Doublet Group distance statistics: 50064

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 14, 17, 8, 8, 1, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.027 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.011, 0.031, 0.050, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.011, 0.033, 0.056, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.033 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.013, 0.038, 0.063, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.038 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.045 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.025, 0.097, 0.169, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.097 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.048, 0.129, 0.209, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.129 std_dev=0.081
C3'	A	0, 0.054, 0.177, 0.299, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.177 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.062, 0.191, 0.319, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.191 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.103, 0.232, 0.361, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.232 std_dev=0.129
N3	B	0, 0.198, 0.373, 0.547, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.373 std_dev=0.175
C5	B	0, 0.221, 0.396, 0.571, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.396 std_dev=0.175
O3'	A	0, 0.102, 0.279, 0.455, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.279 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.196, 0.379, 0.563, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.379 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.132, 0.327, 0.522, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.327 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.184, 0.389, 0.594, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.389 std_dev=0.205
O4'	B	0, 0.140, 0.350, 0.559, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.350 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.115, 0.329, 0.542, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.329 std_dev=0.214
P	B	0, 0.153, 0.381, 0.610, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.381 std_dev=0.228
O5'	A	0, 0.106, 0.337, 0.568, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.337 std_dev=0.231
O4	B	0, 0.150, 0.388, 0.626, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.388 std_dev=0.238
C4'	B	0, 0.183, 0.428, 0.673, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.428 std_dev=0.245
O5'	B	0, 0.143, 0.395, 0.646, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.395 std_dev=0.252
C5'	B	0, 0.171, 0.423, 0.675, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.423 std_dev=0.252
OP2	B	0, 0.156, 0.423, 0.691, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.423 std_dev=0.267
O2	B	0, 0.259, 0.535, 0.812, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.535 std_dev=0.277
C5'	A	0, 0.058, 0.342, 0.626, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.342 std_dev=0.284
OP1	B	0, 0.244, 0.530, 0.815, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.530 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.225, 0.524, 0.824, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.524 std_dev=0.300
C1'	B	0, 0.089, 0.389, 0.689, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.389 std_dev=0.300
OP2	A	0, 0.210, 0.590, 0.970, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.590 std_dev=0.380
P	A	0, 0.142, 0.539, 0.936, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.539 std_dev=0.397
O3'	B	0, 0.266, 0.703, 1.140, 2.692 max_d=2.692 avg_d=0.703 std_dev=0.437
C2'	B	0, 0.074, 0.535, 0.996, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.535 std_dev=0.461
OP1	A	0, 0.082, 0.708, 1.335, 2.903 max_d=2.903 avg_d=0.708 std_dev=0.627
O2'	B	0, -0.034, 0.761, 1.555, 3.975 max_d=3.975 avg_d=0.761 std_dev=0.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.02	0.18	0.11	0.10
C2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.11	0.04	0.16	0.01	0.31	0.22	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.05	0.26	0.09	0.10
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.08	0.12	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.08	0.29	0.12	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.17	0.01	0.28	0.20	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.12	0.10	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.20	0.02	0.32	0.26	0.22
C5'	0.06	0.15	0.03	0.02	0.16	0.01	0.21	0.00	0.21	0.22	0.18	0.13	0.13	0.24	0.15	0.05	0.05	0.02	0.01	0.24	0.13	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.03	0.21	0.01	0.35	0.29	0.24
C8	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.04	0.21	0.02	0.25	0.21	0.19
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.19	0.01	0.34	0.27	0.22
N2	0.06	0.00	0.12	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.15	0.06	0.16	0.02	0.32	0.21	0.17
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.04	0.15	0.01	0.28	0.19	0.15
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.09	0.00	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.23	0.03	0.31	0.28	0.24
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.15	0.02	0.23	0.16	0.14
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.11	0.16	0.12	0.04	0.03	0.00	0.04	0.06	0.06	0.08	0.22	0.07	0.08
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.09	0.09	0.10	0.15	0.10	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.14	0.10	0.34	0.19	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.03	0.15	0.16	0.15
O5'	0.10	0.16	0.10	0.13	0.17	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.19	0.16	0.15	0.23	0.15	0.06	0.14	0.11	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.02	0.24	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.10	0.03	0.23	0.00	0.38	0.33	0.27
OP1	0.18	0.31	0.26	0.29	0.28	0.12	0.32	0.13	0.35	0.25	0.34	0.32	0.28	0.31	0.23	0.22	0.34	0.15	0.02	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.22	0.09	0.12	0.20	0.10	0.26	0.15	0.29	0.21	0.27	0.21	0.19	0.28	0.16	0.07	0.19	0.16	0.02	0.33	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.10	0.13	0.17	0.04	0.22	0.02	0.24	0.19	0.22	0.17	0.15	0.24	0.14	0.08	0.18	0.15	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.15	0.15	0.17	0.15	0.21	0.17	0.22	0.19	0.19	0.26	0.24	0.14	0.20	0.20	0.12	0.06	0.11	0.04
C2	0.32	0.20	0.34	0.26	0.13	0.22	0.20	0.23	0.25	0.24	0.14	0.30	0.45	0.30	0.17	0.22	0.20	0.16	0.20	0.14
C2'	0.18	0.18	0.14	0.14	0.17	0.13	0.20	0.17	0.21	0.17	0.17	0.22	0.19	0.13	0.18	0.18	0.14	0.09	0.11	0.08
C3'	0.12	0.17	0.17	0.10	0.21	0.08	0.23	0.13	0.19	0.14	0.19	0.19	0.11	0.13	0.23	0.14	0.06	0.02	0.07	0.02
C4	0.24	0.20	0.20	0.20	0.13	0.15	0.20	0.17	0.23	0.20	0.17	0.28	0.27	0.17	0.17	0.17	0.15	0.09	0.18	0.09
C4'	0.14	0.19	0.15	0.10	0.24	0.09	0.25	0.14	0.20	0.15	0.22	0.21	0.12	0.12	0.28	0.16	0.05	0.06	0.11	0.05
C5	0.21	0.19	0.18	0.22	0.11	0.14	0.20	0.16	0.21	0.18	0.16	0.26	0.20	0.17	0.17	0.15	0.16	0.11	0.21	0.12
C5'	0.17	0.28	0.23	0.16	0.37	0.10	0.35	0.13	0.27	0.23	0.34	0.28	0.18	0.19	0.42	0.16	0.10	0.16	0.22	0.13
C6	0.24	0.19	0.24	0.24	0.13	0.16	0.21	0.17	0.22	0.20	0.13	0.27	0.25	0.21	0.20	0.17	0.18	0.13	0.23	0.14
C8	0.18	0.20	0.13	0.19	0.17	0.13	0.19	0.14	0.18	0.16	0.20	0.24	0.16	0.15	0.22	0.16	0.15	0.12	0.21	0.13
N1	0.29	0.20	0.32	0.26	0.14	0.20	0.21	0.20	0.23	0.23	0.13	0.30	0.36	0.27	0.20	0.20	0.19	0.14	0.21	0.14
N2	0.35	0.20	0.41	0.29	0.14	0.27	0.20	0.28	0.25	0.25	0.15	0.30	0.58	0.39	0.18	0.26	0.23	0.21	0.21	0.17
N3	0.30	0.20	0.27	0.22	0.13	0.19	0.20	0.22	0.25	0.23	0.15	0.29	0.40	0.24	0.16	0.21	0.18	0.14	0.18	0.12
N7	0.17	0.19	0.14	0.22	0.14	0.13	0.18	0.14	0.18	0.16	0.19	0.25	0.16	0.16	0.20	0.14	0.17	0.14	0.24	0.15
N9	0.21	0.20	0.15	0.17	0.16	0.13	0.20	0.16	0.21	0.18	0.19	0.26	0.21	0.14	0.20	0.17	0.13	0.07	0.16	0.07
O2'	0.26	0.22	0.23	0.21	0.17	0.23	0.20	0.24	0.23	0.21	0.19	0.27	0.34	0.22	0.18	0.26	0.19	0.14	0.11	0.11
O3'	0.12	0.14	0.22	0.11	0.20	0.10	0.22	0.13	0.18	0.13	0.16	0.15	0.12	0.17	0.23	0.14	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.18	0.19	0.13	0.12	0.20	0.12	0.21	0.15	0.19	0.16	0.20	0.24	0.17	0.11	0.24	0.18	0.08	0.04	0.11	0.02
O5'	0.22	0.29	0.25	0.19	0.38	0.15	0.36	0.13	0.29	0.26	0.34	0.28	0.25	0.22	0.42	0.21	0.17	0.20	0.22	0.17
O6	0.22	0.19	0.24	0.26	0.16	0.17	0.22	0.17	0.21	0.19	0.14	0.26	0.22	0.21	0.24	0.17	0.20	0.16	0.25	0.16
OP1	0.54	0.62	0.61	0.56	0.70	0.47	0.68	0.44	0.61	0.59	0.67	0.61	0.60	0.58	0.74	0.48	0.50	0.46	0.56	0.46
OP2	0.32	0.42	0.37	0.34	0.50	0.25	0.44	0.21	0.37	0.37	0.48	0.42	0.42	0.38	0.57	0.28	0.27	0.32	0.36	0.28
P	0.31	0.40	0.36	0.31	0.50	0.24	0.47	0.21	0.39	0.36	0.46	0.39	0.38	0.34	0.56	0.27	0.27	0.28	0.34	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.19	0.02	0.01	0.12	0.12	0.22	0.12
C2	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.02	0.08	0.15	0.14	0.24	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.02	0.10	0.12	0.12	0.02	0.10	0.22	0.00	0.03	0.06	0.01	0.28	0.32	0.36	0.29
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.23	0.00	0.23	0.02	0.20	0.14	0.21	0.15	0.02	0.01	0.25	0.02	0.12	0.15	0.10	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.23	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.16	0.00	0.04	0.22	0.22	0.29	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.08	0.19	0.02	0.10	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03
C5	0.02	0.01	0.10	0.23	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.17	0.01	0.07	0.23	0.23	0.29	0.23
C5'	0.05	0.08	0.12	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.07	0.09	0.10	0.08	0.14	0.14	0.02	0.01	0.08	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.20	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.13	0.01	0.09	0.19	0.17	0.24	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.09	0.01	0.02	0.15	0.13	0.22	0.14
N3	0.02	0.01	0.10	0.21	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.01	0.06	0.18	0.18	0.26	0.18
O2	0.05	0.01	0.22	0.15	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.25	0.02	0.13	0.15	0.14	0.23	0.14
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.22	0.19	0.26	0.08	0.23	0.12	0.15	0.14	0.00	0.05	0.24	0.13	0.19	0.25	0.38	0.23
O3'	0.19	0.16	0.03	0.01	0.16	0.02	0.17	0.14	0.13	0.09	0.15	0.25	0.05	0.00	0.19	0.13	0.18	0.26	0.22	0.20
O4	0.02	0.02	0.06	0.25	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.19	0.00	0.04	0.24	0.26	0.32	0.25
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.02	0.09	0.02	0.06	0.13	0.13	0.13	0.04	0.00	0.07	0.08	0.20	0.10
O5'	0.12	0.15	0.28	0.12	0.22	0.01	0.23	0.01	0.19	0.15	0.18	0.15	0.19	0.18	0.24	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.14	0.32	0.15	0.22	0.07	0.23	0.08	0.17	0.13	0.18	0.14	0.25	0.26	0.26	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.24	0.36	0.10	0.29	0.12	0.29	0.11	0.24	0.22	0.26	0.23	0.38	0.22	0.32	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.29	0.09	0.22	0.03	0.23	0.02	0.17	0.14	0.18	0.14	0.23	0.20	0.25	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00