Doublet Group distance statistics: 50065

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 5, 14, 9, 5, 4, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.004, 0.022, 0.041, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.022 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.006, 0.014, 0.034, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.014 std_dev=0.020
C1'	A	0, -0.002, 0.019, 0.039, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.019 std_dev=0.020
N3	A	0, -0.001, 0.021, 0.042, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.058, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.033 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.011, 0.036, 0.061, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.036 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.008, 0.033, 0.058, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.033 std_dev=0.025
N2	A	0, -0.007, 0.044, 0.095, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.044 std_dev=0.051
C4	B	0, 0.233, 0.417, 0.600, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.417 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.245, 0.441, 0.636, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.441 std_dev=0.195
C5	B	0, 0.267, 0.468, 0.668, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.468 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.265, 0.484, 0.703, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.484 std_dev=0.219
C2	B	0, 0.276, 0.494, 0.713, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.494 std_dev=0.219
O4	B	0, 0.272, 0.497, 0.721, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.497 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.243, 0.479, 0.714, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.479 std_dev=0.235
O4'	A	0, -0.062, 0.203, 0.469, 1.908 max_d=1.908 avg_d=0.203 std_dev=0.265
C2'	A	0, -0.057, 0.224, 0.506, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.224 std_dev=0.281
O2	B	0, 0.362, 0.648, 0.934, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.648 std_dev=0.286
O5'	B	0, 0.220, 0.515, 0.810, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.515 std_dev=0.295
P	B	0, 0.221, 0.521, 0.822, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.521 std_dev=0.301
OP2	B	0, 0.222, 0.527, 0.832, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.527 std_dev=0.305
O2'	A	0, -0.014, 0.303, 0.620, 2.183 max_d=2.183 avg_d=0.303 std_dev=0.317
C1'	B	0, 0.290, 0.615, 0.939, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.615 std_dev=0.325
O4'	B	0, 0.228, 0.560, 0.891, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.560 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.254, 0.587, 0.920, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.587 std_dev=0.333
C4'	B	0, 0.248, 0.597, 0.946, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.597 std_dev=0.349
C3'	B	0, 0.247, 0.622, 0.998, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.622 std_dev=0.376
C4'	A	0, -0.055, 0.338, 0.730, 2.808 max_d=2.808 avg_d=0.338 std_dev=0.393
C3'	A	0, -0.075, 0.361, 0.797, 3.129 max_d=3.129 avg_d=0.361 std_dev=0.436
C2'	B	0, 0.271, 0.737, 1.203, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.737 std_dev=0.466
OP1	B	0, 0.194, 0.696, 1.197, 3.110 max_d=3.110 avg_d=0.696 std_dev=0.501
O3'	B	0, 0.292, 0.798, 1.304, 2.745 max_d=2.745 avg_d=0.798 std_dev=0.506
O3'	A	0, -0.095, 0.528, 1.150, 4.460 max_d=4.460 avg_d=0.528 std_dev=0.622
C5'	A	0, -0.095, 0.576, 1.246, 4.837 max_d=4.837 avg_d=0.576 std_dev=0.670
O2'	B	0, 0.263, 0.991, 1.720, 3.049 max_d=3.049 avg_d=0.991 std_dev=0.728
O5'	A	0, -0.217, 0.730, 1.676, 6.810 max_d=6.810 avg_d=0.730 std_dev=0.946
P	A	0, -0.191, 1.073, 2.337, 9.200 max_d=9.200 avg_d=1.073 std_dev=1.264
OP2	A	0, -0.198, 1.159, 2.516, 9.851 max_d=9.851 avg_d=1.159 std_dev=1.357
OP1	A	0, -0.207, 1.399, 3.006, 11.378 max_d=11.378 avg_d=1.399 std_dev=1.607

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.21	0.10
C2	0.04	0.00	0.19	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.15	0.25	0.02	0.39	0.34	0.29
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.02	0.09	0.09	0.14	0.23	0.18	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.07	0.18	0.15	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.10	0.13	0.18	0.14	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.11	0.30	0.13	0.15
C4	0.02	0.01	0.10	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.10	0.11	0.08	0.23	0.01	0.22	0.34	0.18
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.08	0.12	0.09	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.12	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.04	0.32	0.01	0.29	0.47	0.25
C5'	0.02	0.18	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.15	0.16	0.17	0.21	0.15	0.16	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.16	0.19	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.07	0.31	0.00	0.33	0.49	0.27
C8	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.09	0.42	0.03	0.37	0.52	0.36
N1	0.03	0.01	0.14	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.11	0.27	0.01	0.36	0.41	0.27
N2	0.06	0.01	0.23	0.18	0.02	0.12	0.02	0.21	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.27	0.25	0.18	0.29	0.03	0.50	0.34	0.37
N3	0.04	0.01	0.18	0.14	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.18	0.14	0.22	0.02	0.32	0.29	0.24
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.06	0.43	0.03	0.40	0.60	0.38
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.25	0.02	0.18	0.33	0.17
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.10	0.05	0.06	0.05	0.10	0.08	0.16	0.27	0.19	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.08	0.13	0.15	0.07
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.04	0.13	0.11	0.17	0.25	0.18	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.17	0.14	0.39	0.19	0.17
O4'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.11	0.18	0.14	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.06	0.11	0.24	0.15
O5'	0.11	0.25	0.16	0.21	0.23	0.01	0.32	0.01	0.31	0.42	0.27	0.29	0.22	0.43	0.25	0.06	0.17	0.06	0.00	0.35	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.14	0.06	0.35	0.00	0.38	0.57	0.32
OP1	0.09	0.39	0.18	0.30	0.22	0.12	0.29	0.19	0.33	0.37	0.36	0.50	0.32	0.40	0.18	0.13	0.39	0.11	0.02	0.38	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.34	0.15	0.13	0.34	0.20	0.47	0.26	0.49	0.52	0.41	0.34	0.29	0.60	0.33	0.15	0.19	0.24	0.02	0.57	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.29	0.10	0.15	0.18	0.06	0.25	0.01	0.27	0.36	0.27	0.37	0.24	0.38	0.17	0.07	0.17	0.15	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.26	0.27	0.20	0.19	0.23	0.19	0.21	0.19	0.23	0.23	0.32	0.34	0.21	0.23	0.28	0.18	0.08	0.16	0.09
C2	0.30	0.20	0.33	0.25	0.20	0.24	0.23	0.24	0.21	0.19	0.16	0.33	0.44	0.36	0.27	0.24	0.25	0.17	0.23	0.19
C2'	0.22	0.22	0.22	0.16	0.18	0.18	0.18	0.22	0.17	0.19	0.21	0.26	0.21	0.17	0.20	0.21	0.27	0.17	0.15	0.16
C3'	0.27	0.28	0.33	0.26	0.28	0.24	0.30	0.30	0.30	0.28	0.28	0.29	0.25	0.27	0.28	0.27	0.44	0.45	0.22	0.45
C4	0.27	0.25	0.24	0.19	0.18	0.19	0.21	0.19	0.18	0.20	0.21	0.33	0.32	0.21	0.25	0.22	0.20	0.11	0.21	0.13
C4'	0.24	0.25	0.26	0.12	0.27	0.14	0.28	0.19	0.25	0.23	0.26	0.28	0.25	0.13	0.30	0.23	0.33	0.48	0.26	0.43
C5	0.24	0.25	0.22	0.19	0.20	0.18	0.22	0.19	0.18	0.20	0.23	0.33	0.30	0.18	0.29	0.21	0.21	0.18	0.24	0.16
C5'	0.28	0.32	0.33	0.20	0.39	0.17	0.41	0.25	0.35	0.30	0.34	0.32	0.31	0.22	0.42	0.25	0.44	0.64	0.46	0.58
C6	0.24	0.24	0.24	0.22	0.21	0.19	0.24	0.20	0.19	0.19	0.20	0.34	0.31	0.24	0.31	0.22	0.23	0.21	0.26	0.18
C8	0.27	0.28	0.25	0.19	0.25	0.20	0.24	0.20	0.22	0.24	0.28	0.33	0.31	0.17	0.30	0.25	0.20	0.16	0.23	0.15
N1	0.27	0.21	0.30	0.25	0.21	0.23	0.24	0.23	0.21	0.20	0.16	0.34	0.37	0.33	0.30	0.24	0.24	0.19	0.25	0.19
N2	0.34	0.20	0.41	0.31	0.22	0.30	0.23	0.29	0.23	0.22	0.18	0.32	0.56	0.47	0.27	0.28	0.27	0.20	0.24	0.22
N3	0.30	0.22	0.30	0.22	0.18	0.22	0.21	0.22	0.19	0.19	0.18	0.33	0.41	0.30	0.24	0.23	0.22	0.14	0.20	0.16
N7	0.24	0.28	0.22	0.19	0.25	0.18	0.24	0.19	0.21	0.22	0.28	0.33	0.31	0.15	0.32	0.23	0.21	0.21	0.26	0.17
N9	0.28	0.27	0.25	0.18	0.21	0.20	0.20	0.19	0.20	0.23	0.24	0.33	0.31	0.18	0.25	0.25	0.19	0.08	0.19	0.10
O2'	0.27	0.24	0.25	0.22	0.19	0.24	0.19	0.27	0.20	0.22	0.22	0.29	0.32	0.24	0.20	0.26	0.24	0.16	0.28	0.12
O3'	0.33	0.31	0.43	0.40	0.30	0.36	0.32	0.43	0.34	0.33	0.30	0.32	0.32	0.43	0.29	0.34	0.57	0.67	0.32	0.62
O4'	0.32	0.28	0.30	0.16	0.23	0.20	0.23	0.16	0.20	0.25	0.25	0.34	0.37	0.17	0.28	0.28	0.20	0.27	0.13	0.25
O5'	0.32	0.43	0.41	0.30	0.59	0.23	0.61	0.31	0.48	0.40	0.50	0.41	0.41	0.29	0.66	0.27	0.56	0.72	0.64	0.69
O6	0.24	0.25	0.24	0.23	0.23	0.20	0.24	0.21	0.20	0.21	0.23	0.34	0.33	0.24	0.33	0.22	0.24	0.25	0.28	0.20
OP1	0.39	0.48	0.55	0.45	0.68	0.34	0.69	0.48	0.56	0.45	0.56	0.47	0.59	0.49	0.77	0.31	0.75	1.05	0.95	0.95
OP2	0.39	0.56	0.51	0.43	0.80	0.30	0.77	0.39	0.61	0.51	0.68	0.51	0.53	0.44	0.91	0.32	0.64	0.80	0.73	0.75
P	0.33	0.43	0.46	0.31	0.62	0.22	0.64	0.34	0.50	0.40	0.52	0.42	0.50	0.34	0.71	0.26	0.60	0.80	0.73	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.02	0.01	0.13	0.14	0.25	0.16
C2	0.01	0.00	0.12	0.17	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.17	0.01	0.07	0.12	0.24	0.24	0.16
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.10	0.14	0.11	0.03	0.10	0.21	0.01	0.03	0.08	0.01	0.30	0.32	0.40	0.33
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.27	0.01	0.28	0.02	0.25	0.16	0.23	0.15	0.02	0.01	0.29	0.02	0.06	0.12	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.27	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.18	0.00	0.03	0.19	0.35	0.27	0.21
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.05	0.21	0.03	0.11	0.00	0.02	0.09	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.10	0.28	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.22	0.01	0.05	0.21	0.33	0.26	0.21
C5'	0.06	0.07	0.14	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.12	0.07	0.09	0.08	0.08	0.15	0.14	0.01	0.01	0.14	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.25	0.01	0.12	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.17	0.01	0.07	0.17	0.24	0.24	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.01	0.02	0.12	0.20	0.24	0.16
N3	0.01	0.00	0.10	0.23	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.15	0.01	0.05	0.15	0.31	0.25	0.18
O2	0.02	0.01	0.21	0.15	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.29	0.02	0.10	0.12	0.22	0.24	0.16
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.25	0.21	0.26	0.08	0.22	0.14	0.20	0.14	0.00	0.06	0.27	0.15	0.22	0.24	0.44	0.26
O3'	0.21	0.17	0.03	0.01	0.18	0.03	0.22	0.15	0.17	0.09	0.15	0.29	0.06	0.00	0.22	0.15	0.19	0.33	0.26	0.24
O4	0.02	0.01	0.08	0.29	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.27	0.22	0.00	0.04	0.21	0.39	0.29	0.23
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.05	0.10	0.15	0.15	0.04	0.00	0.08	0.11	0.24	0.14
O5'	0.13	0.12	0.30	0.06	0.19	0.02	0.21	0.01	0.17	0.12	0.15	0.12	0.22	0.19	0.21	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.14	0.24	0.32	0.12	0.35	0.09	0.33	0.14	0.24	0.20	0.31	0.22	0.24	0.33	0.39	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.24	0.40	0.10	0.27	0.14	0.26	0.12	0.24	0.24	0.25	0.24	0.44	0.26	0.29	0.24	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.16	0.33	0.07	0.21	0.04	0.21	0.02	0.17	0.16	0.18	0.16	0.26	0.24	0.23	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00