Doublet Group distance statistics: 50054

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.008, 0.034, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.034 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.007, 0.034, 0.062, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.034 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.029
C2	B	0, 0.210, 0.532, 0.854, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.532 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.291, 0.658, 1.024, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.658 std_dev=0.367
O2	B	0, 0.366, 0.759, 1.153, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.759 std_dev=0.394
N1	B	0, 0.079, 0.489, 0.899, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.489 std_dev=0.410
C5	B	0, 0.337, 0.757, 1.177, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.757 std_dev=0.420
N3	B	0, 0.182, 0.621, 1.059, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.621 std_dev=0.438
C4	B	0, 0.289, 0.752, 1.214, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.752 std_dev=0.462
O4'	A	0, 0.308, 0.812, 1.315, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.812 std_dev=0.503
C1'	B	0, 0.319, 0.836, 1.354, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.836 std_dev=0.517
C2'	A	0, 0.364, 0.902, 1.440, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.902 std_dev=0.538
C2'	B	0, 0.381, 0.946, 1.510, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.946 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.538, 1.163, 1.789, 1.864 max_d=1.864 avg_d=1.163 std_dev=0.626
N4	B	0, 0.458, 1.104, 1.749, 1.993 max_d=1.993 avg_d=1.104 std_dev=0.646
C3'	A	0, 0.545, 1.235, 1.925, 2.125 max_d=2.125 avg_d=1.235 std_dev=0.690
O4'	B	0, 0.484, 1.181, 1.877, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.181 std_dev=0.697
C4'	A	0, 0.455, 1.192, 1.930, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.192 std_dev=0.738
C3'	B	0, 0.441, 1.230, 2.019, 2.320 max_d=2.320 avg_d=1.230 std_dev=0.789
O3'	A	0, 0.782, 1.607, 2.432, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.607 std_dev=0.825
O3'	B	0, 0.579, 1.420, 2.261, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.420 std_dev=0.841
C4'	B	0, 0.626, 1.514, 2.402, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.514 std_dev=0.888
O2'	A	0, 0.473, 1.377, 2.281, 2.694 max_d=2.694 avg_d=1.377 std_dev=0.904
O5'	B	0, 0.882, 1.806, 2.730, 2.411 max_d=2.411 avg_d=1.806 std_dev=0.924
C5'	B	0, 0.836, 1.947, 3.058, 3.457 max_d=3.457 avg_d=1.947 std_dev=1.111
C5'	A	0, 0.756, 1.895, 3.035, 3.512 max_d=3.512 avg_d=1.895 std_dev=1.139
O5'	A	0, 1.148, 2.818, 4.489, 5.111 max_d=5.111 avg_d=2.818 std_dev=1.671
P	B	0, 1.232, 3.084, 4.936, 4.989 max_d=4.989 avg_d=3.084 std_dev=1.852
OP2	B	0, 1.304, 3.617, 5.930, 6.081 max_d=6.081 avg_d=3.617 std_dev=2.313
OP1	B	0, 1.835, 4.327, 6.819, 6.823 max_d=6.823 avg_d=4.327 std_dev=2.492
P	A	0, 1.828, 4.376, 6.925, 7.643 max_d=7.643 avg_d=4.376 std_dev=2.549
OP1	A	0, 2.119, 4.972, 7.825, 8.752 max_d=8.752 avg_d=4.972 std_dev=2.853
OP2	A	0, 1.966, 5.236, 8.506, 9.408 max_d=9.408 avg_d=5.236 std_dev=3.270

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.39	0.00	0.27	0.73	0.25
C2	0.04	0.00	0.16	0.09	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.41	0.24	0.62	0.01	0.58	0.84	0.47
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.17	0.08	0.11	0.12	0.19	0.15	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.07	0.27	0.45	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.15	0.01	0.25	0.02	0.23	0.36	0.15	0.09	0.07	0.36	0.20	0.02	0.01	0.03	0.17	0.28	0.30	0.40	0.09
C4	0.02	0.00	0.08	0.15	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.20	0.12	0.73	0.00	0.48	1.00	0.66
C4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.06	0.20	0.13	0.25	0.18	0.16	0.07	0.30	0.01	0.00	0.02	0.05	0.29	0.77	0.26
C5	0.00	0.00	0.05	0.25	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.03	0.05	0.93	0.01	0.67	1.39	1.00
C5'	0.05	0.23	0.17	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.07	0.17	0.17	0.30	0.22	0.13	0.01	0.11	0.24	0.01	0.00	0.03	0.26	0.39	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.34	0.08	0.10	0.92	0.00	0.67	1.42	1.00
C8	0.02	0.00	0.11	0.36	0.01	0.20	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.42	0.22	0.13	1.04	0.02	0.83	1.47	1.13
N1	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.26	0.18	0.78	0.01	0.57	1.11	0.74
N2	0.05	0.00	0.19	0.09	0.00	0.25	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.54	0.28	0.54	0.01	0.71	0.71	0.32
N3	0.04	0.00	0.15	0.07	0.00	0.18	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.43	0.24	0.56	0.01	0.54	0.77	0.37
N7	0.01	0.00	0.08	0.36	0.01	0.16	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.21	0.07	1.10	0.02	0.92	1.72	1.28
N9	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.08	0.00	0.74	0.01	0.46	0.99	0.67
O2'	0.01	0.26	0.00	0.02	0.24	0.30	0.34	0.11	0.34	0.42	0.28	0.30	0.23	0.44	0.23	0.00	0.03	0.19	0.23	0.39	0.33	0.44	0.10
O3'	0.28	0.41	0.01	0.01	0.20	0.01	0.03	0.24	0.08	0.22	0.26	0.54	0.43	0.21	0.08	0.03	0.00	0.18	0.16	0.03	0.35	0.55	0.20
O4'	0.00	0.24	0.02	0.03	0.12	0.00	0.05	0.01	0.10	0.13	0.18	0.28	0.24	0.07	0.00	0.19	0.18	0.00	0.36	0.07	0.24	0.82	0.21
O5'	0.39	0.62	0.17	0.17	0.73	0.02	0.93	0.00	0.92	1.04	0.78	0.54	0.56	1.10	0.74	0.23	0.16	0.36	0.00	1.01	0.02	0.01	0.01
O6	0.00	0.01	0.07	0.28	0.00	0.05	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.39	0.03	0.07	1.01	0.00	0.79	1.67	1.18
OP1	0.27	0.58	0.27	0.30	0.48	0.29	0.67	0.26	0.67	0.83	0.57	0.71	0.54	0.92	0.46	0.33	0.35	0.24	0.02	0.79	0.00	0.01	0.00
OP2	0.73	0.84	0.45	0.40	1.00	0.77	1.39	0.39	1.42	1.47	1.11	0.71	0.77	1.72	0.99	0.44	0.55	0.82	0.01	1.67	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.47	0.06	0.09	0.66	0.26	1.00	0.01	1.00	1.13	0.74	0.32	0.37	1.28	0.67	0.10	0.20	0.21	0.01	1.18	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.27	0.47	0.55	0.21	0.56	0.29	0.60	0.43	0.36	0.23	0.22	0.27	0.44	0.57	0.51	0.50	0.94	1.11	0.96
C2	0.23	0.14	0.20	0.23	0.22	0.26	0.33	0.25	0.31	0.22	0.08	0.23	0.19	0.20	0.22	0.27	0.54	0.19	0.82	0.44
C2'	0.30	0.15	0.33	0.41	0.18	0.43	0.08	0.47	0.18	0.19	0.18	0.28	0.17	0.35	0.45	0.38	0.51	1.13	1.32	1.12
C3'	0.69	0.28	0.77	0.89	0.18	0.98	0.10	1.05	0.37	0.44	0.16	0.39	0.34	0.84	0.98	0.85	1.00	2.02	1.72	1.80
C4	0.25	0.15	0.27	0.33	0.18	0.34	0.35	0.37	0.38	0.24	0.16	0.17	0.16	0.21	0.33	0.32	0.52	0.58	1.12	0.77
C4'	0.65	0.37	0.69	0.75	0.17	0.81	0.18	0.83	0.41	0.47	0.25	0.24	0.43	0.76	0.80	0.75	0.64	1.60	1.14	1.27
C5	0.18	0.13	0.19	0.27	0.16	0.29	0.34	0.35	0.32	0.18	0.17	0.19	0.19	0.14	0.27	0.26	0.53	0.68	1.29	0.87
C5'	0.64	0.35	0.68	0.77	0.16	0.83	0.24	0.87	0.45	0.47	0.24	0.20	0.41	0.74	0.83	0.74	0.72	1.83	1.31	1.40
C6	0.12	0.14	0.10	0.15	0.12	0.18	0.30	0.24	0.25	0.11	0.14	0.19	0.26	0.11	0.14	0.19	0.53	0.49	1.21	0.75
C8	0.32	0.20	0.36	0.45	0.23	0.47	0.35	0.55	0.40	0.28	0.23	0.28	0.20	0.31	0.47	0.41	0.54	1.08	1.48	1.13
N1	0.18	0.15	0.15	0.16	0.18	0.19	0.31	0.19	0.26	0.16	0.07	0.25	0.27	0.19	0.15	0.21	0.54	0.26	0.99	0.55
N2	0.32	0.22	0.29	0.30	0.27	0.33	0.31	0.30	0.30	0.29	0.18	0.29	0.25	0.31	0.29	0.33	0.58	0.34	0.61	0.29
N3	0.26	0.16	0.26	0.31	0.19	0.32	0.33	0.33	0.37	0.27	0.12	0.15	0.15	0.21	0.30	0.31	0.52	0.29	0.84	0.52
N7	0.23	0.16	0.26	0.35	0.20	0.37	0.33	0.46	0.35	0.21	0.22	0.26	0.20	0.21	0.37	0.32	0.54	0.95	1.48	1.06
N9	0.33	0.21	0.37	0.45	0.21	0.45	0.34	0.50	0.42	0.30	0.21	0.23	0.20	0.33	0.46	0.41	0.51	0.86	1.24	0.95
O2'	0.29	0.31	0.39	0.44	0.40	0.28	0.47	0.27	0.42	0.32	0.33	0.41	0.29	0.33	0.46	0.25	0.46	0.58	0.93	0.64
O3'	1.26	0.75	1.36	1.43	0.24	1.56	0.30	1.54	0.72	0.92	0.45	0.17	0.89	1.48	1.52	1.42	1.46	2.40	1.61	2.13
O4'	0.59	0.42	0.61	0.66	0.28	0.68	0.33	0.70	0.49	0.49	0.34	0.24	0.44	0.63	0.68	0.65	0.49	1.14	1.02	0.99
O5'	0.50	0.38	0.57	0.73	0.66	0.89	0.42	1.03	0.27	0.29	0.60	0.95	0.38	0.70	0.88	0.70	0.96	2.41	1.74	1.83
O6	0.10	0.17	0.08	0.09	0.09	0.14	0.27	0.22	0.21	0.08	0.18	0.17	0.31	0.13	0.08	0.16	0.53	0.54	1.30	0.80
OP1	1.20	0.75	1.28	1.31	0.57	1.48	0.46	1.45	0.67	0.84	0.62	0.77	0.89	1.53	1.47	1.34	1.36	2.80	1.67	2.01
OP2	0.99	0.59	1.10	1.32	0.97	1.57	0.75	1.74	0.67	0.67	0.83	1.40	0.57	1.27	1.50	1.31	1.61	3.11	2.20	2.40
P	0.72	0.16	0.85	1.07	0.58	1.26	0.33	1.43	0.30	0.32	0.45	0.97	0.21	1.02	1.25	1.00	1.30	2.80	1.90	2.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.21	0.46	0.32	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.37	0.28	0.66	0.26
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.01	0.00	0.20	0.58	0.28	0.09
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.26	0.54	0.26	0.15
C4	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.50	0.30	0.99	0.53
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.54	0.19	0.15
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.52	0.37	1.02	0.59
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.34	0.25	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.47	0.25	0.82	0.46
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.37	0.26	0.61	0.25
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.44	0.23	0.84	0.39
N4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.52	0.38	1.11	0.61
O2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.29	0.41	0.53	0.14
O2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.02	0.04	0.82	0.12	0.27
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.21	0.67	0.10	0.14
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.42	0.23	0.11
O5'	0.21	0.37	0.20	0.26	0.50	0.00	0.52	0.01	0.47	0.37	0.44	0.52	0.29	0.04	0.21	0.17	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.46	0.28	0.58	0.54	0.30	0.54	0.37	0.34	0.25	0.26	0.23	0.38	0.41	0.82	0.67	0.42	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.66	0.28	0.26	0.99	0.19	1.02	0.25	0.82	0.61	0.84	1.11	0.53	0.12	0.10	0.23	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.26	0.09	0.15	0.53	0.15	0.59	0.01	0.46	0.25	0.39	0.61	0.14	0.27	0.14	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00