Doublet Group distance statistics: 50094

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.016, 0.026, 0.037, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.019, 0.032, 0.044, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.032 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.033 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.020, 0.033, 0.046, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.033 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.024, 0.039, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.039 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.023, 0.041, 0.059, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.041 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.026, 0.045, 0.065, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.045 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.096, 0.164, 0.232, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.164 std_dev=0.068
O4'	A	0, 0.063, 0.135, 0.207, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.135 std_dev=0.072
C4'	A	0, 0.068, 0.191, 0.313, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.191 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.220, 0.384, 0.547, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.384 std_dev=0.163
C5'	A	0, 0.135, 0.348, 0.561, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.348 std_dev=0.213
O3'	B	0, 0.336, 0.586, 0.836, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.586 std_dev=0.250
O5'	A	0, 0.187, 0.448, 0.709, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.448 std_dev=0.261
C3'	B	0, 0.374, 0.637, 0.899, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.637 std_dev=0.262
O2'	B	0, 0.421, 0.696, 0.970, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.696 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.413, 0.690, 0.968, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.690 std_dev=0.278
C4'	B	0, 0.342, 0.626, 0.910, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.626 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.394, 0.693, 0.993, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.693 std_dev=0.299
O2'	A	0, 0.329, 0.633, 0.938, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.633 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.422, 0.730, 1.039, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.730 std_dev=0.308
C5'	B	0, 0.309, 0.660, 1.012, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.660 std_dev=0.351
O2	B	0, 0.401, 0.772, 1.142, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.772 std_dev=0.370
N1	B	0, 0.426, 0.813, 1.201, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.813 std_dev=0.387
O5'	B	0, 0.288, 0.679, 1.069, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.679 std_dev=0.391
C2	B	0, 0.411, 0.821, 1.231, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.821 std_dev=0.410
C6	B	0, 0.425, 0.916, 1.406, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.916 std_dev=0.490
OP1	B	0, 0.461, 0.951, 1.442, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.951 std_dev=0.490
N3	B	0, 0.431, 0.927, 1.423, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.927 std_dev=0.496
O3'	A	0, 0.578, 1.075, 1.573, 1.490 max_d=1.490 avg_d=1.075 std_dev=0.497
P	B	0, 0.435, 0.961, 1.487, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.961 std_dev=0.526
P	A	0, 0.133, 0.666, 1.199, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.666 std_dev=0.533
C4	B	0, 0.441, 1.011, 1.581, 1.872 max_d=1.872 avg_d=1.011 std_dev=0.570
C5	B	0, 0.429, 1.014, 1.598, 1.916 max_d=1.916 avg_d=1.014 std_dev=0.585
OP1	A	0, 0.191, 0.817, 1.443, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.817 std_dev=0.626
OP2	B	0, 0.604, 1.256, 1.908, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.256 std_dev=0.652
N4	B	0, 0.458, 1.118, 1.777, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.118 std_dev=0.659
OP2	A	0, 0.067, 0.750, 1.433, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.750 std_dev=0.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.03	0.21	0.04	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.18	0.04	0.06	0.19	0.08	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.12	0.05	0.08	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.12	0.34	0.13	0.22
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.10	0.13	0.08	0.06	0.11	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.05	0.21	0.05	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.03	0.06	0.18	0.07	0.07
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.05	0.03	0.07	0.06	0.03	0.13	0.04	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01
C5	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.03	0.03	0.08	0.14	0.08	0.06
C5'	0.04	0.08	0.12	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.07	0.12	0.10	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.05	0.04	0.09	0.13	0.09	0.06
C8	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.14	0.07	0.02	0.08	0.13	0.08	0.06
N1	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.12	0.05	0.07	0.16	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.19	0.04	0.05	0.20	0.07	0.08
N6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.03	0.05	0.11	0.09	0.10	0.06
N7	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.18	0.07	0.02	0.10	0.10	0.09	0.06
N9	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.06	0.01	0.05	0.18	0.06	0.07
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.15	0.13	0.18	0.01	0.20	0.14	0.19	0.13	0.22	0.18	0.11	0.00	0.03	0.13	0.06	0.39	0.09	0.22
O3'	0.18	0.18	0.03	0.01	0.10	0.04	0.03	0.10	0.05	0.07	0.12	0.19	0.03	0.07	0.06	0.03	0.00	0.18	0.25	0.32	0.25	0.27
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.01	0.13	0.18	0.00	0.01	0.11	0.11	0.01
O5'	0.03	0.06	0.12	0.05	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.08	0.07	0.05	0.11	0.10	0.05	0.06	0.25	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.21	0.19	0.34	0.21	0.18	0.07	0.14	0.04	0.13	0.13	0.16	0.20	0.09	0.10	0.18	0.39	0.32	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.08	0.13	0.05	0.07	0.11	0.08	0.06	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.09	0.06	0.09	0.25	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.07	0.22	0.10	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.06	0.07	0.22	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.18	0.14	0.11	0.12	0.12	0.07	0.14	0.07	0.10	0.19	0.14	0.30	0.13	0.08	0.15	0.18	0.19	0.11	0.12
C2	0.22	0.22	0.20	0.18	0.24	0.16	0.25	0.18	0.24	0.23	0.23	0.24	0.21	0.14	0.12	0.21	0.24	0.28	0.25	0.23
C2'	0.10	0.18	0.11	0.10	0.14	0.14	0.12	0.17	0.11	0.10	0.19	0.17	0.29	0.11	0.10	0.15	0.14	0.18	0.09	0.13
C3'	0.17	0.23	0.20	0.18	0.14	0.17	0.10	0.18	0.10	0.13	0.22	0.16	0.36	0.22	0.16	0.18	0.22	0.21	0.13	0.14
C4	0.15	0.14	0.15	0.13	0.10	0.13	0.10	0.15	0.12	0.13	0.13	0.11	0.18	0.13	0.10	0.17	0.19	0.22	0.15	0.15
C4'	0.16	0.21	0.17	0.16	0.12	0.17	0.09	0.21	0.08	0.10	0.21	0.16	0.37	0.18	0.13	0.18	0.24	0.23	0.12	0.16
C5	0.15	0.11	0.15	0.13	0.09	0.13	0.10	0.14	0.11	0.12	0.10	0.10	0.13	0.14	0.10	0.16	0.18	0.23	0.14	0.15
C5'	0.15	0.21	0.18	0.17	0.14	0.19	0.10	0.22	0.08	0.08	0.21	0.18	0.37	0.20	0.15	0.18	0.24	0.23	0.10	0.15
C6	0.19	0.15	0.19	0.16	0.17	0.15	0.19	0.16	0.20	0.19	0.14	0.17	0.12	0.14	0.12	0.19	0.21	0.27	0.21	0.20
C8	0.08	0.19	0.11	0.09	0.17	0.10	0.11	0.12	0.07	0.09	0.21	0.19	0.29	0.13	0.08	0.11	0.13	0.17	0.07	0.08
N1	0.23	0.23	0.21	0.19	0.25	0.17	0.27	0.18	0.26	0.24	0.23	0.26	0.21	0.15	0.13	0.22	0.24	0.30	0.26	0.24
N3	0.19	0.18	0.18	0.15	0.17	0.15	0.17	0.16	0.18	0.18	0.17	0.17	0.19	0.14	0.11	0.19	0.22	0.25	0.20	0.19
N6	0.20	0.15	0.20	0.17	0.17	0.16	0.21	0.17	0.22	0.19	0.14	0.17	0.14	0.15	0.13	0.19	0.20	0.28	0.23	0.21
N7	0.08	0.15	0.12	0.10	0.13	0.10	0.08	0.12	0.06	0.08	0.17	0.15	0.23	0.13	0.08	0.12	0.14	0.18	0.08	0.09
N9	0.12	0.16	0.13	0.11	0.11	0.11	0.06	0.13	0.06	0.09	0.16	0.13	0.26	0.13	0.08	0.14	0.17	0.19	0.10	0.11
O2'	0.13	0.17	0.15	0.17	0.13	0.20	0.10	0.22	0.11	0.11	0.19	0.16	0.26	0.18	0.22	0.18	0.16	0.21	0.11	0.15
O3'	0.16	0.21	0.18	0.18	0.14	0.20	0.09	0.23	0.08	0.11	0.22	0.19	0.34	0.20	0.17	0.21	0.26	0.26	0.15	0.19
O4'	0.16	0.21	0.16	0.15	0.13	0.16	0.09	0.19	0.09	0.12	0.21	0.16	0.35	0.16	0.12	0.18	0.23	0.22	0.14	0.16
O5'	0.14	0.22	0.16	0.15	0.14	0.17	0.11	0.20	0.08	0.08	0.22	0.18	0.38	0.19	0.12	0.16	0.22	0.21	0.08	0.13
OP1	0.14	0.23	0.13	0.13	0.13	0.18	0.09	0.25	0.10	0.12	0.22	0.15	0.35	0.12	0.08	0.19	0.28	0.30	0.18	0.22
OP2	0.15	0.26	0.15	0.10	0.14	0.07	0.15	0.09	0.16	0.15	0.25	0.14	0.41	0.17	0.09	0.09	0.14	0.09	0.12	0.09
P	0.12	0.23	0.13	0.10	0.11	0.12	0.08	0.17	0.09	0.10	0.22	0.13	0.38	0.14	0.05	0.13	0.21	0.19	0.10	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.04	0.12	0.13	0.09	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.05	0.04	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.11	0.05	0.03
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.05	0.07	0.09	0.10	0.02	0.01	0.00	0.03	0.13	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.19	0.19	0.17	0.16
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.01	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.02	0.22	0.20	0.19	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.20	0.17	0.14	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.13	0.13	0.08	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.16	0.15	0.13	0.13
N4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.21	0.20	0.20	0.18
O2	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.13	0.06	0.09	0.10	0.06	0.06
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.13	0.00	0.06	0.02	0.02	0.12	0.05	0.03
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.10	0.02	0.15	0.02	0.14	0.04	0.07	0.12	0.13	0.06	0.00	0.02	0.05	0.18	0.11	0.08
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.05	0.06	0.07	0.05
O5'	0.06	0.12	0.02	0.03	0.19	0.01	0.22	0.01	0.20	0.13	0.16	0.21	0.09	0.02	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.13	0.11	0.13	0.19	0.09	0.20	0.07	0.17	0.13	0.15	0.20	0.10	0.12	0.18	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.09	0.05	0.06	0.17	0.01	0.19	0.01	0.14	0.08	0.13	0.20	0.06	0.05	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.09	0.03	0.05	0.16	0.01	0.17	0.01	0.13	0.08	0.13	0.18	0.06	0.03	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00