	0.10	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.25	0.06	0.38	0.35	0.22
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.33	0.11	0.46	0.38	0.30
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.46	0.01	0.64	0.64	0.46
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.28	0.30	0.11
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.56	0.01	0.79	0.81	0.59
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.17	0.14	0.12	0.20	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.21	0.28	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.59	0.01	0.89	0.89	0.65
C8	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.51	0.02	0.60	0.72	0.51
N1	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.55	0.01	0.85	0.80	0.59
N2	0.05	0.01	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.17	0.04	0.45	0.02	0.72	0.63	0.47
N3	0.04	0.01	0.08	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.42	0.01	0.61	0.57	0.41
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.58	0.02	0.78	0.88	0.63
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.40	0.02	0.49	0.55	0.37
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.11	0.15	0.11	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.08	0.08	0.36	0.31	0.17
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.04	0.11	0.13	0.12	0.17	0.12	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.28	0.13	0.57	0.47	0.33
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.14	0.03	0.24	0.36	0.21
O5'	0.20	0.48	0.25	0.33	0.46	0.02	0.56	0.01	0.59	0.51	0.55	0.45	0.42	0.58	0.40	0.08	0.28	0.14	0.00	0.63	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.13	0.03	0.63	0.00	0.98	0.99	0.73
OP1	0.29	0.73	0.38	0.46	0.64	0.28	0.79	0.28	0.89	0.60	0.85	0.72	0.61	0.78	0.49	0.36	0.57	0.24	0.02	0.98	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.67	0.35	0.38	0.64	0.30	0.81	0.37	0.89	0.72	0.80	0.63	0.57	0.88	0.55	0.31	0.47	0.36	0.02	0.99	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.49	0.22	0.30	0.46	0.11	0.59	0.02	0.65	0.51	0.59	0.47	0.41	0.63	0.37	0.17	0.33	0.21	0.01	0.73	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.20	0.19	0.17	0.27	0.22	0.27	0.22	0.21	0.18	0.23	0.33	0.23	0.27	0.18	0.25	0.20	0.11	0.14	0.06
C2	0.24	0.20	0.25	0.19	0.21	0.21	0.23	0.21	0.21	0.18	0.20	0.26	0.28	0.31	0.20	0.22	0.20	0.18	0.24	0.14
C2'	0.20	0.18	0.17	0.17	0.24	0.20	0.25	0.23	0.20	0.17	0.21	0.29	0.19	0.23	0.18	0.23	0.22	0.11	0.12	0.10
C3'	0.19	0.23	0.15	0.13	0.31	0.13	0.32	0.13	0.25	0.21	0.27	0.35	0.21	0.16	0.12	0.21	0.07	0.10	0.12	0.02
C4	0.24	0.22	0.21	0.17	0.24	0.20	0.23	0.20	0.20	0.19	0.24	0.30	0.26	0.26	0.16	0.24	0.19	0.17	0.26	0.11
C4'	0.18	0.23	0.13	0.12	0.36	0.14	0.36	0.15	0.26	0.20	0.30	0.43	0.21	0.17	0.12	0.20	0.06	0.13	0.19	0.08
C5	0.25	0.25	0.22	0.19	0.22	0.22	0.21	0.22	0.22	0.22	0.26	0.29	0.29	0.27	0.19	0.25	0.22	0.23	0.34	0.17
C5'	0.23	0.35	0.22	0.20	0.50	0.15	0.47	0.13	0.36	0.30	0.43	0.58	0.32	0.19	0.19	0.22	0.11	0.22	0.33	0.16
C6	0.26	0.26	0.25	0.21	0.17	0.22	0.22	0.22	0.23	0.23	0.24	0.22	0.32	0.29	0.21	0.25	0.22	0.25	0.36	0.19
C8	0.24	0.24	0.20	0.19	0.28	0.23	0.24	0.24	0.22	0.21	0.28	0.36	0.27	0.24	0.19	0.26	0.23	0.25	0.34	0.19
N1	0.25	0.23	0.26	0.21	0.17	0.22	0.22	0.21	0.22	0.20	0.19	0.24	0.32	0.31	0.21	0.23	0.20	0.21	0.31	0.16
N2	0.24	0.21	0.27	0.22	0.24	0.23	0.25	0.23	0.22	0.18	0.23	0.27	0.29	0.35	0.25	0.22	0.21	0.20	0.23	0.16
N3	0.23	0.20	0.22	0.17	0.23	0.20	0.24	0.20	0.21	0.18	0.22	0.28	0.26	0.29	0.17	0.21	0.19	0.16	0.21	0.11
N7	0.25	0.26	0.22	0.20	0.27	0.23	0.23	0.24	0.23	0.23	0.29	0.34	0.29	0.25	0.20	0.27	0.24	0.28	0.39	0.21
N9	0.23	0.22	0.19	0.17	0.27	0.21	0.25	0.22	0.21	0.19	0.25	0.34	0.25	0.25	0.17	0.25	0.20	0.17	0.24	0.11
O2'	0.27	0.21	0.27	0.27	0.23	0.30	0.24	0.32	0.22	0.21	0.21	0.26	0.24	0.35	0.30	0.29	0.27	0.15	0.10	0.13
O3'	0.18	0.20	0.14	0.14	0.27	0.14	0.28	0.14	0.23	0.19	0.23	0.30	0.19	0.15	0.15	0.21	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.22	0.15	0.12	0.33	0.18	0.32	0.18	0.23	0.19	0.28	0.41	0.22	0.22	0.13	0.22	0.12	0.12	0.17	0.03
O5'	0.59	0.75	0.59	0.56	0.88	0.45	0.85	0.38	0.73	0.69	0.83	0.94	0.72	0.54	0.53	0.52	0.49	0.43	0.69	0.47
O6	0.27	0.28	0.26	0.23	0.18	0.23	0.24	0.24	0.25	0.24	0.26	0.20	0.34	0.30	0.24	0.25	0.23	0.28	0.41	0.22
OP1	0.88	1.16	0.94	0.90	1.34	0.71	1.24	0.65	1.06	1.04	1.29	1.46	1.13	0.86	0.90	0.74	0.78	0.80	1.01	0.78
OP2	0.75	0.91	0.77	0.76	1.03	0.64	0.97	0.59	0.86	0.84	1.00	1.12	0.89	0.73	0.77	0.67	0.68	0.83	0.79	0.67
P	0.67	0.86	0.70	0.68	1.01	0.52	0.96	0.45	0.83	0.79	0.96	1.10	0.83	0.64	0.68	0.57	0.59	0.61	0.81	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.12	0.04	0.14	0.19	0.27	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.07	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.09	0.16	0.14	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.12	0.07	0.11	0.12	0.14	0.02	0.01	0.01	0.12	0.19	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.19	0.29	0.38	0.24
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.08	0.06	0.06	0.03	0.01	0.02	0.12	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.04	0.20	0.29	0.38	0.24
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.12	0.16	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.13	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.14	0.04	0.18	0.22	0.28	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.13	0.17	0.23	0.15
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.17	0.25	0.34	0.21
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.17	0.04	0.20	0.33	0.43	0.27
O2	0.04	0.00	0.14	0.14	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.17	0.06	0.13	0.17	0.24	0.15
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.04	0.05	0.05	0.15	0.10	0.07
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.15	0.03	0.16	0.04	0.14	0.07	0.14	0.17	0.17	0.04	0.00	0.02	0.13	0.26	0.22	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.07	0.08	0.14	0.10
O5'	0.07	0.14	0.09	0.12	0.19	0.02	0.20	0.01	0.18	0.13	0.17	0.20	0.13	0.05	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.19	0.16	0.19	0.29	0.12	0.29	0.13	0.22	0.17	0.25	0.33	0.17	0.15	0.26	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.27	0.14	0.14	0.38	0.08	0.38	0.13	0.28	0.23	0.34	0.43	0.24	0.10	0.22	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.17	0.11	0.13	0.24	0.03	0.24	0.02	0.19	0.15	0.21	0.27	0.15	0.07	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00