Doublet Group distance statistics: 50067

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 3, 2, 8, 3, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.016, 0.031, 0.047, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.031 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.044 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.024, 0.046, 0.068, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.046 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.013, 0.038, 0.064, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.354, 0.572, 0.791, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.572 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.358, 0.588, 0.819, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.588 std_dev=0.231
O2'	A	0, 0.408, 0.652, 0.896, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.652 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.247, 0.492, 0.737, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.492 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.580, 0.826, 1.072, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.826 std_dev=0.246
O4	B	0, 0.351, 0.600, 0.848, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.600 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.351, 0.601, 0.852, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.601 std_dev=0.251
N1	B	0, 0.393, 0.644, 0.895, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.644 std_dev=0.251
C6	B	0, 0.612, 0.864, 1.116, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.864 std_dev=0.252
N3	B	0, 0.261, 0.515, 0.770, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.515 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.523, 0.831, 1.140, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.831 std_dev=0.308
O2	B	0, 0.549, 0.873, 1.197, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.873 std_dev=0.324
C4'	A	0, 0.495, 0.826, 1.157, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.826 std_dev=0.331
C3'	A	0, 0.546, 0.894, 1.241, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.894 std_dev=0.348
O4'	B	0, 0.587, 0.952, 1.317, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.952 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.590, 0.956, 1.323, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.956 std_dev=0.366
O2'	B	0, 0.620, 1.036, 1.452, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.036 std_dev=0.416
C3'	B	0, 0.643, 1.068, 1.492, 1.812 max_d=1.812 avg_d=1.068 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.710, 1.137, 1.564, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.137 std_dev=0.427
C4'	B	0, 0.678, 1.117, 1.556, 1.747 max_d=1.747 avg_d=1.117 std_dev=0.439
O3'	A	0, 0.737, 1.189, 1.640, 1.759 max_d=1.759 avg_d=1.189 std_dev=0.452
OP2	B	0, 0.630, 1.093, 1.557, 1.773 max_d=1.773 avg_d=1.093 std_dev=0.464
P	B	0, 0.700, 1.165, 1.630, 1.817 max_d=1.817 avg_d=1.165 std_dev=0.465
C5'	B	0, 0.723, 1.215, 1.706, 2.220 max_d=2.220 avg_d=1.215 std_dev=0.492
O3'	B	0, 0.686, 1.227, 1.768, 2.173 max_d=2.173 avg_d=1.227 std_dev=0.541
OP1	B	0, 0.768, 1.350, 1.932, 2.197 max_d=2.197 avg_d=1.350 std_dev=0.582
C5'	A	0, 0.885, 1.484, 2.084, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.484 std_dev=0.600
O5'	A	0, 1.322, 2.289, 3.256, 3.830 max_d=3.830 avg_d=2.289 std_dev=0.967
P	A	0, 1.551, 2.777, 4.002, 4.643 max_d=4.643 avg_d=2.777 std_dev=1.226
OP2	A	0, 1.810, 3.148, 4.486, 5.099 max_d=5.099 avg_d=3.148 std_dev=1.338
OP1	A	0, 1.477, 2.852, 4.227, 5.151 max_d=5.151 avg_d=2.852 std_dev=1.375

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.23	0.02	0.23	0.49	0.21
C2	0.03	0.00	0.12	0.21	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.23	0.03	0.55	0.02	0.54	0.68	0.50
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.29	0.06	0.36	0.48	0.28
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.10	0.03	0.13	0.08	0.18	0.24	0.19	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.38	0.12	0.46	0.41	0.35
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.02	0.52	0.01	0.47	0.61	0.45
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.07	0.11	0.13	0.10	0.07	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.10	0.20	0.40	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.62	0.01	0.56	0.67	0.55
C5'	0.03	0.20	0.02	0.03	0.16	0.01	0.19	0.00	0.22	0.16	0.22	0.21	0.17	0.19	0.12	0.05	0.06	0.01	0.01	0.23	0.28	0.40	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.66	0.00	0.63	0.73	0.61
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.04	0.55	0.02	0.45	0.56	0.44
N1	0.03	0.01	0.09	0.18	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.20	0.03	0.63	0.01	0.61	0.73	0.58
N2	0.05	0.01	0.15	0.24	0.01	0.13	0.02	0.21	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.28	0.05	0.52	0.03	0.54	0.69	0.50
N3	0.03	0.01	0.12	0.19	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.03	0.48	0.01	0.46	0.62	0.43
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.63	0.02	0.56	0.63	0.55
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.45	0.01	0.38	0.54	0.36
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.10	0.13	0.10	0.04	0.03	0.00	0.06	0.06	0.09	0.08	0.24	0.43	0.14
O3'	0.03	0.23	0.03	0.01	0.12	0.03	0.10	0.06	0.14	0.08	0.20	0.28	0.20	0.08	0.04	0.06	0.00	0.03	0.33	0.14	0.50	0.38	0.34
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.16	0.04	0.18	0.49	0.19
O5'	0.23	0.55	0.29	0.38	0.52	0.02	0.62	0.01	0.66	0.55	0.63	0.52	0.48	0.63	0.45	0.09	0.33	0.16	0.00	0.70	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.14	0.04	0.70	0.00	0.69	0.76	0.66
OP1	0.23	0.54	0.36	0.46	0.47	0.20	0.56	0.28	0.63	0.45	0.61	0.54	0.46	0.56	0.38	0.24	0.50	0.18	0.02	0.69	0.00	0.01	0.01
OP2	0.49	0.68	0.48	0.41	0.61	0.40	0.67	0.40	0.73	0.56	0.73	0.69	0.62	0.63	0.54	0.43	0.38	0.49	0.03	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.50	0.28	0.35	0.45	0.09	0.55	0.02	0.61	0.44	0.58	0.50	0.43	0.55	0.36	0.14	0.34	0.19	0.01	0.66	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.17	0.18	0.19	0.20	0.21	0.20	0.26	0.15	0.15	0.18	0.20	0.22	0.19	0.24	0.20	0.25	0.07	0.12	0.07
C2	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.19	0.20	0.22	0.18	0.11	0.15	0.23	0.22	0.17	0.18	0.20	0.24	0.19	0.20	0.17
C2'	0.17	0.14	0.16	0.19	0.20	0.19	0.21	0.27	0.16	0.13	0.15	0.16	0.20	0.19	0.23	0.18	0.29	0.13	0.14	0.14
C3'	0.21	0.20	0.18	0.18	0.28	0.17	0.28	0.18	0.21	0.19	0.23	0.20	0.20	0.18	0.32	0.24	0.09	0.03	0.09	0.02
C4	0.16	0.17	0.15	0.14	0.14	0.16	0.17	0.20	0.14	0.12	0.16	0.22	0.19	0.13	0.18	0.16	0.22	0.10	0.16	0.09
C4'	0.19	0.20	0.16	0.17	0.32	0.17	0.31	0.20	0.22	0.18	0.25	0.18	0.19	0.18	0.38	0.21	0.06	0.14	0.23	0.12
C5	0.15	0.18	0.14	0.13	0.15	0.14	0.17	0.18	0.13	0.12	0.18	0.24	0.18	0.13	0.19	0.15	0.21	0.09	0.19	0.10
C5'	0.28	0.34	0.27	0.28	0.47	0.23	0.44	0.23	0.35	0.31	0.41	0.31	0.26	0.28	0.54	0.28	0.16	0.28	0.41	0.25
C6	0.14	0.17	0.14	0.13	0.17	0.13	0.21	0.16	0.15	0.11	0.16	0.25	0.19	0.12	0.22	0.14	0.21	0.12	0.20	0.13
C8	0.18	0.20	0.16	0.17	0.22	0.19	0.18	0.23	0.15	0.16	0.23	0.23	0.18	0.18	0.27	0.18	0.24	0.11	0.21	0.13
N1	0.16	0.16	0.16	0.14	0.20	0.16	0.22	0.18	0.18	0.11	0.17	0.24	0.21	0.14	0.23	0.17	0.22	0.16	0.21	0.16
N2	0.19	0.17	0.21	0.21	0.18	0.25	0.21	0.27	0.20	0.15	0.18	0.25	0.27	0.23	0.20	0.26	0.27	0.26	0.24	0.22
N3	0.15	0.15	0.15	0.15	0.13	0.18	0.18	0.23	0.16	0.10	0.13	0.22	0.20	0.15	0.15	0.17	0.24	0.17	0.18	0.14
N7	0.16	0.20	0.15	0.15	0.19	0.16	0.16	0.20	0.14	0.15	0.22	0.24	0.17	0.16	0.24	0.16	0.23	0.12	0.22	0.13
N9	0.18	0.18	0.16	0.17	0.19	0.18	0.18	0.23	0.15	0.15	0.19	0.22	0.20	0.17	0.23	0.18	0.24	0.06	0.15	0.07
O2'	0.31	0.24	0.31	0.31	0.21	0.33	0.22	0.38	0.22	0.24	0.21	0.28	0.34	0.31	0.22	0.31	0.39	0.21	0.16	0.20
O3'	0.24	0.20	0.22	0.22	0.27	0.23	0.27	0.22	0.21	0.20	0.23	0.20	0.23	0.23	0.31	0.29	0.02	0.01	0.02	0.01
O4'	0.16	0.17	0.13	0.14	0.26	0.16	0.24	0.21	0.16	0.13	0.21	0.18	0.19	0.15	0.32	0.18	0.14	0.09	0.19	0.06
O5'	0.57	0.71	0.59	0.57	0.83	0.48	0.78	0.44	0.68	0.65	0.78	0.69	0.55	0.56	0.89	0.50	0.51	0.43	0.69	0.49
O6	0.15	0.17	0.15	0.14	0.20	0.13	0.22	0.15	0.16	0.12	0.17	0.25	0.20	0.13	0.28	0.14	0.20	0.13	0.22	0.14
OP1	0.71	0.81	0.78	0.80	0.90	0.67	0.86	0.65	0.78	0.77	0.87	0.80	0.73	0.83	0.96	0.64	0.71	0.69	0.97	0.73
OP2	0.80	0.89	0.81	0.77	0.96	0.70	0.90	0.62	0.84	0.85	0.94	0.89	0.80	0.78	1.02	0.74	0.59	0.57	0.79	0.58
P	0.63	0.75	0.66	0.65	0.86	0.55	0.80	0.50	0.71	0.70	0.82	0.73	0.63	0.66	0.93	0.56	0.55	0.52	0.81	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.10	0.10	0.18	0.10
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.06	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.03	0.20	0.16	0.18	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.12	0.00	0.02	0.06	0.01	0.14	0.17	0.13	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.12	0.01	0.14	0.02	0.12	0.07	0.11	0.13	0.02	0.00	0.13	0.02	0.19	0.23	0.14	0.15
C4	0.04	0.01	0.06	0.12	0.00	0.11	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.06	0.30	0.24	0.25	0.26
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.11	0.00	0.12	0.01	0.10	0.06	0.08	0.06	0.06	0.02	0.12	0.01	0.03	0.09	0.16	0.05
C5	0.03	0.02	0.07	0.14	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.02	0.07	0.31	0.23	0.21	0.24
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.10	0.14	0.09	0.06	0.05	0.20	0.02	0.01	0.11	0.18	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.12	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.06	0.25	0.17	0.17	0.16
N1	0.02	0.01	0.03	0.07	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.03	0.18	0.13	0.17	0.13
N3	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.02	0.04	0.26	0.21	0.22	0.21
O2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.02	0.06	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.15	0.03	0.05	0.17	0.15	0.18	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.04	0.07	0.12	0.00	0.07	0.07	0.06	0.07	0.14	0.14	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.15	0.02	0.16	0.05	0.14	0.06	0.12	0.15	0.07	0.00	0.16	0.02	0.20	0.29	0.20	0.19
O4	0.04	0.02	0.06	0.13	0.01	0.12	0.02	0.20	0.03	0.03	0.02	0.03	0.07	0.16	0.00	0.07	0.33	0.29	0.30	0.30
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.07	0.00	0.09	0.10	0.24	0.15
O5'	0.10	0.20	0.14	0.19	0.30	0.03	0.31	0.01	0.25	0.18	0.26	0.17	0.07	0.20	0.33	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.17	0.23	0.24	0.09	0.23	0.11	0.17	0.13	0.21	0.15	0.14	0.29	0.29	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.18	0.13	0.14	0.25	0.16	0.21	0.18	0.17	0.17	0.22	0.18	0.14	0.20	0.30	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.11	0.15	0.26	0.05	0.24	0.02	0.16	0.13	0.21	0.14	0.08	0.19	0.30	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00