Doublet Group distance statistics: 50049

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.012, 0.023, 0.033, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	B	0, 0.199, 0.347, 0.496, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.347 std_dev=0.149
C2	B	0, 0.181, 0.349, 0.516, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.349 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.150, 0.359, 0.568, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.359 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.154, 0.429, 0.704, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.429 std_dev=0.275
O4'	A	0, -0.074, 0.250, 0.574, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.250 std_dev=0.324
C5	B	0, 0.102, 0.445, 0.789, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.445 std_dev=0.344
O2	B	0, 0.200, 0.551, 0.902, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.551 std_dev=0.351
C2'	A	0, -0.048, 0.304, 0.657, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.304 std_dev=0.353
C6	B	0, 0.120, 0.493, 0.866, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.493 std_dev=0.373
N4	B	0, 0.154, 0.543, 0.931, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.543 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.124, 0.552, 0.980, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.552 std_dev=0.428
OP2	A	0, 0.260, 0.696, 1.132, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.696 std_dev=0.436
C1'	B	0, 0.181, 0.673, 1.165, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.673 std_dev=0.492
C4'	A	0, -0.136, 0.388, 0.911, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.388 std_dev=0.524
P	A	0, 0.188, 0.715, 1.241, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.715 std_dev=0.526
O2'	A	0, -0.076, 0.477, 1.031, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.477 std_dev=0.554
C3'	A	0, -0.086, 0.479, 1.044, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.479 std_dev=0.565
C5'	A	0, -0.021, 0.575, 1.172, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.575 std_dev=0.596
OP1	B	0, 0.254, 0.880, 1.507, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.880 std_dev=0.627
C2'	B	0, 0.175, 0.802, 1.428, 2.136 max_d=2.136 avg_d=0.802 std_dev=0.627
O4'	B	0, 0.076, 0.736, 1.396, 2.219 max_d=2.219 avg_d=0.736 std_dev=0.660
OP1	A	0, 0.190, 0.892, 1.593, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.892 std_dev=0.701
C3'	B	0, 0.067, 0.805, 1.544, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.805 std_dev=0.739
O2'	B	0, 0.232, 1.031, 1.831, 2.706 max_d=2.706 avg_d=1.031 std_dev=0.799
C4'	B	0, 0.001, 0.841, 1.682, 2.770 max_d=2.770 avg_d=0.841 std_dev=0.840
O5'	B	0, -0.155, 0.732, 1.619, 2.821 max_d=2.821 avg_d=0.732 std_dev=0.887
O3'	A	0, -0.141, 0.765, 1.670, 2.914 max_d=2.914 avg_d=0.765 std_dev=0.906
P	B	0, -0.072, 0.837, 1.745, 2.980 max_d=2.980 avg_d=0.837 std_dev=0.908
O3'	B	0, 0.040, 0.964, 1.888, 3.038 max_d=3.038 avg_d=0.964 std_dev=0.924
C5'	B	0, -0.128, 0.848, 1.825, 3.147 max_d=3.147 avg_d=0.848 std_dev=0.976
OP2	B	0, -0.272, 1.100, 2.472, 4.405 max_d=4.405 avg_d=1.100 std_dev=1.372

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.27	0.00	0.17	0.01	0.20	0.23	0.17
C2	0.02	0.00	0.30	0.26	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.16	0.11	0.14	0.00	0.27	0.28	0.20
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.15	0.01	0.07	0.18	0.13	0.14	0.23	0.36	0.30	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.39	0.10	0.48	0.49	0.43
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.22	0.00	0.26	0.02	0.29	0.20	0.29	0.26	0.22	0.25	0.16	0.01	0.00	0.02	0.05	0.31	0.29	0.15	0.14
C4	0.01	0.00	0.15	0.22	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.06	0.14	0.01	0.23	0.26	0.19
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.05	0.04	0.09	0.05	0.23	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.03
C5	0.00	0.00	0.07	0.26	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.03	0.04	0.16	0.01	0.24	0.28	0.21
C5'	0.07	0.07	0.18	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.09	0.07	0.07	0.12	0.08	0.06	0.18	0.01	0.00	0.11	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.29	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.05	0.06	0.16	0.00	0.27	0.30	0.23
C8	0.01	0.01	0.14	0.20	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.09	0.07	0.16	0.01	0.21	0.27	0.20
N1	0.01	0.00	0.23	0.29	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.09	0.16	0.00	0.28	0.30	0.22
N2	0.02	0.00	0.36	0.26	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.21	0.13	0.14	0.00	0.28	0.28	0.19
N3	0.02	0.00	0.30	0.22	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.19	0.11	0.14	0.00	0.24	0.25	0.18
N7	0.00	0.00	0.08	0.25	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.10	0.03	0.16	0.01	0.23	0.28	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.01	0.15	0.01	0.20	0.25	0.18
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.10	0.23	0.20	0.06	0.17	0.27	0.08	0.17	0.10	0.29	0.15	0.00	0.03	0.15	0.29	0.22	0.40	0.54	0.36
O3'	0.27	0.16	0.02	0.00	0.09	0.02	0.03	0.18	0.05	0.09	0.09	0.21	0.19	0.10	0.10	0.03	0.00	0.20	0.19	0.09	0.50	0.32	0.32
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.09	0.13	0.11	0.03	0.01	0.15	0.20	0.00	0.05	0.05	0.06	0.10	0.10
O5'	0.17	0.14	0.39	0.05	0.14	0.01	0.16	0.00	0.16	0.16	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.29	0.19	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.10	0.31	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.09	0.05	0.17	0.00	0.29	0.31	0.24
OP1	0.20	0.27	0.48	0.29	0.23	0.11	0.24	0.05	0.27	0.21	0.28	0.28	0.24	0.23	0.20	0.40	0.50	0.06	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.28	0.49	0.15	0.26	0.03	0.28	0.01	0.30	0.27	0.30	0.28	0.25	0.28	0.25	0.54	0.32	0.10	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.20	0.43	0.14	0.19	0.03	0.21	0.01	0.23	0.20	0.22	0.19	0.18	0.22	0.18	0.36	0.32	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.44	0.16	0.46	0.54	0.23	0.66	0.12	0.73	0.23	0.26	0.20	0.40	0.20	0.50	0.57	0.60	0.66	0.10	0.14	0.32
C2	0.24	0.20	0.22	0.21	0.07	0.25	0.15	0.27	0.17	0.17	0.17	0.14	0.28	0.25	0.22	0.26	0.30	0.50	0.30	0.14
C2'	0.86	0.42	0.89	0.95	0.11	1.10	0.21	1.13	0.53	0.61	0.19	0.28	0.49	0.95	0.98	1.03	1.01	0.04	0.11	0.54
C3'	0.77	0.46	0.88	1.00	0.32	1.04	0.44	1.14	0.62	0.62	0.33	0.27	0.47	0.88	1.06	0.88	1.16	0.52	0.45	0.90
C4	0.32	0.19	0.30	0.36	0.17	0.46	0.14	0.52	0.27	0.23	0.23	0.29	0.23	0.31	0.36	0.44	0.53	0.31	0.10	0.24
C4'	0.64	0.27	0.76	0.92	0.20	1.00	0.32	1.15	0.48	0.45	0.16	0.30	0.27	0.77	1.01	0.80	1.13	0.65	0.41	0.93
C5	0.29	0.23	0.27	0.34	0.17	0.43	0.24	0.52	0.32	0.24	0.28	0.26	0.29	0.26	0.34	0.41	0.56	0.30	0.27	0.32
C5'	0.64	0.26	0.77	0.96	0.28	1.04	0.37	1.22	0.51	0.45	0.21	0.40	0.24	0.78	1.08	0.81	1.20	0.83	0.72	1.10
C6	0.24	0.25	0.21	0.24	0.13	0.32	0.28	0.40	0.29	0.21	0.27	0.13	0.35	0.21	0.24	0.32	0.45	0.39	0.23	0.24
C8	0.38	0.20	0.38	0.49	0.24	0.60	0.19	0.72	0.33	0.27	0.28	0.41	0.23	0.38	0.51	0.54	0.73	0.15	0.42	0.52
N1	0.22	0.24	0.20	0.19	0.09	0.23	0.24	0.28	0.22	0.18	0.21	0.13	0.36	0.23	0.19	0.25	0.33	0.47	0.14	0.12
N2	0.25	0.17	0.26	0.23	0.14	0.22	0.14	0.21	0.11	0.15	0.11	0.21	0.28	0.30	0.24	0.22	0.22	0.58	0.50	0.27
N3	0.29	0.16	0.27	0.29	0.13	0.36	0.10	0.39	0.20	0.20	0.18	0.22	0.22	0.29	0.30	0.37	0.39	0.42	0.32	0.14
N7	0.33	0.23	0.32	0.42	0.21	0.53	0.25	0.64	0.35	0.26	0.29	0.35	0.27	0.30	0.43	0.48	0.68	0.21	0.47	0.48
N9	0.38	0.18	0.38	0.46	0.22	0.58	0.13	0.67	0.28	0.26	0.24	0.39	0.21	0.40	0.48	0.54	0.65	0.18	0.13	0.37
O2'	0.62	0.17	0.63	0.66	0.51	0.91	0.46	0.90	0.09	0.26	0.29	0.76	0.28	0.78	0.71	0.85	0.53	0.46	0.58	0.07
O3'	0.54	0.25	0.75	0.94	0.23	0.91	0.30	1.09	0.41	0.39	0.19	0.28	0.25	0.72	1.06	0.62	1.15	0.88	0.28	1.02
O4'	0.42	0.15	0.48	0.62	0.22	0.73	0.18	0.87	0.29	0.25	0.21	0.38	0.18	0.50	0.69	0.59	0.85	0.28	0.15	0.62
O5'	0.54	0.27	0.64	0.82	0.36	0.89	0.39	1.07	0.47	0.40	0.30	0.50	0.24	0.65	0.91	0.71	1.08	0.57	0.83	1.00
O6	0.22	0.27	0.19	0.22	0.17	0.29	0.33	0.39	0.30	0.21	0.28	0.15	0.38	0.20	0.22	0.29	0.45	0.38	0.35	0.28
OP1	0.75	0.54	0.88	1.06	0.61	1.09	0.63	1.25	0.68	0.63	0.57	0.73	0.52	0.89	1.19	0.88	1.24	0.94	1.20	1.24
OP2	0.51	0.43	0.58	0.75	0.56	0.81	0.51	0.97	0.52	0.45	0.53	0.73	0.41	0.58	0.83	0.65	1.00	0.46	1.07	0.97
P	0.57	0.37	0.68	0.86	0.48	0.92	0.49	1.10	0.53	0.46	0.43	0.63	0.34	0.68	0.96	0.73	1.11	0.66	1.03	1.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.24	0.35	0.16
C2	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.15	0.60	0.34	0.28
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.18	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.09	0.07	0.11	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.20	0.90	0.33	0.37
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.13	0.30	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.14	0.03	0.20	0.89	0.31	0.38
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.00	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.14	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.28	0.28	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.17	0.67	0.30	0.31
N1	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.13	0.51	0.33	0.25
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.18	0.77	0.34	0.34
N4	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.17	0.03	0.21	1.01	0.35	0.40
O2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.13	0.50	0.36	0.25
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.00	0.02	0.04	0.05	0.05	0.26	0.08
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.15	0.01	0.14	0.03	0.11	0.07	0.13	0.17	0.09	0.02	0.00	0.01	0.09	0.25	0.03	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.06	0.11	0.46	0.14
O5'	0.07	0.15	0.05	0.05	0.20	0.01	0.20	0.00	0.17	0.13	0.18	0.21	0.13	0.05	0.09	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.24	0.60	0.11	0.08	0.90	0.13	0.89	0.28	0.67	0.51	0.77	1.01	0.50	0.05	0.25	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.34	0.18	0.08	0.33	0.30	0.31	0.28	0.30	0.33	0.34	0.35	0.36	0.26	0.03	0.46	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.28	0.09	0.04	0.37	0.05	0.38	0.00	0.31	0.25	0.34	0.40	0.25	0.08	0.05	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00