Doublet Group distance statistics: 50061

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 19, 34, 26, 8, 10, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.033, 0.042, 0.052, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.042 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.033, 0.043, 0.054, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.043 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.037, 0.050, 0.062, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.050 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.035, 0.048, 0.062, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.048 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.036, 0.050, 0.064, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.050 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.041, 0.056, 0.072, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.056 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.037, 0.053, 0.068, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.053 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.038, 0.055, 0.072, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.055 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.059, 0.079, 0.100, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.079 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.052, 0.075, 0.097, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.075 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.071, 0.104, 0.137, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.104 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.124, 0.218, 0.311, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.218 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.088, 0.183, 0.277, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.183 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.156, 0.278, 0.400, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.278 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.191, 0.333, 0.474, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.333 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.146, 0.291, 0.435, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.291 std_dev=0.144
N1	B	0, 0.147, 0.304, 0.461, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.304 std_dev=0.157
C2	B	0, 0.238, 0.404, 0.569, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.404 std_dev=0.165
C6	B	0, 0.170, 0.349, 0.528, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.349 std_dev=0.179
C1'	B	0, 0.169, 0.356, 0.544, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.356 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.236, 0.430, 0.625, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.430 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.214, 0.411, 0.609, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.411 std_dev=0.198
O4'	B	0, 0.151, 0.352, 0.552, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.352 std_dev=0.201
O2	B	0, 0.327, 0.535, 0.744, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.535 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.177, 0.391, 0.604, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.391 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.222, 0.438, 0.654, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.438 std_dev=0.216
C4	B	0, 0.190, 0.414, 0.639, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.414 std_dev=0.224
O5'	B	0, 0.241, 0.474, 0.707, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.474 std_dev=0.233
OP2	B	0, 0.235, 0.469, 0.703, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.469 std_dev=0.234
P	B	0, 0.199, 0.434, 0.670, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.434 std_dev=0.235
C3'	B	0, 0.189, 0.446, 0.704, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.446 std_dev=0.257
C4'	B	0, 0.158, 0.422, 0.686, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.422 std_dev=0.264
C5'	A	0, 0.364, 0.644, 0.924, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.644 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.301, 0.587, 0.873, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.587 std_dev=0.286
O4	B	0, 0.246, 0.541, 0.836, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.541 std_dev=0.295
OP1	B	0, 0.222, 0.556, 0.890, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.556 std_dev=0.334
C5'	B	0, 0.104, 0.446, 0.788, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.446 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.693, 1.056, 1.420, 2.687 max_d=2.687 avg_d=1.056 std_dev=0.364
O3'	B	0, 0.210, 0.597, 0.984, 3.034 max_d=3.034 avg_d=0.597 std_dev=0.387
P	A	0, 0.949, 1.475, 2.001, 3.530 max_d=3.530 avg_d=1.475 std_dev=0.526
OP2	A	0, 1.244, 1.853, 2.463, 3.819 max_d=3.819 avg_d=1.853 std_dev=0.610
OP1	A	0, 1.334, 2.009, 2.684, 4.830 max_d=4.830 avg_d=2.009 std_dev=0.675

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.18	0.02	0.16	0.34	0.17
C2	0.03	0.00	0.11	0.15	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.03	0.37	0.02	0.31	0.47	0.32
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.06	0.27	0.27	0.18
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.10	0.10	0.13	0.17	0.13	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.33	0.10	0.38	0.22	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.38	0.01	0.30	0.45	0.32
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09	0.06	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.10	0.16	0.32	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.47	0.01	0.40	0.53	0.42
C5'	0.04	0.15	0.03	0.04	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.20	0.18	0.14	0.13	0.23	0.13	0.05	0.05	0.02	0.01	0.23	0.22	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.49	0.00	0.44	0.57	0.45
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.46	0.02	0.36	0.46	0.38
N1	0.03	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.15	0.03	0.44	0.01	0.39	0.54	0.40
N2	0.05	0.01	0.14	0.17	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.22	0.05	0.33	0.03	0.29	0.46	0.30
N3	0.03	0.01	0.11	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.32	0.01	0.26	0.43	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.51	0.03	0.45	0.55	0.46
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.35	0.02	0.26	0.40	0.28
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.11	0.16	0.11	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.08	0.07	0.20	0.27	0.11
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.11	0.11	0.15	0.22	0.15	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.27	0.12	0.44	0.22	0.24
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.03	0.15	0.40	0.21
O5'	0.18	0.37	0.25	0.33	0.38	0.02	0.47	0.01	0.49	0.46	0.44	0.33	0.32	0.51	0.35	0.08	0.27	0.11	0.00	0.53	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.07	0.12	0.03	0.53	0.00	0.51	0.63	0.51
OP1	0.16	0.31	0.27	0.38	0.30	0.16	0.40	0.22	0.44	0.36	0.39	0.29	0.26	0.45	0.26	0.20	0.44	0.15	0.02	0.51	0.00	0.02	0.01
OP2	0.34	0.47	0.27	0.22	0.45	0.32	0.53	0.38	0.57	0.46	0.54	0.46	0.43	0.55	0.40	0.27	0.22	0.40	0.02	0.63	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.32	0.18	0.24	0.32	0.08	0.42	0.02	0.45	0.38	0.40	0.30	0.28	0.46	0.28	0.11	0.24	0.21	0.01	0.51	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.20	0.16	0.14	0.25	0.16	0.24	0.19	0.20	0.17	0.23	0.22	0.20	0.14	0.28	0.17	0.20	0.06	0.08	0.05
C2	0.25	0.17	0.26	0.24	0.17	0.27	0.17	0.26	0.18	0.15	0.19	0.25	0.33	0.30	0.21	0.26	0.26	0.19	0.19	0.17
C2'	0.17	0.21	0.15	0.13	0.26	0.14	0.27	0.19	0.24	0.19	0.23	0.21	0.17	0.14	0.28	0.15	0.22	0.11	0.09	0.11
C3'	0.19	0.23	0.15	0.12	0.30	0.13	0.30	0.13	0.25	0.21	0.26	0.22	0.15	0.12	0.32	0.18	0.08	0.03	0.07	0.02
C4	0.19	0.19	0.18	0.15	0.20	0.18	0.18	0.21	0.16	0.15	0.21	0.24	0.22	0.17	0.24	0.19	0.22	0.10	0.15	0.10
C4'	0.17	0.23	0.14	0.11	0.32	0.11	0.32	0.12	0.25	0.20	0.28	0.21	0.14	0.11	0.37	0.15	0.06	0.11	0.18	0.08
C5	0.19	0.19	0.17	0.16	0.17	0.19	0.15	0.23	0.15	0.15	0.21	0.24	0.22	0.17	0.23	0.20	0.23	0.12	0.19	0.13
C5'	0.25	0.33	0.23	0.21	0.44	0.18	0.42	0.16	0.34	0.30	0.39	0.31	0.21	0.21	0.50	0.22	0.15	0.22	0.33	0.20
C6	0.23	0.19	0.22	0.19	0.14	0.22	0.19	0.24	0.18	0.17	0.16	0.26	0.27	0.21	0.22	0.23	0.24	0.15	0.22	0.15
C8	0.16	0.21	0.14	0.15	0.25	0.17	0.19	0.23	0.15	0.15	0.25	0.23	0.17	0.15	0.31	0.17	0.22	0.13	0.19	0.14
N1	0.25	0.16	0.26	0.23	0.17	0.25	0.19	0.25	0.19	0.17	0.16	0.25	0.32	0.27	0.23	0.26	0.26	0.18	0.21	0.17
N2	0.26	0.17	0.31	0.30	0.19	0.33	0.18	0.30	0.18	0.15	0.20	0.25	0.40	0.39	0.22	0.29	0.28	0.25	0.21	0.21
N3	0.21	0.19	0.22	0.20	0.18	0.23	0.18	0.24	0.18	0.15	0.20	0.25	0.27	0.24	0.21	0.22	0.23	0.16	0.16	0.14
N7	0.17	0.21	0.15	0.15	0.21	0.18	0.15	0.24	0.14	0.15	0.24	0.24	0.18	0.15	0.28	0.18	0.23	0.15	0.22	0.15
N9	0.17	0.20	0.15	0.13	0.24	0.16	0.21	0.20	0.17	0.16	0.23	0.23	0.18	0.14	0.28	0.16	0.21	0.07	0.13	0.08
O2'	0.25	0.25	0.25	0.24	0.27	0.25	0.28	0.28	0.27	0.25	0.25	0.26	0.27	0.25	0.27	0.25	0.27	0.16	0.09	0.14
O3'	0.19	0.22	0.16	0.13	0.28	0.14	0.29	0.12	0.25	0.22	0.25	0.21	0.16	0.14	0.30	0.19	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.16	0.20	0.13	0.10	0.29	0.13	0.28	0.15	0.21	0.17	0.25	0.21	0.17	0.11	0.34	0.15	0.12	0.06	0.14	0.04
O5'	0.44	0.54	0.45	0.45	0.63	0.37	0.62	0.36	0.54	0.51	0.59	0.52	0.42	0.44	0.67	0.39	0.44	0.32	0.49	0.37
O6	0.23	0.20	0.22	0.20	0.17	0.22	0.22	0.25	0.20	0.19	0.17	0.28	0.28	0.21	0.24	0.23	0.25	0.17	0.24	0.17
OP1	0.49	0.59	0.56	0.60	0.70	0.49	0.67	0.50	0.59	0.56	0.65	0.56	0.52	0.64	0.75	0.44	0.60	0.57	0.73	0.58
OP2	0.48	0.59	0.49	0.47	0.66	0.40	0.61	0.37	0.53	0.54	0.64	0.59	0.47	0.48	0.72	0.43	0.38	0.33	0.41	0.32
P	0.40	0.51	0.43	0.44	0.61	0.35	0.58	0.34	0.50	0.47	0.57	0.50	0.39	0.46	0.67	0.34	0.42	0.36	0.51	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.03	0.00	0.14	0.14	0.16	0.12
C2	0.03	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.03	0.20	0.19	0.25	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.07	0.03	0.07	0.14	0.00	0.02	0.08	0.01	0.15	0.19	0.17	0.14
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.02	0.14	0.08	0.12	0.13	0.02	0.01	0.15	0.02	0.12	0.19	0.11	0.11
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.04	0.26	0.27	0.33	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.06	0.07	0.06	0.08	0.02	0.10	0.00	0.01	0.11	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.01	0.04	0.26	0.26	0.32	0.27
C5'	0.04	0.12	0.05	0.02	0.20	0.01	0.22	0.00	0.19	0.12	0.16	0.10	0.06	0.06	0.21	0.01	0.01	0.15	0.15	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.04	0.24	0.21	0.25	0.22
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.02	0.20	0.17	0.22	0.18
N3	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.13	0.01	0.03	0.23	0.23	0.30	0.24
O2	0.04	0.01	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.17	0.02	0.05	0.18	0.17	0.24	0.17
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.10	0.08	0.09	0.06	0.07	0.05	0.10	0.13	0.00	0.05	0.11	0.06	0.10	0.17	0.16	0.10
O3'	0.07	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.17	0.06	0.14	0.07	0.13	0.17	0.05	0.00	0.18	0.05	0.13	0.25	0.18	0.16
O4	0.03	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.01	0.21	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.18	0.00	0.04	0.27	0.29	0.36	0.30
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.06	0.05	0.04	0.00	0.12	0.12	0.15	0.10
O5'	0.14	0.20	0.15	0.12	0.26	0.01	0.26	0.01	0.24	0.20	0.23	0.18	0.10	0.13	0.27	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.19	0.19	0.19	0.27	0.11	0.26	0.15	0.21	0.17	0.23	0.17	0.17	0.25	0.29	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.25	0.17	0.11	0.33	0.11	0.32	0.15	0.25	0.22	0.30	0.24	0.16	0.18	0.36	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.14	0.11	0.27	0.03	0.27	0.02	0.22	0.18	0.24	0.17	0.10	0.16	0.30	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00