Doublet Group distance statistics: 50055

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.009, 0.033, 0.058, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.033 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.042 std_dev=0.035
N2	A	0, 0.012, 0.047, 0.082, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.047 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.009, 0.045, 0.082, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.045 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.009, 0.050, 0.092, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.050 std_dev=0.041
N7	A	0, 0.008, 0.049, 0.091, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.049 std_dev=0.042
C8	A	0, 0.011, 0.068, 0.126, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.068 std_dev=0.058
N4	B	0, 0.126, 0.340, 0.554, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.340 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.192, 0.423, 0.654, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.423 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.155, 0.399, 0.643, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.399 std_dev=0.244
O2'	A	0, 0.088, 0.353, 0.617, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.353 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.304, 0.619, 0.934, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.619 std_dev=0.315
C5	B	0, 0.203, 0.560, 0.918, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.560 std_dev=0.358
O2	B	0, 0.329, 0.689, 1.048, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.689 std_dev=0.359
C2'	A	0, 0.158, 0.560, 0.962, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.560 std_dev=0.402
N1	B	0, 0.350, 0.778, 1.206, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.778 std_dev=0.428
C6	B	0, 0.289, 0.738, 1.188, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.738 std_dev=0.450
O4'	A	0, 0.182, 0.697, 1.212, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.697 std_dev=0.515
C1'	B	0, 0.438, 1.021, 1.603, 1.523 max_d=1.523 avg_d=1.021 std_dev=0.583
C2'	B	0, 0.474, 1.107, 1.740, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.107 std_dev=0.633
O4'	B	0, 0.422, 1.075, 1.729, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.075 std_dev=0.654
C3'	B	0, 0.399, 1.074, 1.750, 1.639 max_d=1.639 avg_d=1.074 std_dev=0.676
C5'	B	0, 0.306, 1.024, 1.742, 1.808 max_d=1.808 avg_d=1.024 std_dev=0.718
C4'	B	0, 0.399, 1.119, 1.839, 1.733 max_d=1.733 avg_d=1.119 std_dev=0.720
O3'	B	0, 0.447, 1.198, 1.950, 1.820 max_d=1.820 avg_d=1.198 std_dev=0.751
O2'	B	0, 0.618, 1.407, 2.196, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.407 std_dev=0.789
C3'	A	0, 0.298, 1.134, 1.970, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.134 std_dev=0.836
OP2	B	0, 0.238, 1.116, 1.994, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.116 std_dev=0.878
C4'	A	0, 0.352, 1.248, 2.144, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.248 std_dev=0.896
O3'	A	0, 0.409, 1.459, 2.509, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.459 std_dev=1.050
P	B	0, 0.328, 1.395, 2.462, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.395 std_dev=1.067
OP1	B	0, 0.363, 1.531, 2.698, 2.733 max_d=2.733 avg_d=1.531 std_dev=1.167
O5'	B	0, 0.390, 1.703, 3.017, 2.957 max_d=2.957 avg_d=1.703 std_dev=1.313
O5'	A	0, 1.051, 2.498, 3.945, 3.677 max_d=3.677 avg_d=2.498 std_dev=1.447
C5'	A	0, 0.633, 2.112, 3.592, 3.460 max_d=3.460 avg_d=2.112 std_dev=1.479
P	A	0, 1.432, 3.923, 6.415, 5.983 max_d=5.983 avg_d=3.923 std_dev=2.491
OP1	A	0, 1.847, 4.356, 6.865, 6.446 max_d=6.446 avg_d=4.356 std_dev=2.509
OP2	A	0, 1.500, 4.754, 8.007, 7.607 max_d=7.607 avg_d=4.754 std_dev=3.253

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.08	0.01	0.33	0.26	0.10
C2	0.04	0.00	0.29	0.31	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.37	0.20	0.10	0.00	0.34	0.43	0.17
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.17	0.01	0.12	0.01	0.18	0.09	0.25	0.33	0.28	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.31	0.31	0.11
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.23	0.00	0.23	0.02	0.29	0.14	0.32	0.33	0.28	0.18	0.13	0.02	0.00	0.02	0.27	0.29	0.17	0.32	0.16
C4	0.02	0.01	0.17	0.23	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.23	0.10	0.23	0.00	0.17	0.65	0.23
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.08	0.16	0.02	0.07	0.03	0.16	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.37	0.08	0.16
C5	0.01	0.01	0.12	0.23	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.24	0.07	0.39	0.00	0.36	0.99	0.51
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.12	0.01	0.21	0.00	0.20	0.30	0.12	0.07	0.04	0.31	0.15	0.03	0.03	0.02	0.01	0.24	0.08	0.15	0.02
C6	0.02	0.00	0.18	0.29	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.32	0.11	0.35	0.00	0.33	0.97	0.45
C8	0.00	0.01	0.09	0.14	0.00	0.16	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.09	0.59	0.01	0.57	1.14	0.77
N1	0.03	0.00	0.25	0.32	0.01	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.37	0.17	0.20	0.00	0.18	0.69	0.20
N2	0.04	0.00	0.33	0.33	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.41	0.24	0.13	0.01	0.54	0.26	0.33
N3	0.03	0.01	0.28	0.28	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.31	0.18	0.08	0.00	0.37	0.37	0.17
N7	0.00	0.01	0.04	0.18	0.00	0.16	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.18	0.03	0.59	0.01	0.67	1.31	0.84
N9	0.00	0.02	0.04	0.13	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.30	0.00	0.18	0.67	0.32
O2'	0.03	0.20	0.00	0.02	0.10	0.03	0.08	0.03	0.11	0.08	0.16	0.24	0.18	0.06	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.10	0.63	0.08	0.29
O3'	0.02	0.37	0.01	0.00	0.23	0.01	0.24	0.03	0.32	0.14	0.37	0.41	0.31	0.18	0.10	0.05	0.00	0.02	0.22	0.33	0.24	0.19	0.10
O4'	0.00	0.20	0.01	0.02	0.10	0.00	0.07	0.02	0.11	0.09	0.17	0.24	0.18	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.09	0.39	0.03	0.20
O5'	0.08	0.10	0.18	0.27	0.23	0.01	0.39	0.01	0.35	0.59	0.20	0.13	0.08	0.59	0.30	0.03	0.22	0.09	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.16	0.29	0.00	0.11	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.33	0.09	0.42	0.00	0.50	1.16	0.61
OP1	0.33	0.34	0.31	0.17	0.17	0.37	0.36	0.08	0.33	0.57	0.18	0.54	0.37	0.67	0.18	0.63	0.24	0.39	0.00	0.50	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.43	0.31	0.32	0.65	0.08	0.99	0.15	0.97	1.14	0.69	0.26	0.37	1.31	0.67	0.08	0.19	0.03	0.01	1.16	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.17	0.11	0.16	0.23	0.16	0.51	0.02	0.45	0.77	0.20	0.33	0.17	0.84	0.32	0.29	0.10	0.20	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.67	0.45	0.64	0.60	0.20	0.61	0.26	0.48	0.44	0.53	0.30	0.10	0.50	0.75	0.61	0.67	0.49	0.07	0.18	0.19
C2	0.45	0.41	0.49	0.44	0.18	0.35	0.20	0.25	0.29	0.39	0.30	0.08	0.47	0.53	0.45	0.34	0.14	0.21	0.18	0.18
C2'	0.35	0.13	0.38	0.44	0.11	0.47	0.12	0.46	0.22	0.22	0.11	0.17	0.15	0.45	0.46	0.43	0.54	0.20	0.41	0.33
C3'	0.14	0.34	0.15	0.12	0.49	0.03	0.48	0.03	0.36	0.28	0.43	0.53	0.29	0.05	0.07	0.05	0.09	0.03	0.05	0.01
C4	0.54	0.44	0.53	0.50	0.24	0.45	0.29	0.35	0.41	0.48	0.32	0.10	0.45	0.57	0.50	0.48	0.15	0.12	0.11	0.08
C4'	0.18	0.09	0.11	0.04	0.32	0.14	0.35	0.03	0.18	0.05	0.19	0.43	0.13	0.32	0.06	0.23	0.13	0.25	0.36	0.16
C5	0.43	0.35	0.41	0.41	0.22	0.38	0.27	0.32	0.35	0.38	0.27	0.09	0.34	0.44	0.41	0.40	0.08	0.19	0.19	0.16
C5'	0.05	0.26	0.17	0.29	0.58	0.11	0.64	0.26	0.44	0.24	0.41	0.70	0.16	0.07	0.27	0.03	0.19	0.48	0.79	0.43
C6	0.33	0.28	0.33	0.33	0.18	0.29	0.21	0.24	0.26	0.29	0.22	0.08	0.28	0.34	0.34	0.29	0.13	0.25	0.26	0.23
C8	0.53	0.38	0.49	0.51	0.22	0.52	0.33	0.48	0.44	0.46	0.27	0.09	0.38	0.54	0.51	0.55	0.24	0.16	0.15	0.15
N1	0.34	0.31	0.37	0.35	0.16	0.28	0.18	0.21	0.24	0.30	0.24	0.05	0.34	0.39	0.36	0.27	0.13	0.24	0.23	0.22
N2	0.44	0.39	0.53	0.46	0.16	0.35	0.18	0.26	0.26	0.36	0.27	0.08	0.50	0.57	0.48	0.32	0.19	0.24	0.20	0.22
N3	0.57	0.48	0.58	0.52	0.22	0.44	0.25	0.32	0.38	0.50	0.34	0.10	0.53	0.64	0.53	0.45	0.20	0.15	0.14	0.12
N7	0.44	0.32	0.40	0.43	0.22	0.43	0.31	0.40	0.38	0.39	0.24	0.10	0.32	0.44	0.43	0.45	0.14	0.20	0.21	0.17
N9	0.59	0.43	0.56	0.55	0.23	0.54	0.31	0.44	0.46	0.51	0.30	0.10	0.45	0.63	0.55	0.58	0.28	0.07	0.09	0.08
O2'	0.66	0.38	0.72	0.74	0.23	0.76	0.28	0.64	0.44	0.49	0.26	0.17	0.40	0.82	0.76	0.74	0.92	0.31	0.53	0.49
O3'	0.37	0.51	0.39	0.38	0.60	0.27	0.61	0.28	0.56	0.49	0.56	0.61	0.46	0.21	0.31	0.29	0.02	0.02	0.01	0.00
O4'	0.51	0.33	0.45	0.35	0.08	0.41	0.10	0.24	0.20	0.35	0.19	0.16	0.43	0.62	0.36	0.50	0.30	0.15	0.19	0.04
O5'	0.26	0.49	0.42	0.55	0.94	0.31	1.03	0.47	0.76	0.50	0.69	1.12	0.33	0.19	0.53	0.19	0.48	0.67	1.21	0.71
O6	0.26	0.20	0.25	0.27	0.16	0.24	0.19	0.21	0.21	0.22	0.16	0.12	0.20	0.25	0.27	0.24	0.21	0.30	0.32	0.28
OP1	0.27	0.41	0.35	0.49	1.03	0.26	1.11	0.36	0.75	0.41	0.68	1.31	0.26	0.40	0.48	0.31	0.36	0.56	1.36	0.60
OP2	0.60	1.05	0.83	0.94	1.71	0.54	1.70	0.67	1.29	0.98	1.38	2.03	0.83	0.47	0.90	0.40	0.71	0.69	1.54	0.84
P	0.20	0.50	0.37	0.53	1.12	0.23	1.19	0.42	0.82	0.49	0.78	1.40	0.29	0.21	0.51	0.16	0.42	0.63	1.36	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.18	0.22	0.06	0.17
C2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.02	0.35	0.35	0.22	0.34
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.27	0.25	0.05	0.21
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.07	0.07	0.11	0.10	0.12	0.01	0.00	0.01	0.32	0.29	0.08	0.21
C4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.04	0.51	0.49	0.41	0.49
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.13	0.27	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.05	0.55	0.51	0.41	0.52
C5'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.05	0.06	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.20	0.38	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.48	0.43	0.25	0.43
N1	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.35	0.34	0.16	0.32
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.02	0.44	0.42	0.33	0.42
N4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.04	0.54	0.53	0.49	0.54
O2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.26	0.28	0.15	0.27
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.02	0.06	0.14	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.02	0.08	0.07	0.13	0.13	0.13	0.02	0.00	0.00	0.21	0.21	0.15	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.14	0.20	0.04
O5'	0.18	0.35	0.27	0.32	0.51	0.01	0.55	0.01	0.48	0.35	0.44	0.54	0.26	0.02	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.22	0.35	0.25	0.29	0.49	0.13	0.51	0.20	0.43	0.34	0.42	0.53	0.28	0.06	0.21	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.22	0.05	0.08	0.41	0.27	0.41	0.38	0.25	0.16	0.33	0.49	0.15	0.14	0.15	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.34	0.21	0.21	0.49	0.01	0.52	0.01	0.43	0.32	0.42	0.54	0.27	0.03	0.13	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00