Doublet Group distance statistics: 50046

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 3, 5, 7, 5, 5, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.037 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.013, 0.039, 0.065, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.039 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.025, 0.061, 0.098, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.061 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.023, 0.064, 0.106, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.064 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.044, 0.121, 0.198, 0.271 max_d=0.271 avg_d=0.121 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.065, 0.164, 0.263, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.164 std_dev=0.099
O2'	A	0, 0.113, 0.244, 0.375, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.244 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.121, 0.254, 0.388, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.254 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.083, 0.218, 0.352, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.218 std_dev=0.135
O3'	A	0, 0.180, 0.380, 0.579, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.380 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.268, 0.481, 0.694, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.481 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.357, 0.574, 0.791, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.574 std_dev=0.217
C2	B	0, 0.255, 0.477, 0.698, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.477 std_dev=0.221
P	B	0, 0.244, 0.474, 0.704, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.474 std_dev=0.230
O5'	B	0, 0.286, 0.526, 0.766, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.526 std_dev=0.240
O2	B	0, 0.320, 0.561, 0.803, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.561 std_dev=0.241
O4'	B	0, 0.320, 0.576, 0.832, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.576 std_dev=0.256
C5'	A	0, 0.141, 0.398, 0.656, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.398 std_dev=0.258
OP2	B	0, 0.270, 0.529, 0.787, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.529 std_dev=0.258
N3	B	0, 0.269, 0.530, 0.790, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.530 std_dev=0.260
C6	B	0, 0.285, 0.554, 0.824, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.554 std_dev=0.269
C4'	B	0, 0.310, 0.599, 0.889, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.599 std_dev=0.290
C5	B	0, 0.288, 0.591, 0.893, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.591 std_dev=0.302
C4	B	0, 0.251, 0.555, 0.858, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.555 std_dev=0.303
O5'	A	0, 0.159, 0.488, 0.817, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.488 std_dev=0.329
C2'	B	0, 0.347, 0.688, 1.028, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.688 std_dev=0.340
C3'	B	0, 0.276, 0.626, 0.976, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.626 std_dev=0.350
OP1	B	0, 0.296, 0.648, 1.001, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.648 std_dev=0.352
N4	B	0, 0.328, 0.684, 1.039, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.684 std_dev=0.356
P	A	0, 0.282, 0.673, 1.063, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.673 std_dev=0.391
OP2	A	0, 0.335, 0.753, 1.170, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.753 std_dev=0.418
O2'	B	0, 0.484, 0.932, 1.379, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.932 std_dev=0.448
O3'	B	0, 0.341, 0.823, 1.305, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.823 std_dev=0.482
OP1	A	0, 0.365, 0.895, 1.424, 2.089 max_d=2.089 avg_d=0.895 std_dev=0.530
C5'	B	0, 0.220, 0.755, 1.290, 2.485 max_d=2.485 avg_d=0.755 std_dev=0.535

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.21	0.13
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.03	0.21	0.02	0.26	0.37	0.25
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.09	0.13	0.10	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.14	0.07	0.18	0.18	0.14
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.10	0.10	0.12	0.16	0.12	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.11	0.24	0.18	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.20	0.02	0.23	0.34	0.24
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.23	0.01	0.29	0.41	0.30
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.15	0.12	0.11	0.19	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.20	0.13	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.02	0.25	0.01	0.33	0.44	0.32
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.21	0.02	0.24	0.34	0.26
N1	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.15	0.03	0.23	0.01	0.30	0.42	0.29
N2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.20	0.04	0.20	0.02	0.25	0.37	0.24
N3	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.14	0.03	0.18	0.02	0.22	0.33	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.24	0.02	0.31	0.42	0.31
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.17	0.02	0.18	0.29	0.20
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.13	0.17	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.10	0.17	0.17	0.09
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.12	0.11	0.15	0.20	0.14	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.20	0.13	0.31	0.25	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.10	0.03	0.10	0.20	0.13
O5'	0.09	0.21	0.14	0.19	0.20	0.02	0.23	0.01	0.25	0.21	0.23	0.20	0.18	0.24	0.17	0.07	0.20	0.10	0.00	0.26	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.11	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.13	0.03	0.26	0.00	0.38	0.47	0.35
OP1	0.11	0.26	0.18	0.24	0.23	0.12	0.29	0.13	0.33	0.24	0.30	0.25	0.22	0.31	0.18	0.17	0.31	0.10	0.02	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.37	0.18	0.18	0.34	0.13	0.41	0.17	0.44	0.34	0.42	0.37	0.33	0.42	0.29	0.17	0.25	0.20	0.02	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.25	0.14	0.17	0.24	0.04	0.30	0.02	0.32	0.26	0.29	0.24	0.22	0.31	0.20	0.09	0.20	0.13	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.21	0.16	0.16	0.33	0.16	0.34	0.28	0.28	0.18	0.28	0.39	0.22	0.28	0.16	0.16	0.22	0.06	0.11	0.07
C2	0.32	0.17	0.35	0.28	0.17	0.29	0.22	0.28	0.28	0.23	0.18	0.22	0.26	0.45	0.31	0.29	0.33	0.24	0.23	0.21
C2'	0.16	0.22	0.14	0.19	0.32	0.15	0.34	0.32	0.29	0.19	0.28	0.36	0.21	0.23	0.18	0.15	0.25	0.11	0.13	0.12
C3'	0.17	0.26	0.19	0.28	0.40	0.17	0.41	0.27	0.32	0.23	0.34	0.45	0.23	0.19	0.27	0.17	0.10	0.03	0.07	0.02
C4	0.25	0.19	0.22	0.15	0.26	0.19	0.27	0.19	0.27	0.18	0.25	0.31	0.23	0.33	0.17	0.21	0.27	0.14	0.19	0.14
C4'	0.16	0.25	0.16	0.26	0.41	0.16	0.42	0.31	0.32	0.21	0.34	0.48	0.22	0.20	0.25	0.16	0.08	0.11	0.17	0.07
C5	0.26	0.23	0.22	0.15	0.27	0.19	0.27	0.17	0.27	0.20	0.28	0.33	0.27	0.31	0.16	0.22	0.27	0.16	0.22	0.16
C5'	0.21	0.32	0.24	0.33	0.50	0.20	0.50	0.28	0.38	0.29	0.42	0.59	0.28	0.22	0.34	0.21	0.11	0.22	0.30	0.17
C6	0.29	0.23	0.28	0.21	0.16	0.23	0.24	0.20	0.28	0.23	0.23	0.23	0.31	0.35	0.22	0.24	0.30	0.19	0.25	0.19
C8	0.22	0.25	0.18	0.14	0.38	0.16	0.36	0.15	0.29	0.21	0.34	0.46	0.26	0.25	0.14	0.21	0.22	0.14	0.21	0.14
N1	0.32	0.21	0.34	0.27	0.16	0.27	0.24	0.23	0.29	0.25	0.18	0.22	0.30	0.42	0.29	0.28	0.32	0.23	0.25	0.20
N2	0.36	0.22	0.43	0.36	0.21	0.36	0.23	0.35	0.28	0.26	0.23	0.24	0.30	0.54	0.41	0.34	0.37	0.30	0.25	0.25
N3	0.27	0.15	0.28	0.22	0.20	0.25	0.23	0.28	0.26	0.17	0.20	0.25	0.22	0.40	0.25	0.24	0.31	0.20	0.20	0.18
N7	0.24	0.26	0.19	0.14	0.36	0.17	0.32	0.17	0.27	0.21	0.34	0.45	0.28	0.26	0.14	0.22	0.25	0.17	0.24	0.17
N9	0.22	0.22	0.17	0.13	0.33	0.15	0.33	0.18	0.28	0.18	0.30	0.39	0.23	0.28	0.13	0.18	0.22	0.08	0.15	0.09
O2'	0.24	0.25	0.23	0.26	0.31	0.26	0.33	0.48	0.29	0.24	0.28	0.34	0.27	0.32	0.25	0.23	0.33	0.17	0.14	0.16
O3'	0.18	0.27	0.24	0.35	0.40	0.20	0.42	0.33	0.34	0.26	0.34	0.44	0.23	0.21	0.35	0.18	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.18	0.22	0.14	0.18	0.37	0.14	0.38	0.28	0.29	0.19	0.31	0.45	0.22	0.25	0.18	0.15	0.15	0.07	0.13	0.04
O5'	0.25	0.46	0.32	0.39	0.65	0.19	0.61	0.23	0.46	0.38	0.58	0.75	0.42	0.23	0.40	0.18	0.28	0.20	0.30	0.22
O6	0.29	0.27	0.28	0.23	0.16	0.24	0.26	0.23	0.28	0.25	0.25	0.21	0.34	0.34	0.23	0.25	0.30	0.21	0.27	0.21
OP1	0.33	0.57	0.44	0.50	0.79	0.26	0.72	0.27	0.54	0.48	0.71	0.93	0.53	0.33	0.54	0.23	0.36	0.29	0.45	0.32
OP2	0.41	0.64	0.47	0.48	0.83	0.34	0.73	0.35	0.56	0.53	0.77	0.97	0.61	0.42	0.51	0.33	0.35	0.36	0.37	0.32
P	0.30	0.54	0.38	0.42	0.75	0.22	0.68	0.22	0.51	0.45	0.68	0.88	0.50	0.29	0.44	0.21	0.29	0.21	0.32	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.18	0.19	0.18	0.10
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.16	0.05	0.35	0.30	0.24	0.26
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.02	0.10	0.02	0.12	0.02	0.10	0.06	0.23	0.01	0.02	0.01	0.25	0.31	0.10	0.19
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.01	0.15	0.03	0.17	0.07	0.14	0.12	0.23	0.02	0.01	0.02	0.35	0.40	0.14	0.28
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.49	0.41	0.38	0.40
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.08	0.11	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.15	0.26	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.19	0.07	0.52	0.43	0.38	0.42
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.22	0.01	0.23	0.00	0.19	0.12	0.18	0.25	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.20	0.36	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.17	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.08	0.46	0.36	0.26	0.33
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.35	0.28	0.21	0.23
N3	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.04	0.42	0.36	0.32	0.34
N4	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.05	0.52	0.46	0.44	0.45
O2	0.06	0.01	0.23	0.23	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.19	0.27	0.09	0.28	0.26	0.21	0.20
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.03	0.09	0.07	0.19	0.00	0.04	0.06	0.09	0.19	0.15	0.09
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.13	0.03	0.19	0.05	0.19	0.07	0.16	0.15	0.27	0.04	0.00	0.02	0.31	0.45	0.21	0.31
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.04	0.05	0.09	0.06	0.02	0.00	0.15	0.14	0.31	0.13
O5'	0.18	0.35	0.25	0.35	0.49	0.02	0.52	0.01	0.46	0.35	0.42	0.52	0.28	0.09	0.31	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.30	0.31	0.40	0.41	0.15	0.43	0.20	0.36	0.28	0.36	0.46	0.26	0.19	0.45	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.24	0.10	0.14	0.38	0.26	0.38	0.36	0.26	0.21	0.32	0.44	0.21	0.15	0.21	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.26	0.19	0.28	0.40	0.04	0.42	0.02	0.33	0.23	0.34	0.45	0.20	0.09	0.31	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00