Doublet Group distance statistics: 50072

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.019, 0.046, 0.074, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.046 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.025, 0.060, 0.096, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.060 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.023, 0.065, 0.108, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.065 std_dev=0.042
N2	A	0, 0.009, 0.065, 0.121, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.065 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.082, 0.278, 0.474, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.278 std_dev=0.196
C2'	A	0, 0.112, 0.341, 0.569, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.341 std_dev=0.228
C4'	A	0, 0.167, 0.473, 0.779, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.473 std_dev=0.306
O2'	A	0, 0.102, 0.411, 0.721, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.411 std_dev=0.309
C3'	A	0, 0.183, 0.525, 0.868, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.525 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.167, 0.526, 0.886, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.526 std_dev=0.359
C6	B	0, 0.123, 0.484, 0.845, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.484 std_dev=0.361
C5	B	0, 0.122, 0.488, 0.853, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.488 std_dev=0.366
C4	B	0, 0.187, 0.581, 0.975, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.581 std_dev=0.394
C2	B	0, 0.148, 0.586, 1.024, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.586 std_dev=0.438
N3	B	0, 0.160, 0.614, 1.067, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.614 std_dev=0.454
C1'	B	0, 0.211, 0.712, 1.213, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.712 std_dev=0.501
P	A	0, 0.225, 0.727, 1.228, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.727 std_dev=0.501
O3'	A	0, 0.260, 0.766, 1.272, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.766 std_dev=0.506
O4	B	0, 0.222, 0.731, 1.240, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.731 std_dev=0.509
C5'	A	0, 0.258, 0.769, 1.280, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.769 std_dev=0.511
C2'	B	0, 0.210, 0.754, 1.299, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.754 std_dev=0.545
O4'	B	0, 0.225, 0.797, 1.369, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.797 std_dev=0.572
O2	B	0, 0.123, 0.711, 1.298, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.711 std_dev=0.588
C3'	B	0, 0.237, 0.839, 1.441, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.839 std_dev=0.602
O5'	A	0, 0.196, 0.807, 1.418, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.807 std_dev=0.611
O5'	B	0, 0.229, 0.856, 1.484, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.856 std_dev=0.627
C4'	B	0, 0.195, 0.877, 1.559, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.877 std_dev=0.682
P	B	0, 0.234, 0.952, 1.670, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.952 std_dev=0.718
C5'	B	0, 0.180, 0.922, 1.663, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.922 std_dev=0.741
OP1	A	0, 0.271, 1.017, 1.764, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.017 std_dev=0.747
O3'	B	0, 0.214, 0.972, 1.729, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.972 std_dev=0.758
O2'	B	0, 0.186, 0.947, 1.708, 2.310 max_d=2.310 avg_d=0.947 std_dev=0.761
OP2	B	0, 0.420, 1.430, 2.441, 2.811 max_d=2.811 avg_d=1.430 std_dev=1.010
OP1	B	0, 0.489, 1.559, 2.629, 2.897 max_d=2.897 avg_d=1.559 std_dev=1.070
OP2	A	0, 0.169, 1.241, 2.313, 3.074 max_d=3.074 avg_d=1.241 std_dev=1.072

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.45	0.12	0.10
C2	0.04	0.00	0.28	0.30	0.01	0.12	0.02	0.10	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.27	0.40	0.03	0.18	0.05	0.57	0.50	0.14
C2'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.02	0.11	0.12	0.21	0.37	0.29	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.41	0.05	0.10
C3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.15	0.01	0.09	0.02	0.14	0.17	0.24	0.39	0.28	0.12	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.41	0.11	0.17
C4	0.02	0.01	0.14	0.15	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.17	0.02	0.20	0.02	0.59	0.46	0.12
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.13	0.09	0.18	0.12	0.12	0.04	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.14	0.30	0.05
C5	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.10	0.03	0.30	0.01	0.63	0.70	0.19
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.11	0.00	0.18	0.00	0.18	0.23	0.13	0.13	0.09	0.25	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.22	0.18	0.40	0.02
C6	0.01	0.03	0.11	0.14	0.02	0.07	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.10	0.18	0.04	0.31	0.01	0.62	0.80	0.22
C8	0.01	0.02	0.12	0.17	0.02	0.13	0.02	0.23	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.18	0.02	0.34	0.02	0.65	0.53	0.16
N1	0.03	0.02	0.21	0.24	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.21	0.32	0.03	0.24	0.03	0.60	0.68	0.18
N2	0.07	0.01	0.37	0.39	0.01	0.18	0.03	0.13	0.05	0.02	0.05	0.00	0.02	0.04	0.02	0.38	0.53	0.03	0.16	0.08	0.55	0.44	0.15
N3	0.04	0.00	0.29	0.28	0.01	0.12	0.02	0.09	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.26	0.36	0.03	0.14	0.04	0.55	0.37	0.13
N7	0.01	0.03	0.08	0.12	0.02	0.12	0.02	0.25	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.38	0.02	0.66	0.78	0.23
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.19	0.02	0.57	0.32	0.10
O2'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.12	0.03	0.06	0.03	0.10	0.08	0.21	0.38	0.26	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.08	0.36	0.14	0.09
O3'	0.02	0.40	0.02	0.01	0.17	0.04	0.10	0.03	0.18	0.18	0.32	0.53	0.36	0.13	0.03	0.03	0.00	0.03	0.09	0.16	0.59	0.19	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.04	0.43	0.33	0.21
O5'	0.07	0.18	0.05	0.06	0.20	0.01	0.30	0.01	0.31	0.34	0.24	0.16	0.14	0.38	0.19	0.02	0.09	0.05	0.00	0.36	0.04	0.02	0.01
O6	0.01	0.05	0.08	0.13	0.02	0.09	0.01	0.22	0.01	0.02	0.03	0.08	0.04	0.02	0.02	0.08	0.16	0.04	0.36	0.00	0.63	0.94	0.27
OP1	0.45	0.57	0.41	0.41	0.59	0.14	0.63	0.18	0.62	0.65	0.60	0.55	0.55	0.66	0.57	0.36	0.59	0.43	0.04	0.63	0.00	0.01	0.02
OP2	0.12	0.50	0.05	0.11	0.46	0.30	0.70	0.40	0.80	0.53	0.68	0.44	0.37	0.78	0.32	0.14	0.19	0.33	0.02	0.94	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.10	0.17	0.12	0.05	0.19	0.02	0.22	0.16	0.18	0.15	0.13	0.23	0.10	0.09	0.26	0.21	0.01	0.27	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.24	0.29	0.21	0.17	0.26	0.19	0.11	0.09	0.18	0.19	0.34	0.45	0.21	0.26	0.36	0.05	0.29	0.30	0.04
C2	0.33	0.24	0.32	0.44	0.24	0.58	0.24	0.71	0.32	0.19	0.33	0.37	0.39	0.46	0.30	0.56	0.57	0.63	0.31	0.48
C2'	0.38	0.25	0.32	0.24	0.13	0.29	0.10	0.12	0.06	0.22	0.19	0.32	0.48	0.23	0.18	0.41	0.10	0.12	0.17	0.07
C3'	0.19	0.04	0.11	0.12	0.17	0.19	0.23	0.14	0.16	0.07	0.07	0.08	0.26	0.11	0.22	0.29	0.03	0.32	0.31	0.02
C4	0.18	0.18	0.16	0.18	0.15	0.23	0.18	0.34	0.21	0.07	0.22	0.29	0.26	0.19	0.21	0.21	0.26	0.47	0.27	0.19
C4'	0.22	0.10	0.14	0.13	0.27	0.21	0.35	0.14	0.23	0.12	0.14	0.13	0.29	0.12	0.35	0.32	0.05	0.43	0.38	0.05
C5	0.24	0.09	0.23	0.23	0.13	0.26	0.16	0.30	0.23	0.15	0.17	0.16	0.27	0.24	0.21	0.26	0.19	0.57	0.38	0.11
C5'	0.24	0.24	0.19	0.22	0.40	0.22	0.46	0.17	0.35	0.25	0.29	0.21	0.24	0.21	0.47	0.31	0.13	0.68	0.61	0.09
C6	0.39	0.07	0.36	0.37	0.24	0.42	0.22	0.46	0.30	0.25	0.23	0.04	0.41	0.38	0.33	0.43	0.33	0.61	0.27	0.22
C8	0.28	0.20	0.25	0.26	0.17	0.25	0.13	0.16	0.18	0.21	0.20	0.24	0.30	0.26	0.25	0.31	0.15	0.61	0.68	0.21
N1	0.46	0.17	0.43	0.48	0.26	0.59	0.24	0.65	0.34	0.28	0.31	0.21	0.49	0.49	0.35	0.59	0.51	0.63	0.23	0.39
N2	0.39	0.30	0.39	0.57	0.27	0.75	0.25	0.89	0.34	0.23	0.38	0.46	0.47	0.60	0.33	0.69	0.72	0.78	0.47	0.64
N3	0.17	0.25	0.17	0.28	0.19	0.39	0.23	0.57	0.26	0.08	0.29	0.39	0.29	0.29	0.24	0.34	0.48	0.54	0.27	0.41
N7	0.24	0.17	0.23	0.23	0.07	0.20	0.13	0.16	0.21	0.19	0.16	0.20	0.25	0.24	0.15	0.23	0.08	0.66	0.63	0.15
N9	0.26	0.21	0.22	0.17	0.16	0.18	0.16	0.13	0.13	0.15	0.20	0.29	0.33	0.17	0.24	0.25	0.05	0.44	0.41	0.02
O2'	0.52	0.35	0.49	0.39	0.15	0.45	0.08	0.25	0.11	0.32	0.27	0.46	0.70	0.39	0.17	0.52	0.19	0.16	0.16	0.10
O3'	0.13	0.02	0.05	0.06	0.15	0.15	0.20	0.11	0.13	0.04	0.07	0.03	0.22	0.06	0.19	0.24	0.03	0.02	0.04	0.01
O4'	0.25	0.14	0.17	0.13	0.31	0.21	0.36	0.11	0.21	0.11	0.18	0.22	0.33	0.13	0.42	0.32	0.03	0.43	0.40	0.02
O5'	0.24	0.32	0.22	0.23	0.47	0.18	0.51	0.14	0.39	0.31	0.37	0.29	0.20	0.23	0.52	0.27	0.11	0.86	0.77	0.06
O6	0.45	0.17	0.43	0.41	0.29	0.44	0.26	0.44	0.30	0.31	0.21	0.16	0.49	0.42	0.42	0.45	0.31	0.68	0.31	0.20
OP1	0.35	0.49	0.31	0.37	0.69	0.49	0.45	0.57	0.30	0.34	0.64	0.50	0.36	0.41	0.90	0.48	0.60	1.33	1.30	0.79
OP2	0.77	0.95	0.70	0.63	1.05	0.57	0.91	0.39	0.80	0.85	1.03	0.96	0.72	0.58	1.13	0.70	0.37	1.01	0.97	0.29
P	0.20	0.31	0.12	0.17	0.47	0.25	0.38	0.24	0.25	0.23	0.40	0.29	0.14	0.15	0.59	0.31	0.24	1.00	1.01	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.00	0.06	0.15	0.16	0.03
C2	0.01	0.00	0.08	0.12	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.16	0.03	0.03	0.13	0.52	0.41	0.11
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.03	0.07	0.00	0.08	0.02	0.05	0.15	0.01	0.06	0.08	0.02	0.09	0.16	0.20	0.11
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.06	0.06	0.11	0.16	0.05	0.02	0.12	0.02	0.08	0.18	0.19	0.11
C4	0.04	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.02	0.08	0.03	0.03	0.01	0.03	0.08	0.13	0.02	0.05	0.12	0.80	0.65	0.14
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.16	0.03	0.05	0.00	0.00	0.20	0.19	0.01
C5	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.05	0.13	0.76	0.65	0.15
C5'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.09	0.08	0.10	0.15	0.02	0.07	0.01	0.01	0.34	0.32	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.08	0.05	0.05	0.13	0.55	0.49	0.13
N1	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.09	0.05	0.00	0.12	0.42	0.36	0.09
N3	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.16	0.03	0.03	0.12	0.68	0.54	0.12
O2	0.05	0.00	0.15	0.16	0.03	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.21	0.04	0.07	0.14	0.45	0.33	0.11
O2'	0.03	0.02	0.01	0.05	0.08	0.16	0.08	0.15	0.07	0.03	0.04	0.07	0.00	0.11	0.10	0.10	0.05	0.08	0.15	0.03
O3'	0.05	0.16	0.06	0.02	0.13	0.03	0.09	0.02	0.08	0.09	0.16	0.21	0.11	0.00	0.15	0.03	0.09	0.34	0.34	0.15
O4	0.05	0.03	0.08	0.12	0.02	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.03	0.04	0.10	0.15	0.00	0.07	0.10	0.88	0.74	0.13
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.03	0.07	0.10	0.03	0.07	0.00	0.07	0.06	0.13	0.12
O5'	0.06	0.13	0.09	0.08	0.12	0.00	0.13	0.01	0.13	0.12	0.12	0.14	0.05	0.09	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.52	0.16	0.18	0.80	0.20	0.76	0.34	0.55	0.42	0.68	0.45	0.08	0.34	0.88	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.16	0.41	0.20	0.19	0.65	0.19	0.65	0.32	0.49	0.36	0.54	0.33	0.15	0.34	0.74	0.13	0.01	0.03	0.00	0.02
P	0.03	0.11	0.11	0.11	0.14	0.01	0.15	0.02	0.13	0.09	0.12	0.11	0.03	0.15	0.13	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00